MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC chromosome

Total Repeats: 22956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_017434	CTT	2	6	566154	566159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243696
12503	NC_017434	CGTC	2	8	566161	566168	0 %	25 %	25 %	50 %	385243696
12504	NC_017434	CCA	2	6	566188	566193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12505	NC_017434	A	6	6	566195	566200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_017434	A	6	6	566208	566213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_017434	ATT	2	6	566217	566222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_017434	A	6	6	566223	566228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_017434	ACAA	2	8	566234	566241	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12510	NC_017434	ATT	2	6	566249	566254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_017434	AAT	2	6	566260	566265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_017434	ATTTT	2	10	566272	566281	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_017434	AAAAAT	2	12	566292	566303	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_017434	A	6	6	566318	566323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_017434	TTG	2	6	566387	566392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243697
12516	NC_017434	CCT	2	6	566428	566433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243697
12517	NC_017434	AAAG	2	8	566488	566495	75 %	0 %	25 %	0 %	385243697
12518	NC_017434	CTA	2	6	566536	566541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243697
12519	NC_017434	ATC	2	6	566593	566598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243697
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12522	NC_017434	TTC	2	6	566782	566787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243698
12523	NC_017434	ATCA	2	8	566923	566930	50 %	25 %	0 %	25 %	385243698
12524	NC_017434	TCC	2	6	566956	566961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243698
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12530	NC_017434	GAG	2	6	567348	567353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243698
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12532	NC_017434	ACG	2	6	567616	567621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243698
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12535	NC_017434	TCA	2	6	567740	567745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243698
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12537	NC_017434	TCT	2	6	567911	567916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243698
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12540	NC_017434	CGA	2	6	568066	568071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243699
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12543	NC_017434	T	6	6	568121	568126	0 %	100 %	0 %	0 %	385243699
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12549	NC_017434	TCT	2	6	568372	568377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243699
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12552	NC_017434	ACAG	2	8	568674	568681	50 %	0 %	25 %	25 %	385243700
12553	NC_017434	TTC	2	6	568733	568738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243700
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12555	NC_017434	TAA	3	9	568775	568783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243700
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12557	NC_017434	GCA	2	6	568851	568856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243700
12558	NC_017434	CT	3	6	568940	568945	0 %	50 %	0 %	50 %	385243700
12559	NC_017434	TAA	2	6	568999	569004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243700
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12562	NC_017434	GCT	3	9	569146	569154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243700
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12575	NC_017434	A	7	7	569965	569971	100 %	0 %	0 %	0 %	385243700
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12599	NC_017434	T	6	6	571217	571222	0 %	100 %	0 %	0 %	385243700
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12602	NC_017434	AACCC	2	10	571361	571370	40 %	0 %	0 %	60 %	385243701
12603	NC_017434	TTC	2	6	571413	571418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243701
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12608	NC_017434	AATA	2	8	571482	571489	75 %	25 %	0 %	0 %	385243701
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12622	NC_017434	CAGA	2	8	572191	572198	50 %	0 %	25 %	25 %	385243701
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12995	NC_017434	T	6	6	587872	587877	0 %	100 %	0 %	0 %	385243717
12996	NC_017434	GCA	2	6	587989	587994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243718
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12998	NC_017434	TCTT	2	8	588072	588079	0 %	75 %	0 %	25 %	385243718
12999	NC_017434	GTTGT	2	10	588131	588140	0 %	60 %	40 %	0 %	385243718
13000	NC_017434	TTC	2	6	588144	588149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243718

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