MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/SW3

Total Repeats: 22989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017952	AGG	2	6	18	23	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389858572
2	NC_017952	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	389858572
3	NC_017952	TAA	3	9	93	101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389858572
4	NC_017952	GTA	2	6	137	142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858572
5	NC_017952	AGT	2	6	168	173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858572
6	NC_017952	GA	3	6	212	217	50 %	0 %	50 %	0 %	389858572
7	NC_017952	AAG	2	6	324	329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858572
8	NC_017952	CAA	2	6	338	343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389858572
9	NC_017952	AGT	2	6	364	369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858572
10	NC_017952	GTG	2	6	380	385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389858572
11	NC_017952	CAG	2	6	416	421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389858572
12	NC_017952	AGTG	2	8	547	554	25 %	25 %	50 %	0 %	389858572
13	NC_017952	TGGC	2	8	581	588	0 %	25 %	50 %	25 %	389858572
14	NC_017952	GCC	2	6	604	609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389858572
15	NC_017952	TGC	2	6	663	668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389858572
16	NC_017952	ATT	2	6	675	680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389858572
17	NC_017952	CGA	2	6	697	702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389858572
18	NC_017952	TC	3	6	825	830	0 %	50 %	0 %	50 %	389858572
19	NC_017952	TAT	2	6	839	844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389858572
20	NC_017952	AG	3	6	847	852	50 %	0 %	50 %	0 %	389858572
21	NC_017952	GAA	2	6	886	891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858572
22	NC_017952	AGA	2	6	915	920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858572
23	NC_017952	AGA	2	6	969	974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858572
24	NC_017952	CAA	2	6	1042	1047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389858572
25	NC_017952	AATG	2	8	1066	1073	50 %	25 %	25 %	0 %	389858572
26	NC_017952	TTG	2	6	1185	1190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389858572
27	NC_017952	CTC	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389858572
28	NC_017952	GAT	2	6	1276	1281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858572
29	NC_017952	GAT	2	6	1330	1335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858572
30	NC_017952	GAAGGA	2	12	1360	1371	50 %	0 %	50 %	0 %	389858572
31	NC_017952	ATG	2	6	1393	1398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858572
32	NC_017952	CTAT	2	8	1400	1407	25 %	50 %	0 %	25 %	389858572
33	NC_017952	TATGGA	2	12	1413	1424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858572
34	NC_017952	CCT	2	6	1552	1557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389858572
35	NC_017952	CTT	2	6	1613	1618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389858572
36	NC_017952	CAG	2	6	1678	1683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389858572
37	NC_017952	TGA	2	6	1739	1744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858572
38	NC_017952	A	6	6	1803	1808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017952	AAG	2	6	1820	1825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017952	TGG	2	6	1836	1841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017952	CTT	2	6	1843	1848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017952	T	7	7	1847	1853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017952	A	6	6	1858	1863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017952	AAGG	2	8	1909	1916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017952	ATG	2	6	1936	1941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858573
46	NC_017952	GTG	2	6	1942	1947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389858573
47	NC_017952	TCC	2	6	1951	1956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389858573
48	NC_017952	AGC	2	6	1965	1970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389858573
49	NC_017952	T	6	6	1984	1989	0 %	100 %	0 %	0 %	389858573
50	NC_017952	AGC	2	6	1992	1997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389858573
51	NC_017952	AAG	2	6	2003	2008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858573
52	NC_017952	TAC	2	6	2041	2046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389858573
53	NC_017952	GCT	2	6	2051	2056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389858573
54	NC_017952	AGTA	2	8	2089	2096	50 %	25 %	25 %	0 %	389858573
55	NC_017952	AAC	2	6	2149	2154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389858573
56	NC_017952	AGA	2	6	2161	2166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858573
57	NC_017952	T	6	6	2239	2244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017952	TAA	2	6	2251	2256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017952	T	7	7	2261	2267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017952	TC	3	6	2270	2275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017952	A	6	6	2333	2338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017952	AGA	2	6	2417	2422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858574
63	NC_017952	ATC	2	6	2424	2429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389858574
64	NC_017952	TGC	2	6	2444	2449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389858574
65	NC_017952	ATGA	2	8	2493	2500	50 %	25 %	25 %	0 %	389858574
66	NC_017952	GATA	2	8	2531	2538	50 %	25 %	25 %	0 %	389858574
67	NC_017952	CAT	2	6	2568	2573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389858574
68	NC_017952	AGA	2	6	2597	2602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858574
69	NC_017952	AAG	2	6	2626	2631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858574
70	NC_017952	GGA	2	6	2661	2666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389858574
71	NC_017952	AG	3	6	2753	2758	50 %	0 %	50 %	0 %	389858575
72	NC_017952	ATC	2	6	2790	2795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389858575
73	NC_017952	TTTC	2	8	2828	2835	0 %	75 %	0 %	25 %	389858575
74	NC_017952	ATA	2	6	2940	2945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389858575
75	NC_017952	AAC	2	6	2965	2970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389858575
76	NC_017952	GGT	2	6	3019	3024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389858575
77	NC_017952	AAT	2	6	3125	3130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389858575
78	NC_017952	TTC	2	6	3160	3165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389858575
79	NC_017952	GCA	2	6	3179	3184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389858575
80	NC_017952	GGA	2	6	3227	3232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389858575
81	NC_017952	CAG	2	6	3246	3251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389858575
82	NC_017952	GTT	2	6	3263	3268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389858575
83	NC_017952	GGT	2	6	3355	3360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389858575
84	NC_017952	GA	3	6	3421	3426	50 %	0 %	50 %	0 %	389858575
85	NC_017952	T	6	6	3428	3433	0 %	100 %	0 %	0 %	389858575
86	NC_017952	AAG	2	6	3513	3518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858575
87	NC_017952	ATT	2	6	3575	3580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389858575
88	NC_017952	TTG	2	6	3627	3632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389858575
89	NC_017952	CATG	2	8	3709	3716	25 %	25 %	25 %	25 %	389858575
90	NC_017952	AAG	2	6	3738	3743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858575
91	NC_017952	AAG	2	6	3753	3758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858575
92	NC_017952	CAG	2	6	3795	3800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389858575
93	NC_017952	GCT	2	6	3866	3871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389858575
94	NC_017952	TGTGA	2	10	3881	3890	20 %	40 %	40 %	0 %	389858575
95	NC_017952	TTCC	2	8	4014	4021	0 %	50 %	0 %	50 %	389858575
96	NC_017952	AAG	2	6	4032	4037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858575
97	NC_017952	CAG	2	6	4082	4087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389858575
98	NC_017952	GGA	2	6	4169	4174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389858575
99	NC_017952	AAT	2	6	4179	4184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389858575
100	NC_017952	TTGAA	2	10	4237	4246	40 %	40 %	20 %	0 %	389858576
101	NC_017952	ATT	2	6	4259	4264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389858576
102	NC_017952	TGA	2	6	4289	4294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858576
103	NC_017952	TTTA	2	8	4412	4419	25 %	75 %	0 %	0 %	389858576
104	NC_017952	GTA	2	6	4521	4526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858576
105	NC_017952	GAGAA	2	10	4531	4540	60 %	0 %	40 %	0 %	389858576
106	NC_017952	AGA	2	6	4568	4573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858576
107	NC_017952	ATCC	2	8	4712	4719	25 %	25 %	0 %	50 %	389858576
108	NC_017952	GAA	2	6	4752	4757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858576
109	NC_017952	CGT	2	6	4884	4889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389858576
110	NC_017952	A	7	7	4928	4934	100 %	0 %	0 %	0 %	389858576
111	NC_017952	GTT	2	6	4935	4940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389858576
112	NC_017952	GAAAA	2	10	4968	4977	80 %	0 %	20 %	0 %	389858576
113	NC_017952	A	7	7	4974	4980	100 %	0 %	0 %	0 %	389858576
114	NC_017952	TGA	2	6	5072	5077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858576
115	NC_017952	AT	3	6	5114	5119	50 %	50 %	0 %	0 %	389858576
116	NC_017952	TTACA	2	10	5123	5132	40 %	40 %	0 %	20 %	389858576
117	NC_017952	TTG	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389858576
118	NC_017952	TTC	2	6	5308	5313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389858576
119	NC_017952	TCT	2	6	5400	5405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389858576
120	NC_017952	AGA	2	6	5420	5425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389858576
121	NC_017952	GTT	2	6	5447	5452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389858576
122	NC_017952	GACG	2	8	5459	5466	25 %	0 %	50 %	25 %	389858576
123	NC_017952	GGT	2	6	5495	5500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389858576
124	NC_017952	AAAGCT	2	12	5541	5552	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	389858576
125	NC_017952	TTGG	2	8	5562	5569	0 %	50 %	50 %	0 %	389858576
126	NC_017952	CTC	2	6	5599	5604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389858576
127	NC_017952	AGC	2	6	5630	5635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389858576
128	NC_017952	GCA	2	6	5655	5660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017952	A	6	6	5666	5671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017952	AGA	2	6	5682	5687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017952	ATT	2	6	5749	5754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389858577
132	NC_017952	TCT	2	6	5767	5772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389858577
133	NC_017952	GCT	2	6	5813	5818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389858577
134	NC_017952	GTCTT	2	10	5819	5828	0 %	60 %	20 %	20 %	389858577
135	NC_017952	GAT	2	6	5848	5853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389858577
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137	NC_017952	GA	3	6	5875	5880	50 %	0 %	50 %	0 %	389858577
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