MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC chromosome

Total Repeats: 22956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_017434	ACT	2	6	182621	182626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243364
4003	NC_017434	GAT	2	6	182650	182655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243364
4004	NC_017434	GA	3	6	182676	182681	50 %	0 %	50 %	0 %	385243364
4005	NC_017434	GCG	2	6	182684	182689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385243364
4006	NC_017434	ACT	2	6	182732	182737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243364
4007	NC_017434	TAG	2	6	182766	182771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243364
4008	NC_017434	TCGC	2	8	182864	182871	0 %	25 %	25 %	50 %	385243365
4009	NC_017434	AGA	2	6	182875	182880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243365
4010	NC_017434	GCA	2	6	182884	182889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243365
4011	NC_017434	TA	3	6	182919	182924	50 %	50 %	0 %	0 %	385243365
4012	NC_017434	GAA	2	6	182954	182959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243365
4013	NC_017434	AGA	2	6	182993	182998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243365
4014	NC_017434	GA	3	6	183032	183037	50 %	0 %	50 %	0 %	385243365
4015	NC_017434	GTT	2	6	183049	183054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243365
4016	NC_017434	GTT	2	6	183084	183089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243365
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4019	NC_017434	GTT	2	6	183146	183151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243365
4020	NC_017434	GAG	2	6	183167	183172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243365
4021	NC_017434	GAA	2	6	183187	183192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243365
4022	NC_017434	TTG	2	6	183198	183203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243365
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4028	NC_017434	GTTG	2	8	183511	183518	0 %	50 %	50 %	0 %	385243365
4029	NC_017434	GGA	3	9	183526	183534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243365
4030	NC_017434	TC	3	6	183542	183547	0 %	50 %	0 %	50 %	385243365
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4036	NC_017434	TAT	2	6	183734	183739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017434	GA	3	6	183774	183779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017434	AGA	2	6	183816	183821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243366
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4054	NC_017434	TCTA	2	8	185028	185035	25 %	50 %	0 %	25 %	385243367
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4056	NC_017434	TGC	2	6	185229	185234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243368
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4061	NC_017434	T	7	7	185519	185525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017434	T	6	6	185531	185536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017434	T	7	7	185581	185587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017434	A	7	7	185603	185609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017434	T	6	6	185626	185631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017434	T	7	7	185721	185727	0 %	100 %	0 %	0 %	385243369
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4069	NC_017434	GTC	2	6	185846	185851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243369
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4095	NC_017434	A	6	6	186809	186814	100 %	0 %	0 %	0 %	385243369
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4099	NC_017434	TAG	2	6	187241	187246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243369
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4102	NC_017434	TTA	2	6	187314	187319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243369
4103	NC_017434	ATC	2	6	187321	187326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_017434	CGATA	2	10	187349	187358	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4105	NC_017434	T	6	6	187362	187367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017434	TCC	2	6	187382	187387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243370
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4108	NC_017434	AGT	2	6	187406	187411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243370
4109	NC_017434	AAAC	2	8	187431	187438	75 %	0 %	0 %	25 %	385243370
4110	NC_017434	TGC	2	6	187497	187502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243370
4111	NC_017434	AGT	2	6	187565	187570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243370
4112	NC_017434	AGT	2	6	187588	187593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243370
4113	NC_017434	TTG	2	6	187596	187601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243370
4114	NC_017434	TAT	2	6	187676	187681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017434	T	6	6	187695	187700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017434	GCA	2	6	187748	187753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_017434	CTT	2	6	187763	187768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_017434	GGAC	2	8	187790	187797	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4119	NC_017434	AAG	2	6	187900	187905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017434	TTG	2	6	187922	187927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017434	CAT	2	6	187932	187937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_017434	T	7	7	187971	187977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_017434	TAA	2	6	188050	188055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017434	TTG	2	6	188078	188083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_017434	CTC	2	6	188153	188158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243371
4126	NC_017434	CAC	2	6	188199	188204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385243371
4127	NC_017434	TAC	2	6	188280	188285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243371
4128	NC_017434	CAT	2	6	188296	188301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243371
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4130	NC_017434	CCT	2	6	188404	188409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243371
4131	NC_017434	CCT	2	6	188419	188424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243371
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4135	NC_017434	G	9	9	188578	188586	0 %	0 %	100 %	0 %	385243372
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4155	NC_017434	GAC	2	6	189314	189319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243372
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4221	NC_017434	AAG	2	6	192793	192798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4231	NC_017434	TGCT	2	8	193190	193197	0 %	50 %	25 %	25 %	385243376
4232	NC_017434	ACA	2	6	193242	193247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243376
4233	NC_017434	AGCAAC	2	12	193254	193265	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385243376
4234	NC_017434	GTA	2	6	193294	193299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243376
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4244	NC_017434	GATTA	2	10	193811	193820	40 %	40 %	20 %	0 %	385243376
4245	NC_017434	T	6	6	193908	193913	0 %	100 %	0 %	0 %	385243376
4246	NC_017434	ATT	2	6	193936	193941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243376
4247	NC_017434	ATC	2	6	194059	194064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243376
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4499	NC_017434	GTC	2	6	205666	205671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243390
4500	NC_017434	ATG	2	6	205675	205680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243390

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