MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/11074 chromosome

Total Repeats: 22969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_017440	TTCTG	2	10	520485	520494	0 %	60 %	20 %	20 %	385246357
11503	NC_017440	AT	3	6	520544	520549	50 %	50 %	0 %	0 %	385246357
11504	NC_017440	TTG	2	6	520610	520615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385246357
11505	NC_017440	CA	4	8	520660	520667	50 %	0 %	0 %	50 %	385246357
11506	NC_017440	ATCC	2	8	520703	520710	25 %	25 %	0 %	50 %	385246357
11507	NC_017440	ACT	2	6	520764	520769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246357
11508	NC_017440	AAG	2	6	520803	520808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246357
11509	NC_017440	TCA	2	6	520834	520839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246357
11510	NC_017440	TC	4	8	520852	520859	0 %	50 %	0 %	50 %	385246357
11511	NC_017440	GAT	2	6	520931	520936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246357
11512	NC_017440	CAG	2	6	520979	520984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246357
11513	NC_017440	TAG	2	6	521002	521007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246357
11514	NC_017440	ATA	2	6	521151	521156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385246357
11515	NC_017440	CAG	2	6	521225	521230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246357
11516	NC_017440	GTA	2	6	521264	521269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246357
11517	NC_017440	CAACA	2	10	521303	521312	60 %	0 %	0 %	40 %	385246357
11518	NC_017440	GA	3	6	521313	521318	50 %	0 %	50 %	0 %	385246357
11519	NC_017440	CTT	2	6	521362	521367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246357
11520	NC_017440	CTCC	2	8	521541	521548	0 %	25 %	0 %	75 %	385246357
11521	NC_017440	T	6	6	521562	521567	0 %	100 %	0 %	0 %	385246357
11522	NC_017440	CTT	2	6	521581	521586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246357
11523	NC_017440	TTG	2	6	521615	521620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385246357
11524	NC_017440	CT	3	6	521777	521782	0 %	50 %	0 %	50 %	385246357
11525	NC_017440	AAG	2	6	521824	521829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246357
11526	NC_017440	GAG	2	6	521962	521967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385246357
11527	NC_017440	CTT	2	6	522039	522044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246357
11528	NC_017440	AGA	2	6	522104	522109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246357
11529	NC_017440	CTG	2	6	522115	522120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246357
11530	NC_017440	TCA	2	6	522207	522212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246357
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11533	NC_017440	TCT	2	6	522475	522480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246357
11534	NC_017440	TAC	2	6	522491	522496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246357
11535	NC_017440	TGT	2	6	522681	522686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385246357
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11539	NC_017440	AACT	2	8	523100	523107	50 %	25 %	0 %	25 %	385246357
11540	NC_017440	AGC	2	6	523118	523123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246357
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11543	NC_017440	CAA	2	6	523207	523212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246357
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11546	NC_017440	CTTC	2	8	523300	523307	0 %	50 %	0 %	50 %	385246357
11547	NC_017440	TGT	2	6	523317	523322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385246357
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11549	NC_017440	TTG	2	6	523531	523536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385246357
11550	NC_017440	AAAG	2	8	523590	523597	75 %	0 %	25 %	0 %	385246357
11551	NC_017440	AAG	2	6	523612	523617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246357
11552	NC_017440	AAC	2	6	523640	523645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246357
11553	NC_017440	TC	3	6	523648	523653	0 %	50 %	0 %	50 %	385246357
11554	NC_017440	ACA	2	6	523674	523679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246357
11555	NC_017440	AATA	2	8	523733	523740	75 %	25 %	0 %	0 %	385246357
11556	NC_017440	TCT	2	6	523749	523754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246357
11557	NC_017440	TGC	2	6	523797	523802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246357
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11560	NC_017440	AGC	2	6	524097	524102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11561	NC_017440	GAAG	2	8	524105	524112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_017440	AT	3	6	524131	524136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_017440	AAAG	2	8	524144	524151	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_017440	T	6	6	524192	524197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_017440	TTGGA	2	10	524215	524224	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_017440	T	6	6	524238	524243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_017440	ACA	2	6	524246	524251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11568	NC_017440	AACC	2	8	524279	524286	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11569	NC_017440	A	7	7	524350	524356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_017440	T	6	6	524372	524377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_017440	A	7	7	524423	524429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11574	NC_017440	CAA	2	6	524545	524550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246358
11575	NC_017440	GAACT	2	10	524702	524711	40 %	20 %	20 %	20 %	385246358
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11581	NC_017440	AAT	2	6	524861	524866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_017440	ACTT	2	8	524871	524878	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11583	NC_017440	GCT	2	6	524962	524967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11585	NC_017440	AGA	2	6	525039	525044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_017440	ATA	2	6	525073	525078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_017440	CTA	2	6	525147	525152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11589	NC_017440	TCCC	2	8	525310	525317	0 %	25 %	0 %	75 %	385246359
11590	NC_017440	CAT	3	9	525330	525338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246359
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11594	NC_017440	GCA	2	6	525557	525562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246359
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11596	NC_017440	ACA	2	6	525641	525646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246359
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11599	NC_017440	A	7	7	525769	525775	100 %	0 %	0 %	0 %	385246359
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11602	NC_017440	GTC	2	6	526074	526079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246360
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11604	NC_017440	TTC	2	6	526108	526113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246361
11605	NC_017440	CTT	2	6	526155	526160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246361
11606	NC_017440	TCC	2	6	526161	526166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385246361
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11608	NC_017440	TTCT	2	8	526335	526342	0 %	75 %	0 %	25 %	385246361
11609	NC_017440	CTT	2	6	526343	526348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246361
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11611	NC_017440	TCC	2	6	526459	526464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385246361
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11615	NC_017440	A	6	6	526587	526592	100 %	0 %	0 %	0 %	385246361
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11617	NC_017440	ATCT	2	8	526655	526662	25 %	50 %	0 %	25 %	385246361
11618	NC_017440	CTT	2	6	526671	526676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246361
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11621	NC_017440	CTT	2	6	526872	526877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246361
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11623	NC_017440	GAT	2	6	526933	526938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246361
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11991	NC_017440	TCC	2	6	543365	543370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385246378
11992	NC_017440	AT	3	6	543453	543458	50 %	50 %	0 %	0 %	385246378
11993	NC_017440	GAAAA	2	10	543483	543492	80 %	0 %	20 %	0 %	385246378
11994	NC_017440	T	6	6	543500	543505	0 %	100 %	0 %	0 %	385246378
11995	NC_017440	CTA	2	6	543528	543533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246378
11996	NC_017440	TGC	2	6	543556	543561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246378
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11999	NC_017440	ACAAGA	2	12	543733	543744	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385246378
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