MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/11074 chromosome

Total Repeats: 22969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017440	AAC	2	6	135596	135601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246013
3002	NC_017440	GTT	2	6	135639	135644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385246013
3003	NC_017440	ATT	2	6	135651	135656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246013
3004	NC_017440	ATTGG	2	10	135714	135723	20 %	40 %	40 %	0 %	385246013
3005	NC_017440	ATTGT	2	10	135747	135756	20 %	60 %	20 %	0 %	385246013
3006	NC_017440	TGG	2	6	135796	135801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385246013
3007	NC_017440	GTG	2	6	136000	136005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385246014
3008	NC_017440	GCTA	2	8	136011	136018	25 %	25 %	25 %	25 %	385246014
3009	NC_017440	GCT	2	6	136045	136050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246014
3010	NC_017440	TG	3	6	136070	136075	0 %	50 %	50 %	0 %	385246014
3011	NC_017440	TG	3	6	136096	136101	0 %	50 %	50 %	0 %	385246014
3012	NC_017440	TAG	2	6	136133	136138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246014
3013	NC_017440	ACA	2	6	136141	136146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246014
3014	NC_017440	CTT	2	6	136155	136160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246014
3015	NC_017440	TGTTT	2	10	136173	136182	0 %	80 %	20 %	0 %	385246014
3016	NC_017440	GCT	2	6	136186	136191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246014
3017	NC_017440	GGAT	2	8	136201	136208	25 %	25 %	50 %	0 %	385246014
3018	NC_017440	CTG	2	6	136322	136327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246015
3019	NC_017440	CAAT	2	8	136350	136357	50 %	25 %	0 %	25 %	385246015
3020	NC_017440	AAGC	2	8	136404	136411	50 %	0 %	25 %	25 %	385246015
3021	NC_017440	TTTG	2	8	136430	136437	0 %	75 %	25 %	0 %	385246015
3022	NC_017440	GCG	2	6	136473	136478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385246015
3023	NC_017440	CTG	3	9	136495	136503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246015
3024	NC_017440	TTC	2	6	136504	136509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246015
3025	NC_017440	CTG	2	6	136515	136520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246015
3026	NC_017440	AAC	2	6	136526	136531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246015
3027	NC_017440	TTTG	2	8	136545	136552	0 %	75 %	25 %	0 %	385246015
3028	NC_017440	CAG	2	6	136582	136587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246015
3029	NC_017440	GAA	2	6	136617	136622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246015
3030	NC_017440	GCT	2	6	136632	136637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246015
3031	NC_017440	CAG	2	6	136650	136655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246015
3032	NC_017440	AGG	2	6	136661	136666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385246015
3033	NC_017440	GAG	2	6	136677	136682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385246015
3034	NC_017440	CAC	2	6	136690	136695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385246015
3035	NC_017440	GAT	2	6	136773	136778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246015
3036	NC_017440	ATAA	2	8	136779	136786	75 %	25 %	0 %	0 %	385246015
3037	NC_017440	ACA	2	6	136789	136794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246015
3038	NC_017440	AGG	2	6	136850	136855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_017440	CCT	2	6	136860	136865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_017440	T	9	9	136867	136875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017440	TTGCA	2	10	136963	136972	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3042	NC_017440	GAG	2	6	137027	137032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385246016
3043	NC_017440	TC	3	6	137037	137042	0 %	50 %	0 %	50 %	385246016
3044	NC_017440	CT	3	6	137066	137071	0 %	50 %	0 %	50 %	385246016
3045	NC_017440	TTC	2	6	137164	137169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246016
3046	NC_017440	CTT	2	6	137214	137219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246016
3047	NC_017440	CT	3	6	137248	137253	0 %	50 %	0 %	50 %	385246016
3048	NC_017440	A	6	6	137298	137303	100 %	0 %	0 %	0 %	385246016
3049	NC_017440	TCT	2	6	137315	137320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246016
3050	NC_017440	CAG	2	6	137409	137414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246016
3051	NC_017440	AG	3	6	137413	137418	50 %	0 %	50 %	0 %	385246016
3052	NC_017440	GAA	2	6	137454	137459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246016
3053	NC_017440	TTCT	2	8	137461	137468	0 %	75 %	0 %	25 %	385246016
3054	NC_017440	AATT	2	8	137487	137494	50 %	50 %	0 %	0 %	385246016
3055	NC_017440	AAG	2	6	137599	137604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246016
3056	NC_017440	CAA	2	6	137637	137642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246016
3057	NC_017440	GCT	2	6	137699	137704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246016
3058	NC_017440	AAG	2	6	137727	137732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246016
3059	NC_017440	GGA	2	6	137777	137782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385246016
3060	NC_017440	TTG	2	6	137917	137922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_017440	ATGT	2	8	138065	138072	25 %	50 %	25 %	0 %	385246017
3062	NC_017440	AGG	2	6	138082	138087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385246017
3063	NC_017440	AAT	2	6	138115	138120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385246017
3064	NC_017440	CTT	2	6	138138	138143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_017440	AG	3	6	138149	138154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_017440	GA	3	6	138212	138217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_017440	A	6	6	138228	138233	100 %	0 %	0 %	0 %	385246018
3068	NC_017440	TAT	2	6	138257	138262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246018
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3070	NC_017440	ATGG	2	8	138342	138349	25 %	25 %	50 %	0 %	385246018
3071	NC_017440	GTT	2	6	138384	138389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385246018
3072	NC_017440	ATT	2	6	138531	138536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246018
3073	NC_017440	TC	3	6	138577	138582	0 %	50 %	0 %	50 %	385246018
3074	NC_017440	AGAA	2	8	138692	138699	75 %	0 %	25 %	0 %	385246018
3075	NC_017440	GAAG	2	8	138738	138745	50 %	0 %	50 %	0 %	385246018
3076	NC_017440	TTGA	2	8	138750	138757	25 %	50 %	25 %	0 %	385246018
3077	NC_017440	GGT	2	6	138765	138770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385246018
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3079	NC_017440	T	7	7	138836	138842	0 %	100 %	0 %	0 %	385246018
3080	NC_017440	GAAA	2	8	138863	138870	75 %	0 %	25 %	0 %	385246018
3081	NC_017440	GAA	2	6	138891	138896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246018
3082	NC_017440	AGT	2	6	138960	138965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246019
3083	NC_017440	TTA	2	6	139004	139009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246019
3084	NC_017440	GA	3	6	139048	139053	50 %	0 %	50 %	0 %	385246019
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3086	NC_017440	T	6	6	139256	139261	0 %	100 %	0 %	0 %	385246019
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3088	NC_017440	A	6	6	139345	139350	100 %	0 %	0 %	0 %	385246019
3089	NC_017440	TTA	2	6	139409	139414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246019
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3091	NC_017440	GAGTTA	2	12	139552	139563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246020
3092	NC_017440	AAGA	2	8	139634	139641	75 %	0 %	25 %	0 %	385246020
3093	NC_017440	AG	3	6	139683	139688	50 %	0 %	50 %	0 %	385246020
3094	NC_017440	GAA	2	6	139695	139700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246020
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3099	NC_017440	GAA	2	6	139968	139973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246021
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3101	NC_017440	ATT	2	6	140011	140016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246021
3102	NC_017440	AAG	2	6	140072	140077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246021
3103	NC_017440	CTT	2	6	140089	140094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246021
3104	NC_017440	GCA	2	6	140128	140133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246021
3105	NC_017440	CCTA	2	8	140138	140145	25 %	25 %	0 %	50 %	385246021
3106	NC_017440	GCT	2	6	140164	140169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246021
3107	NC_017440	TCA	2	6	140429	140434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246021
3108	NC_017440	TAA	2	6	140538	140543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385246021
3109	NC_017440	GTACA	2	10	140648	140657	40 %	20 %	20 %	20 %	385246021
3110	NC_017440	AGA	2	6	140679	140684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246021
3111	NC_017440	GAA	2	6	140863	140868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246021
3112	NC_017440	TAA	2	6	140997	141002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385246021
3113	NC_017440	TAGAT	2	10	141021	141030	40 %	40 %	20 %	0 %	385246021
3114	NC_017440	TAT	2	6	141031	141036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246021
3115	NC_017440	CTCC	2	8	141037	141044	0 %	25 %	0 %	75 %	385246021
3116	NC_017440	CTG	2	6	141053	141058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246021
3117	NC_017440	CCT	2	6	141097	141102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385246021
3118	NC_017440	TAT	2	6	141103	141108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246021
3119	NC_017440	TGG	2	6	141198	141203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385246021
3120	NC_017440	TCA	2	6	141225	141230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246021
3121	NC_017440	TCT	2	6	141255	141260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246021
3122	NC_017440	ATTA	2	8	141274	141281	50 %	50 %	0 %	0 %	385246021
3123	NC_017440	T	8	8	141343	141350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_017440	T	6	6	141388	141393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_017440	AAG	2	6	141397	141402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3127	NC_017440	T	6	6	141457	141462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3188	NC_017440	T	7	7	144294	144300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3251	NC_017440	AG	3	6	147519	147524	50 %	0 %	50 %	0 %	385246028
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3367	NC_017440	A	6	6	152163	152168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3368	NC_017440	TGC	2	6	152296	152301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246032
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3371	NC_017440	ATTCT	2	10	152437	152446	20 %	60 %	0 %	20 %	385246032
3372	NC_017440	AACG	2	8	152453	152460	50 %	0 %	25 %	25 %	385246032
3373	NC_017440	TGA	3	9	152574	152582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246032
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3375	NC_017440	CTGTG	2	10	152641	152650	0 %	40 %	40 %	20 %	385246032
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3495	NC_017440	TAAT	2	8	158172	158179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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