MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 chromosome

Total Repeats: 43379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_018019	ACA	2	6	569352	569357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11002	NC_018019	CGC	2	6	569394	569399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400110
11003	NC_018019	AGC	2	6	569400	569405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400110
11004	NC_018019	TCG	2	6	569416	569421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400110
11005	NC_018019	GGCT	2	8	569427	569434	0 %	25 %	50 %	25 %	392400110
11006	NC_018019	TGA	2	6	569491	569496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400110
11007	NC_018019	TGC	2	6	569506	569511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400110
11008	NC_018019	CTG	2	6	569565	569570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400110
11009	NC_018019	AAGAA	2	10	569590	569599	80 %	0 %	20 %	0 %	392400110
11010	NC_018019	CCG	2	6	569609	569614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400110
11011	NC_018019	CATCCT	2	12	569615	569626	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	392400110
11012	NC_018019	CAG	2	6	569662	569667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400110
11013	NC_018019	GTG	2	6	569672	569677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400110
11014	NC_018019	TCA	2	6	569701	569706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400110
11015	NC_018019	A	6	6	569751	569756	100 %	0 %	0 %	0 %	392400110
11016	NC_018019	CG	3	6	569765	569770	0 %	0 %	50 %	50 %	392400110
11017	NC_018019	GTG	2	6	569781	569786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400110
11018	NC_018019	ACT	2	6	569788	569793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400110
11019	NC_018019	TGC	2	6	569812	569817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400110
11020	NC_018019	GGA	2	6	569858	569863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392400110
11021	NC_018019	TGC	2	6	569965	569970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400110
11022	NC_018019	GC	3	6	569969	569974	0 %	0 %	50 %	50 %	392400110
11023	NC_018019	GC	3	6	569987	569992	0 %	0 %	50 %	50 %	392400110
11024	NC_018019	TGC	2	6	570022	570027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400110
11025	NC_018019	GTG	2	6	570096	570101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400110
11026	NC_018019	GC	3	6	570149	570154	0 %	0 %	50 %	50 %	392400110
11027	NC_018019	GTCTG	2	10	570217	570226	0 %	40 %	40 %	20 %	392400110
11028	NC_018019	GGTG	2	8	570227	570234	0 %	25 %	75 %	0 %	392400110
11029	NC_018019	CAAC	2	8	570250	570257	50 %	0 %	0 %	50 %	392400110
11030	NC_018019	TGC	2	6	570302	570307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400110
11031	NC_018019	GCT	2	6	570323	570328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400110
11032	NC_018019	GTC	2	6	570381	570386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400110
11033	NC_018019	GAC	2	6	570416	570421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400110
11034	NC_018019	TGGT	2	8	570459	570466	0 %	50 %	50 %	0 %	392400110
11035	NC_018019	GTCG	2	8	570497	570504	0 %	25 %	50 %	25 %	392400110
11036	NC_018019	GCG	2	6	570564	570569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400110
11037	NC_018019	CTGT	2	8	570669	570676	0 %	50 %	25 %	25 %	392400110
11038	NC_018019	CGG	2	6	570725	570730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400110
11039	NC_018019	AACA	2	8	570731	570738	75 %	0 %	0 %	25 %	392400110
11040	NC_018019	TGG	2	6	570892	570897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400110
11041	NC_018019	TGT	2	6	571022	571027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400110
11042	NC_018019	GC	3	6	571036	571041	0 %	0 %	50 %	50 %	392400110
11043	NC_018019	CA	3	6	571080	571085	50 %	0 %	0 %	50 %	392400110
11044	NC_018019	CAA	2	6	571319	571324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400110
11045	NC_018019	CG	4	8	571432	571439	0 %	0 %	50 %	50 %	392400110
11046	NC_018019	GTG	2	6	571509	571514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400110
11047	NC_018019	GC	3	6	571590	571595	0 %	0 %	50 %	50 %	392400110
11048	NC_018019	GGA	2	6	571637	571642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392400110
11049	NC_018019	GGT	2	6	571655	571660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400110
11050	NC_018019	CAG	2	6	571689	571694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400110
11051	NC_018019	GGTC	2	8	571709	571716	0 %	25 %	50 %	25 %	392400110
11052	NC_018019	CG	3	6	571755	571760	0 %	0 %	50 %	50 %	392400110
11053	NC_018019	CGT	2	6	571772	571777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400110
11054	NC_018019	CGG	2	6	571778	571783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392400110
11055	NC_018019	CCG	2	6	571837	571842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400110
11056	NC_018019	GCT	2	6	571877	571882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400110
11057	NC_018019	C	6	6	572045	572050	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11058	NC_018019	GAC	2	6	572056	572061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11059	NC_018019	GTTT	2	8	572163	572170	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_018019	TTAGG	2	10	572258	572267	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_018019	ACCTA	2	10	572271	572280	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
11062	NC_018019	TCCC	2	8	572301	572308	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11063	NC_018019	AAAG	2	8	572311	572318	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_018019	TCT	2	6	572320	572325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_018019	TGC	2	6	572379	572384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400111
11066	NC_018019	CGA	2	6	572412	572417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400111
11067	NC_018019	TAT	2	6	572616	572621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392400111
11068	NC_018019	TGG	2	6	572862	572867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400111
11069	NC_018019	G	6	6	572946	572951	0 %	0 %	100 %	0 %	392400111
11070	NC_018019	GAA	2	6	572985	572990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_018019	GCG	2	6	572991	572996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11072	NC_018019	TCT	2	6	573072	573077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11073	NC_018019	CTA	2	6	573106	573111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11074	NC_018019	GAG	2	6	573161	573166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_018019	GAAG	2	8	573180	573187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_018019	CCA	2	6	573516	573521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400112
11077	NC_018019	CGT	2	6	573661	573666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400112
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11079	NC_018019	TAC	2	6	573800	573805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400112
11080	NC_018019	GTG	2	6	573831	573836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400112
11081	NC_018019	CTT	2	6	573856	573861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400112
11082	NC_018019	AAG	2	6	573875	573880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400112
11083	NC_018019	CTT	2	6	573953	573958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400112
11084	NC_018019	ACC	2	6	573963	573968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400112
11085	NC_018019	CGG	2	6	573982	573987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11086	NC_018019	T	6	6	573993	573998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_018019	TGGA	2	8	574030	574037	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11088	NC_018019	GCA	2	6	574043	574048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11089	NC_018019	TCC	2	6	574054	574059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11090	NC_018019	GCA	2	6	574091	574096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11091	NC_018019	GTGC	2	8	574129	574136	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11092	NC_018019	TTTC	2	8	574164	574171	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11093	NC_018019	CAAT	2	8	574427	574434	50 %	25 %	0 %	25 %	392400113
11094	NC_018019	GT	3	6	574526	574531	0 %	50 %	50 %	0 %	392400113
11095	NC_018019	AGCC	2	8	574551	574558	25 %	0 %	25 %	50 %	392400113
11096	NC_018019	ACC	2	6	574559	574564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400113
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11098	NC_018019	GA	3	6	574655	574660	50 %	0 %	50 %	0 %	392400113
11099	NC_018019	AGA	2	6	574693	574698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400113
11100	NC_018019	ACC	2	6	574813	574818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400113
11101	NC_018019	ACC	2	6	574827	574832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400113
11102	NC_018019	ACAA	2	8	574834	574841	75 %	0 %	0 %	25 %	392400113
11103	NC_018019	TGA	2	6	574844	574849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400113
11104	NC_018019	GAG	2	6	574876	574881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_018019	GTG	3	9	574897	574905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_018019	AAC	2	6	574975	574980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392400114
11107	NC_018019	CAG	2	6	575013	575018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400114
11108	NC_018019	TAG	2	6	575022	575027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400114
11109	NC_018019	GTA	2	6	575031	575036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400114
11110	NC_018019	TCG	2	6	575068	575073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400114
11111	NC_018019	CAAAG	2	10	575085	575094	60 %	0 %	20 %	20 %	392400114
11112	NC_018019	CG	3	6	575103	575108	0 %	0 %	50 %	50 %	392400114
11113	NC_018019	AAG	2	6	575172	575177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400114
11114	NC_018019	CAG	2	6	575196	575201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392400114
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11118	NC_018019	AGA	2	6	575358	575363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400114
11119	NC_018019	GGT	2	6	575413	575418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400114
11120	NC_018019	GTA	2	6	575435	575440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392400114
11121	NC_018019	GGAC	2	8	575464	575471	25 %	0 %	50 %	25 %	392400114
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11123	NC_018019	TGC	2	6	575518	575523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400114
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11220	NC_018019	CTAG	2	8	580533	580540	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11221	NC_018019	A	6	6	580581	580586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11222	NC_018019	A	6	6	580592	580597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11223	NC_018019	AAAT	2	8	580609	580616	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11224	NC_018019	ATCG	2	8	580670	580677	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11225	NC_018019	TATT	2	8	580682	580689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11226	NC_018019	ACT	2	6	580882	580887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400117
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11228	NC_018019	TCTG	2	8	580988	580995	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11229	NC_018019	GTA	2	6	580997	581002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11231	NC_018019	GGTC	2	8	581265	581272	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11232	NC_018019	TTC	2	6	581294	581299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400118
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11236	NC_018019	CGT	2	6	581431	581436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400118
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11238	NC_018019	CTTT	2	8	581470	581477	0 %	75 %	0 %	25 %	392400118
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11240	NC_018019	TGG	2	6	581575	581580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392400118
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11246	NC_018019	GTT	2	6	581919	581924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400118
11247	NC_018019	CTG	2	6	581971	581976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400118
11248	NC_018019	CAT	2	6	582038	582043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392400118
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11251	NC_018019	GTT	2	6	582177	582182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392400118
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11255	NC_018019	TTA	2	6	582418	582423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392400118
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11267	NC_018019	ACGCG	2	10	583063	583072	20 %	0 %	40 %	40 %	392400119
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11330	NC_018019	CGCT	2	8	586545	586552	0 %	25 %	25 %	50 %	392400122
11331	NC_018019	GAA	2	6	586577	586582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392400122
11332	NC_018019	GGCC	2	8	586597	586604	0 %	0 %	50 %	50 %	392400122
11333	NC_018019	TCC	2	6	586608	586613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392400122
11334	NC_018019	TGAG	2	8	586788	586795	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11335	NC_018019	CGT	2	6	586858	586863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400123
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11346	NC_018019	A	6	6	587454	587459	100 %	0 %	0 %	0 %	392400123
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11353	NC_018019	CCA	2	6	587942	587947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392400123
11354	NC_018019	A	6	6	587980	587985	100 %	0 %	0 %	0 %	392400123
11355	NC_018019	TGC	2	6	588135	588140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392400124
11356	NC_018019	GCC	2	6	588174	588179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400124
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11358	NC_018019	CTT	2	6	588224	588229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392400124
11359	NC_018019	AGG	2	6	588410	588415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392400124
11360	NC_018019	GA	3	6	588452	588457	50 %	0 %	50 %	0 %	392400124
11361	NC_018019	CCG	2	6	588478	588483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400124
11362	NC_018019	GCC	2	6	588514	588519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392400124
11363	NC_018019	CAAG	2	8	588578	588585	50 %	0 %	25 %	25 %	392400124
11364	NC_018019	T	6	6	588625	588630	0 %	100 %	0 %	0 %	392400124
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