MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 31 chromosome

Total Repeats: 43319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42002	NC_017730	GTGGCT	2	12	2227495	2227506	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386741352
42003	NC_017730	GCA	2	6	2227573	2227578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386741352
42004	NC_017730	CGT	2	6	2227612	2227617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386741352
42005	NC_017730	ACT	2	6	2227620	2227625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386741352
42006	NC_017730	TCT	2	6	2227687	2227692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386741352
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42009	NC_017730	AC	3	6	2228014	2228019	50 %	0 %	0 %	50 %	386741352
42010	NC_017730	CAG	2	6	2228095	2228100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386741352
42011	NC_017730	CCA	2	6	2228161	2228166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386741352
42012	NC_017730	ACG	2	6	2228206	2228211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386741352
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42236	NC_017730	GCCC	2	8	2240106	2240113	0 %	0 %	25 %	75 %	386741362
42237	NC_017730	CCGT	2	8	2240125	2240132	0 %	25 %	25 %	50 %	386741362
42238	NC_017730	GTA	2	6	2240157	2240162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386741362
42239	NC_017730	GCT	2	6	2240289	2240294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386741362
42240	NC_017730	ACGG	2	8	2240361	2240368	25 %	0 %	50 %	25 %	386741362
42241	NC_017730	CAGG	2	8	2240451	2240458	25 %	0 %	50 %	25 %	386741362
42242	NC_017730	CCG	2	6	2240459	2240464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386741362
42243	NC_017730	TTG	2	6	2240491	2240496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42244	NC_017730	TCC	2	6	2240551	2240556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42245	NC_017730	TAG	2	6	2240560	2240565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42246	NC_017730	GA	3	6	2240567	2240572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42247	NC_017730	CCA	2	6	2240573	2240578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42248	NC_017730	AAT	2	6	2240656	2240661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42249	NC_017730	TAC	2	6	2240701	2240706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42250	NC_017730	A	6	6	2240772	2240777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42251	NC_017730	TAA	2	6	2240847	2240852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42252	NC_017730	AGGCCG	2	12	2241019	2241030	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386741363
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42264	NC_017730	CCG	2	6	2241643	2241648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386741363
42265	NC_017730	TGGG	2	8	2241657	2241664	0 %	25 %	75 %	0 %	386741363
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42273	NC_017730	GAGC	2	8	2242134	2242141	25 %	0 %	50 %	25 %	386741364
42274	NC_017730	AGC	3	9	2242139	2242147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386741364
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42302	NC_017730	TTAAA	2	10	2243559	2243568	60 %	40 %	0 %	0 %	386741366
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42336	NC_017730	GA	4	8	2245188	2245195	50 %	0 %	50 %	0 %	386741367
42337	NC_017730	TTA	2	6	2245196	2245201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386741367
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42340	NC_017730	GA	3	6	2245371	2245376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42341	NC_017730	GTTG	2	8	2245386	2245393	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42342	NC_017730	CAG	2	6	2245416	2245421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42343	NC_017730	CA	3	6	2245439	2245444	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42344	NC_017730	GAG	2	6	2245458	2245463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42345	NC_017730	CGC	2	6	2245596	2245601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42346	NC_017730	A	7	7	2245660	2245666	100 %	0 %	0 %	0 %	386741368
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42348	NC_017730	CT	3	6	2245734	2245739	0 %	50 %	0 %	50 %	386741368
42349	NC_017730	CAG	2	6	2245822	2245827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386741368
42350	NC_017730	CCA	2	6	2245870	2245875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386741368
42351	NC_017730	GCA	2	6	2245893	2245898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386741368
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42354	NC_017730	CCT	2	6	2246113	2246118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386741368
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42382	NC_017730	TCGG	2	8	2247691	2247698	0 %	25 %	50 %	25 %	386741369
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42457	NC_017730	TCT	2	6	2251427	2251432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386741371
42458	NC_017730	TC	3	6	2251435	2251440	0 %	50 %	0 %	50 %	386741371
42459	NC_017730	CAG	2	6	2251446	2251451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386741371
42460	NC_017730	GCT	2	6	2251466	2251471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386741371
42461	NC_017730	TGC	2	6	2251472	2251477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386741371
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42463	NC_017730	C	6	6	2251549	2251554	0 %	0 %	0 %	100 %	386741372
42464	NC_017730	GTTT	2	8	2251644	2251651	0 %	75 %	25 %	0 %	386741372
42465	NC_017730	TTC	2	6	2251660	2251665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386741372
42466	NC_017730	AGGCAG	2	12	2251803	2251814	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386741372
42467	NC_017730	ATT	2	6	2251919	2251924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386741372
42468	NC_017730	GTGC	2	8	2251942	2251949	0 %	25 %	50 %	25 %	386741372
42469	NC_017730	GGCG	2	8	2252002	2252009	0 %	0 %	75 %	25 %	386741372
42470	NC_017730	TCC	2	6	2252018	2252023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386741372
42471	NC_017730	TGA	2	6	2252026	2252031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386741372
42472	NC_017730	CCG	2	6	2252041	2252046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386741372
42473	NC_017730	CAA	2	6	2252059	2252064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386741372
42474	NC_017730	GGC	2	6	2252065	2252070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386741372
42475	NC_017730	CTG	2	6	2252087	2252092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386741372
42476	NC_017730	CGC	2	6	2252248	2252253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386741372
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42478	NC_017730	CGA	2	6	2252383	2252388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386741372
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42480	NC_017730	CA	3	6	2252512	2252517	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42481	NC_017730	CAGG	2	8	2252523	2252530	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42482	NC_017730	TAC	2	6	2252581	2252586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386741373
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42484	NC_017730	CAGTT	2	10	2252674	2252683	20 %	40 %	20 %	20 %	386741373
42485	NC_017730	CT	4	8	2252803	2252810	0 %	50 %	0 %	50 %	386741373
42486	NC_017730	GTA	2	6	2252822	2252827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386741373
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42489	NC_017730	TTC	2	6	2253015	2253020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42490	NC_017730	T	6	6	2253024	2253029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42491	NC_017730	ATA	2	6	2253146	2253151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42492	NC_017730	AAAAT	2	10	2253169	2253178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42493	NC_017730	GAA	2	6	2253235	2253240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42494	NC_017730	AT	3	6	2253262	2253267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42495	NC_017730	ATTT	2	8	2253270	2253277	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42496	NC_017730	CTT	2	6	2253381	2253386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386741374
42497	NC_017730	TACCC	2	10	2253404	2253413	20 %	20 %	0 %	60 %	386741374
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