MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/11074 chromosome

Total Repeats: 22969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_017440	A	6	6	633735	633740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_017440	CCTG	2	8	633826	633833	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14003	NC_017440	AT	3	6	633888	633893	50 %	50 %	0 %	0 %	385246476
14004	NC_017440	GTC	2	6	633906	633911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246476
14005	NC_017440	TAA	2	6	633914	633919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385246476
14006	NC_017440	A	6	6	633918	633923	100 %	0 %	0 %	0 %	385246476
14007	NC_017440	TC	3	6	633926	633931	0 %	50 %	0 %	50 %	385246476
14008	NC_017440	AAG	2	6	633985	633990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246476
14009	NC_017440	GAA	2	6	634020	634025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246476
14010	NC_017440	AGGA	2	8	634066	634073	50 %	0 %	50 %	0 %	385246476
14011	NC_017440	TTA	2	6	634105	634110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246476
14012	NC_017440	CCTC	2	8	634144	634151	0 %	25 %	0 %	75 %	385246476
14013	NC_017440	ATC	2	6	634182	634187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246476
14014	NC_017440	AAC	2	6	634309	634314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246476
14015	NC_017440	A	7	7	634328	634334	100 %	0 %	0 %	0 %	385246476
14016	NC_017440	CT	3	6	634362	634367	0 %	50 %	0 %	50 %	385246476
14017	NC_017440	A	6	6	634488	634493	100 %	0 %	0 %	0 %	385246476
14018	NC_017440	ACA	2	6	634509	634514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246476
14019	NC_017440	AAGA	2	8	634530	634537	75 %	0 %	25 %	0 %	385246476
14020	NC_017440	GATT	2	8	634558	634565	25 %	50 %	25 %	0 %	385246477
14021	NC_017440	TCT	2	6	634576	634581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246477
14022	NC_017440	GCA	2	6	634629	634634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246477
14023	NC_017440	CTT	2	6	634645	634650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246477
14024	NC_017440	CTC	2	6	634669	634674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385246477
14025	NC_017440	A	6	6	634699	634704	100 %	0 %	0 %	0 %	385246477
14026	NC_017440	CCT	2	6	634764	634769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385246477
14027	NC_017440	AAG	2	6	634771	634776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246477
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14029	NC_017440	CCT	2	6	634879	634884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385246477
14030	NC_017440	ATT	2	6	634896	634901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246477
14031	NC_017440	ACA	2	6	634934	634939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246477
14032	NC_017440	CCT	2	6	634944	634949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385246477
14033	NC_017440	A	6	6	635031	635036	100 %	0 %	0 %	0 %	385246477
14034	NC_017440	TCGAG	2	10	635041	635050	20 %	20 %	40 %	20 %	385246477
14035	NC_017440	T	6	6	635068	635073	0 %	100 %	0 %	0 %	385246477
14036	NC_017440	TTG	2	6	635098	635103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385246477
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14039	NC_017440	ATC	2	6	635244	635249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246477
14040	NC_017440	TCA	2	6	635260	635265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246477
14041	NC_017440	CTTT	2	8	635314	635321	0 %	75 %	0 %	25 %	385246477
14042	NC_017440	ATG	3	9	635364	635372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246477
14043	NC_017440	TC	4	8	635389	635396	0 %	50 %	0 %	50 %	385246477
14044	NC_017440	CTA	2	6	635442	635447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246477
14045	NC_017440	TGA	2	6	635455	635460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246477
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14047	NC_017440	TTTG	2	8	635518	635525	0 %	75 %	25 %	0 %	385246478
14048	NC_017440	TTA	2	6	635546	635551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246478
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14050	NC_017440	TAT	2	6	635575	635580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246478
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14053	NC_017440	TTG	2	6	635667	635672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385246478
14054	NC_017440	GGCT	2	8	635702	635709	0 %	25 %	50 %	25 %	385246478
14055	NC_017440	TGC	2	6	635731	635736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246478
14056	NC_017440	GGCTC	2	10	635805	635814	0 %	20 %	40 %	40 %	385246479
14057	NC_017440	TA	3	6	635828	635833	50 %	50 %	0 %	0 %	385246479
14058	NC_017440	AGCC	2	8	635841	635848	25 %	0 %	25 %	50 %	385246479
14059	NC_017440	TCTT	2	8	635865	635872	0 %	75 %	0 %	25 %	385246479
14060	NC_017440	ATC	2	6	635906	635911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246479
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14062	NC_017440	TGC	2	6	635979	635984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246479
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14066	NC_017440	CT	3	6	636175	636180	0 %	50 %	0 %	50 %	385246479
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14080	NC_017440	CTCC	2	8	636661	636668	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14081	NC_017440	A	6	6	636669	636674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14088	NC_017440	C	6	6	637057	637062	0 %	0 %	0 %	100 %	385246480
14089	NC_017440	TG	3	6	637075	637080	0 %	50 %	50 %	0 %	385246480
14090	NC_017440	GAG	2	6	637136	637141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385246480
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14092	NC_017440	T	7	7	637181	637187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14093	NC_017440	ATTAA	2	10	637194	637203	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_017440	A	6	6	637248	637253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_017440	TCT	2	6	637270	637275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246481
14096	NC_017440	CAG	2	6	637338	637343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246481
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14099	NC_017440	GCA	2	6	637469	637474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246481
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14101	NC_017440	CG	3	6	637511	637516	0 %	0 %	50 %	50 %	385246481
14102	NC_017440	GAA	2	6	637584	637589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246481
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14104	NC_017440	GGA	2	6	637725	637730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385246481
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14106	NC_017440	AGCA	2	8	637792	637799	50 %	0 %	25 %	25 %	385246481
14107	NC_017440	GAA	2	6	637892	637897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246481
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14112	NC_017440	TCGTT	2	10	638074	638083	0 %	60 %	20 %	20 %	385246481
14113	NC_017440	TTG	2	6	638116	638121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385246481
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14120	NC_017440	TCCAT	2	10	638375	638384	20 %	40 %	0 %	40 %	385246482
14121	NC_017440	AGAA	2	8	638385	638392	75 %	0 %	25 %	0 %	385246482
14122	NC_017440	CCT	2	6	638426	638431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385246482
14123	NC_017440	CT	3	6	638430	638435	0 %	50 %	0 %	50 %	385246482
14124	NC_017440	CTA	2	6	638444	638449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246482
14125	NC_017440	GAAA	2	8	638538	638545	75 %	0 %	25 %	0 %	385246482
14126	NC_017440	A	6	6	638543	638548	100 %	0 %	0 %	0 %	385246482
14127	NC_017440	CTCTTT	2	12	638646	638657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246482
14128	NC_017440	ATATCC	2	12	638663	638674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246482
14129	NC_017440	AGC	2	6	638701	638706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246482
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14131	NC_017440	TAAACA	2	12	638774	638785	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385246482
14132	NC_017440	AGG	2	6	638883	638888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385246483
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14144	NC_017440	ACA	2	6	639241	639246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246484
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14149	NC_017440	TTTC	2	8	639309	639316	0 %	75 %	0 %	25 %	385246484
14150	NC_017440	CAC	2	6	639325	639330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385246484
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14153	NC_017440	CCA	2	6	639496	639501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385246484
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14155	NC_017440	CAT	2	6	639528	639533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246484
14156	NC_017440	T	8	8	639560	639567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14157	NC_017440	TTC	2	6	639571	639576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14158	NC_017440	CCT	2	6	639585	639590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14159	NC_017440	GAA	2	6	639624	639629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246485
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14184	NC_017440	CGT	2	6	640721	640726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246485
14185	NC_017440	T	6	6	640726	640731	0 %	100 %	0 %	0 %	385246485
14186	NC_017440	CCT	2	6	640775	640780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14187	NC_017440	CGGAA	2	10	640991	641000	40 %	0 %	40 %	20 %	385246486
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14190	NC_017440	TTG	2	6	641153	641158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385246486
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14196	NC_017440	GTC	2	6	641488	641493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246486
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14231	NC_017440	ACG	2	6	642899	642904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246487
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14233	NC_017440	T	7	7	643146	643152	0 %	100 %	0 %	0 %	385246487
14234	NC_017440	CAA	2	6	643171	643176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246487
14235	NC_017440	ATCTTG	2	12	643178	643189	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385246487
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14241	NC_017440	AGCG	2	8	643559	643566	25 %	0 %	50 %	25 %	385246487
14242	NC_017440	AGA	2	6	643606	643611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246487
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14478	NC_017440	A	7	7	654103	654109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14479	NC_017440	A	6	6	654119	654124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14491	NC_017440	GAA	2	6	654784	654789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246496
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