MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/11074 chromosome

Total Repeats: 22969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_017440	AC	3	6	611459	611464	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13502	NC_017440	CCT	2	6	611511	611516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385246459
13503	NC_017440	TCT	2	6	611584	611589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246459
13504	NC_017440	TTC	2	6	611613	611618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246459
13505	NC_017440	TGCCA	2	10	611645	611654	20 %	20 %	20 %	40 %	385246459
13506	NC_017440	GTA	2	6	611704	611709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246459
13507	NC_017440	CT	3	6	611710	611715	0 %	50 %	0 %	50 %	385246459
13508	NC_017440	GATT	2	8	611794	611801	25 %	50 %	25 %	0 %	385246459
13509	NC_017440	TCT	2	6	611821	611826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246459
13510	NC_017440	TC	3	6	611831	611836	0 %	50 %	0 %	50 %	385246459
13511	NC_017440	GGTT	2	8	611877	611884	0 %	50 %	50 %	0 %	385246459
13512	NC_017440	GGATGG	2	12	611889	611900	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385246459
13513	NC_017440	AG	4	8	611942	611949	50 %	0 %	50 %	0 %	385246459
13514	NC_017440	TGG	2	6	611955	611960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385246459
13515	NC_017440	ATA	2	6	611980	611985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385246459
13516	NC_017440	GGCGC	2	10	612040	612049	0 %	0 %	60 %	40 %	385246459
13517	NC_017440	ATT	2	6	612066	612071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246459
13518	NC_017440	TAT	2	6	612074	612079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246459
13519	NC_017440	ATCG	2	8	612096	612103	25 %	25 %	25 %	25 %	385246459
13520	NC_017440	AGA	2	6	612158	612163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246459
13521	NC_017440	GAA	2	6	612180	612185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246459
13522	NC_017440	AG	3	6	612219	612224	50 %	0 %	50 %	0 %	385246459
13523	NC_017440	CT	3	6	612225	612230	0 %	50 %	0 %	50 %	385246459
13524	NC_017440	TTAC	2	8	612247	612254	25 %	50 %	0 %	25 %	385246459
13525	NC_017440	TAA	2	6	612263	612268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385246459
13526	NC_017440	CCT	2	6	612292	612297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385246459
13527	NC_017440	TTTA	2	8	612300	612307	25 %	75 %	0 %	0 %	385246459
13528	NC_017440	CT	3	6	612340	612345	0 %	50 %	0 %	50 %	385246459
13529	NC_017440	ATT	2	6	612364	612369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246459
13530	NC_017440	TTTG	2	8	612398	612405	0 %	75 %	25 %	0 %	385246459
13531	NC_017440	ATT	2	6	612416	612421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246459
13532	NC_017440	GGCT	2	8	612438	612445	0 %	25 %	50 %	25 %	385246459
13533	NC_017440	TCT	2	6	612490	612495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246459
13534	NC_017440	ATT	2	6	612503	612508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246459
13535	NC_017440	TGG	2	6	612552	612557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385246459
13536	NC_017440	T	6	6	612587	612592	0 %	100 %	0 %	0 %	385246459
13537	NC_017440	ATG	2	6	612609	612614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246459
13538	NC_017440	ATTGG	2	10	612615	612624	20 %	40 %	40 %	0 %	385246459
13539	NC_017440	A	6	6	612645	612650	100 %	0 %	0 %	0 %	385246459
13540	NC_017440	AGC	2	6	612698	612703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246459
13541	NC_017440	TTG	2	6	612760	612765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385246459
13542	NC_017440	TCAA	2	8	612925	612932	50 %	25 %	0 %	25 %	385246460
13543	NC_017440	TTG	2	6	612938	612943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385246460
13544	NC_017440	CGCT	2	8	612971	612978	0 %	25 %	25 %	50 %	385246460
13545	NC_017440	TTTG	2	8	612996	613003	0 %	75 %	25 %	0 %	385246460
13546	NC_017440	ATC	2	6	613051	613056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246460
13547	NC_017440	A	9	9	613096	613104	100 %	0 %	0 %	0 %	385246460
13548	NC_017440	CTT	2	6	613138	613143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246460
13549	NC_017440	GAA	2	6	613153	613158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246460
13550	NC_017440	TTTG	2	8	613172	613179	0 %	75 %	25 %	0 %	385246460
13551	NC_017440	CTCTC	2	10	613180	613189	0 %	40 %	0 %	60 %	385246460
13552	NC_017440	ATAG	2	8	613225	613232	50 %	25 %	25 %	0 %	385246460
13553	NC_017440	GAA	2	6	613318	613323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246460
13554	NC_017440	AAG	2	6	613364	613369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246460
13555	NC_017440	AGA	2	6	613404	613409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246460
13556	NC_017440	GAA	2	6	613426	613431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246460
13557	NC_017440	AAAAC	2	10	613440	613449	80 %	0 %	0 %	20 %	385246460
13558	NC_017440	AAC	2	6	613469	613474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246460
13559	NC_017440	GCTC	2	8	613569	613576	0 %	25 %	25 %	50 %	385246460
13560	NC_017440	AG	3	6	613603	613608	50 %	0 %	50 %	0 %	385246460
13561	NC_017440	TAG	2	6	613668	613673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246460
13562	NC_017440	ATTTT	2	10	613677	613686	20 %	80 %	0 %	0 %	385246460
13563	NC_017440	GCA	2	6	613717	613722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246460
13564	NC_017440	CTATC	2	10	613797	613806	20 %	40 %	0 %	40 %	385246460
13565	NC_017440	A	8	8	613826	613833	100 %	0 %	0 %	0 %	385246460
13566	NC_017440	AGA	2	6	613845	613850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246460
13567	NC_017440	CTT	2	6	613875	613880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246460
13568	NC_017440	AGA	2	6	613881	613886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246460
13569	NC_017440	AC	3	6	613916	613921	50 %	0 %	0 %	50 %	385246460
13570	NC_017440	TAT	3	9	614007	614015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246460
13571	NC_017440	ATT	2	6	614056	614061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246460
13572	NC_017440	TTC	2	6	614176	614181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246460
13573	NC_017440	TCA	2	6	614189	614194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246460
13574	NC_017440	CGATAT	3	18	614217	614234	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385246460
13575	NC_017440	AG	3	6	614248	614253	50 %	0 %	50 %	0 %	385246460
13576	NC_017440	TTA	2	6	614258	614263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246460
13577	NC_017440	ATT	2	6	614305	614310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246460
13578	NC_017440	A	6	6	614509	614514	100 %	0 %	0 %	0 %	385246460
13579	NC_017440	TGC	2	6	614547	614552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246460
13580	NC_017440	T	6	6	614679	614684	0 %	100 %	0 %	0 %	385246460
13581	NC_017440	CA	3	6	614718	614723	50 %	0 %	0 %	50 %	385246460
13582	NC_017440	A	7	7	614734	614740	100 %	0 %	0 %	0 %	385246460
13583	NC_017440	TC	3	6	614792	614797	0 %	50 %	0 %	50 %	385246460
13584	NC_017440	TTC	2	6	614798	614803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246460
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13586	NC_017440	CAT	2	6	614942	614947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246460
13587	NC_017440	CGC	2	6	615106	615111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385246460
13588	NC_017440	A	6	6	615121	615126	100 %	0 %	0 %	0 %	385246460
13589	NC_017440	GA	3	6	615152	615157	50 %	0 %	50 %	0 %	385246460
13590	NC_017440	TAA	2	6	615249	615254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385246460
13591	NC_017440	ACA	2	6	615289	615294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246460
13592	NC_017440	GCC	2	6	615331	615336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385246460
13593	NC_017440	AAG	2	6	615386	615391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246460
13594	NC_017440	CCT	2	6	615418	615423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385246460
13595	NC_017440	TTG	2	6	615524	615529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385246460
13596	NC_017440	AG	4	8	615531	615538	50 %	0 %	50 %	0 %	385246460
13597	NC_017440	A	7	7	615539	615545	100 %	0 %	0 %	0 %	385246460
13598	NC_017440	A	6	6	615592	615597	100 %	0 %	0 %	0 %	385246460
13599	NC_017440	TGG	2	6	615623	615628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385246460
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13601	NC_017440	A	8	8	615713	615720	100 %	0 %	0 %	0 %	385246460
13602	NC_017440	GCT	2	6	615724	615729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246460
13603	NC_017440	T	7	7	615745	615751	0 %	100 %	0 %	0 %	385246460
13604	NC_017440	TC	3	6	615791	615796	0 %	50 %	0 %	50 %	385246460
13605	NC_017440	GTT	2	6	615828	615833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385246460
13606	NC_017440	ATT	2	6	615958	615963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246460
13607	NC_017440	ACT	2	6	615991	615996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246460
13608	NC_017440	GCAGA	2	10	616009	616018	40 %	0 %	40 %	20 %	385246460
13609	NC_017440	A	6	6	616018	616023	100 %	0 %	0 %	0 %	385246460
13610	NC_017440	GAA	2	6	616111	616116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246460
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13612	NC_017440	CGA	2	6	616230	616235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246460
13613	NC_017440	A	6	6	616279	616284	100 %	0 %	0 %	0 %	385246460
13614	NC_017440	AAAG	2	8	616314	616321	75 %	0 %	25 %	0 %	385246460
13615	NC_017440	AG	3	6	616330	616335	50 %	0 %	50 %	0 %	385246460
13616	NC_017440	TC	3	6	616337	616342	0 %	50 %	0 %	50 %	385246460
13617	NC_017440	TAAA	2	8	616364	616371	75 %	25 %	0 %	0 %	385246460
13618	NC_017440	TTAT	2	8	616387	616394	25 %	75 %	0 %	0 %	385246460
13619	NC_017440	CT	4	8	616435	616442	0 %	50 %	0 %	50 %	385246460
13620	NC_017440	TC	3	6	616478	616483	0 %	50 %	0 %	50 %	385246460
13621	NC_017440	T	6	6	616494	616499	0 %	100 %	0 %	0 %	385246460
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