MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC chromosome

Total Repeats: 22956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_017434	TTC	2	6	498552	498557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243636
11003	NC_017434	CTT	2	6	498571	498576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243636
11004	NC_017434	CGT	3	9	498577	498585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243636
11005	NC_017434	CTC	2	6	498587	498592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243636
11006	NC_017434	GAA	2	6	498596	498601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243636
11007	NC_017434	TC	3	6	498610	498615	0 %	50 %	0 %	50 %	385243636
11008	NC_017434	CTC	3	9	498709	498717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243636
11009	NC_017434	TTC	3	9	498734	498742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243636
11010	NC_017434	GAA	2	6	498771	498776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243636
11011	NC_017434	CGT	2	6	498807	498812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243636
11012	NC_017434	GTC	2	6	498852	498857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243636
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11016	NC_017434	TCT	2	6	499047	499052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243636
11017	NC_017434	AAACTG	2	12	499061	499072	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385243636
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11019	NC_017434	ATG	2	6	499092	499097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243636
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11021	NC_017434	TCT	2	6	499267	499272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243636
11022	NC_017434	TTC	2	6	499322	499327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243636
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11024	NC_017434	TCA	2	6	499425	499430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243636
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11026	NC_017434	GTC	2	6	499497	499502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243636
11027	NC_017434	CT	4	8	499541	499548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11028	NC_017434	ACC	2	6	499594	499599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385243637
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11032	NC_017434	ATC	2	6	499826	499831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243637
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11036	NC_017434	A	6	6	499973	499978	100 %	0 %	0 %	0 %	385243637
11037	NC_017434	T	6	6	500027	500032	0 %	100 %	0 %	0 %	385243637
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11081	NC_017434	CTA	2	6	502727	502732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11094	NC_017434	CT	3	6	503209	503214	0 %	50 %	0 %	50 %	385243640
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11103	NC_017434	TATT	2	8	503492	503499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_017434	AAG	2	6	503517	503522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_017434	CTT	3	9	503595	503603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243641
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11107	NC_017434	AT	3	6	503627	503632	50 %	50 %	0 %	0 %	385243641
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11116	NC_017434	T	7	7	504216	504222	0 %	100 %	0 %	0 %	385243642
11117	NC_017434	CAAA	2	8	504227	504234	75 %	0 %	0 %	25 %	385243642
11118	NC_017434	AAAG	2	8	504235	504242	75 %	0 %	25 %	0 %	385243642
11119	NC_017434	CTT	2	6	504243	504248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243642
11120	NC_017434	CTT	2	6	504258	504263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243642
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11342	NC_017434	CAAA	2	8	514223	514230	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11343	NC_017434	ATA	2	6	514236	514241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11345	NC_017434	AATA	2	8	514297	514304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11346	NC_017434	AACTAA	2	12	514305	514316	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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11348	NC_017434	AACA	2	8	514337	514344	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11349	NC_017434	ACTA	2	8	514346	514353	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11350	NC_017434	TA	3	6	514352	514357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11351	NC_017434	A	6	6	514378	514383	100 %	0 %	0 %	0 %	385243652
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11365	NC_017434	CTC	2	6	514967	514972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243653
11366	NC_017434	AAG	2	6	515001	515006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243653
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11493	NC_017434	ATA	2	6	520539	520544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243656
11494	NC_017434	CAG	2	6	520613	520618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243656
11495	NC_017434	GTA	2	6	520652	520657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243656
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