MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/11074 chromosome

Total Repeats: 22969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017440	TCTT	2	8	588397	588404	0 %	75 %	0 %	25 %	385246426
13002	NC_017440	GTTGT	2	10	588456	588465	0 %	60 %	40 %	0 %	385246426
13003	NC_017440	TTC	2	6	588469	588474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246426
13004	NC_017440	AGA	2	6	588625	588630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246426
13005	NC_017440	TTC	2	6	588654	588659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246426
13006	NC_017440	ATA	2	6	588723	588728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385246427
13007	NC_017440	AG	3	6	588740	588745	50 %	0 %	50 %	0 %	385246427
13008	NC_017440	AGG	2	6	588750	588755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385246427
13009	NC_017440	ATT	2	6	588788	588793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246427
13010	NC_017440	CAT	2	6	588913	588918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246427
13011	NC_017440	TCC	2	6	588947	588952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385246427
13012	NC_017440	T	6	6	588978	588983	0 %	100 %	0 %	0 %	385246427
13013	NC_017440	AGC	2	6	588986	588991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246427
13014	NC_017440	AAACT	2	10	589089	589098	60 %	20 %	0 %	20 %	385246427
13015	NC_017440	CCT	2	6	589104	589109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385246427
13016	NC_017440	AAC	2	6	589112	589117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246427
13017	NC_017440	ACA	2	6	589121	589126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246427
13018	NC_017440	GAC	2	6	589133	589138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246427
13019	NC_017440	CT	3	6	589225	589230	0 %	50 %	0 %	50 %	385246428
13020	NC_017440	CTA	2	6	589251	589256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246428
13021	NC_017440	CTC	2	6	589275	589280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385246428
13022	NC_017440	AAC	2	6	589288	589293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246428
13023	NC_017440	T	6	6	589361	589366	0 %	100 %	0 %	0 %	385246428
13024	NC_017440	CAT	2	6	589434	589439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246428
13025	NC_017440	TA	3	6	589560	589565	50 %	50 %	0 %	0 %	385246428
13026	NC_017440	T	6	6	589603	589608	0 %	100 %	0 %	0 %	385246429
13027	NC_017440	GCT	2	6	589619	589624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246429
13028	NC_017440	ACG	2	6	589636	589641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246429
13029	NC_017440	AACT	2	8	589726	589733	50 %	25 %	0 %	25 %	385246429
13030	NC_017440	TCTA	2	8	589969	589976	25 %	50 %	0 %	25 %	385246429
13031	NC_017440	AACA	2	8	589996	590003	75 %	0 %	0 %	25 %	385246429
13032	NC_017440	CTT	2	6	590031	590036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246429
13033	NC_017440	TCA	2	6	590084	590089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246429
13034	NC_017440	ACCAA	2	10	590181	590190	60 %	0 %	0 %	40 %	385246430
13035	NC_017440	CGC	2	6	590202	590207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385246430
13036	NC_017440	GAG	2	6	590250	590255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385246430
13037	NC_017440	TGC	2	6	590302	590307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246430
13038	NC_017440	CCT	2	6	590320	590325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385246430
13039	NC_017440	AC	3	6	590337	590342	50 %	0 %	0 %	50 %	385246430
13040	NC_017440	TCT	2	6	590372	590377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246430
13041	NC_017440	TCA	2	6	590397	590402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246430
13042	NC_017440	TCT	2	6	590417	590422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246430
13043	NC_017440	TGC	2	6	590450	590455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246430
13044	NC_017440	CTT	2	6	590607	590612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246431
13045	NC_017440	ATTC	2	8	590685	590692	25 %	50 %	0 %	25 %	385246431
13046	NC_017440	ATC	2	6	590742	590747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246431
13047	NC_017440	CATA	2	8	590849	590856	50 %	25 %	0 %	25 %	385246431
13048	NC_017440	TTA	2	6	591032	591037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246431
13049	NC_017440	TCT	2	6	591041	591046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246431
13050	NC_017440	TCTT	2	8	591098	591105	0 %	75 %	0 %	25 %	385246431
13051	NC_017440	TA	3	6	591116	591121	50 %	50 %	0 %	0 %	385246431
13052	NC_017440	T	7	7	591123	591129	0 %	100 %	0 %	0 %	385246431
13053	NC_017440	TC	4	8	591151	591158	0 %	50 %	0 %	50 %	385246432
13054	NC_017440	GAA	2	6	591176	591181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246432
13055	NC_017440	TC	3	6	591219	591224	0 %	50 %	0 %	50 %	385246432
13056	NC_017440	ACGT	2	8	591268	591275	25 %	25 %	25 %	25 %	385246432
13057	NC_017440	GAG	2	6	591288	591293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385246432
13058	NC_017440	T	6	6	591344	591349	0 %	100 %	0 %	0 %	385246432
13059	NC_017440	AAC	2	6	591390	591395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246432
13060	NC_017440	AGCA	2	8	591430	591437	50 %	0 %	25 %	25 %	385246432
13061	NC_017440	ATC	2	6	591592	591597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246433
13062	NC_017440	GAT	2	6	591598	591603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246433
13063	NC_017440	AAC	2	6	591685	591690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246433
13064	NC_017440	CTT	2	6	591697	591702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246433
13065	NC_017440	ATCAC	2	10	591743	591752	40 %	20 %	0 %	40 %	385246433
13066	NC_017440	CGA	2	6	591770	591775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246433
13067	NC_017440	TAT	2	6	591819	591824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246433
13068	NC_017440	ACT	2	6	591871	591876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246434
13069	NC_017440	CTT	2	6	591952	591957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246434
13070	NC_017440	ATA	2	6	591980	591985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385246434
13071	NC_017440	ACC	2	6	592002	592007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385246434
13072	NC_017440	AAC	3	9	592046	592054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246434
13073	NC_017440	T	6	6	592057	592062	0 %	100 %	0 %	0 %	385246434
13074	NC_017440	TGA	2	6	592070	592075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246434
13075	NC_017440	ACT	2	6	592077	592082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246434
13076	NC_017440	T	7	7	592138	592144	0 %	100 %	0 %	0 %	385246435
13077	NC_017440	TGA	2	6	592195	592200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246435
13078	NC_017440	AGC	2	6	592224	592229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246435
13079	NC_017440	CGCA	2	8	592233	592240	25 %	0 %	25 %	50 %	385246435
13080	NC_017440	AG	3	6	592247	592252	50 %	0 %	50 %	0 %	385246435
13081	NC_017440	T	6	6	592254	592259	0 %	100 %	0 %	0 %	385246435
13082	NC_017440	TC	3	6	592298	592303	0 %	50 %	0 %	50 %	385246435
13083	NC_017440	TAA	2	6	592314	592319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385246435
13084	NC_017440	T	6	6	592324	592329	0 %	100 %	0 %	0 %	385246435
13085	NC_017440	GCA	2	6	592388	592393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246436
13086	NC_017440	TCT	2	6	592418	592423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246436
13087	NC_017440	ACA	2	6	592466	592471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246436
13088	NC_017440	CAG	2	6	592518	592523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246436
13089	NC_017440	T	6	6	592525	592530	0 %	100 %	0 %	0 %	385246436
13090	NC_017440	GGC	2	6	592620	592625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385246436
13091	NC_017440	ATCC	2	8	592631	592638	25 %	25 %	0 %	50 %	385246436
13092	NC_017440	CAA	2	6	592674	592679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246436
13093	NC_017440	CTG	2	6	592717	592722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246436
13094	NC_017440	ATA	2	6	592754	592759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385246436
13095	NC_017440	CA	3	6	592763	592768	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13096	NC_017440	GCA	2	6	592792	592797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246437
13097	NC_017440	AGC	2	6	592806	592811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246437
13098	NC_017440	CTT	2	6	592839	592844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246437
13099	NC_017440	AGT	2	6	592887	592892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246437
13100	NC_017440	CCGA	2	8	592967	592974	25 %	0 %	25 %	50 %	385246437
13101	NC_017440	GAAA	2	8	593073	593080	75 %	0 %	25 %	0 %	385246437
13102	NC_017440	CGA	2	6	593114	593119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246437
13103	NC_017440	TTC	2	6	593224	593229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246437
13104	NC_017440	AAC	2	6	593292	593297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246437
13105	NC_017440	GCA	2	6	593305	593310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246437
13106	NC_017440	AAG	2	6	593318	593323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246437
13107	NC_017440	TCT	2	6	593327	593332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246437
13108	NC_017440	ATT	2	6	593385	593390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246437
13109	NC_017440	CT	3	6	593480	593485	0 %	50 %	0 %	50 %	385246438
13110	NC_017440	CAA	2	6	593489	593494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246438
13111	NC_017440	T	6	6	593664	593669	0 %	100 %	0 %	0 %	385246438
13112	NC_017440	CAA	2	6	593720	593725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246438
13113	NC_017440	TCA	2	6	593738	593743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246438
13114	NC_017440	GTAT	2	8	593780	593787	25 %	50 %	25 %	0 %	385246438
13115	NC_017440	T	6	6	593832	593837	0 %	100 %	0 %	0 %	385246439
13116	NC_017440	TTG	2	6	593861	593866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385246439
13117	NC_017440	GA	3	6	593867	593872	50 %	0 %	50 %	0 %	385246439
13118	NC_017440	ACG	2	6	593982	593987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246439
13119	NC_017440	TCT	2	6	594011	594016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246439
13120	NC_017440	TGA	2	6	594052	594057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246439
13121	NC_017440	CAA	2	6	594059	594064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246439
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13242	NC_017440	CT	4	8	599174	599181	0 %	50 %	0 %	50 %	385246446
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13245	NC_017440	TTG	2	6	599368	599373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385246446
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13280	NC_017440	T	12	12	601314	601325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13282	NC_017440	A	6	6	601343	601348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13491	NC_017440	TAT	2	6	611189	611194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13492	NC_017440	AC	3	6	611207	611212	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13493	NC_017440	ATCC	2	8	611227	611234	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13494	NC_017440	CGC	2	6	611241	611246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13495	NC_017440	CT	3	6	611264	611269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13496	NC_017440	TCT	2	6	611289	611294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13497	NC_017440	GAC	2	6	611326	611331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13498	NC_017440	TAC	2	6	611334	611339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13499	NC_017440	ATG	2	6	611351	611356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13500	NC_017440	A	6	6	611386	611391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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