MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 chromosome

Total Repeats: 43379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_018019	GAAA	2	8	673244	673251	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_018019	CTG	2	6	673299	673304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400197
13003	NC_018019	CGC	2	6	673319	673324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400197
13004	NC_018019	GCG	2	6	673327	673332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400197
13005	NC_018019	GTA	2	6	673333	673338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400197
13006	NC_018019	CTC	2	6	673356	673361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400197
13007	NC_018019	AAG	2	6	673426	673431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400197
13008	NC_018019	GAT	2	6	673683	673688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400197
13009	NC_018019	AAG	2	6	673699	673704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400197
13010	NC_018019	AGG	2	6	673933	673938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392400197
13011	NC_018019	A	6	6	673980	673985	100 %	0 %	0 %	0 %	392400197
13012	NC_018019	AAG	2	6	674064	674069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400197
13013	NC_018019	AAT	2	6	674131	674136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392400197
13014	NC_018019	TTC	2	6	674310	674315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400198
13015	NC_018019	TAG	2	6	674322	674327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400198
13016	NC_018019	TAG	2	6	674422	674427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400198
13017	NC_018019	ATA	2	6	674451	674456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392400198
13018	NC_018019	AATA	2	8	674527	674534	75 %	25 %	0 %	0 %	392400198
13019	NC_018019	TAA	2	6	674596	674601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392400198
13020	NC_018019	ATT	2	6	674603	674608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392400198
13021	NC_018019	CTG	2	6	674714	674719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400198
13022	NC_018019	AGG	2	6	674724	674729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392400198
13023	NC_018019	GTT	2	6	674769	674774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400198
13024	NC_018019	A	6	6	674849	674854	100 %	0 %	0 %	0 %	392400198
13025	NC_018019	GTGC	2	8	674860	674867	0 %	25 %	50 %	25 %	392400199
13026	NC_018019	TA	3	6	674918	674923	50 %	50 %	0 %	0 %	392400199
13027	NC_018019	TAG	2	6	674939	674944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400199
13028	NC_018019	GTTG	2	8	674967	674974	0 %	50 %	50 %	0 %	392400199
13029	NC_018019	TTG	2	6	675062	675067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400199
13030	NC_018019	GCG	2	6	675172	675177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400199
13031	NC_018019	CTG	2	6	675211	675216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400199
13032	NC_018019	ATT	2	6	675217	675222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392400199
13033	NC_018019	AGT	2	6	675252	675257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400199
13034	NC_018019	GCC	2	6	675258	675263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400199
13035	NC_018019	GTG	2	6	675286	675291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400199
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13037	NC_018019	ATT	2	6	675566	675571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392400199
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13041	NC_018019	GCAG	2	8	675661	675668	25 %	0 %	50 %	25 %	392400199
13042	NC_018019	CGC	2	6	675673	675678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400199
13043	NC_018019	AT	3	6	675680	675685	50 %	50 %	0 %	0 %	392400199
13044	NC_018019	ACT	2	6	675721	675726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400199
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13052	NC_018019	ATC	2	6	676095	676100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400200
13053	NC_018019	CGA	2	6	676282	676287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400200
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13055	NC_018019	AGC	2	6	676402	676407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400200
13056	NC_018019	AAGTGG	2	12	676527	676538	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	392400200
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13058	NC_018019	GCG	2	6	676582	676587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400200
13059	NC_018019	TGG	2	6	676641	676646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400200
13060	NC_018019	TCA	2	6	676656	676661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400200
13061	NC_018019	GAAA	2	8	676733	676740	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_018019	CTT	2	6	676757	676762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400201
13063	NC_018019	CGG	2	6	676768	676773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400201
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13067	NC_018019	GCG	2	6	676986	676991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400201
13068	NC_018019	CAG	2	6	677105	677110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400201
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13071	NC_018019	GTA	2	6	677252	677257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400201
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13074	NC_018019	TCCT	2	8	677440	677447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13075	NC_018019	T	6	6	677548	677553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_018019	AAACT	2	10	677597	677606	60 %	20 %	0 %	20 %	392400202
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13086	NC_018019	GGTT	2	8	678129	678136	0 %	50 %	50 %	0 %	392400202
13087	NC_018019	TCA	2	6	678207	678212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400202
13088	NC_018019	GA	3	6	678346	678351	50 %	0 %	50 %	0 %	392400202
13089	NC_018019	GTT	2	6	678700	678705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_018019	GCT	2	6	678787	678792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400203
13091	NC_018019	ACG	2	6	678815	678820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400203
13092	NC_018019	TTC	2	6	678912	678917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400203
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13100	NC_018019	CTT	2	6	679279	679284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400204
13101	NC_018019	CTC	2	6	679300	679305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400205
13102	NC_018019	ACC	2	6	679328	679333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400205
13103	NC_018019	TCA	2	6	679344	679349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400205
13104	NC_018019	GTT	2	6	679366	679371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400205
13105	NC_018019	TGA	2	6	679428	679433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400205
13106	NC_018019	CGGA	2	8	679435	679442	25 %	0 %	50 %	25 %	392400205
13107	NC_018019	TCT	2	6	679467	679472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400206
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13109	NC_018019	ACG	2	6	679591	679596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400206
13110	NC_018019	GTGCGA	2	12	679633	679644	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	392400206
13111	NC_018019	TTTC	2	8	679702	679709	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13112	NC_018019	GCC	2	6	679715	679720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13113	NC_018019	ACA	2	6	679802	679807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13114	NC_018019	GT	4	8	679902	679909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_018019	TA	3	6	679923	679928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_018019	TTG	2	6	679948	679953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_018019	T	6	6	680045	680050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_018019	TAG	2	6	680060	680065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_018019	GTT	2	6	680152	680157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13121	NC_018019	ACC	2	6	680263	680268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400207
13122	NC_018019	TCG	2	6	680374	680379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400207
13123	NC_018019	CGT	2	6	680463	680468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400207
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13126	NC_018019	CGT	2	6	680537	680542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400208
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13132	NC_018019	GGT	2	6	680780	680785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13133	NC_018019	CAT	2	6	680803	680808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13221	NC_018019	TGA	3	9	685539	685547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13222	NC_018019	GCC	2	6	685620	685625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13223	NC_018019	AGC	2	6	685759	685764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400213
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13226	NC_018019	CTG	2	6	685871	685876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400213
13227	NC_018019	ATG	2	6	685879	685884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400213
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13232	NC_018019	TCT	2	6	686176	686181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13233	NC_018019	ATA	2	6	686236	686241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392400214
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13240	NC_018019	T	6	6	686521	686526	0 %	100 %	0 %	0 %	392400214
13241	NC_018019	TCT	2	6	686645	686650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400214
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13356	NC_018019	CGACC	2	10	693485	693494	20 %	0 %	20 %	60 %	392400222
13357	NC_018019	GA	3	6	693572	693577	50 %	0 %	50 %	0 %	392400222
13358	NC_018019	AACGAT	2	12	693578	693589	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	392400222
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