MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 chromosome

Total Repeats: 43379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_018019	CACT	2	8	1099475	1099482	25 %	25 %	0 %	50 %	392400570
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21005	NC_018019	ATT	2	6	1099561	1099566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392400570
21006	NC_018019	TTTC	2	8	1099628	1099635	0 %	75 %	0 %	25 %	392400570
21007	NC_018019	T	6	6	1099652	1099657	0 %	100 %	0 %	0 %	392400570
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21011	NC_018019	ATT	2	6	1099779	1099784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392400570
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21085	NC_018019	GATT	2	8	1102896	1102903	25 %	50 %	25 %	0 %	392400574
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21109	NC_018019	AT	3	6	1104677	1104682	50 %	50 %	0 %	0 %	392400575
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21113	NC_018019	TTC	2	6	1104765	1104770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400575
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21118	NC_018019	ATG	2	6	1104919	1104924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400575
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21227	NC_018019	CTG	2	6	1111057	1111062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400581
21228	NC_018019	ATC	2	6	1111076	1111081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400581
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21231	NC_018019	CAG	2	6	1111179	1111184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400581
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21233	NC_018019	CT	3	6	1111222	1111227	0 %	50 %	0 %	50 %	392400581
21234	NC_018019	CAA	2	6	1111233	1111238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400581
21235	NC_018019	TTTTG	2	10	1111387	1111396	0 %	80 %	20 %	0 %	392400581
21236	NC_018019	CGA	2	6	1111446	1111451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400581
21237	NC_018019	CGGGG	2	10	1111571	1111580	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
21238	NC_018019	GGT	2	6	1111594	1111599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21239	NC_018019	CTA	2	6	1111618	1111623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400582
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21269	NC_018019	TCCT	2	8	1113119	1113126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21270	NC_018019	TAGG	2	8	1113161	1113168	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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21272	NC_018019	CAC	2	6	1113244	1113249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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21277	NC_018019	CATC	2	8	1113529	1113536	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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21286	NC_018019	TG	3	6	1113850	1113855	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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21291	NC_018019	CTTTT	2	10	1114065	1114074	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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21342	NC_018019	TCCA	2	8	1116985	1116992	25 %	25 %	0 %	50 %	392400585
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21344	NC_018019	TC	3	6	1117069	1117074	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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21348	NC_018019	T	6	6	1117323	1117328	0 %	100 %	0 %	0 %	392400586
21349	NC_018019	GAA	2	6	1117347	1117352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400586
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21353	NC_018019	CTA	2	6	1117789	1117794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400586
21354	NC_018019	AGG	2	6	1117804	1117809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392400586
21355	NC_018019	CTG	2	6	1117813	1117818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400586
21356	NC_018019	AGT	2	6	1117872	1117877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400586
21357	NC_018019	AGCTTT	2	12	1117991	1118002	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	392400586
21358	NC_018019	GCT	2	6	1118010	1118015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400586
21359	NC_018019	CTTT	2	8	1118053	1118060	0 %	75 %	0 %	25 %	392400586
21360	NC_018019	TGC	2	6	1118063	1118068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400586
21361	NC_018019	TAA	2	6	1118166	1118171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392400586
21362	NC_018019	ATC	2	6	1118198	1118203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400586
21363	NC_018019	AGC	2	6	1118225	1118230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400586
21364	NC_018019	ACC	2	6	1118231	1118236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400586
21365	NC_018019	CAA	2	6	1118315	1118320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400586
21366	NC_018019	AGC	2	6	1118357	1118362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400586
21367	NC_018019	GTT	2	6	1118417	1118422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400586
21368	NC_018019	T	6	6	1118445	1118450	0 %	100 %	0 %	0 %	392400586
21369	NC_018019	GTC	2	6	1118510	1118515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400586
21370	NC_018019	GAA	2	6	1118575	1118580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400586
21371	NC_018019	TGA	2	6	1118653	1118658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400586
21372	NC_018019	T	6	6	1118713	1118718	0 %	100 %	0 %	0 %	392400586
21373	NC_018019	CT	3	6	1118731	1118736	0 %	50 %	0 %	50 %	392400586
21374	NC_018019	AGC	2	6	1118762	1118767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400586
21375	NC_018019	CTG	2	6	1118851	1118856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400586
21376	NC_018019	GCT	2	6	1118893	1118898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400586
21377	NC_018019	ATCT	2	8	1118903	1118910	25 %	50 %	0 %	25 %	392400586
21378	NC_018019	CATT	2	8	1118970	1118977	25 %	50 %	0 %	25 %	392400586
21379	NC_018019	GCA	2	6	1119006	1119011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400586
21380	NC_018019	AG	3	6	1119035	1119040	50 %	0 %	50 %	0 %	392400586
21381	NC_018019	TCT	2	6	1119123	1119128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400586
21382	NC_018019	GAT	2	6	1119164	1119169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400586
21383	NC_018019	GTC	2	6	1119170	1119175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400586
21384	NC_018019	TTC	2	6	1119176	1119181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400586
21385	NC_018019	TAA	2	6	1119208	1119213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392400586
21386	NC_018019	T	7	7	1119232	1119238	0 %	100 %	0 %	0 %	392400586
21387	NC_018019	AGC	2	6	1119239	1119244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400586
21388	NC_018019	GTGC	2	8	1119246	1119253	0 %	25 %	50 %	25 %	392400586
21389	NC_018019	TCG	2	6	1119264	1119269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400586
21390	NC_018019	CTA	2	6	1119280	1119285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400586
21391	NC_018019	TGC	2	6	1119297	1119302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400586
21392	NC_018019	CAGCG	2	10	1119373	1119382	20 %	0 %	40 %	40 %	392400586
21393	NC_018019	ACC	2	6	1119383	1119388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400586
21394	NC_018019	AATC	2	8	1119430	1119437	50 %	25 %	0 %	25 %	392400586
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21398	NC_018019	TTG	2	6	1119554	1119559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400586
21399	NC_018019	ATC	2	6	1119648	1119653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400586
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21402	NC_018019	CAA	2	6	1119763	1119768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400586
21403	NC_018019	CTG	2	6	1119781	1119786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400586
21404	NC_018019	GCT	2	6	1119864	1119869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400586
21405	NC_018019	GAAA	2	8	1119966	1119973	75 %	0 %	25 %	0 %	392400586
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21407	NC_018019	AC	3	6	1120115	1120120	50 %	0 %	0 %	50 %	392400586
21408	NC_018019	CTA	2	6	1120138	1120143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400586
21409	NC_018019	ATC	2	6	1120236	1120241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400586
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21412	NC_018019	TCG	2	6	1120371	1120376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400586
21413	NC_018019	AAGC	2	8	1120408	1120415	50 %	0 %	25 %	25 %	392400586
21414	NC_018019	CAA	2	6	1120483	1120488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400586
21415	NC_018019	GTAT	2	8	1120724	1120731	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21416	NC_018019	TG	3	6	1120732	1120737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21417	NC_018019	ATCTTC	2	12	1120815	1120826	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	392400587
21418	NC_018019	CGTA	2	8	1120844	1120851	25 %	25 %	25 %	25 %	392400587
21419	NC_018019	TTC	2	6	1120866	1120871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400587
21420	NC_018019	TCC	2	6	1120888	1120893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400587
21421	NC_018019	T	6	6	1120899	1120904	0 %	100 %	0 %	0 %	392400587
21422	NC_018019	CTG	2	6	1120911	1120916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400587
21423	NC_018019	GAA	2	6	1121099	1121104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400587
21424	NC_018019	TGG	2	6	1121139	1121144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400587
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21426	NC_018019	CAT	2	6	1121247	1121252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400587
21427	NC_018019	TCA	2	6	1121272	1121277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21428	NC_018019	CCA	2	6	1121357	1121362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400588
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21431	NC_018019	CAG	2	6	1121429	1121434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400588
21432	NC_018019	GATA	2	8	1121464	1121471	50 %	25 %	25 %	0 %	392400588
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21444	NC_018019	CGA	2	6	1122110	1122115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400588
21445	NC_018019	CAG	2	6	1122135	1122140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400588
21446	NC_018019	GAG	2	6	1122197	1122202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392400588
21447	NC_018019	GC	3	6	1122289	1122294	0 %	0 %	50 %	50 %	392400588
21448	NC_018019	TTAA	2	8	1122370	1122377	50 %	50 %	0 %	0 %	392400588
21449	NC_018019	CATA	2	8	1122439	1122446	50 %	25 %	0 %	25 %	392400588
21450	NC_018019	AGA	3	9	1122632	1122640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21451	NC_018019	GTT	2	6	1122680	1122685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400589
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21453	NC_018019	TAA	2	6	1122724	1122729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392400589
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21455	NC_018019	AAC	2	6	1122902	1122907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400589
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21458	NC_018019	T	6	6	1123093	1123098	0 %	100 %	0 %	0 %	392400589
21459	NC_018019	CTG	2	6	1123113	1123118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400589
21460	NC_018019	GAAA	2	8	1123129	1123136	75 %	0 %	25 %	0 %	392400589
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21462	NC_018019	ATG	2	6	1123211	1123216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400589
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21464	NC_018019	TCC	2	6	1123397	1123402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400589
21465	NC_018019	C	6	6	1123401	1123406	0 %	0 %	0 %	100 %	392400589
21466	NC_018019	A	6	6	1123407	1123412	100 %	0 %	0 %	0 %	392400589
21467	NC_018019	GA	3	6	1123416	1123421	50 %	0 %	50 %	0 %	392400589
21468	NC_018019	AGA	2	6	1123438	1123443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400589
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21470	NC_018019	GA	3	6	1123605	1123610	50 %	0 %	50 %	0 %	392400590
21471	NC_018019	ACA	3	9	1123660	1123668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400590
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21473	NC_018019	TGT	2	6	1123806	1123811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400590
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21479	NC_018019	TTA	2	6	1124107	1124112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392400590
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21482	NC_018019	CAG	2	6	1124354	1124359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400590
21483	NC_018019	AGCC	2	8	1124374	1124381	25 %	0 %	25 %	50 %	392400590
21484	NC_018019	CAT	2	6	1124419	1124424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400590
21485	NC_018019	TGA	2	6	1124484	1124489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400590
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21491	NC_018019	TTC	2	6	1124789	1124794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400591
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21493	NC_018019	A	6	6	1124849	1124854	100 %	0 %	0 %	0 %	392400591
21494	NC_018019	ATG	2	6	1124888	1124893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400591
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21496	NC_018019	ACCG	2	8	1124944	1124951	25 %	0 %	25 %	50 %	392400591
21497	NC_018019	ATG	2	6	1125014	1125019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400591
21498	NC_018019	ACG	2	6	1125055	1125060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400591
21499	NC_018019	GCG	2	6	1125062	1125067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400591
21500	NC_018019	ATT	2	6	1125070	1125075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392400591

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