MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017432	AAG	2	6	587906	587911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242816
13002	NC_017432	AAC	2	6	587942	587947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242816
13003	NC_017432	A	6	6	587989	587994	100 %	0 %	0 %	0 %	385242816
13004	NC_017432	GCAA	2	8	588108	588115	50 %	0 %	25 %	25 %	385242816
13005	NC_017432	T	6	6	588133	588138	0 %	100 %	0 %	0 %	385242816
13006	NC_017432	GCA	2	6	588250	588255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242817
13007	NC_017432	TC	3	6	588314	588319	0 %	50 %	0 %	50 %	385242817
13008	NC_017432	TCTT	2	8	588333	588340	0 %	75 %	0 %	25 %	385242817
13009	NC_017432	GTTGT	2	10	588392	588401	0 %	60 %	40 %	0 %	385242817
13010	NC_017432	TTC	2	6	588405	588410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242817
13011	NC_017432	AGA	2	6	588561	588566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242817
13012	NC_017432	TTC	2	6	588590	588595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242817
13013	NC_017432	ATA	2	6	588659	588664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242818
13014	NC_017432	AG	3	6	588676	588681	50 %	0 %	50 %	0 %	385242818
13015	NC_017432	AGG	2	6	588686	588691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242818
13016	NC_017432	ATT	2	6	588724	588729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242818
13017	NC_017432	CAT	2	6	588849	588854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242818
13018	NC_017432	TCC	2	6	588883	588888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242818
13019	NC_017432	T	6	6	588914	588919	0 %	100 %	0 %	0 %	385242818
13020	NC_017432	AGC	2	6	588922	588927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242818
13021	NC_017432	AAACT	2	10	589025	589034	60 %	20 %	0 %	20 %	385242818
13022	NC_017432	CCT	2	6	589040	589045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242818
13023	NC_017432	AAC	2	6	589048	589053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242818
13024	NC_017432	ACA	2	6	589057	589062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242818
13025	NC_017432	GAC	2	6	589069	589074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242818
13026	NC_017432	CT	3	6	589161	589166	0 %	50 %	0 %	50 %	385242819
13027	NC_017432	CTA	2	6	589187	589192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242819
13028	NC_017432	CTC	2	6	589211	589216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242819
13029	NC_017432	AAC	2	6	589224	589229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242819
13030	NC_017432	T	6	6	589297	589302	0 %	100 %	0 %	0 %	385242819
13031	NC_017432	CAT	2	6	589370	589375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242819
13032	NC_017432	TA	3	6	589496	589501	50 %	50 %	0 %	0 %	385242819
13033	NC_017432	T	6	6	589539	589544	0 %	100 %	0 %	0 %	385242820
13034	NC_017432	GCT	2	6	589555	589560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242820
13035	NC_017432	ACG	2	6	589572	589577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242820
13036	NC_017432	AACT	2	8	589662	589669	50 %	25 %	0 %	25 %	385242820
13037	NC_017432	TCTA	2	8	589905	589912	25 %	50 %	0 %	25 %	385242820
13038	NC_017432	AACA	2	8	589932	589939	75 %	0 %	0 %	25 %	385242820
13039	NC_017432	CTT	2	6	589967	589972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242820
13040	NC_017432	TCA	2	6	590020	590025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242820
13041	NC_017432	ACCAA	2	10	590117	590126	60 %	0 %	0 %	40 %	385242821
13042	NC_017432	CGC	2	6	590138	590143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385242821
13043	NC_017432	GAG	2	6	590186	590191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242821
13044	NC_017432	TGC	2	6	590238	590243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242821
13045	NC_017432	CCT	2	6	590256	590261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242821
13046	NC_017432	AC	3	6	590273	590278	50 %	0 %	0 %	50 %	385242821
13047	NC_017432	TCT	2	6	590308	590313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242821
13048	NC_017432	TCT	2	6	590353	590358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242821
13049	NC_017432	TGC	2	6	590386	590391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242821
13050	NC_017432	CTT	2	6	590543	590548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242822
13051	NC_017432	ATTC	2	8	590621	590628	25 %	50 %	0 %	25 %	385242822
13052	NC_017432	ATC	2	6	590678	590683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242822
13053	NC_017432	CATA	2	8	590785	590792	50 %	25 %	0 %	25 %	385242822
13054	NC_017432	TTA	2	6	590968	590973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242822
13055	NC_017432	TCT	2	6	590977	590982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242822
13056	NC_017432	TCTT	2	8	591034	591041	0 %	75 %	0 %	25 %	385242822
13057	NC_017432	TA	3	6	591052	591057	50 %	50 %	0 %	0 %	385242822
13058	NC_017432	T	7	7	591059	591065	0 %	100 %	0 %	0 %	385242822
13059	NC_017432	TC	4	8	591087	591094	0 %	50 %	0 %	50 %	385242823
13060	NC_017432	GAA	2	6	591112	591117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242823
13061	NC_017432	TC	3	6	591155	591160	0 %	50 %	0 %	50 %	385242823
13062	NC_017432	ACGT	2	8	591204	591211	25 %	25 %	25 %	25 %	385242823
13063	NC_017432	GAG	2	6	591224	591229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242823
13064	NC_017432	T	6	6	591280	591285	0 %	100 %	0 %	0 %	385242823
13065	NC_017432	AAC	2	6	591326	591331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242823
13066	NC_017432	AGCA	2	8	591366	591373	50 %	0 %	25 %	25 %	385242823
13067	NC_017432	ATC	2	6	591528	591533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242824
13068	NC_017432	GAT	2	6	591534	591539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242824
13069	NC_017432	AAC	2	6	591621	591626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242824
13070	NC_017432	CTT	2	6	591633	591638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242824
13071	NC_017432	ATCAC	2	10	591679	591688	40 %	20 %	0 %	40 %	385242824
13072	NC_017432	CGA	2	6	591706	591711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242824
13073	NC_017432	TAT	2	6	591755	591760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242824
13074	NC_017432	ACT	2	6	591807	591812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242825
13075	NC_017432	CTT	2	6	591888	591893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242825
13076	NC_017432	ATA	2	6	591916	591921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242825
13077	NC_017432	ACC	2	6	591938	591943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242825
13078	NC_017432	AAC	3	9	591982	591990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242825
13079	NC_017432	T	6	6	591993	591998	0 %	100 %	0 %	0 %	385242825
13080	NC_017432	TGA	2	6	592006	592011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242825
13081	NC_017432	ACT	2	6	592013	592018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242825
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13083	NC_017432	TGA	2	6	592131	592136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242826
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13086	NC_017432	AG	3	6	592183	592188	50 %	0 %	50 %	0 %	385242826
13087	NC_017432	T	6	6	592190	592195	0 %	100 %	0 %	0 %	385242826
13088	NC_017432	TC	3	6	592234	592239	0 %	50 %	0 %	50 %	385242826
13089	NC_017432	TAA	2	6	592250	592255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242826
13090	NC_017432	T	6	6	592260	592265	0 %	100 %	0 %	0 %	385242826
13091	NC_017432	GCA	2	6	592324	592329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242827
13092	NC_017432	TCT	2	6	592354	592359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242827
13093	NC_017432	ACA	2	6	592402	592407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242827
13094	NC_017432	CAG	2	6	592454	592459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242827
13095	NC_017432	T	6	6	592461	592466	0 %	100 %	0 %	0 %	385242827
13096	NC_017432	GGC	2	6	592556	592561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385242827
13097	NC_017432	ATCC	2	8	592567	592574	25 %	25 %	0 %	50 %	385242827
13098	NC_017432	CAA	2	6	592610	592615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242827
13099	NC_017432	CTG	2	6	592653	592658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242827
13100	NC_017432	ATA	2	6	592690	592695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242827
13101	NC_017432	CA	3	6	592699	592704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13102	NC_017432	GCA	2	6	592728	592733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242828
13103	NC_017432	AGC	2	6	592742	592747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242828
13104	NC_017432	CTT	2	6	592775	592780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242828
13105	NC_017432	AGT	2	6	592823	592828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242828
13106	NC_017432	CCGA	2	8	592903	592910	25 %	0 %	25 %	50 %	385242828
13107	NC_017432	GAAA	2	8	593009	593016	75 %	0 %	25 %	0 %	385242828
13108	NC_017432	CGA	2	6	593050	593055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242828
13109	NC_017432	TTC	2	6	593160	593165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242828
13110	NC_017432	AAC	2	6	593228	593233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242828
13111	NC_017432	GCA	2	6	593241	593246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242828
13112	NC_017432	AAG	2	6	593254	593259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242828
13113	NC_017432	TCT	2	6	593263	593268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242828
13114	NC_017432	ATT	2	6	593321	593326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242828
13115	NC_017432	CT	3	6	593416	593421	0 %	50 %	0 %	50 %	385242829
13116	NC_017432	CAA	2	6	593425	593430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242829
13117	NC_017432	T	6	6	593600	593605	0 %	100 %	0 %	0 %	385242829
13118	NC_017432	CAA	2	6	593656	593661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242829
13119	NC_017432	TCA	2	6	593674	593679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242829
13120	NC_017432	GTAT	2	8	593716	593723	25 %	50 %	25 %	0 %	385242829
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13122	NC_017432	TTG	2	6	593797	593802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242830
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13223	NC_017432	TACA	2	8	597963	597970	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13224	NC_017432	AG	3	6	597977	597982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13225	NC_017432	GCA	2	6	598024	598029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13227	NC_017432	T	6	6	598098	598103	0 %	100 %	0 %	0 %	385242836
13228	NC_017432	AACC	2	8	598117	598124	50 %	0 %	0 %	50 %	385242836
13229	NC_017432	A	7	7	598138	598144	100 %	0 %	0 %	0 %	385242836
13230	NC_017432	TCA	2	6	598155	598160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242836
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13233	NC_017432	TCCC	2	8	598416	598423	0 %	25 %	0 %	75 %	385242836
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13238	NC_017432	CAGA	2	8	598653	598660	50 %	0 %	25 %	25 %	385242836
13239	NC_017432	CCAT	2	8	598667	598674	25 %	25 %	0 %	50 %	385242836
13240	NC_017432	GCT	2	6	598694	598699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242836
13241	NC_017432	GTA	2	6	598713	598718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242836
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13245	NC_017432	CTT	2	6	599062	599067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242837
13246	NC_017432	T	6	6	599066	599071	0 %	100 %	0 %	0 %	385242837
13247	NC_017432	CT	4	8	599110	599117	0 %	50 %	0 %	50 %	385242837
13248	NC_017432	TCT	2	6	599184	599189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242837
13249	NC_017432	GCC	2	6	599284	599289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385242837
13250	NC_017432	TTG	2	6	599304	599309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242837
13251	NC_017432	ACG	2	6	599363	599368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242837
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13254	NC_017432	TG	3	6	599524	599529	0 %	50 %	50 %	0 %	385242837
13255	NC_017432	ATT	2	6	599558	599563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242837
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13261	NC_017432	CAT	2	6	599773	599778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242837
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13274	NC_017432	TCA	2	6	600517	600522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242839
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13280	NC_017432	CTGCTC	2	12	600840	600851	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385242839
13281	NC_017432	CCTG	2	8	600859	600866	0 %	25 %	25 %	50 %	385242839
13282	NC_017432	CAA	2	6	600972	600977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242839
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13284	NC_017432	TAT	2	6	601242	601247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13285	NC_017432	T	12	12	601250	601261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13286	NC_017432	AGCA	2	8	601262	601269	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13287	NC_017432	A	6	6	601279	601284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13288	NC_017432	TAC	2	6	601286	601291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13289	NC_017432	A	7	7	601317	601323	100 %	0 %	0 %	0 %	385242840
13290	NC_017432	TGG	2	6	601330	601335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242840
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13354	NC_017432	CTGT	2	8	604415	604422	0 %	50 %	25 %	25 %	385242843
13355	NC_017432	TACT	2	8	604431	604438	25 %	50 %	0 %	25 %	385242843
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13363	NC_017432	TCC	2	6	604918	604923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242844
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13365	NC_017432	GTAA	2	8	605009	605016	50 %	25 %	25 %	0 %	385242844
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