MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 chromosome

Total Repeats: 43379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_018019	CTG	2	6	284178	284183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399839
5502	NC_018019	GGC	2	6	284192	284197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399839
5503	NC_018019	CTC	2	6	284227	284232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392399839
5504	NC_018019	ATC	2	6	284256	284261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399839
5505	NC_018019	GTAG	2	8	284291	284298	25 %	25 %	50 %	0 %	392399839
5506	NC_018019	ATCA	2	8	284343	284350	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5507	NC_018019	GCTT	2	8	284386	284393	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5508	NC_018019	TGT	2	6	284408	284413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_018019	ATT	2	6	284416	284421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_018019	CGT	2	6	284485	284490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399840
5511	NC_018019	GCCG	2	8	284512	284519	0 %	0 %	50 %	50 %	392399840
5512	NC_018019	CTT	2	6	284587	284592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399840
5513	NC_018019	GCG	2	6	284616	284621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399840
5514	NC_018019	GCC	2	6	284674	284679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399840
5515	NC_018019	GGC	2	6	284890	284895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399840
5516	NC_018019	ATG	2	6	284926	284931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399840
5517	NC_018019	GCT	2	6	285229	285234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399840
5518	NC_018019	CG	3	6	285249	285254	0 %	0 %	50 %	50 %	392399840
5519	NC_018019	TGC	2	6	285269	285274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399840
5520	NC_018019	GAC	2	6	285310	285315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399840
5521	NC_018019	CGC	2	6	285366	285371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399840
5522	NC_018019	AT	3	6	285389	285394	50 %	50 %	0 %	0 %	392399840
5523	NC_018019	TCAT	2	8	285458	285465	25 %	50 %	0 %	25 %	392399840
5524	NC_018019	CTCG	2	8	285480	285487	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5525	NC_018019	AAGG	2	8	285526	285533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_018019	CAT	2	6	285553	285558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399841
5527	NC_018019	GCT	2	6	285584	285589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399841
5528	NC_018019	GGC	2	6	285653	285658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399841
5529	NC_018019	GAG	2	6	285764	285769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399841
5530	NC_018019	CTT	2	6	285795	285800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399841
5531	NC_018019	TGA	2	6	285991	285996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399841
5532	NC_018019	TGT	2	6	285997	286002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392399841
5533	NC_018019	GGC	2	6	286028	286033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399841
5534	NC_018019	TTC	2	6	286039	286044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399841
5535	NC_018019	GAT	2	6	286052	286057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399841
5536	NC_018019	GC	3	6	286066	286071	0 %	0 %	50 %	50 %	392399841
5537	NC_018019	AGA	2	6	286111	286116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399841
5538	NC_018019	A	6	6	286181	286186	100 %	0 %	0 %	0 %	392399841
5539	NC_018019	GGC	2	6	286223	286228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399841
5540	NC_018019	TTA	2	6	286290	286295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392399841
5541	NC_018019	CGG	2	6	286383	286388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399841
5542	NC_018019	CTG	2	6	286391	286396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399841
5543	NC_018019	TTG	2	6	286515	286520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392399841
5544	NC_018019	AAG	2	6	286568	286573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399841
5545	NC_018019	CG	4	8	286645	286652	0 %	0 %	50 %	50 %	392399841
5546	NC_018019	AGACGA	2	12	286654	286665	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	392399841
5547	NC_018019	CGA	2	6	286684	286689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399841
5548	NC_018019	GACG	2	8	286712	286719	25 %	0 %	50 %	25 %	392399841
5549	NC_018019	TGC	2	6	286720	286725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399841
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5553	NC_018019	CTG	2	6	286988	286993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399842
5554	NC_018019	TTC	2	6	286997	287002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399842
5555	NC_018019	GAG	2	6	287019	287024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399842
5556	NC_018019	CTG	2	6	287086	287091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399842
5557	NC_018019	ACA	2	6	287124	287129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392399842
5558	NC_018019	AGGCC	2	10	287155	287164	20 %	0 %	40 %	40 %	392399842
5559	NC_018019	TCC	2	6	287190	287195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392399842
5560	NC_018019	GAG	2	6	287219	287224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399842
5561	NC_018019	CCT	2	6	287230	287235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392399842
5562	NC_018019	GCG	2	6	287301	287306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399842
5563	NC_018019	CGA	2	6	287344	287349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399842
5564	NC_018019	GCA	2	6	287352	287357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399842
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5569	NC_018019	GAA	2	6	287628	287633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399842
5570	NC_018019	CTG	2	6	287647	287652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399842
5571	NC_018019	TGCTT	2	10	287666	287675	0 %	60 %	20 %	20 %	392399842
5572	NC_018019	GT	3	6	287805	287810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_018019	GGT	2	6	287941	287946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399843
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5575	NC_018019	GGA	2	6	288207	288212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392399843
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5580	NC_018019	CCG	2	6	288404	288409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399843
5581	NC_018019	GTG	2	6	288421	288426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399843
5582	NC_018019	ATG	2	6	288470	288475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399843
5583	NC_018019	CAT	2	6	288489	288494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399843
5584	NC_018019	TGA	2	6	288605	288610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399843
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5586	NC_018019	GGTT	2	8	288634	288641	0 %	50 %	50 %	0 %	392399843
5587	NC_018019	ACC	2	6	288670	288675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392399843
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5589	NC_018019	TGG	2	6	288717	288722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399843
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5591	NC_018019	GTGC	2	8	288856	288863	0 %	25 %	50 %	25 %	392399843
5592	NC_018019	AGC	2	6	288892	288897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399843
5593	NC_018019	GC	3	6	288896	288901	0 %	0 %	50 %	50 %	392399843
5594	NC_018019	ATCC	2	8	288951	288958	25 %	25 %	0 %	50 %	392399843
5595	NC_018019	TTC	2	6	289027	289032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399843
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5597	NC_018019	GCG	2	6	289096	289101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399843
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5600	NC_018019	ACC	2	6	289273	289278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392399844
5601	NC_018019	GCT	2	6	289302	289307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399844
5602	NC_018019	AGCT	2	8	289313	289320	25 %	25 %	25 %	25 %	392399844
5603	NC_018019	ACG	2	6	289333	289338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399844
5604	NC_018019	GC	4	8	289367	289374	0 %	0 %	50 %	50 %	392399844
5605	NC_018019	CAG	2	6	289381	289386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399844
5606	NC_018019	CGA	2	6	289424	289429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399844
5607	NC_018019	TCT	2	6	289433	289438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392399844
5608	NC_018019	CTG	2	6	289530	289535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399844
5609	NC_018019	G	6	6	289543	289548	0 %	0 %	100 %	0 %	392399844
5610	NC_018019	ATG	2	6	289575	289580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399844
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5614	NC_018019	TG	3	6	289652	289657	0 %	50 %	50 %	0 %	392399844
5615	NC_018019	CGG	2	6	289699	289704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392399844
5616	NC_018019	CGA	2	6	289821	289826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392399845
5617	NC_018019	GTGC	2	8	289851	289858	0 %	25 %	50 %	25 %	392399845
5618	NC_018019	TGA	2	6	290020	290025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392399845
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5620	NC_018019	GTG	2	6	290065	290070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392399845
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5622	NC_018019	CGTG	2	8	290158	290165	0 %	25 %	50 %	25 %	392399845
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5990	NC_018019	GCT	2	6	309886	309891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399864
5991	NC_018019	CAA	2	6	309951	309956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392399864
5992	NC_018019	GAA	2	6	310022	310027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392399864
5993	NC_018019	T	6	6	310029	310034	0 %	100 %	0 %	0 %	392399864
5994	NC_018019	CG	3	6	310054	310059	0 %	0 %	50 %	50 %	392399864
5995	NC_018019	TCG	2	6	310147	310152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399864
5996	NC_018019	TCA	2	6	310183	310188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392399864
5997	NC_018019	CGC	2	6	310235	310240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392399864
5998	NC_018019	CGT	2	6	310325	310330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399864
5999	NC_018019	CTCG	2	8	310368	310375	0 %	25 %	25 %	50 %	392399864
6000	NC_018019	TGC	2	6	310447	310452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392399864

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