MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 chromosome

Total Repeats: 43379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22004	NC_018019	ATT	2	6	1153269	1153274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392400616
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22120	NC_018019	GTT	2	6	1159258	1159263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400620
22121	NC_018019	TCG	2	6	1159271	1159276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400620
22122	NC_018019	GC	3	6	1159292	1159297	0 %	0 %	50 %	50 %	392400620
22123	NC_018019	CAC	2	6	1159335	1159340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400620
22124	NC_018019	GAG	2	6	1159396	1159401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392400620
22125	NC_018019	CAGA	2	8	1159454	1159461	50 %	0 %	25 %	25 %	392400620
22126	NC_018019	GCC	2	6	1159531	1159536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400620
22127	NC_018019	TC	3	6	1159549	1159554	0 %	50 %	0 %	50 %	392400620
22128	NC_018019	GAG	2	6	1159564	1159569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392400620
22129	NC_018019	CGT	2	6	1159579	1159584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400620
22130	NC_018019	ACC	2	6	1159610	1159615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400620
22131	NC_018019	CAT	2	6	1159783	1159788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400620
22132	NC_018019	T	6	6	1159788	1159793	0 %	100 %	0 %	0 %	392400620
22133	NC_018019	GCA	2	6	1159820	1159825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400620
22134	NC_018019	AGC	3	9	1159870	1159878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400620
22135	NC_018019	TCT	2	6	1159881	1159886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400620
22136	NC_018019	GCTC	2	8	1159895	1159902	0 %	25 %	25 %	50 %	392400620
22137	NC_018019	ACG	2	6	1159903	1159908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400620
22138	NC_018019	TCA	2	6	1159919	1159924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400620
22139	NC_018019	CAC	2	6	1159977	1159982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400620
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22141	NC_018019	GGT	2	6	1160112	1160117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400620
22142	NC_018019	TCG	2	6	1160126	1160131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400620
22143	NC_018019	GTG	2	6	1160141	1160146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400620
22144	NC_018019	TCC	2	6	1160212	1160217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400620
22145	NC_018019	GCT	2	6	1160291	1160296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400620
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22147	NC_018019	T	6	6	1160365	1160370	0 %	100 %	0 %	0 %	392400620
22148	NC_018019	ATC	2	6	1160371	1160376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400620
22149	NC_018019	CG	3	6	1160459	1160464	0 %	0 %	50 %	50 %	392400620
22150	NC_018019	GTA	2	6	1160573	1160578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400620
22151	NC_018019	CAA	2	6	1160601	1160606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400620
22152	NC_018019	TCACAA	2	12	1160697	1160708	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	392400620
22153	NC_018019	CGG	2	6	1160709	1160714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22154	NC_018019	TGG	2	6	1160776	1160781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22155	NC_018019	CGG	2	6	1160888	1160893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400621
22156	NC_018019	AATG	2	8	1160905	1160912	50 %	25 %	25 %	0 %	392400621
22157	NC_018019	TTA	2	6	1160931	1160936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392400621
22158	NC_018019	CCAT	2	8	1161034	1161041	25 %	25 %	0 %	50 %	392400621
22159	NC_018019	TCT	2	6	1161138	1161143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400621
22160	NC_018019	CTG	2	6	1161169	1161174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400621
22161	NC_018019	CAGAT	2	10	1161176	1161185	40 %	20 %	20 %	20 %	392400621
22162	NC_018019	CTT	2	6	1161301	1161306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400621
22163	NC_018019	TCC	2	6	1161308	1161313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400622
22164	NC_018019	GC	3	6	1161357	1161362	0 %	0 %	50 %	50 %	392400622
22165	NC_018019	ATC	2	6	1161455	1161460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400622
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22168	NC_018019	TTC	2	6	1161514	1161519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400622
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22171	NC_018019	TCT	2	6	1161596	1161601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400622
22172	NC_018019	CGC	2	6	1161630	1161635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400622
22173	NC_018019	ATG	2	6	1161649	1161654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400622
22174	NC_018019	TGCA	2	8	1161685	1161692	25 %	25 %	25 %	25 %	392400622
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22176	NC_018019	CCT	2	6	1161754	1161759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400623
22177	NC_018019	GCT	2	6	1161790	1161795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400623
22178	NC_018019	TGC	2	6	1161801	1161806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400623
22179	NC_018019	GTCG	2	8	1161812	1161819	0 %	25 %	50 %	25 %	392400623
22180	NC_018019	CTT	2	6	1161821	1161826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400623
22181	NC_018019	TGT	2	6	1161833	1161838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400623
22182	NC_018019	AC	4	8	1161921	1161928	50 %	0 %	0 %	50 %	392400623
22183	NC_018019	ATC	2	6	1161933	1161938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400623
22184	NC_018019	CTT	2	6	1162112	1162117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400623
22185	NC_018019	CAC	2	6	1162146	1162151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400623
22186	NC_018019	GTT	2	6	1162262	1162267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400623
22187	NC_018019	CGC	2	6	1162301	1162306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400623
22188	NC_018019	CA	3	6	1162313	1162318	50 %	0 %	0 %	50 %	392400623
22189	NC_018019	GCAT	2	8	1162392	1162399	25 %	25 %	25 %	25 %	392400623
22190	NC_018019	GC	3	6	1162412	1162417	0 %	0 %	50 %	50 %	392400623
22191	NC_018019	ACG	2	6	1162431	1162436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400623
22192	NC_018019	ACT	2	6	1162495	1162500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400623
22193	NC_018019	GGTCTA	2	12	1162511	1162522	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	392400623
22194	NC_018019	GC	3	6	1162584	1162589	0 %	0 %	50 %	50 %	392400623
22195	NC_018019	GTG	2	6	1162620	1162625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400623
22196	NC_018019	TAC	3	9	1162638	1162646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400623
22197	NC_018019	CTT	2	6	1162655	1162660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400623
22198	NC_018019	GC	3	6	1162879	1162884	0 %	0 %	50 %	50 %	392400623
22199	NC_018019	ATA	2	6	1162961	1162966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22200	NC_018019	TCAG	2	8	1163011	1163018	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22201	NC_018019	GA	3	6	1163034	1163039	50 %	0 %	50 %	0 %	392400624
22202	NC_018019	ATC	2	6	1163066	1163071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400624
22203	NC_018019	TAA	2	6	1163095	1163100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392400624
22204	NC_018019	ATC	2	6	1163169	1163174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400624
22205	NC_018019	TCT	2	6	1163320	1163325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400624
22206	NC_018019	CTT	2	6	1163404	1163409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400624
22207	NC_018019	AAG	2	6	1163466	1163471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400624
22208	NC_018019	GC	3	6	1163535	1163540	0 %	0 %	50 %	50 %	392400624
22209	NC_018019	AAG	2	6	1163576	1163581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400624
22210	NC_018019	TCA	2	6	1163736	1163741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400624
22211	NC_018019	GTA	2	6	1163746	1163751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400624
22212	NC_018019	GCT	2	6	1163905	1163910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400625
22213	NC_018019	TCG	2	6	1163925	1163930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400625
22214	NC_018019	TTC	2	6	1163939	1163944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400625
22215	NC_018019	TTC	2	6	1163974	1163979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400625
22216	NC_018019	AGA	2	6	1163992	1163997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400625
22217	NC_018019	TCT	2	6	1164027	1164032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400625
22218	NC_018019	CG	3	6	1164040	1164045	0 %	0 %	50 %	50 %	392400625
22219	NC_018019	TCG	2	6	1164066	1164071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400625
22220	NC_018019	AGC	2	6	1164089	1164094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400625
22221	NC_018019	CCCA	2	8	1164234	1164241	25 %	0 %	0 %	75 %	392400625
22222	NC_018019	GCT	2	6	1164346	1164351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400625
22223	NC_018019	CCG	2	6	1164450	1164455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400625
22224	NC_018019	CAT	2	6	1164526	1164531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400625
22225	NC_018019	CAA	2	6	1164547	1164552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400625
22226	NC_018019	TGCG	2	8	1164599	1164606	0 %	25 %	50 %	25 %	392400625
22227	NC_018019	AAG	2	6	1164632	1164637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400625
22228	NC_018019	T	6	6	1164685	1164690	0 %	100 %	0 %	0 %	392400625
22229	NC_018019	TTC	2	6	1164725	1164730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400625
22230	NC_018019	CCA	2	6	1164847	1164852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400625
22231	NC_018019	GGT	2	6	1164905	1164910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400625
22232	NC_018019	CGT	2	6	1164928	1164933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400625
22233	NC_018019	GAA	2	6	1165017	1165022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400625
22234	NC_018019	TGT	3	9	1165036	1165044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400625
22235	NC_018019	TGT	3	9	1165062	1165070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400625
22236	NC_018019	CAA	2	6	1165173	1165178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400626
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22264	NC_018019	TTC	2	6	1167345	1167350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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22266	NC_018019	AC	3	6	1167431	1167436	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22267	NC_018019	AACC	2	8	1167463	1167470	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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22303	NC_018019	GCT	2	6	1169885	1169890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400629
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22306	NC_018019	GGA	2	6	1169943	1169948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392400629
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22308	NC_018019	ACC	2	6	1170183	1170188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400629
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22322	NC_018019	CCTG	2	8	1170820	1170827	0 %	25 %	25 %	50 %	392400630
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22327	NC_018019	AGTT	2	8	1171022	1171029	25 %	50 %	25 %	0 %	392400630
22328	NC_018019	TCG	2	6	1171061	1171066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400630
22329	NC_018019	CTT	2	6	1171073	1171078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400630
22330	NC_018019	CAA	2	6	1171106	1171111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400630
22331	NC_018019	TGG	2	6	1171167	1171172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400630
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22333	NC_018019	AC	3	6	1171334	1171339	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22334	NC_018019	CG	3	6	1171427	1171432	0 %	0 %	50 %	50 %	392400631
22335	NC_018019	TTG	2	6	1171623	1171628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400631
22336	NC_018019	CGA	2	6	1171670	1171675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400631
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22339	NC_018019	TGG	2	6	1171766	1171771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400631
22340	NC_018019	TCC	2	6	1171788	1171793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400631
22341	NC_018019	TGTA	2	8	1171827	1171834	25 %	50 %	25 %	0 %	392400631
22342	NC_018019	GAC	2	6	1171850	1171855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400631
22343	NC_018019	GCG	2	6	1171910	1171915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400631
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22347	NC_018019	AAGG	2	8	1172365	1172372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22348	NC_018019	T	6	6	1172415	1172420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22349	NC_018019	TTA	2	6	1172430	1172435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22350	NC_018019	CTT	2	6	1172471	1172476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400632
22351	NC_018019	AGA	2	6	1172477	1172482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400632
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22353	NC_018019	ATT	2	6	1172571	1172576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392400632
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22470	NC_018019	TCC	2	6	1179323	1179328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400636
22471	NC_018019	CCG	2	6	1179347	1179352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400636
22472	NC_018019	GCC	2	6	1179504	1179509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400636
22473	NC_018019	TTG	2	6	1179709	1179714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400636
22474	NC_018019	CGT	2	6	1179723	1179728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400636
22475	NC_018019	GAA	2	6	1179750	1179755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400636
22476	NC_018019	CAG	2	6	1179806	1179811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400636
22477	NC_018019	CTACC	2	10	1179818	1179827	20 %	20 %	0 %	60 %	392400636
22478	NC_018019	CAG	2	6	1179898	1179903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400637
22479	NC_018019	CGG	2	6	1179944	1179949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400637
22480	NC_018019	T	8	8	1180057	1180064	0 %	100 %	0 %	0 %	392400637
22481	NC_018019	GAA	2	6	1180152	1180157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400637
22482	NC_018019	AC	3	6	1180213	1180218	50 %	0 %	0 %	50 %	392400637
22483	NC_018019	CAG	2	6	1180369	1180374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400637
22484	NC_018019	TTG	2	6	1180429	1180434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400637
22485	NC_018019	GCC	2	6	1180470	1180475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400637
22486	NC_018019	GCT	2	6	1180529	1180534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400637
22487	NC_018019	TTG	2	6	1180537	1180542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400637
22488	NC_018019	TGC	2	6	1180550	1180555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400637
22489	NC_018019	ACAG	2	8	1180574	1180581	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22490	NC_018019	AGCG	2	8	1180636	1180643	25 %	0 %	50 %	25 %	392400638
22491	NC_018019	GAT	2	6	1180685	1180690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400638
22492	NC_018019	CCA	2	6	1180726	1180731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400638
22493	NC_018019	CGC	3	9	1180759	1180767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400638
22494	NC_018019	GCC	2	6	1180784	1180789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400638
22495	NC_018019	AGC	2	6	1180806	1180811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400638
22496	NC_018019	TCA	2	6	1180822	1180827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400638
22497	NC_018019	AAGTGC	2	12	1180856	1180867	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	392400638
22498	NC_018019	CAC	2	6	1180939	1180944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22499	NC_018019	TCA	2	6	1181048	1181053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400639
22500	NC_018019	GTC	2	6	1181152	1181157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400639

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