MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC chromosome

Total Repeats: 22956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_017434	TTG	2	6	521003	521008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243656
11503	NC_017434	CT	3	6	521165	521170	0 %	50 %	0 %	50 %	385243656
11504	NC_017434	AAG	2	6	521212	521217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243656
11505	NC_017434	CT	3	6	521258	521263	0 %	50 %	0 %	50 %	385243656
11506	NC_017434	GAG	2	6	521350	521355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243656
11507	NC_017434	CTT	2	6	521427	521432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243656
11508	NC_017434	AGA	2	6	521492	521497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243656
11509	NC_017434	CTG	2	6	521503	521508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243656
11510	NC_017434	TCA	2	6	521595	521600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243656
11511	NC_017434	TAA	2	6	521630	521635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243656
11512	NC_017434	CCT	2	6	521676	521681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243656
11513	NC_017434	TCT	2	6	521863	521868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243656
11514	NC_017434	TAC	2	6	521879	521884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243656
11515	NC_017434	TGT	2	6	522069	522074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243656
11516	NC_017434	AGC	2	6	522080	522085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243656
11517	NC_017434	TTC	2	6	522086	522091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243656
11518	NC_017434	GCC	2	6	522363	522368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385243656
11519	NC_017434	AACT	2	8	522488	522495	50 %	25 %	0 %	25 %	385243656
11520	NC_017434	AGC	2	6	522506	522511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243656
11521	NC_017434	AAC	2	6	522534	522539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243656
11522	NC_017434	GA	3	6	522577	522582	50 %	0 %	50 %	0 %	385243656
11523	NC_017434	CAA	2	6	522595	522600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243656
11524	NC_017434	AAG	2	6	522661	522666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243656
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11526	NC_017434	CTTC	2	8	522688	522695	0 %	50 %	0 %	50 %	385243656
11527	NC_017434	TGT	2	6	522705	522710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243656
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11529	NC_017434	TTG	2	6	522919	522924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243656
11530	NC_017434	AAAG	2	8	522978	522985	75 %	0 %	25 %	0 %	385243656
11531	NC_017434	AAG	2	6	523000	523005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243656
11532	NC_017434	AAC	2	6	523028	523033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243656
11533	NC_017434	TC	3	6	523036	523041	0 %	50 %	0 %	50 %	385243656
11534	NC_017434	ACA	2	6	523062	523067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243656
11535	NC_017434	AATA	2	8	523121	523128	75 %	25 %	0 %	0 %	385243656
11536	NC_017434	TCT	2	6	523137	523142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243656
11537	NC_017434	TGC	2	6	523185	523190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243656
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11539	NC_017434	AAT	3	9	523388	523396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243656
11540	NC_017434	AGC	2	6	523485	523490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11541	NC_017434	GAAG	2	8	523493	523500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_017434	AT	3	6	523519	523524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_017434	AAAG	2	8	523532	523539	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_017434	T	6	6	523580	523585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_017434	TTGGA	2	10	523603	523612	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_017434	T	6	6	523626	523631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_017434	ACA	2	6	523634	523639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11548	NC_017434	AACC	2	8	523667	523674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11549	NC_017434	A	7	7	523738	523744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_017434	T	6	6	523760	523765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_017434	A	7	7	523811	523817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_017434	AGA	2	6	523864	523869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243657
11553	NC_017434	AAAG	2	8	523877	523884	75 %	0 %	25 %	0 %	385243657
11554	NC_017434	CAA	2	6	523933	523938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243657
11555	NC_017434	GAACT	2	10	524090	524099	40 %	20 %	20 %	20 %	385243657
11556	NC_017434	TTG	2	6	524121	524126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243657
11557	NC_017434	ACTC	2	8	524158	524165	25 %	25 %	0 %	50 %	385243657
11558	NC_017434	TCA	2	6	524194	524199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11559	NC_017434	A	7	7	524204	524210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_017434	CTAA	2	8	524225	524232	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11561	NC_017434	AAT	2	6	524249	524254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_017434	ACTT	2	8	524259	524266	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11563	NC_017434	GCT	2	6	524350	524355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11564	NC_017434	CAAAA	2	10	524369	524378	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11565	NC_017434	AGA	2	6	524427	524432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_017434	ATA	2	6	524461	524466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_017434	CTA	2	6	524535	524540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11568	NC_017434	CTTTAG	2	12	524645	524656	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385243658
11569	NC_017434	TCCC	2	8	524698	524705	0 %	25 %	0 %	75 %	385243658
11570	NC_017434	CAT	3	9	524718	524726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243658
11571	NC_017434	TCG	2	6	524736	524741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243658
11572	NC_017434	TTG	2	6	524822	524827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243658
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11579	NC_017434	A	7	7	525157	525163	100 %	0 %	0 %	0 %	385243658
11580	NC_017434	CAA	2	6	525373	525378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243658
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11582	NC_017434	GTC	2	6	525462	525467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243659
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11588	NC_017434	TTCT	2	8	525723	525730	0 %	75 %	0 %	25 %	385243659
11589	NC_017434	CTT	2	6	525731	525736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243659
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11591	NC_017434	TCC	2	6	525847	525852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243659
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11594	NC_017434	CTT	2	6	525953	525958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243659
11595	NC_017434	A	6	6	525975	525980	100 %	0 %	0 %	0 %	385243659
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11597	NC_017434	ATCT	2	8	526043	526050	25 %	50 %	0 %	25 %	385243659
11598	NC_017434	CTT	2	6	526059	526064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243659
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11602	NC_017434	TCC	2	6	526288	526293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243659
11603	NC_017434	GAT	2	6	526321	526326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243659
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11605	NC_017434	AAG	2	6	526464	526469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243660
11606	NC_017434	AGA	2	6	526477	526482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243660
11607	NC_017434	CCT	2	6	526496	526501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243660
11608	NC_017434	TTTC	2	8	526503	526510	0 %	75 %	0 %	25 %	385243660
11609	NC_017434	AAG	2	6	526581	526586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243660
11610	NC_017434	TCT	2	6	526734	526739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243660
11611	NC_017434	ACG	2	6	526768	526773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243660
11612	NC_017434	CCTC	2	8	526783	526790	0 %	25 %	0 %	75 %	385243660
11613	NC_017434	CAA	2	6	526850	526855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243660
11614	NC_017434	AG	3	6	526856	526861	50 %	0 %	50 %	0 %	385243660
11615	NC_017434	AGA	2	6	527023	527028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243661
11616	NC_017434	AAGC	2	8	527045	527052	50 %	0 %	25 %	25 %	385243661
11617	NC_017434	TAT	2	6	527073	527078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243661
11618	NC_017434	CAT	2	6	527109	527114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243661
11619	NC_017434	AGCT	2	8	527147	527154	25 %	25 %	25 %	25 %	385243661
11620	NC_017434	ATTC	2	8	527174	527181	25 %	50 %	0 %	25 %	385243661
11621	NC_017434	TGC	2	6	527238	527243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243661
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11623	NC_017434	GGAG	2	8	527278	527285	25 %	0 %	75 %	0 %	385243661
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11744	NC_017434	ACACC	2	10	532554	532563	40 %	0 %	0 %	60 %	385243664
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