MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC chromosome

Total Repeats: 22956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_017434	TTAATT	2	12	318622	318633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243492
7002	NC_017434	GTC	2	6	318638	318643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243492
7003	NC_017434	GAA	2	6	318644	318649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243492
7004	NC_017434	A	6	6	318648	318653	100 %	0 %	0 %	0 %	385243492
7005	NC_017434	A	6	6	318754	318759	100 %	0 %	0 %	0 %	385243492
7006	NC_017434	GAA	2	6	318820	318825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243492
7007	NC_017434	GATG	2	8	318840	318847	25 %	25 %	50 %	0 %	385243492
7008	NC_017434	TTAT	2	8	318874	318881	25 %	75 %	0 %	0 %	385243492
7009	NC_017434	TGA	2	6	318882	318887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243492
7010	NC_017434	TTG	2	6	318899	318904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243492
7011	NC_017434	GCT	2	6	318913	318918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243492
7012	NC_017434	GAG	2	6	318965	318970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243492
7013	NC_017434	A	6	6	319052	319057	100 %	0 %	0 %	0 %	385243492
7014	NC_017434	GTT	2	6	319060	319065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243492
7015	NC_017434	CCT	2	6	319069	319074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243492
7016	NC_017434	A	6	6	319114	319119	100 %	0 %	0 %	0 %	385243492
7017	NC_017434	TCA	2	6	319142	319147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243492
7018	NC_017434	TGA	2	6	319149	319154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243492
7019	NC_017434	TGC	2	6	319164	319169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243492
7020	NC_017434	CT	3	6	319177	319182	0 %	50 %	0 %	50 %	385243492
7021	NC_017434	TTC	2	6	319205	319210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243492
7022	NC_017434	A	6	6	319310	319315	100 %	0 %	0 %	0 %	385243492
7023	NC_017434	GCT	2	6	319363	319368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243492
7024	NC_017434	TGA	2	6	319377	319382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243492
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7027	NC_017434	GAA	2	6	319441	319446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243492
7028	NC_017434	TGA	2	6	319461	319466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243492
7029	NC_017434	AGT	2	6	319482	319487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243492
7030	NC_017434	AAAG	2	8	319569	319576	75 %	0 %	25 %	0 %	385243492
7031	NC_017434	CGT	2	6	319621	319626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243492
7032	NC_017434	TCCT	2	8	319666	319673	0 %	50 %	0 %	50 %	385243492
7033	NC_017434	GCA	2	6	319713	319718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243492
7034	NC_017434	GGA	2	6	319738	319743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243492
7035	NC_017434	GAT	2	6	319803	319808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243492
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7037	NC_017434	CGC	2	6	319870	319875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385243492
7038	NC_017434	TGTGT	2	10	319882	319891	0 %	60 %	40 %	0 %	385243492
7039	NC_017434	TGA	2	6	319896	319901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243492
7040	NC_017434	CAT	3	9	320004	320012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243492
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7042	NC_017434	TTA	2	6	320096	320101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243492
7043	NC_017434	TGC	2	6	320115	320120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243492
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7049	NC_017434	CG	4	8	320425	320432	0 %	0 %	50 %	50 %	385243492
7050	NC_017434	AGA	2	6	320439	320444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243492
7051	NC_017434	GTT	2	6	320449	320454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243492
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7053	NC_017434	TGA	2	6	320523	320528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243492
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7055	NC_017434	TAAAG	2	10	320769	320778	60 %	20 %	20 %	0 %	385243493
7056	NC_017434	GAT	2	6	320779	320784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243493
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7058	NC_017434	TAA	2	6	320892	320897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243493
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7061	NC_017434	T	7	7	321029	321035	0 %	100 %	0 %	0 %	385243493
7062	NC_017434	CTT	2	6	321055	321060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243493
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7064	NC_017434	AAT	2	6	321214	321219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243493
7065	NC_017434	A	6	6	321231	321236	100 %	0 %	0 %	0 %	385243493
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7068	NC_017434	ATGGA	2	10	321394	321403	40 %	20 %	40 %	0 %	385243493
7069	NC_017434	CAA	2	6	321499	321504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243493
7070	NC_017434	CTT	2	6	321521	321526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243493
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7072	NC_017434	CTC	2	6	321556	321561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243493
7073	NC_017434	CAA	2	6	321571	321576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243493
7074	NC_017434	CAT	2	6	321645	321650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7075	NC_017434	A	7	7	321657	321663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_017434	A	7	7	321671	321677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_017434	GCC	2	6	321690	321695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7078	NC_017434	TCAAT	2	10	321726	321735	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7079	NC_017434	A	6	6	321741	321746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_017434	TTG	2	6	321762	321767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7081	NC_017434	A	7	7	321769	321775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_017434	ATA	2	6	321792	321797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_017434	TCA	2	6	321841	321846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243494
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7087	NC_017434	AAAACA	2	12	322108	322119	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385243494
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7089	NC_017434	A	8	8	322263	322270	100 %	0 %	0 %	0 %	385243494
7090	NC_017434	AAG	2	6	322278	322283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243494
7091	NC_017434	CT	4	8	322352	322359	0 %	50 %	0 %	50 %	385243494
7092	NC_017434	GAG	2	6	322386	322391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243494
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7095	NC_017434	T	6	6	322497	322502	0 %	100 %	0 %	0 %	385243494
7096	NC_017434	TA	3	6	322542	322547	50 %	50 %	0 %	0 %	385243494
7097	NC_017434	GCT	2	6	322592	322597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243494
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7101	NC_017434	A	6	6	322752	322757	100 %	0 %	0 %	0 %	385243494
7102	NC_017434	GAGC	2	8	322858	322865	25 %	0 %	50 %	25 %	385243494
7103	NC_017434	CTT	2	6	322867	322872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243494
7104	NC_017434	AT	3	6	322926	322931	50 %	50 %	0 %	0 %	385243494
7105	NC_017434	TAA	2	6	322945	322950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243494
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7107	NC_017434	CTTA	2	8	322998	323005	25 %	50 %	0 %	25 %	385243494
7108	NC_017434	TAA	2	6	323017	323022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243494
7109	NC_017434	CGA	2	6	323023	323028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243494
7110	NC_017434	TAAA	2	8	323100	323107	75 %	25 %	0 %	0 %	385243494
7111	NC_017434	ACG	2	6	323128	323133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243494
7112	NC_017434	AGA	2	6	323221	323226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243494
7113	NC_017434	CAA	2	6	323261	323266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243494
7114	NC_017434	CTC	2	6	323270	323275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243494
7115	NC_017434	AGA	2	6	323278	323283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243494
7116	NC_017434	GGC	2	6	323347	323352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385243494
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7118	NC_017434	CT	3	6	323468	323473	0 %	50 %	0 %	50 %	385243494
7119	NC_017434	ACA	2	6	323479	323484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243494
7120	NC_017434	TTC	2	6	323519	323524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7121	NC_017434	AAAAAG	2	12	323534	323545	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_017434	CCT	4	12	323618	323629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243495
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7124	NC_017434	ACC	2	6	323708	323713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385243495
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7472	NC_017434	TTC	2	6	339526	339531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243508
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7477	NC_017434	CAAG	2	8	339979	339986	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7478	NC_017434	TCCA	2	8	340031	340038	25 %	25 %	0 %	50 %	385243509
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7496	NC_017434	AAT	2	6	340718	340723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243510
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7498	NC_017434	AT	3	6	340854	340859	50 %	50 %	0 %	0 %	385243510
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