MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 31 chromosome

Total Repeats: 43319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017730	AAG	2	6	38	43	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739354
2	NC_017730	GCT	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739354
3	NC_017730	A	6	6	187	192	100 %	0 %	0 %	0 %	386739354
4	NC_017730	ACT	2	6	202	207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739354
5	NC_017730	TGCA	2	8	275	282	25 %	25 %	25 %	25 %	386739354
6	NC_017730	TGC	2	6	321	326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739354
7	NC_017730	CAA	2	6	400	405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386739354
8	NC_017730	AT	3	6	412	417	50 %	50 %	0 %	0 %	386739354
9	NC_017730	TTC	3	9	456	464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386739354
10	NC_017730	TCA	2	6	513	518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739354
11	NC_017730	CA	3	6	610	615	50 %	0 %	0 %	50 %	386739354
12	NC_017730	TGC	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739354
13	NC_017730	G	6	6	661	666	0 %	0 %	100 %	0 %	386739354
14	NC_017730	CTG	2	6	698	703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739354
15	NC_017730	TTCC	2	8	710	717	0 %	50 %	0 %	50 %	386739354
16	NC_017730	CGC	2	6	722	727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386739354
17	NC_017730	AGC	2	6	737	742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739354
18	NC_017730	CAG	2	6	833	838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739354
19	NC_017730	AGCC	2	8	857	864	25 %	0 %	25 %	50 %	386739354
20	NC_017730	ATGC	2	8	922	929	25 %	25 %	25 %	25 %	386739354
21	NC_017730	AT	3	6	1005	1010	50 %	50 %	0 %	0 %	386739354
22	NC_017730	CAGG	2	8	1029	1036	25 %	0 %	50 %	25 %	386739354
23	NC_017730	TCC	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386739354
24	NC_017730	AAG	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739354
25	NC_017730	GAA	2	6	1120	1125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739354
26	NC_017730	T	6	6	1126	1131	0 %	100 %	0 %	0 %	386739354
27	NC_017730	ACT	2	6	1204	1209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739354
28	NC_017730	TACG	2	8	1223	1230	25 %	25 %	25 %	25 %	386739354
29	NC_017730	TGA	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739354
30	NC_017730	GGC	2	6	1305	1310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386739354
31	NC_017730	TTG	2	6	1322	1327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386739354
32	NC_017730	ATG	2	6	1489	1494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739354
33	NC_017730	CGA	2	6	1523	1528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739354
34	NC_017730	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739354
35	NC_017730	GATG	2	8	1560	1567	25 %	25 %	50 %	0 %	386739354
36	NC_017730	CG	3	6	1611	1616	0 %	0 %	50 %	50 %	386739354
37	NC_017730	ACCAC	2	10	1694	1703	40 %	0 %	0 %	60 %	386739354
38	NC_017730	GAA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739354
39	NC_017730	ATG	2	6	1760	1765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739354
40	NC_017730	GCT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739354
41	NC_017730	GCA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739354
42	NC_017730	TTC	2	6	1797	1802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386739354
43	NC_017730	TAAA	2	8	1829	1836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017730	AGT	2	6	1905	1910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017730	TTA	2	6	2195	2200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017730	AAC	2	6	2250	2255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017730	TGC	2	6	2309	2314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017730	GAG	2	6	2379	2384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017730	GAAG	2	8	2428	2435	50 %	0 %	50 %	0 %	386739355
50	NC_017730	CCCA	2	8	2483	2490	25 %	0 %	0 %	75 %	386739355
51	NC_017730	TAC	2	6	2496	2501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739355
52	NC_017730	TCA	2	6	2511	2516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739355
53	NC_017730	GAT	2	6	2522	2527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739355
54	NC_017730	GCT	2	6	2626	2631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739355
55	NC_017730	CAT	2	6	2638	2643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739355
56	NC_017730	CTGC	2	8	2768	2775	0 %	25 %	25 %	50 %	386739355
57	NC_017730	GCA	3	9	2828	2836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739355
58	NC_017730	TC	3	6	3004	3009	0 %	50 %	0 %	50 %	386739355
59	NC_017730	GCT	2	6	3169	3174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739355
60	NC_017730	GAAA	2	8	3254	3261	75 %	0 %	25 %	0 %	386739355
61	NC_017730	CGG	2	6	3306	3311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386739355
62	NC_017730	AGA	2	6	3334	3339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739355
63	NC_017730	TTAC	2	8	3397	3404	25 %	50 %	0 %	25 %	386739355
64	NC_017730	GAG	2	6	3491	3496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386739355
65	NC_017730	CTG	2	6	3592	3597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017730	TCGT	2	8	3681	3688	0 %	50 %	25 %	25 %	386739356
67	NC_017730	TTG	2	6	3764	3769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386739356
68	NC_017730	AT	3	6	3780	3785	50 %	50 %	0 %	0 %	386739356
69	NC_017730	CTG	2	6	3866	3871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739356
70	NC_017730	TTG	2	6	4064	4069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386739356
71	NC_017730	GAT	2	6	4183	4188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739356
72	NC_017730	GAG	2	6	4387	4392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386739356
73	NC_017730	TCA	2	6	4396	4401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739356
74	NC_017730	A	6	6	4461	4466	100 %	0 %	0 %	0 %	386739356
75	NC_017730	GAC	2	6	4507	4512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739356
76	NC_017730	CGA	2	6	4647	4652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739356
77	NC_017730	GCC	2	6	4732	4737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386739356
78	NC_017730	AAGG	2	8	4837	4844	50 %	0 %	50 %	0 %	386739356
79	NC_017730	CTG	2	6	4866	4871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739357
80	NC_017730	AGA	2	6	4882	4887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739357
81	NC_017730	GCG	2	6	4930	4935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386739357
82	NC_017730	TC	3	6	4954	4959	0 %	50 %	0 %	50 %	386739357
83	NC_017730	A	6	6	5022	5027	100 %	0 %	0 %	0 %	386739357
84	NC_017730	TGG	2	6	5175	5180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386739357
85	NC_017730	A	6	6	5184	5189	100 %	0 %	0 %	0 %	386739357
86	NC_017730	AGC	2	6	5191	5196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739357
87	NC_017730	AC	3	6	5197	5202	50 %	0 %	0 %	50 %	386739357
88	NC_017730	ATG	2	6	5276	5281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739357
89	NC_017730	ATAC	2	8	5412	5419	50 %	25 %	0 %	25 %	386739357
90	NC_017730	TAA	2	6	5542	5547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017730	CACGC	2	10	5733	5742	20 %	0 %	20 %	60 %	386739358
92	NC_017730	GTGGA	2	10	5770	5779	20 %	20 %	60 %	0 %	386739358
93	NC_017730	ATGC	2	8	5814	5821	25 %	25 %	25 %	25 %	386739358
94	NC_017730	TGG	2	6	5867	5872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386739358
95	NC_017730	TGG	2	6	5903	5908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386739358
96	NC_017730	ACC	2	6	6057	6062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386739358
97	NC_017730	ACC	3	9	6096	6104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386739358
98	NC_017730	CAT	2	6	6116	6121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386739358
99	NC_017730	CGT	2	6	6126	6131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739358
100	NC_017730	TGA	2	6	6224	6229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739358
101	NC_017730	A	6	6	6259	6264	100 %	0 %	0 %	0 %	386739358
102	NC_017730	CCGATG	2	12	6271	6282	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386739358
103	NC_017730	CTG	2	6	6298	6303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739358
104	NC_017730	GAA	2	6	6308	6313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739358
105	NC_017730	GAA	2	6	6320	6325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739358
106	NC_017730	TTA	2	6	6335	6340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386739358
107	NC_017730	TGA	2	6	6428	6433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739358
108	NC_017730	GAA	2	6	6531	6536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739358
109	NC_017730	TGA	2	6	6562	6567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739358
110	NC_017730	CG	3	6	6575	6580	0 %	0 %	50 %	50 %	386739358
111	NC_017730	AAAGAA	2	12	6597	6608	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386739358
112	NC_017730	TCT	2	6	6816	6821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386739358
113	NC_017730	GGC	2	6	6836	6841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386739358
114	NC_017730	TGG	2	6	6887	6892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386739358
115	NC_017730	ATT	2	6	7095	7100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386739358
116	NC_017730	ATG	2	6	7123	7128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739358
117	NC_017730	CAA	2	6	7139	7144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386739358
118	NC_017730	GCT	3	9	7208	7216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739358
119	NC_017730	TTG	2	6	7221	7226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386739358
120	NC_017730	CCG	2	6	7278	7283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386739358
121	NC_017730	GAA	2	6	7356	7361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739358
122	NC_017730	CAA	2	6	7385	7390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386739358
123	NC_017730	GAT	2	6	7392	7397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739358
124	NC_017730	ATG	2	6	7498	7503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739358
125	NC_017730	TGA	2	6	7514	7519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739358
126	NC_017730	TCG	2	6	7556	7561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739358
127	NC_017730	A	6	6	7622	7627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017730	TAG	3	9	7671	7679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017730	CAG	2	6	7748	7753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739359
130	NC_017730	T	6	6	7802	7807	0 %	100 %	0 %	0 %	386739359
131	NC_017730	TTC	2	6	7896	7901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386739359
132	NC_017730	GAG	2	6	7944	7949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386739359
133	NC_017730	AGC	2	6	7956	7961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386739359
134	NC_017730	TGC	2	6	7992	7997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739359
135	NC_017730	GAG	2	6	8103	8108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386739359
136	NC_017730	AT	3	6	8125	8130	50 %	50 %	0 %	0 %	386739359
137	NC_017730	ATG	2	6	8148	8153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017730	TA	4	8	8187	8194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017730	GTT	2	6	8206	8211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017730	ACG	2	6	8238	8243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017730	TTC	2	6	8263	8268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017730	T	6	6	8285	8290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017730	ATT	2	6	8301	8306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386739360
144	NC_017730	TTA	2	6	8408	8413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017730	GAAA	2	8	8468	8475	75 %	0 %	25 %	0 %	386739361
146	NC_017730	CTG	2	6	8544	8549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739361
147	NC_017730	TGT	2	6	8589	8594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386739361
148	NC_017730	CTG	2	6	8597	8602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386739361
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155	NC_017730	CGA	2	6	9083	9088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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157	NC_017730	GAG	2	6	9138	9143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017730	CCG	2	6	9230	9235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_017730	ACG	2	6	9436	9441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_017730	CGC	2	6	9446	9451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_017730	ACTC	2	8	9473	9480	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
162	NC_017730	TTC	2	6	9568	9573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_017730	CG	3	6	9577	9582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
164	NC_017730	TGA	2	6	9595	9600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017730	CAAC	2	8	9631	9638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
166	NC_017730	TCT	2	6	9676	9681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_017730	GCAT	2	8	9726	9733	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
168	NC_017730	GAA	3	9	9852	9860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017730	ACA	2	6	9913	9918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_017730	CG	3	6	10042	10047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
171	NC_017730	TGC	2	6	10153	10158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_017730	TTA	2	6	10160	10165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017730	TCG	2	6	10193	10198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_017730	GAA	2	6	10215	10220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
175	NC_017730	CGA	2	6	10274	10279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_017730	GC	3	6	10320	10325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
177	NC_017730	GATC	2	8	10334	10341	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
178	NC_017730	AGA	2	6	10417	10422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
179	NC_017730	GAAATT	3	18	10440	10457	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
180	NC_017730	CGT	2	6	10551	10556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_017730	ATT	2	6	10563	10568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_017730	GAA	2	6	10590	10595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_017730	GTG	2	6	10617	10622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
184	NC_017730	CGT	2	6	10683	10688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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186	NC_017730	CACG	2	8	10757	10764	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
187	NC_017730	CG	4	8	10841	10848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
188	NC_017730	GGT	2	6	11008	11013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
189	NC_017730	GAA	2	6	11035	11040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_017730	GAA	2	6	11098	11103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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244	NC_017730	T	7	7	13256	13262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
245	NC_017730	GT	3	6	13322	13327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
246	NC_017730	GGT	2	6	13354	13359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
247	NC_017730	T	6	6	13371	13376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
248	NC_017730	GAC	2	6	13455	13460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
249	NC_017730	CAA	2	6	13483	13488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
250	NC_017730	CAT	2	6	13493	13498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_017730	TTGT	2	8	13529	13536	0 %	75 %	25 %	0 %	386739365
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254	NC_017730	TGA	2	6	13640	13645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739365
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260	NC_017730	TGA	2	6	13847	13852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739365
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263	NC_017730	AGT	2	6	13988	13993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386739365
264	NC_017730	TTATC	2	10	14079	14088	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
265	NC_017730	AGG	2	6	14321	14326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
266	NC_017730	GAA	2	6	14360	14365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386739366
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268	NC_017730	GGT	2	6	14387	14392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386739366
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