MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 chromosome

Total Repeats: 43379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_018019	ATT	2	6	831637	831642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392400347
16003	NC_018019	CAG	2	6	831675	831680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400347
16004	NC_018019	CGC	3	9	831735	831743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400347
16005	NC_018019	TAA	2	6	831825	831830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392400347
16006	NC_018019	CTG	2	6	832032	832037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400347
16007	NC_018019	AT	3	6	832182	832187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_018019	GCA	2	6	832230	832235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16009	NC_018019	GAA	2	6	832303	832308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_018019	ACG	2	6	832323	832328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16011	NC_018019	CAGG	2	8	832344	832351	25 %	0 %	50 %	25 %	392400348
16012	NC_018019	CCG	2	6	832384	832389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400348
16013	NC_018019	CGC	2	6	832450	832455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400348
16014	NC_018019	GCA	2	6	832485	832490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400348
16015	NC_018019	ACA	2	6	832521	832526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400348
16016	NC_018019	GA	3	6	832535	832540	50 %	0 %	50 %	0 %	392400348
16017	NC_018019	TCA	2	6	832557	832562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400348
16018	NC_018019	TCCA	2	8	832657	832664	25 %	25 %	0 %	50 %	392400348
16019	NC_018019	CG	3	6	832701	832706	0 %	0 %	50 %	50 %	392400348
16020	NC_018019	GCG	2	6	832740	832745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400348
16021	NC_018019	ACA	2	6	832746	832751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400348
16022	NC_018019	CGT	2	6	832867	832872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400348
16023	NC_018019	CGG	2	6	832906	832911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400348
16024	NC_018019	TGA	2	6	833094	833099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400348
16025	NC_018019	GC	3	6	833105	833110	0 %	0 %	50 %	50 %	392400348
16026	NC_018019	CAGC	2	8	833185	833192	25 %	0 %	25 %	50 %	392400349
16027	NC_018019	TCC	2	6	833217	833222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400349
16028	NC_018019	AAC	3	9	833237	833245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400349
16029	NC_018019	AGA	2	6	833255	833260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400349
16030	NC_018019	GCG	2	6	833284	833289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400349
16031	NC_018019	TGGG	2	8	833340	833347	0 %	25 %	75 %	0 %	392400349
16032	NC_018019	CAAC	2	8	833385	833392	50 %	0 %	0 %	50 %	392400349
16033	NC_018019	GTT	2	6	833481	833486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400349
16034	NC_018019	CGG	2	6	833495	833500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400349
16035	NC_018019	AAC	2	6	833527	833532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400349
16036	NC_018019	GAT	2	6	833634	833639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400349
16037	NC_018019	CCTTG	2	10	833672	833681	0 %	40 %	20 %	40 %	392400349
16038	NC_018019	CAA	2	6	833723	833728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400349
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16040	NC_018019	CACT	2	8	833767	833774	25 %	25 %	0 %	50 %	392400349
16041	NC_018019	TG	4	8	833779	833786	0 %	50 %	50 %	0 %	392400349
16042	NC_018019	GCA	2	6	833793	833798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400349
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16044	NC_018019	GTCC	2	8	833861	833868	0 %	25 %	25 %	50 %	392400349
16045	NC_018019	AGG	2	6	833897	833902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392400349
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16047	NC_018019	ATG	2	6	833967	833972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400349
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16049	NC_018019	GTT	2	6	834035	834040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400349
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16051	NC_018019	GGC	2	6	834164	834169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400349
16052	NC_018019	TTGC	2	8	834261	834268	0 %	50 %	25 %	25 %	392400349
16053	NC_018019	TCT	2	6	834277	834282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400349
16054	NC_018019	GCCTA	2	10	834287	834296	20 %	20 %	20 %	40 %	392400349
16055	NC_018019	CGAG	2	8	834397	834404	25 %	0 %	50 %	25 %	392400349
16056	NC_018019	CATG	2	8	834521	834528	25 %	25 %	25 %	25 %	392400349
16057	NC_018019	ATT	2	6	834574	834579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392400349
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16059	NC_018019	CTG	2	6	834702	834707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400349
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16061	NC_018019	CAC	2	6	834894	834899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400350
16062	NC_018019	CTG	2	6	834900	834905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400350
16063	NC_018019	TGA	2	6	835014	835019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400350
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16065	NC_018019	TGA	2	6	835081	835086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400350
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16090	NC_018019	CGA	2	6	836377	836382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400351
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16099	NC_018019	AGGT	2	8	836790	836797	25 %	25 %	50 %	0 %	392400352
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16101	NC_018019	GCT	2	6	836886	836891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400352
16102	NC_018019	CGG	2	6	836892	836897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400352
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16105	NC_018019	CAT	2	6	836968	836973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400352
16106	NC_018019	T	6	6	837034	837039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16107	NC_018019	GCA	2	6	837048	837053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16108	NC_018019	A	6	6	837190	837195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16109	NC_018019	GA	3	6	837271	837276	50 %	0 %	50 %	0 %	392400353
16110	NC_018019	TGG	2	6	837343	837348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400353
16111	NC_018019	ATCTTT	2	12	837358	837369	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	392400353
16112	NC_018019	ATA	2	6	837372	837377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392400353
16113	NC_018019	GAT	2	6	837407	837412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400353
16114	NC_018019	TTTA	2	8	837473	837480	25 %	75 %	0 %	0 %	392400353
16115	NC_018019	CAA	2	6	837523	837528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400353
16116	NC_018019	AAG	2	6	837569	837574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400353
16117	NC_018019	TGGG	2	8	837715	837722	0 %	25 %	75 %	0 %	392400353
16118	NC_018019	GAA	2	6	837752	837757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400353
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16235	NC_018019	GAT	2	6	843653	843658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400358
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16240	NC_018019	TGC	2	6	843979	843984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400358
16241	NC_018019	CTA	2	6	844000	844005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400358
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16287	NC_018019	TCG	2	6	845849	845854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400361
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16304	NC_018019	TGGTT	2	10	846848	846857	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
16305	NC_018019	TGGA	2	8	846893	846900	25 %	25 %	50 %	0 %	392400363
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16329	NC_018019	ATC	2	6	847928	847933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400363
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16337	NC_018019	GTC	2	6	848323	848328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400363
16338	NC_018019	AT	4	8	848381	848388	50 %	50 %	0 %	0 %	392400363
16339	NC_018019	ATG	2	6	848390	848395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400363
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16341	NC_018019	TAC	2	6	848673	848678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400364
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16345	NC_018019	TGG	2	6	848917	848922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400364
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16353	NC_018019	AGA	2	6	849252	849257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400364
16354	NC_018019	CCAG	2	8	849424	849431	25 %	0 %	25 %	50 %	392400364
16355	NC_018019	AC	3	6	849435	849440	50 %	0 %	0 %	50 %	392400364
16356	NC_018019	TGC	2	6	849461	849466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400364
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16479	NC_018019	AGA	2	6	855576	855581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400367
16480	NC_018019	GAT	2	6	855582	855587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400367
16481	NC_018019	GCT	2	6	855631	855636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400367
16482	NC_018019	GCCGA	2	10	855674	855683	20 %	0 %	40 %	40 %	392400367
16483	NC_018019	GCG	2	6	855732	855737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400367
16484	NC_018019	GGT	2	6	855831	855836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400367
16485	NC_018019	TC	3	6	855876	855881	0 %	50 %	0 %	50 %	392400367
16486	NC_018019	CGA	2	6	855942	855947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400367
16487	NC_018019	GAT	2	6	855967	855972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400367
16488	NC_018019	ACA	2	6	855991	855996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400367
16489	NC_018019	ACA	2	6	855999	856004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400367
16490	NC_018019	TGT	2	6	856086	856091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400367
16491	NC_018019	GGC	2	6	856142	856147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16492	NC_018019	TGTA	2	8	856151	856158	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16493	NC_018019	GCC	2	6	856164	856169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16494	NC_018019	TA	3	6	856176	856181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16495	NC_018019	TGCT	2	8	856188	856195	0 %	50 %	25 %	25 %	392400368
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16497	NC_018019	AG	3	6	856233	856238	50 %	0 %	50 %	0 %	392400368
16498	NC_018019	GT	3	6	856325	856330	0 %	50 %	50 %	0 %	392400368
16499	NC_018019	TCT	2	6	856342	856347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400368
16500	NC_018019	TCGA	2	8	856357	856364	25 %	25 %	25 %	25 %	392400368

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