MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 22971

< Previous12...34353637383940414243444546Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19003	NC_017432	TGC	2	6	861159	861164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243059
19004	NC_017432	A	6	6	861267	861272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19005	NC_017432	T	6	6	861282	861287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19006	NC_017432	TTA	2	6	861294	861299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19007	NC_017432	AGC	2	6	861379	861384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243060
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19013	NC_017432	TTA	2	6	861705	861710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19014	NC_017432	T	7	7	861950	861956	0 %	100 %	0 %	0 %	385243061
19015	NC_017432	GAG	2	6	862007	862012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243061
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19018	NC_017432	T	8	8	862166	862173	0 %	100 %	0 %	0 %	385243061
19019	NC_017432	AG	3	6	862226	862231	50 %	0 %	50 %	0 %	385243061
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19058	NC_017432	T	6	6	863379	863384	0 %	100 %	0 %	0 %	385243062
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19110	NC_017432	AG	3	6	865437	865442	50 %	0 %	50 %	0 %	385243063
19111	NC_017432	CT	3	6	865446	865451	0 %	50 %	0 %	50 %	385243063
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19125	NC_017432	AAG	2	6	866155	866160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385243063
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19128	NC_017432	TTA	2	6	866295	866300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243063
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19133	NC_017432	GACCTG	2	12	866462	866473	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385243064
19134	NC_017432	TAGA	2	8	866513	866520	50 %	25 %	25 %	0 %	385243064
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19136	NC_017432	GAG	2	6	866600	866605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243064
19137	NC_017432	GCT	2	6	866632	866637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243064
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19143	NC_017432	ATGC	2	8	866804	866811	25 %	25 %	25 %	25 %	385243064
19144	NC_017432	AG	3	6	866829	866834	50 %	0 %	50 %	0 %	385243064
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19150	NC_017432	TCT	2	6	867249	867254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243064
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19155	NC_017432	TTTG	2	8	867353	867360	0 %	75 %	25 %	0 %	385243064
19156	NC_017432	TAT	3	9	867392	867400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243064
19157	NC_017432	TA	3	6	867434	867439	50 %	50 %	0 %	0 %	385243064
19158	NC_017432	GT	3	6	867481	867486	0 %	50 %	50 %	0 %	385243064
19159	NC_017432	CAT	2	6	867491	867496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243064
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19161	NC_017432	TTG	2	6	867540	867545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243064
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19174	NC_017432	ATC	2	6	868172	868177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243065
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19197	NC_017432	TAA	2	6	869848	869853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385243066
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19199	NC_017432	TA	3	6	869947	869952	50 %	50 %	0 %	0 %	385243066
19200	NC_017432	GGA	2	6	869967	869972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243066
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19206	NC_017432	CTG	2	6	870163	870168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243067
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19211	NC_017432	TA	3	6	870379	870384	50 %	50 %	0 %	0 %	385243067
19212	NC_017432	GC	3	6	870397	870402	0 %	0 %	50 %	50 %	385243067
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19218	NC_017432	TGC	2	6	871015	871020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243067
19219	NC_017432	TTC	2	6	871030	871035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243067
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19221	NC_017432	GA	3	6	871093	871098	50 %	0 %	50 %	0 %	385243067
19222	NC_017432	AG	3	6	871120	871125	50 %	0 %	50 %	0 %	385243067
19223	NC_017432	GTT	2	6	871221	871226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243067
19224	NC_017432	TCA	2	6	871229	871234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243067
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19226	NC_017432	T	7	7	871335	871341	0 %	100 %	0 %	0 %	385243067
19227	NC_017432	CAGCC	2	10	871390	871399	20 %	0 %	20 %	60 %	385243067
19228	NC_017432	CTTG	2	8	871464	871471	0 %	50 %	25 %	25 %	385243067
19229	NC_017432	CA	4	8	871479	871486	50 %	0 %	0 %	50 %	385243067
19230	NC_017432	CAT	2	6	871570	871575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243067
19231	NC_017432	TTC	2	6	871618	871623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243067
19232	NC_017432	GATA	2	8	871671	871678	50 %	25 %	25 %	0 %	385243067
19233	NC_017432	TCG	2	6	871765	871770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243067
19234	NC_017432	T	6	6	871806	871811	0 %	100 %	0 %	0 %	385243067
19235	NC_017432	GAT	2	6	871917	871922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243067
19236	NC_017432	TC	3	6	871980	871985	0 %	50 %	0 %	50 %	385243067
19237	NC_017432	CTT	2	6	872004	872009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385243067
19238	NC_017432	GTA	2	6	872015	872020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385243067
19239	NC_017432	GTT	2	6	872034	872039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385243067
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19241	NC_017432	GCA	2	6	872087	872092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385243067
19242	NC_017432	CTA	2	6	872103	872108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385243067
19243	NC_017432	GGA	2	6	872119	872124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385243067
19244	NC_017432	GA	3	6	872123	872128	50 %	0 %	50 %	0 %	385243067
19245	NC_017432	GCT	2	6	872168	872173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385243067
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19500	NC_017432	TTA	2	6	886159	886164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385243075

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