MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC chromosome

Total Repeats: 22956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017434	TCT	2	6	274029	274034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243452
6002	NC_017434	TCCCT	2	10	274113	274122	0 %	40 %	0 %	60 %	385243452
6003	NC_017434	ATT	2	6	274131	274136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243452
6004	NC_017434	ATGG	2	8	274144	274151	25 %	25 %	50 %	0 %	385243452
6005	NC_017434	TCTT	2	8	274223	274230	0 %	75 %	0 %	25 %	385243452
6006	NC_017434	ATTT	2	8	274252	274259	25 %	75 %	0 %	0 %	385243452
6007	NC_017434	CAC	2	6	274290	274295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385243452
6008	NC_017434	CAA	2	6	274299	274304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243452
6009	NC_017434	TAT	2	6	274316	274321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243452
6010	NC_017434	TCT	2	6	274403	274408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243452
6011	NC_017434	ATCCT	2	10	274417	274426	20 %	40 %	0 %	40 %	385243452
6012	NC_017434	GAT	2	6	274470	274475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243452
6013	NC_017434	AGA	2	6	274565	274570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243452
6014	NC_017434	TGA	2	6	274629	274634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243453
6015	NC_017434	AGGAG	2	10	274668	274677	40 %	0 %	60 %	0 %	385243453
6016	NC_017434	GCT	2	6	274768	274773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243453
6017	NC_017434	TGGAAT	2	12	274779	274790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243453
6018	NC_017434	AGC	2	6	274794	274799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243453
6019	NC_017434	ATT	2	6	274819	274824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243453
6020	NC_017434	TC	3	6	274844	274849	0 %	50 %	0 %	50 %	385243453
6021	NC_017434	TGC	2	6	274854	274859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243453
6022	NC_017434	GCA	2	6	274879	274884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243453
6023	NC_017434	TAT	2	6	274891	274896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243453
6024	NC_017434	GCT	2	6	274948	274953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243453
6025	NC_017434	CTT	2	6	275056	275061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243453
6026	NC_017434	AAC	2	6	275080	275085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243453
6027	NC_017434	AGA	2	6	275142	275147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243453
6028	NC_017434	AAG	2	6	275183	275188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243453
6029	NC_017434	GCT	2	6	275242	275247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243453
6030	NC_017434	AAC	2	6	275258	275263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243453
6031	NC_017434	CT	3	6	275272	275277	0 %	50 %	0 %	50 %	385243453
6032	NC_017434	ACGA	2	8	275295	275302	50 %	0 %	25 %	25 %	385243453
6033	NC_017434	CTC	2	6	275326	275331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243453
6034	NC_017434	A	7	7	275341	275347	100 %	0 %	0 %	0 %	385243453
6035	NC_017434	TTGTC	2	10	275355	275364	0 %	60 %	20 %	20 %	385243453
6036	NC_017434	GAA	2	6	275368	275373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243453
6037	NC_017434	ATT	2	6	275378	275383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243453
6038	NC_017434	ACG	2	6	275410	275415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243453
6039	NC_017434	ATC	2	6	275444	275449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243453
6040	NC_017434	CTC	2	6	275450	275455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243453
6041	NC_017434	ATA	2	6	275489	275494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243453
6042	NC_017434	A	6	6	275549	275554	100 %	0 %	0 %	0 %	385243453
6043	NC_017434	A	6	6	275639	275644	100 %	0 %	0 %	0 %	385243454
6044	NC_017434	TGGT	2	8	275728	275735	0 %	50 %	50 %	0 %	385243454
6045	NC_017434	TTG	2	6	275748	275753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243454
6046	NC_017434	AAG	2	6	275754	275759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243454
6047	NC_017434	GGAA	2	8	275845	275852	50 %	0 %	50 %	0 %	385243454
6048	NC_017434	TGT	2	6	275854	275859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243454
6049	NC_017434	A	6	6	275887	275892	100 %	0 %	0 %	0 %	385243454
6050	NC_017434	ATG	2	6	275939	275944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243454
6051	NC_017434	TCCG	2	8	275949	275956	0 %	25 %	25 %	50 %	385243454
6052	NC_017434	ACC	2	6	275959	275964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385243454
6053	NC_017434	A	7	7	276025	276031	100 %	0 %	0 %	0 %	385243454
6054	NC_017434	CT	3	6	276056	276061	0 %	50 %	0 %	50 %	385243454
6055	NC_017434	GGA	2	6	276083	276088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243454
6056	NC_017434	AAAG	2	8	276097	276104	75 %	0 %	25 %	0 %	385243454
6057	NC_017434	CTC	2	6	276117	276122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243454
6058	NC_017434	TA	3	6	276179	276184	50 %	50 %	0 %	0 %	385243454
6059	NC_017434	GAA	2	6	276185	276190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243454
6060	NC_017434	GCT	2	6	276233	276238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243454
6061	NC_017434	C	6	6	276285	276290	0 %	0 %	0 %	100 %	385243454
6062	NC_017434	ATT	2	6	276298	276303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243454
6063	NC_017434	CT	3	6	276332	276337	0 %	50 %	0 %	50 %	385243454
6064	NC_017434	ATTGT	2	10	276345	276354	20 %	60 %	20 %	0 %	385243454
6065	NC_017434	AATT	2	8	276391	276398	50 %	50 %	0 %	0 %	385243454
6066	NC_017434	ATT	2	6	276425	276430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243454
6067	NC_017434	A	6	6	276511	276516	100 %	0 %	0 %	0 %	385243454
6068	NC_017434	CAG	2	6	276566	276571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243454
6069	NC_017434	AGA	3	9	276580	276588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243454
6070	NC_017434	AGG	2	6	276595	276600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243454
6071	NC_017434	TTCT	2	8	276601	276608	0 %	75 %	0 %	25 %	385243454
6072	NC_017434	TCC	2	6	276661	276666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243454
6073	NC_017434	GCT	2	6	276671	276676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243454
6074	NC_017434	AAC	2	6	276702	276707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243454
6075	NC_017434	AGCT	2	8	276726	276733	25 %	25 %	25 %	25 %	385243454
6076	NC_017434	TGAT	2	8	276777	276784	25 %	50 %	25 %	0 %	385243454
6077	NC_017434	CTC	2	6	276824	276829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243454
6078	NC_017434	AAG	2	6	276859	276864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243454
6079	NC_017434	CTT	2	6	276876	276881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_017434	TCT	2	6	276882	276887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243455
6081	NC_017434	AAG	2	6	276888	276893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243455
6082	NC_017434	C	6	6	276964	276969	0 %	0 %	0 %	100 %	385243455
6083	NC_017434	CTT	2	6	276985	276990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243455
6084	NC_017434	TA	3	6	277042	277047	50 %	50 %	0 %	0 %	385243455
6085	NC_017434	TCT	2	6	277127	277132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243455
6086	NC_017434	TTG	2	6	277176	277181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243455
6087	NC_017434	AGA	2	6	277244	277249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243455
6088	NC_017434	CCAT	2	8	277304	277311	25 %	25 %	0 %	50 %	385243455
6089	NC_017434	ATT	2	6	277489	277494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243455
6090	NC_017434	AAC	2	6	277495	277500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243455
6091	NC_017434	GCT	2	6	277502	277507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243455
6092	NC_017434	ATT	2	6	277510	277515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243455
6093	NC_017434	CATAG	2	10	277540	277549	40 %	20 %	20 %	20 %	385243455
6094	NC_017434	TC	3	6	277593	277598	0 %	50 %	0 %	50 %	385243455
6095	NC_017434	AAAT	2	8	277625	277632	75 %	25 %	0 %	0 %	385243455
6096	NC_017434	GCT	2	6	277742	277747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243455
6097	NC_017434	AACTT	2	10	277881	277890	40 %	40 %	0 %	20 %	385243455
6098	NC_017434	CCAA	2	8	277905	277912	50 %	0 %	0 %	50 %	385243455
6099	NC_017434	CAA	2	6	277965	277970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243455
6100	NC_017434	CAA	2	6	278040	278045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385243455
6101	NC_017434	CTTC	2	8	278078	278085	0 %	50 %	0 %	50 %	385243455
6102	NC_017434	ATA	2	6	278090	278095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243455
6103	NC_017434	ATAA	2	8	278170	278177	75 %	25 %	0 %	0 %	385243455
6104	NC_017434	GAA	2	6	278193	278198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243455
6105	NC_017434	AAAT	2	8	278206	278213	75 %	25 %	0 %	0 %	385243455
6106	NC_017434	TC	3	6	278224	278229	0 %	50 %	0 %	50 %	385243455
6107	NC_017434	GAA	2	6	278241	278246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243455
6108	NC_017434	TAA	2	6	278323	278328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243455
6109	NC_017434	CAT	2	6	278332	278337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243455
6110	NC_017434	ACG	2	6	278428	278433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243455
6111	NC_017434	CAT	2	6	278649	278654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243455
6112	NC_017434	GGAACA	2	12	278666	278677	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385243455
6113	NC_017434	ATGCT	2	10	278744	278753	20 %	40 %	20 %	20 %	385243455
6114	NC_017434	TCT	2	6	278865	278870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243455
6115	NC_017434	TCC	2	6	278968	278973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243455
6116	NC_017434	CAT	2	6	278988	278993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243455
6117	NC_017434	CTT	2	6	279042	279047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243455
6118	NC_017434	AGA	2	6	279059	279064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243455
6119	NC_017434	CTC	2	6	279092	279097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385243455
6120	NC_017434	GTA	2	6	279121	279126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243455
6121	NC_017434	ATA	2	6	279148	279153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243455
6122	NC_017434	ACC	2	6	279171	279176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385243455
6123	NC_017434	CCAT	2	8	279183	279190	25 %	25 %	0 %	50 %	385243455
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6225	NC_017434	AT	4	8	283988	283995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6241	NC_017434	A	7	7	284731	284737	100 %	0 %	0 %	0 %	385243459
6242	NC_017434	AG	3	6	284798	284803	50 %	0 %	50 %	0 %	385243459
6243	NC_017434	CT	3	6	284840	284845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6244	NC_017434	TAAA	2	8	284864	284871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6245	NC_017434	A	6	6	284869	284874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6497	NC_017434	AAG	2	6	295950	295955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243471
6498	NC_017434	AGC	2	6	295972	295977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243471
6499	NC_017434	AATT	2	8	295991	295998	50 %	50 %	0 %	0 %	385243471
6500	NC_017434	A	6	6	296015	296020	100 %	0 %	0 %	0 %	385243471

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