MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/11074 chromosome

Total Repeats: 22969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_017440	AGC	2	6	498152	498157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246332
11003	NC_017440	TTC	2	6	498212	498217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246332
11004	NC_017440	ATTTC	2	10	498222	498231	20 %	60 %	0 %	20 %	385246332
11005	NC_017440	ATT	2	6	498262	498267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246332
11006	NC_017440	AGA	2	6	498281	498286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246332
11007	NC_017440	AGC	2	6	498299	498304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385246332
11008	NC_017440	ATACT	2	10	498341	498350	40 %	40 %	0 %	20 %	385246332
11009	NC_017440	TAT	2	6	498408	498413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246332
11010	NC_017440	CAA	2	6	498426	498431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246332
11011	NC_017440	CCTA	2	8	498466	498473	25 %	25 %	0 %	50 %	385246332
11012	NC_017440	TC	3	6	498535	498540	0 %	50 %	0 %	50 %	385246333
11013	NC_017440	TTG	2	6	498635	498640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385246333
11014	NC_017440	CAA	2	6	498647	498652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385246333
11015	NC_017440	AC	3	6	498718	498723	50 %	0 %	0 %	50 %	385246333
11016	NC_017440	ATA	2	6	498737	498742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385246333
11017	NC_017440	CGTTT	2	10	498743	498752	0 %	60 %	20 %	20 %	385246333
11018	NC_017440	TATCC	2	10	498782	498791	20 %	40 %	0 %	40 %	385246333
11019	NC_017440	GGA	2	6	498832	498837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385246333
11020	NC_017440	TTG	2	6	498914	498919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385246333
11021	NC_017440	GAAA	2	8	498972	498979	75 %	0 %	25 %	0 %	385246333
11022	NC_017440	ACT	2	6	499059	499064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246333
11023	NC_017440	CTT	2	6	499139	499144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246334
11024	NC_017440	TTC	2	6	499164	499169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246334
11025	NC_017440	CTT	2	6	499183	499188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246334
11026	NC_017440	CGT	3	9	499189	499197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246334
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11029	NC_017440	TC	3	6	499222	499227	0 %	50 %	0 %	50 %	385246334
11030	NC_017440	CTC	3	9	499321	499329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385246334
11031	NC_017440	TTC	3	9	499346	499354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246334
11032	NC_017440	GAA	2	6	499383	499388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246334
11033	NC_017440	CGT	2	6	499419	499424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246334
11034	NC_017440	GTC	2	6	499464	499469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246334
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11039	NC_017440	AAACTG	2	12	499673	499684	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385246334
11040	NC_017440	ATT	2	6	499685	499690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246334
11041	NC_017440	ATG	2	6	499704	499709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246334
11042	NC_017440	T	6	6	499852	499857	0 %	100 %	0 %	0 %	385246334
11043	NC_017440	TCT	2	6	499879	499884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246334
11044	NC_017440	TTC	2	6	499934	499939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246334
11045	NC_017440	TC	4	8	500028	500035	0 %	50 %	0 %	50 %	385246334
11046	NC_017440	TCA	2	6	500037	500042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246334
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11048	NC_017440	GTC	2	6	500109	500114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246334
11049	NC_017440	CT	4	8	500153	500160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11050	NC_017440	ACC	2	6	500206	500211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385246335
11051	NC_017440	A	6	6	500275	500280	100 %	0 %	0 %	0 %	385246335
11052	NC_017440	CTA	2	6	500295	500300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246335
11053	NC_017440	AC	3	6	500306	500311	50 %	0 %	0 %	50 %	385246335
11054	NC_017440	ATC	2	6	500438	500443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246335
11055	NC_017440	CTT	2	6	500444	500449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246335
11056	NC_017440	AAGA	2	8	500505	500512	75 %	0 %	25 %	0 %	385246335
11057	NC_017440	CTTA	2	8	500534	500541	25 %	50 %	0 %	25 %	385246335
11058	NC_017440	A	6	6	500585	500590	100 %	0 %	0 %	0 %	385246335
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11087	NC_017440	TCT	2	6	502311	502316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246337
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11093	NC_017440	GTAA	2	8	502830	502837	50 %	25 %	25 %	0 %	385246337
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11097	NC_017440	AATCT	2	10	503141	503150	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11098	NC_017440	TGA	2	6	503153	503158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_017440	ATTT	2	8	503188	503195	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_017440	TAACTA	2	12	503196	503207	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11101	NC_017440	AAGAAA	2	12	503209	503220	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_017440	AAG	2	6	503329	503334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246338
11103	NC_017440	CTA	2	6	503339	503344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246338
11104	NC_017440	A	6	6	503347	503352	100 %	0 %	0 %	0 %	385246338
11105	NC_017440	CTTCT	2	10	503354	503363	0 %	60 %	0 %	40 %	385246338
11106	NC_017440	A	8	8	503368	503375	100 %	0 %	0 %	0 %	385246338
11107	NC_017440	ATCC	2	8	503442	503449	25 %	25 %	0 %	50 %	385246339
11108	NC_017440	CTG	2	6	503466	503471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385246339
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11111	NC_017440	CTT	2	6	503670	503675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246339
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11114	NC_017440	CTC	2	6	503773	503778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385246339
11115	NC_017440	CTCG	2	8	503801	503808	0 %	25 %	25 %	50 %	385246339
11116	NC_017440	CT	3	6	503821	503826	0 %	50 %	0 %	50 %	385246339
11117	NC_017440	TCC	2	6	503846	503851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385246339
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11119	NC_017440	TAT	2	6	503920	503925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385246339
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11364	NC_017440	ATA	2	6	514848	514853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11491	NC_017440	TCT	2	6	520095	520100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385246357
11492	NC_017440	AAT	2	6	520115	520120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385246357
11493	NC_017440	TCA	2	6	520153	520158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385246357
11494	NC_017440	TTGC	2	8	520168	520175	0 %	50 %	25 %	25 %	385246357
11495	NC_017440	AATC	2	8	520177	520184	50 %	25 %	0 %	25 %	385246357
11496	NC_017440	AGCAC	2	10	520218	520227	40 %	0 %	20 %	40 %	385246357
11497	NC_017440	TAA	2	6	520235	520240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385246357
11498	NC_017440	AAT	2	6	520329	520334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385246357
11499	NC_017440	AGT	2	6	520421	520426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385246357
11500	NC_017440	GAA	2	6	520453	520458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385246357

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