MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 chromosome

Total Repeats: 43379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_018019	AGG	2	6	1207801	1207806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392400663
23003	NC_018019	ACT	3	9	1207826	1207834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400663
23004	NC_018019	CTG	2	6	1207900	1207905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400663
23005	NC_018019	TTC	2	6	1207914	1207919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400663
23006	NC_018019	TCT	2	6	1207998	1208003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400663
23007	NC_018019	GAA	2	6	1208213	1208218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400663
23008	NC_018019	GCT	2	6	1208300	1208305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400663
23009	NC_018019	AAAG	2	8	1208321	1208328	75 %	0 %	25 %	0 %	392400663
23010	NC_018019	CA	3	6	1208368	1208373	50 %	0 %	0 %	50 %	392400663
23011	NC_018019	TGCT	2	8	1208395	1208402	0 %	50 %	25 %	25 %	392400663
23012	NC_018019	GCAC	2	8	1208483	1208490	25 %	0 %	25 %	50 %	392400664
23013	NC_018019	TGC	2	6	1208504	1208509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400664
23014	NC_018019	CAT	2	6	1208604	1208609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400664
23015	NC_018019	GCCG	2	8	1208626	1208633	0 %	0 %	50 %	50 %	392400664
23016	NC_018019	TGA	2	6	1208667	1208672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400664
23017	NC_018019	CGAT	2	8	1208679	1208686	25 %	25 %	25 %	25 %	392400664
23018	NC_018019	AAC	2	6	1208743	1208748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400664
23019	NC_018019	GCA	2	6	1208772	1208777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400664
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23025	NC_018019	TTG	2	6	1209141	1209146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400664
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23028	NC_018019	GTC	2	6	1209256	1209261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400664
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23033	NC_018019	CGA	2	6	1209504	1209509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400664
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23046	NC_018019	GCA	2	6	1210323	1210328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400664
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23050	NC_018019	CCTG	2	8	1210574	1210581	0 %	25 %	25 %	50 %	392400664
23051	NC_018019	ACG	2	6	1210614	1210619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400664
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23053	NC_018019	TCA	2	6	1210682	1210687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400664
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23088	NC_018019	A	6	6	1212567	1212572	100 %	0 %	0 %	0 %	392400665
23089	NC_018019	CCAGA	2	10	1212627	1212636	40 %	0 %	20 %	40 %	392400665
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23100	NC_018019	GAT	2	6	1213694	1213699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400666
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23103	NC_018019	CGA	2	6	1213832	1213837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400666
23104	NC_018019	GCCA	2	8	1213859	1213866	25 %	0 %	25 %	50 %	392400666
23105	NC_018019	CAG	2	6	1213880	1213885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400666
23106	NC_018019	GTCA	2	8	1213914	1213921	25 %	25 %	25 %	25 %	392400666
23107	NC_018019	ATG	2	6	1213990	1213995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400666
23108	NC_018019	CAT	2	6	1214058	1214063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400666
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23110	NC_018019	CAT	2	6	1214351	1214356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400666
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23113	NC_018019	TAAT	2	8	1214658	1214665	50 %	50 %	0 %	0 %	392400667
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23115	NC_018019	CTG	2	6	1214801	1214806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400667
23116	NC_018019	CAT	2	6	1214816	1214821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400667
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23217	NC_018019	GCA	2	6	1221036	1221041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400674
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23221	NC_018019	GC	3	6	1221202	1221207	0 %	0 %	50 %	50 %	392400674
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23224	NC_018019	CTC	2	6	1221522	1221527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400675
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23229	NC_018019	AGT	2	6	1221791	1221796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400675
23230	NC_018019	AC	3	6	1221896	1221901	50 %	0 %	0 %	50 %	392400676
23231	NC_018019	TTTA	2	8	1221906	1221913	25 %	75 %	0 %	0 %	392400676
23232	NC_018019	GCA	2	6	1221925	1221930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400676
23233	NC_018019	TCAGC	2	10	1221932	1221941	20 %	20 %	20 %	40 %	392400676
23234	NC_018019	TCT	2	6	1221952	1221957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400676
23235	NC_018019	GCA	2	6	1222028	1222033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400676
23236	NC_018019	GGT	2	6	1222071	1222076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400676
23237	NC_018019	GC	3	6	1222146	1222151	0 %	0 %	50 %	50 %	392400676
23238	NC_018019	TGC	2	6	1222155	1222160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400676
23239	NC_018019	CAT	2	6	1222167	1222172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400676
23240	NC_018019	GCC	2	6	1222196	1222201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400676
23241	NC_018019	TCT	2	6	1222372	1222377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400676
23242	NC_018019	CTG	2	6	1222430	1222435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400676
23243	NC_018019	T	6	6	1222445	1222450	0 %	100 %	0 %	0 %	392400676
23244	NC_018019	T	6	6	1222525	1222530	0 %	100 %	0 %	0 %	392400676
23245	NC_018019	TCCC	2	8	1222556	1222563	0 %	25 %	0 %	75 %	392400676
23246	NC_018019	CCA	2	6	1222574	1222579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400676
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23248	NC_018019	TGA	2	6	1222679	1222684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400676
23249	NC_018019	TTC	2	6	1222709	1222714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400676
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23251	NC_018019	T	6	6	1222750	1222755	0 %	100 %	0 %	0 %	392400676
23252	NC_018019	TTG	2	6	1222784	1222789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400676
23253	NC_018019	CTT	2	6	1222790	1222795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400676
23254	NC_018019	CTA	2	6	1222817	1222822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400676
23255	NC_018019	T	6	6	1222824	1222829	0 %	100 %	0 %	0 %	392400676
23256	NC_018019	ATG	2	6	1222858	1222863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400676
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23258	NC_018019	GTG	2	6	1223091	1223096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400677
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23261	NC_018019	C	6	6	1223304	1223309	0 %	0 %	0 %	100 %	392400677
23262	NC_018019	TAGC	2	8	1223470	1223477	25 %	25 %	25 %	25 %	392400677
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23264	NC_018019	TAC	2	6	1223522	1223527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400677
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23306	NC_018019	TC	3	6	1225497	1225502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23307	NC_018019	CG	3	6	1225562	1225567	0 %	0 %	50 %	50 %	392400680
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23325	NC_018019	CCT	2	6	1226406	1226411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23326	NC_018019	CAG	2	6	1226478	1226483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23327	NC_018019	TGA	2	6	1226538	1226543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400681
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23329	NC_018019	GGT	2	6	1226585	1226590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400681
23330	NC_018019	CTT	2	6	1226641	1226646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400681
23331	NC_018019	GCAG	2	8	1226670	1226677	25 %	0 %	50 %	25 %	392400681
23332	NC_018019	GTA	2	6	1226730	1226735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400681
23333	NC_018019	CTT	2	6	1226740	1226745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400681
23334	NC_018019	CAC	2	6	1226950	1226955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400681
23335	NC_018019	AAC	2	6	1227237	1227242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400681
23336	NC_018019	AGG	2	6	1227291	1227296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392400681
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23339	NC_018019	TGC	2	6	1227572	1227577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400681
23340	NC_018019	TACT	2	8	1227615	1227622	25 %	50 %	0 %	25 %	392400681
23341	NC_018019	GCA	2	6	1227786	1227791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400682
23342	NC_018019	ATCA	2	8	1227797	1227804	50 %	25 %	0 %	25 %	392400682
23343	NC_018019	TCA	2	6	1227876	1227881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400682
23344	NC_018019	CTA	2	6	1228000	1228005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400682
23345	NC_018019	TC	3	6	1228071	1228076	0 %	50 %	0 %	50 %	392400682
23346	NC_018019	TCG	2	6	1228178	1228183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400682
23347	NC_018019	ATC	2	6	1228196	1228201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400682
23348	NC_018019	CTGAA	2	10	1228262	1228271	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23349	NC_018019	ATA	2	6	1228369	1228374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23350	NC_018019	CA	3	6	1228432	1228437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23351	NC_018019	TGCGC	2	10	1228550	1228559	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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23465	NC_018019	GGA	2	6	1234081	1234086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392400685
23466	NC_018019	AT	3	6	1234087	1234092	50 %	50 %	0 %	0 %	392400685
23467	NC_018019	CAC	2	6	1234098	1234103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400685
23468	NC_018019	TAA	2	6	1234188	1234193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392400685
23469	NC_018019	ACC	2	6	1234203	1234208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400685
23470	NC_018019	TGC	2	6	1234233	1234238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400685
23471	NC_018019	CTC	2	6	1234339	1234344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23472	NC_018019	TGC	2	6	1234355	1234360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23473	NC_018019	AAAT	2	8	1234389	1234396	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23474	NC_018019	GAT	3	9	1234404	1234412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23475	NC_018019	CTT	3	9	1234476	1234484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400686
23476	NC_018019	ACG	2	6	1234509	1234514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400686
23477	NC_018019	GCC	2	6	1234608	1234613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400686
23478	NC_018019	TCC	2	6	1234650	1234655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400686
23479	NC_018019	TCC	2	6	1234717	1234722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400686
23480	NC_018019	CGG	2	6	1234762	1234767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400686
23481	NC_018019	TCC	2	6	1234782	1234787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400686
23482	NC_018019	AC	3	6	1234806	1234811	50 %	0 %	0 %	50 %	392400686
23483	NC_018019	TCA	2	6	1234849	1234854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400686
23484	NC_018019	GTG	2	6	1234893	1234898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400686
23485	NC_018019	CAAA	2	8	1234964	1234971	75 %	0 %	0 %	25 %	392400686
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23487	NC_018019	GCGA	2	8	1235028	1235035	25 %	0 %	50 %	25 %	392400686
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23489	NC_018019	AGA	2	6	1235093	1235098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400686
23490	NC_018019	GC	3	6	1235140	1235145	0 %	0 %	50 %	50 %	392400686
23491	NC_018019	TCT	2	6	1235191	1235196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400686
23492	NC_018019	CCA	2	6	1235198	1235203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400686
23493	NC_018019	CAC	2	6	1235225	1235230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400686
23494	NC_018019	GTT	2	6	1235231	1235236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400686
23495	NC_018019	GAC	2	6	1235264	1235269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400686
23496	NC_018019	GGT	2	6	1235334	1235339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400686
23497	NC_018019	TCT	2	6	1235494	1235499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400686
23498	NC_018019	CAT	2	6	1235513	1235518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400686
23499	NC_018019	AGC	2	6	1235597	1235602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400686
23500	NC_018019	ATA	2	6	1235613	1235618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392400686

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