MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D-LC chromosome

Total Repeats: 22956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017436	ACA	2	6	136072	136077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244203
3002	NC_017436	CTT	2	6	136086	136091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244203
3003	NC_017436	TGTTT	2	10	136104	136113	0 %	80 %	20 %	0 %	385244203
3004	NC_017436	GCT	2	6	136117	136122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244203
3005	NC_017436	GGAT	2	8	136132	136139	25 %	25 %	50 %	0 %	385244203
3006	NC_017436	CTG	2	6	136253	136258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244204
3007	NC_017436	CAAT	2	8	136281	136288	50 %	25 %	0 %	25 %	385244204
3008	NC_017436	AAGC	2	8	136335	136342	50 %	0 %	25 %	25 %	385244204
3009	NC_017436	TTTG	2	8	136361	136368	0 %	75 %	25 %	0 %	385244204
3010	NC_017436	GCG	2	6	136404	136409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385244204
3011	NC_017436	CTG	3	9	136426	136434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244204
3012	NC_017436	TTC	2	6	136435	136440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244204
3013	NC_017436	CTG	2	6	136446	136451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244204
3014	NC_017436	AAC	2	6	136457	136462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244204
3015	NC_017436	TTTG	2	8	136476	136483	0 %	75 %	25 %	0 %	385244204
3016	NC_017436	CAG	2	6	136513	136518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244204
3017	NC_017436	GAA	2	6	136548	136553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244204
3018	NC_017436	GCT	2	6	136563	136568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244204
3019	NC_017436	CAG	2	6	136581	136586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244204
3020	NC_017436	AGG	2	6	136592	136597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244204
3021	NC_017436	GAG	2	6	136608	136613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244204
3022	NC_017436	CAC	2	6	136621	136626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385244204
3023	NC_017436	GAT	2	6	136704	136709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244204
3024	NC_017436	ATAA	2	8	136710	136717	75 %	25 %	0 %	0 %	385244204
3025	NC_017436	ACA	2	6	136720	136725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244204
3026	NC_017436	AGG	2	6	136781	136786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_017436	CCT	2	6	136791	136796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3028	NC_017436	T	9	9	136798	136806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_017436	TTGCA	2	10	136893	136902	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3030	NC_017436	GAG	2	6	136957	136962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244205
3031	NC_017436	TC	3	6	136967	136972	0 %	50 %	0 %	50 %	385244205
3032	NC_017436	CT	3	6	136996	137001	0 %	50 %	0 %	50 %	385244205
3033	NC_017436	TTC	2	6	137094	137099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244205
3034	NC_017436	CTT	2	6	137144	137149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244205
3035	NC_017436	CT	3	6	137178	137183	0 %	50 %	0 %	50 %	385244205
3036	NC_017436	A	6	6	137228	137233	100 %	0 %	0 %	0 %	385244205
3037	NC_017436	TCT	2	6	137245	137250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244205
3038	NC_017436	CAG	2	6	137339	137344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244205
3039	NC_017436	AG	3	6	137343	137348	50 %	0 %	50 %	0 %	385244205
3040	NC_017436	GAA	2	6	137384	137389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244205
3041	NC_017436	TTCT	2	8	137391	137398	0 %	75 %	0 %	25 %	385244205
3042	NC_017436	AATT	2	8	137417	137424	50 %	50 %	0 %	0 %	385244205
3043	NC_017436	AAG	2	6	137529	137534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244205
3044	NC_017436	CAA	2	6	137567	137572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385244205
3045	NC_017436	GCT	2	6	137629	137634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244205
3046	NC_017436	AAG	2	6	137657	137662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244205
3047	NC_017436	TTG	2	6	137847	137852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244206
3048	NC_017436	ATGT	2	8	137997	138004	25 %	50 %	25 %	0 %	385244206
3049	NC_017436	AGG	2	6	138014	138019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244206
3050	NC_017436	AAT	2	6	138047	138052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244206
3051	NC_017436	CTT	2	6	138070	138075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_017436	GA	3	6	138144	138149	50 %	0 %	50 %	0 %	385244207
3053	NC_017436	A	6	6	138160	138165	100 %	0 %	0 %	0 %	385244207
3054	NC_017436	TAT	2	6	138189	138194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244207
3055	NC_017436	AGA	2	6	138237	138242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244207
3056	NC_017436	ATGG	2	8	138274	138281	25 %	25 %	50 %	0 %	385244207
3057	NC_017436	GTT	2	6	138316	138321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244207
3058	NC_017436	ATT	2	6	138463	138468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244207
3059	NC_017436	TC	3	6	138509	138514	0 %	50 %	0 %	50 %	385244207
3060	NC_017436	AGAA	2	8	138624	138631	75 %	0 %	25 %	0 %	385244207
3061	NC_017436	GAAG	2	8	138670	138677	50 %	0 %	50 %	0 %	385244207
3062	NC_017436	TTGA	2	8	138682	138689	25 %	50 %	25 %	0 %	385244207
3063	NC_017436	GGT	2	6	138697	138702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385244207
3064	NC_017436	CCT	2	6	138761	138766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244207
3065	NC_017436	T	7	7	138768	138774	0 %	100 %	0 %	0 %	385244207
3066	NC_017436	GAAA	2	8	138795	138802	75 %	0 %	25 %	0 %	385244207
3067	NC_017436	GAA	2	6	138823	138828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244207
3068	NC_017436	AGT	2	6	138892	138897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244208
3069	NC_017436	TTA	2	6	138936	138941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244208
3070	NC_017436	GA	3	6	138980	138985	50 %	0 %	50 %	0 %	385244208
3071	NC_017436	AAG	2	6	139011	139016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244208
3072	NC_017436	T	6	6	139188	139193	0 %	100 %	0 %	0 %	385244208
3073	NC_017436	AGG	2	6	139267	139272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244208
3074	NC_017436	A	6	6	139277	139282	100 %	0 %	0 %	0 %	385244208
3075	NC_017436	TTA	2	6	139341	139346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244208
3076	NC_017436	TAA	2	6	139444	139449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244209
3077	NC_017436	GAGTTA	2	12	139484	139495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385244209
3078	NC_017436	AAGA	2	8	139566	139573	75 %	0 %	25 %	0 %	385244209
3079	NC_017436	AG	3	6	139615	139620	50 %	0 %	50 %	0 %	385244209
3080	NC_017436	GAA	2	6	139627	139632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244209
3081	NC_017436	TTA	2	6	139722	139727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244209
3082	NC_017436	GTT	2	6	139757	139762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385244209
3083	NC_017436	AGA	2	6	139822	139827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244209
3084	NC_017436	TCCAG	2	10	139849	139858	20 %	20 %	20 %	40 %	385244209
3085	NC_017436	GAA	2	6	139900	139905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244210
3086	NC_017436	ATTG	2	8	139909	139916	25 %	50 %	25 %	0 %	385244210
3087	NC_017436	ATT	2	6	139943	139948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244210
3088	NC_017436	AAG	2	6	140004	140009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244210
3089	NC_017436	CTT	2	6	140021	140026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244210
3090	NC_017436	GCA	2	6	140060	140065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385244210
3091	NC_017436	CCTA	2	8	140070	140077	25 %	25 %	0 %	50 %	385244210
3092	NC_017436	GCT	2	6	140096	140101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244210
3093	NC_017436	TCA	2	6	140361	140366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244210
3094	NC_017436	TAA	2	6	140470	140475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244210
3095	NC_017436	GTACA	2	10	140580	140589	40 %	20 %	20 %	20 %	385244210
3096	NC_017436	AGA	2	6	140611	140616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244210
3097	NC_017436	GAA	2	6	140795	140800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244210
3098	NC_017436	TAA	2	6	140929	140934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385244210
3099	NC_017436	TAGAT	2	10	140953	140962	40 %	40 %	20 %	0 %	385244210
3100	NC_017436	TAT	2	6	140963	140968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244210
3101	NC_017436	CTCC	2	8	140969	140976	0 %	25 %	0 %	75 %	385244210
3102	NC_017436	CTG	2	6	140985	140990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385244210
3103	NC_017436	CCT	2	6	141029	141034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244210
3104	NC_017436	TAT	2	6	141035	141040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385244210
3105	NC_017436	TGG	2	6	141130	141135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385244210
3106	NC_017436	TCA	2	6	141157	141162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244210
3107	NC_017436	TCT	2	6	141187	141192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244210
3108	NC_017436	ATTA	2	8	141206	141213	50 %	50 %	0 %	0 %	385244210
3109	NC_017436	T	8	8	141275	141282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_017436	T	6	6	141320	141325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_017436	AAG	2	6	141329	141334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_017436	AAAAG	2	10	141365	141374	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_017436	T	6	6	141389	141394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_017436	GCT	2	6	141425	141430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_017436	A	6	6	141441	141446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_017436	ATC	2	6	141449	141454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_017436	A	6	6	141498	141503	100 %	0 %	0 %	0 %	385244211
3118	NC_017436	CTC	2	6	141648	141653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385244211
3119	NC_017436	AAAAC	2	10	141845	141854	80 %	0 %	0 %	20 %	385244211
3120	NC_017436	AGA	2	6	141999	142004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244212
3121	NC_017436	TGGAAA	2	12	142037	142048	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385244212
3122	NC_017436	GGA	2	6	142173	142178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385244212
3123	NC_017436	AGAA	2	8	142237	142244	75 %	0 %	25 %	0 %	385244212
3124	NC_017436	CTT	2	6	142274	142279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385244212
3125	NC_017436	AAGA	2	8	142296	142303	75 %	0 %	25 %	0 %	385244212
3126	NC_017436	A	6	6	142308	142313	100 %	0 %	0 %	0 %	385244212
3127	NC_017436	AT	3	6	142376	142381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_017436	CTT	2	6	142403	142408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_017436	AAG	2	6	142413	142418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385244213
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3134	NC_017436	TCA	2	6	142576	142581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385244213
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