MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 chromosome

Total Repeats: 43379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_018019	GAA	2	6	1017893	1017898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19502	NC_018019	GACG	2	8	1017925	1017932	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19503	NC_018019	TACG	2	8	1017979	1017986	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19504	NC_018019	G	6	6	1018065	1018070	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19505	NC_018019	AAC	2	6	1018133	1018138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19506	NC_018019	TGT	2	6	1018143	1018148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19507	NC_018019	GT	3	6	1018147	1018152	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19508	NC_018019	TGT	2	6	1018158	1018163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19509	NC_018019	A	6	6	1018177	1018182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19510	NC_018019	TGT	2	6	1018192	1018197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19511	NC_018019	CATGT	2	10	1018230	1018239	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19512	NC_018019	GTTGT	2	10	1018240	1018249	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
19513	NC_018019	TGG	2	6	1018260	1018265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19514	NC_018019	CGC	2	6	1018364	1018369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19515	NC_018019	TA	3	6	1018400	1018405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19516	NC_018019	GT	4	8	1018408	1018415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19517	NC_018019	GAG	2	6	1018423	1018428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19518	NC_018019	TCT	3	9	1018434	1018442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19519	NC_018019	AC	4	8	1018448	1018455	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19520	NC_018019	TAA	2	6	1018471	1018476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19521	NC_018019	GCC	2	6	1018544	1018549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19522	NC_018019	GGT	2	6	1018555	1018560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19523	NC_018019	CGT	2	6	1018570	1018575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19524	NC_018019	GACG	2	8	1018642	1018649	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19525	NC_018019	TGA	2	6	1018764	1018769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19526	NC_018019	AGA	2	6	1018801	1018806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19527	NC_018019	AAG	2	6	1018817	1018822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19528	NC_018019	CGT	2	6	1018825	1018830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19529	NC_018019	CGC	2	6	1018852	1018857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19530	NC_018019	GTG	2	6	1018874	1018879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19531	NC_018019	TTC	2	6	1018914	1018919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19532	NC_018019	GAACG	2	10	1018933	1018942	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19533	NC_018019	CGG	2	6	1018965	1018970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19534	NC_018019	TAA	2	6	1018980	1018985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19535	NC_018019	ACA	2	6	1018986	1018991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19536	NC_018019	AAT	2	6	1019032	1019037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19537	NC_018019	GAT	2	6	1019062	1019067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19538	NC_018019	GGC	2	6	1019160	1019165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19539	NC_018019	ATGG	2	8	1019169	1019176	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19540	NC_018019	GAT	2	6	1019179	1019184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19541	NC_018019	GCA	2	6	1019212	1019217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19542	NC_018019	GTT	2	6	1019242	1019247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19543	NC_018019	GA	3	6	1019249	1019254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19544	NC_018019	AAG	2	6	1019291	1019296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19545	NC_018019	GA	3	6	1019368	1019373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19546	NC_018019	CAT	2	6	1019426	1019431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19547	NC_018019	GC	3	6	1019474	1019479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19548	NC_018019	GCA	2	6	1019503	1019508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19549	NC_018019	TGC	2	6	1019538	1019543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19550	NC_018019	ATT	2	6	1019710	1019715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19551	NC_018019	CAT	2	6	1019763	1019768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400500
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19553	NC_018019	A	7	7	1019845	1019851	100 %	0 %	0 %	0 %	392400500
19554	NC_018019	AGC	2	6	1019969	1019974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400500
19555	NC_018019	CTG	2	6	1020082	1020087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400500
19556	NC_018019	GCC	2	6	1020153	1020158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400500
19557	NC_018019	CTG	2	6	1020292	1020297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400500
19558	NC_018019	CAG	2	6	1020325	1020330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400500
19559	NC_018019	TTTG	2	8	1020512	1020519	0 %	75 %	25 %	0 %	392400500
19560	NC_018019	TACG	2	8	1020631	1020638	25 %	25 %	25 %	25 %	392400500
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19562	NC_018019	ATG	2	6	1020661	1020666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400500
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19564	NC_018019	GAT	2	6	1021002	1021007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400502
19565	NC_018019	CGA	2	6	1021104	1021109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400502
19566	NC_018019	GCT	2	6	1021134	1021139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400502
19567	NC_018019	CGT	2	6	1021240	1021245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400502
19568	NC_018019	ATG	2	6	1021307	1021312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400502
19569	NC_018019	TCTT	2	8	1021398	1021405	0 %	75 %	0 %	25 %	392400502
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19574	NC_018019	A	6	6	1021665	1021670	100 %	0 %	0 %	0 %	392400502
19575	NC_018019	TAGC	2	8	1021900	1021907	25 %	25 %	25 %	25 %	392400503
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19578	NC_018019	AATC	2	8	1022051	1022058	50 %	25 %	0 %	25 %	392400503
19579	NC_018019	T	6	6	1022072	1022077	0 %	100 %	0 %	0 %	392400503
19580	NC_018019	CT	3	6	1022096	1022101	0 %	50 %	0 %	50 %	392400503
19581	NC_018019	TGA	2	6	1022102	1022107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400503
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19585	NC_018019	AG	4	8	1022198	1022205	50 %	0 %	50 %	0 %	392400503
19586	NC_018019	GCG	2	6	1022248	1022253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400503
19587	NC_018019	CTG	2	6	1022356	1022361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400503
19588	NC_018019	AAT	2	6	1022409	1022414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392400503
19589	NC_018019	GTT	2	6	1022442	1022447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400503
19590	NC_018019	ACC	2	6	1022534	1022539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400503
19591	NC_018019	CTT	2	6	1022713	1022718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19592	NC_018019	TGAGC	2	10	1022823	1022832	20 %	20 %	40 %	20 %	392400504
19593	NC_018019	GACT	2	8	1022837	1022844	25 %	25 %	25 %	25 %	392400504
19594	NC_018019	AGG	2	6	1023033	1023038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392400504
19595	NC_018019	GCT	2	6	1023130	1023135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400504
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19598	NC_018019	CGGAG	2	10	1023498	1023507	20 %	0 %	60 %	20 %	392400504
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19602	NC_018019	TGC	2	6	1023788	1023793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400504
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19604	NC_018019	GAA	2	6	1023853	1023858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400504
19605	NC_018019	CGC	2	6	1023879	1023884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400504
19606	NC_018019	AAG	2	6	1023886	1023891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400504
19607	NC_018019	TGC	2	6	1023897	1023902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400504
19608	NC_018019	TAA	2	6	1023903	1023908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392400504
19609	NC_018019	AGC	2	6	1023933	1023938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400504
19610	NC_018019	A	6	6	1023940	1023945	100 %	0 %	0 %	0 %	392400504
19611	NC_018019	AGA	2	6	1023963	1023968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400504
19612	NC_018019	GT	3	6	1024031	1024036	0 %	50 %	50 %	0 %	392400504
19613	NC_018019	TCT	2	6	1024102	1024107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400504
19614	NC_018019	TTCT	2	8	1024154	1024161	0 %	75 %	0 %	25 %	392400504
19615	NC_018019	AAC	2	6	1024176	1024181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400504
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19617	NC_018019	GTGG	2	8	1024210	1024217	0 %	25 %	75 %	0 %	392400504
19618	NC_018019	TTG	2	6	1024277	1024282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400504
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19972	NC_018019	ATT	2	6	1043936	1043941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392400522
19973	NC_018019	GAA	2	6	1043961	1043966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400522
19974	NC_018019	TGT	3	9	1044061	1044069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400522
19975	NC_018019	TTC	2	6	1044136	1044141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400522
19976	NC_018019	ATT	2	6	1044171	1044176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392400522
19977	NC_018019	TCT	2	6	1044270	1044275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400522
19978	NC_018019	TC	3	6	1044315	1044320	0 %	50 %	0 %	50 %	392400522
19979	NC_018019	TGC	2	6	1044324	1044329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400522
19980	NC_018019	TGA	2	6	1044376	1044381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400522
19981	NC_018019	GTTA	2	8	1044436	1044443	25 %	50 %	25 %	0 %	392400522
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19984	NC_018019	ATA	2	6	1044560	1044565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392400522
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19988	NC_018019	TAC	2	6	1044666	1044671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400522
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19991	NC_018019	TCA	2	6	1044768	1044773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400522
19992	NC_018019	ATC	2	6	1044849	1044854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400522
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19994	NC_018019	TGC	2	6	1044919	1044924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400522
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19999	NC_018019	GAA	2	6	1045216	1045221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400522
20000	NC_018019	AAG	2	6	1045260	1045265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400522

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