MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC chromosome

Total Repeats: 22956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017434	AGA	2	6	588300	588305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243718
13002	NC_017434	TTC	2	6	588329	588334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243718
13003	NC_017434	ATA	2	6	588398	588403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243719
13004	NC_017434	AG	3	6	588415	588420	50 %	0 %	50 %	0 %	385243719
13005	NC_017434	AGG	2	6	588425	588430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243719
13006	NC_017434	ATT	2	6	588463	588468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243719
13007	NC_017434	CAT	2	6	588588	588593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243719
13008	NC_017434	TCC	2	6	588622	588627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243719
13009	NC_017434	T	6	6	588653	588658	0 %	100 %	0 %	0 %	385243719
13010	NC_017434	AGC	2	6	588661	588666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243719
13011	NC_017434	AAACT	2	10	588764	588773	60 %	20 %	0 %	20 %	385243719
13012	NC_017434	CCT	2	6	588779	588784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243719
13013	NC_017434	AAC	2	6	588787	588792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243719
13014	NC_017434	ACA	2	6	588796	588801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243719
13015	NC_017434	GAC	2	6	588808	588813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243719
13016	NC_017434	CT	3	6	588900	588905	0 %	50 %	0 %	50 %	385243720
13017	NC_017434	CTA	2	6	588926	588931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243720
13018	NC_017434	CTC	2	6	588950	588955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243720
13019	NC_017434	AAC	2	6	588963	588968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243720
13020	NC_017434	T	6	6	589036	589041	0 %	100 %	0 %	0 %	385243720
13021	NC_017434	CAT	2	6	589109	589114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243720
13022	NC_017434	TA	3	6	589235	589240	50 %	50 %	0 %	0 %	385243720
13023	NC_017434	T	6	6	589278	589283	0 %	100 %	0 %	0 %	385243721
13024	NC_017434	GCT	2	6	589294	589299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243721
13025	NC_017434	ACG	2	6	589311	589316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243721
13026	NC_017434	AACT	2	8	589401	589408	50 %	25 %	0 %	25 %	385243721
13027	NC_017434	TCTA	2	8	589644	589651	25 %	50 %	0 %	25 %	385243721
13028	NC_017434	AACA	2	8	589671	589678	75 %	0 %	0 %	25 %	385243721
13029	NC_017434	CTT	2	6	589706	589711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243721
13030	NC_017434	TCA	2	6	589759	589764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243721
13031	NC_017434	ACCAA	2	10	589856	589865	60 %	0 %	0 %	40 %	385243722
13032	NC_017434	CGC	2	6	589877	589882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385243722
13033	NC_017434	GAG	2	6	589925	589930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243722
13034	NC_017434	TGC	2	6	589977	589982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243722
13035	NC_017434	CCT	2	6	589995	590000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243722
13036	NC_017434	AC	3	6	590012	590017	50 %	0 %	0 %	50 %	385243722
13037	NC_017434	TCT	2	6	590047	590052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243722
13038	NC_017434	TCT	2	6	590092	590097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243722
13039	NC_017434	TGC	2	6	590125	590130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243722
13040	NC_017434	CTT	2	6	590282	590287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243723
13041	NC_017434	ATTC	2	8	590360	590367	25 %	50 %	0 %	25 %	385243723
13042	NC_017434	ATC	2	6	590417	590422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243723
13043	NC_017434	CATA	2	8	590524	590531	50 %	25 %	0 %	25 %	385243723
13044	NC_017434	TTA	2	6	590707	590712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243723
13045	NC_017434	TCT	2	6	590716	590721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243723
13046	NC_017434	TCTT	2	8	590773	590780	0 %	75 %	0 %	25 %	385243723
13047	NC_017434	TA	3	6	590791	590796	50 %	50 %	0 %	0 %	385243723
13048	NC_017434	T	7	7	590798	590804	0 %	100 %	0 %	0 %	385243723
13049	NC_017434	TC	4	8	590826	590833	0 %	50 %	0 %	50 %	385243724
13050	NC_017434	GAA	2	6	590851	590856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243724
13051	NC_017434	TC	3	6	590894	590899	0 %	50 %	0 %	50 %	385243724
13052	NC_017434	ACGT	2	8	590943	590950	25 %	25 %	25 %	25 %	385243724
13053	NC_017434	GAG	2	6	590963	590968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243724
13054	NC_017434	T	6	6	591019	591024	0 %	100 %	0 %	0 %	385243724
13055	NC_017434	AAC	2	6	591065	591070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243724
13056	NC_017434	AGCA	2	8	591105	591112	50 %	0 %	25 %	25 %	385243724
13057	NC_017434	ATC	2	6	591267	591272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243725
13058	NC_017434	GAT	2	6	591273	591278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243725
13059	NC_017434	AAC	2	6	591360	591365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243725
13060	NC_017434	CTT	2	6	591372	591377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243725
13061	NC_017434	ATCAC	2	10	591418	591427	40 %	20 %	0 %	40 %	385243725
13062	NC_017434	CGA	2	6	591445	591450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243725
13063	NC_017434	TAT	2	6	591494	591499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243725
13064	NC_017434	ACT	2	6	591546	591551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243726
13065	NC_017434	CTT	2	6	591627	591632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243726
13066	NC_017434	ATA	2	6	591655	591660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243726
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13068	NC_017434	AAC	3	9	591721	591729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243726
13069	NC_017434	T	6	6	591732	591737	0 %	100 %	0 %	0 %	385243726
13070	NC_017434	TGA	2	6	591745	591750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243726
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13072	NC_017434	T	7	7	591813	591819	0 %	100 %	0 %	0 %	385243727
13073	NC_017434	TGA	2	6	591870	591875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243727
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13076	NC_017434	AG	3	6	591922	591927	50 %	0 %	50 %	0 %	385243727
13077	NC_017434	T	6	6	591929	591934	0 %	100 %	0 %	0 %	385243727
13078	NC_017434	TC	3	6	591973	591978	0 %	50 %	0 %	50 %	385243727
13079	NC_017434	TAA	2	6	591989	591994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243727
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13086	NC_017434	GGC	2	6	592295	592300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385243728
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13088	NC_017434	CAA	2	6	592349	592354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243728
13089	NC_017434	CTG	2	6	592392	592397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243728
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13091	NC_017434	CA	3	6	592438	592443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13092	NC_017434	GCA	2	6	592467	592472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243729
13093	NC_017434	AGC	2	6	592481	592486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243729
13094	NC_017434	CTT	2	6	592514	592519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243729
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13096	NC_017434	CCGA	2	8	592642	592649	25 %	0 %	25 %	50 %	385243729
13097	NC_017434	GAAA	2	8	592748	592755	75 %	0 %	25 %	0 %	385243729
13098	NC_017434	CGA	2	6	592789	592794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243729
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13101	NC_017434	GCA	2	6	592980	592985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243729
13102	NC_017434	AAG	2	6	592993	592998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243729
13103	NC_017434	TCT	2	6	593002	593007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243729
13104	NC_017434	ATT	2	6	593060	593065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243729
13105	NC_017434	CT	3	6	593155	593160	0 %	50 %	0 %	50 %	385243730
13106	NC_017434	CAA	2	6	593164	593169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243730
13107	NC_017434	T	6	6	593339	593344	0 %	100 %	0 %	0 %	385243730
13108	NC_017434	CAA	2	6	593395	593400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243730
13109	NC_017434	TCA	2	6	593413	593418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243730
13110	NC_017434	GTAT	2	8	593455	593462	25 %	50 %	25 %	0 %	385243730
13111	NC_017434	T	6	6	593507	593512	0 %	100 %	0 %	0 %	385243731
13112	NC_017434	TTG	2	6	593536	593541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243731
13113	NC_017434	GA	3	6	593542	593547	50 %	0 %	50 %	0 %	385243731
13114	NC_017434	ACG	2	6	593657	593662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243731
13115	NC_017434	TCT	2	6	593686	593691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243731
13116	NC_017434	TGA	2	6	593727	593732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243731
13117	NC_017434	CAA	2	6	593734	593739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243731
13118	NC_017434	TTA	2	6	593801	593806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243732
13119	NC_017434	CAC	2	6	593889	593894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385243732
13120	NC_017434	CGA	2	6	593960	593965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243732
13121	NC_017434	AC	3	6	593984	593989	50 %	0 %	0 %	50 %	385243732
13122	NC_017434	TTCA	2	8	594037	594044	25 %	50 %	0 %	25 %	385243732
13123	NC_017434	GAT	2	6	594100	594105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243732
13124	NC_017434	GCA	2	6	594208	594213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243732
13125	NC_017434	CTTC	2	8	594230	594237	0 %	50 %	0 %	50 %	385243732
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13182	NC_017434	A	6	6	596769	596774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13236	NC_017434	CT	4	8	598849	598856	0 %	50 %	0 %	50 %	385243738
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13240	NC_017434	ACG	2	6	599102	599107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243738
13241	NC_017434	CACC	2	8	599164	599171	25 %	0 %	0 %	75 %	385243738
13242	NC_017434	ACA	2	6	599238	599243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243738
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13492	NC_017434	AC	3	6	611134	611139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13493	NC_017434	CCT	2	6	611186	611191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243751
13494	NC_017434	TCT	2	6	611259	611264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243751
13495	NC_017434	TTC	2	6	611288	611293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243751
13496	NC_017434	TGCCA	2	10	611320	611329	20 %	20 %	20 %	40 %	385243751
13497	NC_017434	GTA	2	6	611379	611384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243751
13498	NC_017434	CT	3	6	611385	611390	0 %	50 %	0 %	50 %	385243751
13499	NC_017434	GATT	2	8	611469	611476	25 %	50 %	25 %	0 %	385243751
13500	NC_017434	TCT	2	6	611496	611501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243751

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