MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_017432	TCT	2	6	611225	611230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13502	NC_017432	GAC	2	6	611262	611267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13503	NC_017432	TAC	2	6	611270	611275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13504	NC_017432	ATG	2	6	611287	611292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_017432	A	6	6	611322	611327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_017432	AC	3	6	611395	611400	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13507	NC_017432	CCT	2	6	611447	611452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242850
13508	NC_017432	TCT	2	6	611520	611525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242850
13509	NC_017432	TTC	2	6	611549	611554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242850
13510	NC_017432	TGCCA	2	10	611581	611590	20 %	20 %	20 %	40 %	385242850
13511	NC_017432	GTA	2	6	611640	611645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242850
13512	NC_017432	CT	3	6	611646	611651	0 %	50 %	0 %	50 %	385242850
13513	NC_017432	GATT	2	8	611730	611737	25 %	50 %	25 %	0 %	385242850
13514	NC_017432	TCT	2	6	611757	611762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242850
13515	NC_017432	TC	3	6	611767	611772	0 %	50 %	0 %	50 %	385242850
13516	NC_017432	GGTT	2	8	611813	611820	0 %	50 %	50 %	0 %	385242850
13517	NC_017432	GGATGG	2	12	611825	611836	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385242850
13518	NC_017432	AG	4	8	611878	611885	50 %	0 %	50 %	0 %	385242850
13519	NC_017432	TGG	2	6	611891	611896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242850
13520	NC_017432	ATA	2	6	611916	611921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242850
13521	NC_017432	GGCGC	2	10	611976	611985	0 %	0 %	60 %	40 %	385242850
13522	NC_017432	ATT	2	6	612002	612007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242850
13523	NC_017432	TAT	2	6	612010	612015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242850
13524	NC_017432	ATCG	2	8	612032	612039	25 %	25 %	25 %	25 %	385242850
13525	NC_017432	AGA	2	6	612094	612099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242850
13526	NC_017432	GAA	2	6	612116	612121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242850
13527	NC_017432	AG	3	6	612155	612160	50 %	0 %	50 %	0 %	385242850
13528	NC_017432	CT	3	6	612161	612166	0 %	50 %	0 %	50 %	385242850
13529	NC_017432	TTAC	2	8	612183	612190	25 %	50 %	0 %	25 %	385242850
13530	NC_017432	TAA	2	6	612199	612204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242850
13531	NC_017432	CCT	2	6	612228	612233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242850
13532	NC_017432	TTTA	2	8	612236	612243	25 %	75 %	0 %	0 %	385242850
13533	NC_017432	CT	3	6	612276	612281	0 %	50 %	0 %	50 %	385242850
13534	NC_017432	ATT	2	6	612300	612305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242850
13535	NC_017432	TTTG	2	8	612334	612341	0 %	75 %	25 %	0 %	385242850
13536	NC_017432	ATT	2	6	612352	612357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242850
13537	NC_017432	GGCT	2	8	612374	612381	0 %	25 %	50 %	25 %	385242850
13538	NC_017432	TCT	2	6	612426	612431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242850
13539	NC_017432	ATT	2	6	612439	612444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242850
13540	NC_017432	TGG	2	6	612488	612493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242850
13541	NC_017432	T	6	6	612523	612528	0 %	100 %	0 %	0 %	385242850
13542	NC_017432	ATG	2	6	612545	612550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242850
13543	NC_017432	ATTGG	2	10	612551	612560	20 %	40 %	40 %	0 %	385242850
13544	NC_017432	A	6	6	612581	612586	100 %	0 %	0 %	0 %	385242850
13545	NC_017432	AGC	2	6	612634	612639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242850
13546	NC_017432	TTG	2	6	612696	612701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242850
13547	NC_017432	TCAA	2	8	612861	612868	50 %	25 %	0 %	25 %	385242851
13548	NC_017432	TTG	2	6	612874	612879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242851
13549	NC_017432	CGCT	2	8	612907	612914	0 %	25 %	25 %	50 %	385242851
13550	NC_017432	TTTG	2	8	612932	612939	0 %	75 %	25 %	0 %	385242851
13551	NC_017432	ATC	2	6	612987	612992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242851
13552	NC_017432	A	9	9	613032	613040	100 %	0 %	0 %	0 %	385242851
13553	NC_017432	CTT	2	6	613074	613079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242851
13554	NC_017432	GAA	2	6	613089	613094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242851
13555	NC_017432	TTTG	2	8	613108	613115	0 %	75 %	25 %	0 %	385242851
13556	NC_017432	CTCTC	2	10	613116	613125	0 %	40 %	0 %	60 %	385242851
13557	NC_017432	ATAG	2	8	613161	613168	50 %	25 %	25 %	0 %	385242851
13558	NC_017432	GAA	2	6	613254	613259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242851
13559	NC_017432	AAG	2	6	613300	613305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242851
13560	NC_017432	AGA	2	6	613340	613345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242851
13561	NC_017432	GAA	2	6	613362	613367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242851
13562	NC_017432	AAAAC	2	10	613376	613385	80 %	0 %	0 %	20 %	385242851
13563	NC_017432	AAC	2	6	613405	613410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242851
13564	NC_017432	GCTC	2	8	613505	613512	0 %	25 %	25 %	50 %	385242851
13565	NC_017432	AG	3	6	613539	613544	50 %	0 %	50 %	0 %	385242851
13566	NC_017432	TAG	2	6	613604	613609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242851
13567	NC_017432	ATTTT	2	10	613613	613622	20 %	80 %	0 %	0 %	385242851
13568	NC_017432	GCA	2	6	613653	613658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242851
13569	NC_017432	CTATC	2	10	613733	613742	20 %	40 %	0 %	40 %	385242851
13570	NC_017432	A	8	8	613762	613769	100 %	0 %	0 %	0 %	385242851
13571	NC_017432	AGA	2	6	613781	613786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242851
13572	NC_017432	CTT	2	6	613811	613816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242851
13573	NC_017432	AGA	2	6	613817	613822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242851
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13575	NC_017432	TAT	3	9	613943	613951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242851
13576	NC_017432	ATT	2	6	613992	613997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242851
13577	NC_017432	TTC	2	6	614112	614117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242851
13578	NC_017432	TCA	2	6	614125	614130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242851
13579	NC_017432	CGATAT	3	18	614153	614170	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385242851
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13581	NC_017432	TTA	2	6	614194	614199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242851
13582	NC_017432	ATT	2	6	614241	614246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242851
13583	NC_017432	A	6	6	614445	614450	100 %	0 %	0 %	0 %	385242851
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13587	NC_017432	A	7	7	614670	614676	100 %	0 %	0 %	0 %	385242851
13588	NC_017432	TC	3	6	614728	614733	0 %	50 %	0 %	50 %	385242851
13589	NC_017432	TTC	2	6	614734	614739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242851
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13591	NC_017432	CAT	2	6	614878	614883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242851
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13593	NC_017432	A	6	6	615057	615062	100 %	0 %	0 %	0 %	385242851
13594	NC_017432	GA	3	6	615088	615093	50 %	0 %	50 %	0 %	385242851
13595	NC_017432	TAA	2	6	615185	615190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242851
13596	NC_017432	ACA	2	6	615225	615230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242851
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13601	NC_017432	AG	4	8	615467	615474	50 %	0 %	50 %	0 %	385242851
13602	NC_017432	A	7	7	615475	615481	100 %	0 %	0 %	0 %	385242851
13603	NC_017432	A	6	6	615528	615533	100 %	0 %	0 %	0 %	385242851
13604	NC_017432	TGG	2	6	615559	615564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242851
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13606	NC_017432	A	8	8	615649	615656	100 %	0 %	0 %	0 %	385242851
13607	NC_017432	GCT	2	6	615660	615665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242851
13608	NC_017432	T	7	7	615681	615687	0 %	100 %	0 %	0 %	385242851
13609	NC_017432	TC	3	6	615727	615732	0 %	50 %	0 %	50 %	385242851
13610	NC_017432	GTT	2	6	615764	615769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242851
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13613	NC_017432	GCAGA	2	10	615945	615954	40 %	0 %	40 %	20 %	385242851
13614	NC_017432	A	6	6	615954	615959	100 %	0 %	0 %	0 %	385242851
13615	NC_017432	GAA	2	6	616047	616052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242851
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13618	NC_017432	A	6	6	616215	616220	100 %	0 %	0 %	0 %	385242851
13619	NC_017432	AAAG	2	8	616250	616257	75 %	0 %	25 %	0 %	385242851
13620	NC_017432	AG	3	6	616266	616271	50 %	0 %	50 %	0 %	385242851
13621	NC_017432	TC	3	6	616273	616278	0 %	50 %	0 %	50 %	385242851
13622	NC_017432	TAAA	2	8	616300	616307	75 %	25 %	0 %	0 %	385242851
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13992	NC_017432	TCC	2	6	633046	633051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242866
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13996	NC_017432	ACGGA	2	10	633227	633236	40 %	0 %	40 %	20 %	385242866
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13999	NC_017432	CTT	2	6	633352	633357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242866
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