MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 31 chromosome

Total Repeats: 43319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_017730	GCC	2	6	2281198	2281203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386741402
43002	NC_017730	TGGC	2	8	2281210	2281217	0 %	25 %	50 %	25 %	386741402
43003	NC_017730	CAA	2	6	2281299	2281304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386741402
43004	NC_017730	GCA	2	6	2281420	2281425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386741402
43005	NC_017730	AAAG	2	8	2281450	2281457	75 %	0 %	25 %	0 %	386741402
43006	NC_017730	C	6	6	2281473	2281478	0 %	0 %	0 %	100 %	386741402
43007	NC_017730	CAC	2	6	2281620	2281625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386741402
43008	NC_017730	ATA	2	6	2281667	2281672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386741402
43009	NC_017730	GGCA	2	8	2281679	2281686	25 %	0 %	50 %	25 %	386741402
43010	NC_017730	CTG	2	6	2281715	2281720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386741402
43011	NC_017730	GCT	2	6	2281867	2281872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386741402
43012	NC_017730	ATG	2	6	2281915	2281920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386741402
43013	NC_017730	GCA	2	6	2282025	2282030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386741402
43014	NC_017730	AGG	3	9	2282033	2282041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386741402
43015	NC_017730	GCA	2	6	2282059	2282064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386741402
43016	NC_017730	ATC	2	6	2282094	2282099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386741402
43017	NC_017730	CAG	2	6	2282100	2282105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386741402
43018	NC_017730	CAG	2	6	2282112	2282117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386741402
43019	NC_017730	ACG	2	6	2282150	2282155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386741402
43020	NC_017730	GAC	2	6	2282321	2282326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386741402
43021	NC_017730	TCCT	2	8	2282457	2282464	0 %	50 %	0 %	50 %	386741402
43022	NC_017730	CGC	2	6	2282465	2282470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386741402
43023	NC_017730	CGC	2	6	2282478	2282483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386741402
43024	NC_017730	ACTTCC	2	12	2282493	2282504	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386741402
43025	NC_017730	CGA	3	9	2282619	2282627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386741402
43026	NC_017730	GACCA	2	10	2282629	2282638	40 %	0 %	20 %	40 %	386741402
43027	NC_017730	TGGC	2	8	2282650	2282657	0 %	25 %	50 %	25 %	386741402
43028	NC_017730	GCG	2	6	2282671	2282676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386741402
43029	NC_017730	TGT	2	6	2282771	2282776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386741402
43030	NC_017730	CAA	2	6	2282828	2282833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386741402
43031	NC_017730	AAC	2	6	2282867	2282872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386741402
43032	NC_017730	GAT	2	6	2282947	2282952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386741402
43033	NC_017730	ACA	2	6	2283020	2283025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43034	NC_017730	CA	3	6	2283064	2283069	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43035	NC_017730	GGC	2	6	2283103	2283108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386741403
43036	NC_017730	AGAAA	2	10	2283115	2283124	80 %	0 %	20 %	0 %	386741403
43037	NC_017730	CGGCAC	2	12	2283198	2283209	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386741403
43038	NC_017730	AAC	2	6	2283323	2283328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386741403
43039	NC_017730	AGT	2	6	2283424	2283429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386741403
43040	NC_017730	GCA	2	6	2283461	2283466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386741403
43041	NC_017730	CGA	2	6	2283477	2283482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386741403
43042	NC_017730	CGT	2	6	2283538	2283543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386741403
43043	NC_017730	CCA	2	6	2283618	2283623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386741403
43044	NC_017730	CG	3	6	2283737	2283742	0 %	0 %	50 %	50 %	386741403
43045	NC_017730	AGA	2	6	2283748	2283753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386741403
43046	NC_017730	GGC	2	6	2283796	2283801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386741403
43047	NC_017730	TAC	2	6	2283804	2283809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386741403
43048	NC_017730	AGT	2	6	2283814	2283819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386741403
43049	NC_017730	ATC	2	6	2283833	2283838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386741403
43050	NC_017730	CTA	2	6	2283900	2283905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386741403
43051	NC_017730	TCT	2	6	2283936	2283941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386741403
43052	NC_017730	TGT	2	6	2284047	2284052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386741403
43053	NC_017730	TGC	2	6	2284056	2284061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386741403
43054	NC_017730	CA	3	6	2284107	2284112	50 %	0 %	0 %	50 %	386741403
43055	NC_017730	GTT	2	6	2284148	2284153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386741403
43056	NC_017730	CCG	2	6	2284172	2284177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386741403
43057	NC_017730	TC	3	6	2284196	2284201	0 %	50 %	0 %	50 %	386741403
43058	NC_017730	TC	3	6	2284278	2284283	0 %	50 %	0 %	50 %	386741403
43059	NC_017730	TAC	2	6	2284300	2284305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386741403
43060	NC_017730	CTT	2	6	2284314	2284319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386741403
43061	NC_017730	TGA	2	6	2284324	2284329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386741403
43062	NC_017730	GTT	2	6	2284360	2284365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386741403
43063	NC_017730	TACT	2	8	2284401	2284408	25 %	50 %	0 %	25 %	386741403
43064	NC_017730	CAT	2	6	2284411	2284416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386741403
43065	NC_017730	CGC	2	6	2284435	2284440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386741403
43066	NC_017730	TGA	2	6	2284447	2284452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386741403
43067	NC_017730	TCG	2	6	2284476	2284481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386741403
43068	NC_017730	T	6	6	2284523	2284528	0 %	100 %	0 %	0 %	386741403
43069	NC_017730	TTG	2	6	2284634	2284639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386741403
43070	NC_017730	CTG	2	6	2284655	2284660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386741403
43071	NC_017730	T	6	6	2284671	2284676	0 %	100 %	0 %	0 %	386741403
43072	NC_017730	TCA	2	6	2284707	2284712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386741403
43073	NC_017730	TC	3	6	2284741	2284746	0 %	50 %	0 %	50 %	386741403
43074	NC_017730	GCT	2	6	2284763	2284768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386741403
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43076	NC_017730	TTG	2	6	2284821	2284826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386741403
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43080	NC_017730	TTCT	2	8	2285067	2285074	0 %	75 %	0 %	25 %	386741403
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43083	NC_017730	CAT	2	6	2285140	2285145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386741403
43084	NC_017730	CGA	2	6	2285218	2285223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386741403
43085	NC_017730	CTG	2	6	2285259	2285264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386741403
43086	NC_017730	CCGCTT	2	12	2285314	2285325	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386741403
43087	NC_017730	GCT	3	9	2285456	2285464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386741403
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43089	NC_017730	GCTA	2	8	2285500	2285507	25 %	25 %	25 %	25 %	386741403
43090	NC_017730	ATC	2	6	2285514	2285519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386741403
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43092	NC_017730	TCAG	2	8	2285661	2285668	25 %	25 %	25 %	25 %	386741403
43093	NC_017730	CACG	2	8	2285717	2285724	25 %	0 %	25 %	50 %	386741403
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43100	NC_017730	TTG	2	6	2286186	2286191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386741403
43101	NC_017730	AGCT	2	8	2286264	2286271	25 %	25 %	25 %	25 %	386741403
43102	NC_017730	TGT	2	6	2286373	2286378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386741403
43103	NC_017730	AG	3	6	2286382	2286387	50 %	0 %	50 %	0 %	386741403
43104	NC_017730	GTCT	2	8	2286409	2286416	0 %	50 %	25 %	25 %	386741403
43105	NC_017730	AGA	2	6	2286424	2286429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386741403
43106	NC_017730	TCTT	2	8	2286436	2286443	0 %	75 %	0 %	25 %	386741403
43107	NC_017730	AGA	2	6	2286466	2286471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386741403
43108	NC_017730	TTC	2	6	2286481	2286486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386741403
43109	NC_017730	GGT	2	6	2286592	2286597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386741403
43110	NC_017730	CTT	2	6	2286603	2286608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386741403
43111	NC_017730	TAC	2	6	2286614	2286619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43112	NC_017730	TGG	2	6	2286629	2286634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43113	NC_017730	CCA	2	6	2286655	2286660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43114	NC_017730	TTTTCT	2	12	2286664	2286675	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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43116	NC_017730	TTC	2	6	2286829	2286834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.