MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_017432	AGT	2	6	520420	520425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242748
11502	NC_017432	GAA	2	6	520452	520457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242748
11503	NC_017432	GAT	2	6	520467	520472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242748
11504	NC_017432	TTCTG	2	10	520484	520493	0 %	60 %	20 %	20 %	385242748
11505	NC_017432	AT	3	6	520543	520548	50 %	50 %	0 %	0 %	385242748
11506	NC_017432	TTG	2	6	520609	520614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242748
11507	NC_017432	CA	4	8	520659	520666	50 %	0 %	0 %	50 %	385242748
11508	NC_017432	ATCC	2	8	520702	520709	25 %	25 %	0 %	50 %	385242748
11509	NC_017432	ACT	2	6	520763	520768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242748
11510	NC_017432	AAG	2	6	520802	520807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242748
11511	NC_017432	TCA	2	6	520833	520838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242748
11512	NC_017432	TC	4	8	520851	520858	0 %	50 %	0 %	50 %	385242748
11513	NC_017432	GAT	2	6	520930	520935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242748
11514	NC_017432	CAG	2	6	520978	520983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242748
11515	NC_017432	TAG	2	6	521001	521006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242748
11516	NC_017432	ATA	2	6	521150	521155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242748
11517	NC_017432	CAG	2	6	521224	521229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242748
11518	NC_017432	GTA	2	6	521263	521268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242748
11519	NC_017432	CAACA	2	10	521302	521311	60 %	0 %	0 %	40 %	385242748
11520	NC_017432	GA	3	6	521312	521317	50 %	0 %	50 %	0 %	385242748
11521	NC_017432	CTT	2	6	521361	521366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242748
11522	NC_017432	CTCC	2	8	521540	521547	0 %	25 %	0 %	75 %	385242748
11523	NC_017432	T	6	6	521561	521566	0 %	100 %	0 %	0 %	385242748
11524	NC_017432	CTT	2	6	521580	521585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242748
11525	NC_017432	TTG	2	6	521614	521619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242748
11526	NC_017432	CT	3	6	521776	521781	0 %	50 %	0 %	50 %	385242748
11527	NC_017432	AAG	2	6	521823	521828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242748
11528	NC_017432	GAG	2	6	521961	521966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242748
11529	NC_017432	CTT	2	6	522038	522043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242748
11530	NC_017432	AGA	2	6	522103	522108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242748
11531	NC_017432	CTG	2	6	522114	522119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242748
11532	NC_017432	TCA	2	6	522206	522211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242748
11533	NC_017432	TAA	2	6	522241	522246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242748
11534	NC_017432	CCT	2	6	522287	522292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242748
11535	NC_017432	TCT	2	6	522474	522479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242748
11536	NC_017432	TAC	2	6	522490	522495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242748
11537	NC_017432	TGT	2	6	522680	522685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242748
11538	NC_017432	AGC	2	6	522691	522696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242748
11539	NC_017432	TTC	2	6	522697	522702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242748
11540	NC_017432	GCC	2	6	522974	522979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385242748
11541	NC_017432	AACT	2	8	523099	523106	50 %	25 %	0 %	25 %	385242748
11542	NC_017432	AGC	2	6	523117	523122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242748
11543	NC_017432	AAC	2	6	523145	523150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242748
11544	NC_017432	GA	3	6	523188	523193	50 %	0 %	50 %	0 %	385242748
11545	NC_017432	CAA	2	6	523206	523211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242748
11546	NC_017432	AAG	2	6	523272	523277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242748
11547	NC_017432	CTC	2	6	523288	523293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242748
11548	NC_017432	CTTC	2	8	523299	523306	0 %	50 %	0 %	50 %	385242748
11549	NC_017432	TGT	2	6	523316	523321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242748
11550	NC_017432	ATAA	2	8	523520	523527	75 %	25 %	0 %	0 %	385242748
11551	NC_017432	TTG	2	6	523530	523535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242748
11552	NC_017432	AAAG	2	8	523589	523596	75 %	0 %	25 %	0 %	385242748
11553	NC_017432	AAG	2	6	523611	523616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242748
11554	NC_017432	AAC	2	6	523639	523644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242748
11555	NC_017432	TC	3	6	523647	523652	0 %	50 %	0 %	50 %	385242748
11556	NC_017432	ACA	2	6	523673	523678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242748
11557	NC_017432	AATA	2	8	523732	523739	75 %	25 %	0 %	0 %	385242748
11558	NC_017432	TCT	2	6	523748	523753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242748
11559	NC_017432	TGC	2	6	523796	523801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242748
11560	NC_017432	CAAAGC	2	12	523978	523989	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385242748
11561	NC_017432	AAT	3	9	523999	524007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242748
11562	NC_017432	AGC	2	6	524096	524101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11563	NC_017432	GAAG	2	8	524104	524111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_017432	AT	3	6	524130	524135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_017432	AAAG	2	8	524143	524150	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_017432	T	6	6	524191	524196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_017432	TTGGA	2	10	524214	524223	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_017432	T	6	6	524237	524242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_017432	ACA	2	6	524245	524250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11570	NC_017432	AACC	2	8	524278	524285	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11571	NC_017432	A	7	7	524349	524355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_017432	T	6	6	524371	524376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_017432	A	7	7	524422	524428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_017432	AGA	2	6	524475	524480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242749
11575	NC_017432	AAAG	2	8	524488	524495	75 %	0 %	25 %	0 %	385242749
11576	NC_017432	CAA	2	6	524544	524549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242749
11577	NC_017432	GAACT	2	10	524701	524710	40 %	20 %	20 %	20 %	385242749
11578	NC_017432	TTG	2	6	524732	524737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242749
11579	NC_017432	ACTC	2	8	524769	524776	25 %	25 %	0 %	50 %	385242749
11580	NC_017432	TCA	2	6	524805	524810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11581	NC_017432	A	7	7	524815	524821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_017432	CTAA	2	8	524836	524843	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11583	NC_017432	AAT	2	6	524860	524865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_017432	ACTT	2	8	524870	524877	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11585	NC_017432	GCT	2	6	524961	524966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11586	NC_017432	CAAAA	2	10	524980	524989	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11587	NC_017432	AGA	2	6	525038	525043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_017432	ATA	2	6	525072	525077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_017432	CTA	2	6	525146	525151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11590	NC_017432	CTTTAG	2	12	525256	525267	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385242750
11591	NC_017432	TCCC	2	8	525309	525316	0 %	25 %	0 %	75 %	385242750
11592	NC_017432	CAT	3	9	525329	525337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242750
11593	NC_017432	TCG	2	6	525347	525352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242750
11594	NC_017432	TTG	2	6	525433	525438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242750
11595	NC_017432	ATT	2	6	525527	525532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242750
11596	NC_017432	GCA	2	6	525556	525561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242750
11597	NC_017432	CT	3	6	525564	525569	0 %	50 %	0 %	50 %	385242750
11598	NC_017432	ACA	2	6	525640	525645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242750
11599	NC_017432	CCT	2	6	525655	525660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242750
11600	NC_017432	ATTA	2	8	525702	525709	50 %	50 %	0 %	0 %	385242750
11601	NC_017432	A	7	7	525768	525774	100 %	0 %	0 %	0 %	385242750
11602	NC_017432	CAA	2	6	525984	525989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242750
11603	NC_017432	TAAA	2	8	526007	526014	75 %	25 %	0 %	0 %	385242750
11604	NC_017432	GTC	2	6	526073	526078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242751
11605	NC_017432	TTC	2	6	526086	526091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242752
11606	NC_017432	TTC	2	6	526107	526112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242752
11607	NC_017432	CTT	2	6	526154	526159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242752
11608	NC_017432	TCC	2	6	526160	526165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242752
11609	NC_017432	TTTC	2	8	526224	526231	0 %	75 %	0 %	25 %	385242752
11610	NC_017432	TTCT	2	8	526334	526341	0 %	75 %	0 %	25 %	385242752
11611	NC_017432	CTT	2	6	526342	526347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242752
11612	NC_017432	GTT	2	6	526417	526422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242752
11613	NC_017432	TCC	2	6	526458	526463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242752
11614	NC_017432	TGG	2	6	526511	526516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242752
11615	NC_017432	ACA	2	6	526535	526540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242752
11616	NC_017432	CTT	2	6	526564	526569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242752
11617	NC_017432	A	6	6	526586	526591	100 %	0 %	0 %	0 %	385242752
11618	NC_017432	AGT	2	6	526624	526629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242752
11619	NC_017432	ATCT	2	8	526654	526661	25 %	50 %	0 %	25 %	385242752
11620	NC_017432	CTT	2	6	526670	526675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242752
11621	NC_017432	CAG	2	6	526819	526824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242752
11622	NC_017432	GGA	2	6	526841	526846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242752
11623	NC_017432	CTT	2	6	526871	526876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242752
11624	NC_017432	TCC	2	6	526899	526904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242752
11625	NC_017432	GAT	2	6	526932	526937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242752
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11719	NC_017432	TGT	2	6	531495	531500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11720	NC_017432	TTTA	2	8	531502	531509	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11721	NC_017432	CAT	2	6	531566	531571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242757
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11727	NC_017432	GTA	2	6	531709	531714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242757
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11735	NC_017432	GTAG	2	8	531946	531953	25 %	25 %	50 %	0 %	385242757
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11737	NC_017432	TGC	3	9	531987	531995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242757
11738	NC_017432	ACT	2	6	532015	532020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242757
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11740	NC_017432	GTG	3	9	532076	532084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242757
11741	NC_017432	CAG	3	9	532085	532093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242757
11742	NC_017432	CTC	2	6	532113	532118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242757
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11744	NC_017432	ACT	2	6	532165	532170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242757
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