MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017432	TGC	2	6	497983	497988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242723
11002	NC_017432	ATG	2	6	498079	498084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242723
11003	NC_017432	TAT	2	6	498088	498093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242723
11004	NC_017432	AGC	2	6	498152	498157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242723
11005	NC_017432	TTC	2	6	498212	498217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242723
11006	NC_017432	ATTTC	2	10	498222	498231	20 %	60 %	0 %	20 %	385242723
11007	NC_017432	ATT	2	6	498262	498267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242723
11008	NC_017432	AGA	2	6	498281	498286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242723
11009	NC_017432	AGC	2	6	498299	498304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242723
11010	NC_017432	ATACT	2	10	498341	498350	40 %	40 %	0 %	20 %	385242723
11011	NC_017432	TAT	2	6	498408	498413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242723
11012	NC_017432	CAA	2	6	498426	498431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242723
11013	NC_017432	CCTA	2	8	498466	498473	25 %	25 %	0 %	50 %	385242723
11014	NC_017432	TC	3	6	498535	498540	0 %	50 %	0 %	50 %	385242724
11015	NC_017432	TTG	2	6	498635	498640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242724
11016	NC_017432	CAA	2	6	498647	498652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242724
11017	NC_017432	AC	3	6	498718	498723	50 %	0 %	0 %	50 %	385242724
11018	NC_017432	ATA	2	6	498737	498742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242724
11019	NC_017432	CGTTT	2	10	498743	498752	0 %	60 %	20 %	20 %	385242724
11020	NC_017432	TATCC	2	10	498782	498791	20 %	40 %	0 %	40 %	385242724
11021	NC_017432	GGA	2	6	498832	498837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242724
11022	NC_017432	TTG	2	6	498914	498919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242724
11023	NC_017432	GAAA	2	8	498972	498979	75 %	0 %	25 %	0 %	385242724
11024	NC_017432	ACT	2	6	499059	499064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242724
11025	NC_017432	CTT	2	6	499139	499144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242725
11026	NC_017432	TTC	2	6	499164	499169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242725
11027	NC_017432	CTT	2	6	499183	499188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242725
11028	NC_017432	CGT	3	9	499189	499197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242725
11029	NC_017432	CTC	2	6	499199	499204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242725
11030	NC_017432	GAA	2	6	499208	499213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242725
11031	NC_017432	TC	3	6	499222	499227	0 %	50 %	0 %	50 %	385242725
11032	NC_017432	CTC	3	9	499321	499329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242725
11033	NC_017432	TTC	3	9	499346	499354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242725
11034	NC_017432	GAA	2	6	499383	499388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242725
11035	NC_017432	CGT	2	6	499419	499424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242725
11036	NC_017432	GTC	2	6	499464	499469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242725
11037	NC_017432	AGG	2	6	499496	499501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242725
11038	NC_017432	AAG	2	6	499565	499570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242725
11039	NC_017432	GTT	2	6	499627	499632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242725
11040	NC_017432	TCT	2	6	499659	499664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242725
11041	NC_017432	AAACTG	2	12	499673	499684	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385242725
11042	NC_017432	ATT	2	6	499685	499690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242725
11043	NC_017432	ATG	2	6	499704	499709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242725
11044	NC_017432	T	6	6	499852	499857	0 %	100 %	0 %	0 %	385242725
11045	NC_017432	TCT	2	6	499879	499884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242725
11046	NC_017432	TTC	2	6	499934	499939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242725
11047	NC_017432	TC	4	8	500028	500035	0 %	50 %	0 %	50 %	385242725
11048	NC_017432	TCA	2	6	500037	500042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242725
11049	NC_017432	TAA	2	6	500078	500083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242725
11050	NC_017432	GTC	2	6	500109	500114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242725
11051	NC_017432	CT	4	8	500153	500160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11052	NC_017432	ACC	2	6	500206	500211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242726
11053	NC_017432	A	6	6	500275	500280	100 %	0 %	0 %	0 %	385242726
11054	NC_017432	CTA	2	6	500295	500300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242726
11055	NC_017432	AC	3	6	500306	500311	50 %	0 %	0 %	50 %	385242726
11056	NC_017432	ATC	2	6	500438	500443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242726
11057	NC_017432	CTT	2	6	500444	500449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242726
11058	NC_017432	AAGA	2	8	500505	500512	75 %	0 %	25 %	0 %	385242726
11059	NC_017432	CTTA	2	8	500534	500541	25 %	50 %	0 %	25 %	385242726
11060	NC_017432	A	6	6	500585	500590	100 %	0 %	0 %	0 %	385242726
11061	NC_017432	T	6	6	500639	500644	0 %	100 %	0 %	0 %	385242726
11062	NC_017432	AGA	2	6	500849	500854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242726
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11064	NC_017432	TCGA	2	8	501051	501058	25 %	25 %	25 %	25 %	385242727
11065	NC_017432	AAT	2	6	501111	501116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242727
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11068	NC_017432	CA	3	6	501251	501256	50 %	0 %	0 %	50 %	385242727
11069	NC_017432	TGC	2	6	501279	501284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242727
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11085	NC_017432	T	6	6	502148	502153	0 %	100 %	0 %	0 %	385242728
11086	NC_017432	CGT	3	9	502196	502204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242728
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11088	NC_017432	AC	3	6	502249	502254	50 %	0 %	0 %	50 %	385242728
11089	NC_017432	TCT	2	6	502311	502316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242728
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11093	NC_017432	TAA	2	6	502673	502678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242728
11094	NC_017432	AAT	2	6	502728	502733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242728
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11099	NC_017432	AATCT	2	10	503141	503150	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11100	NC_017432	TGA	2	6	503153	503158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_017432	ATTT	2	8	503188	503195	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_017432	TAACTA	2	12	503196	503207	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11103	NC_017432	AAGAAA	2	12	503209	503220	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_017432	AAG	2	6	503329	503334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242729
11105	NC_017432	CTA	2	6	503339	503344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242729
11106	NC_017432	A	6	6	503347	503352	100 %	0 %	0 %	0 %	385242729
11107	NC_017432	CTTCT	2	10	503354	503363	0 %	60 %	0 %	40 %	385242729
11108	NC_017432	A	8	8	503368	503375	100 %	0 %	0 %	0 %	385242729
11109	NC_017432	ATCC	2	8	503442	503449	25 %	25 %	0 %	50 %	385242730
11110	NC_017432	CTG	2	6	503466	503471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242730
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11113	NC_017432	CTT	2	6	503670	503675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242730
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11116	NC_017432	CTC	2	6	503773	503778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242730
11117	NC_017432	CTCG	2	8	503801	503808	0 %	25 %	25 %	50 %	385242730
11118	NC_017432	CT	3	6	503821	503826	0 %	50 %	0 %	50 %	385242730
11119	NC_017432	TCC	2	6	503846	503851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242730
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11238	NC_017432	T	8	8	509774	509781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11240	NC_017432	ACA	2	6	509822	509827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11354	NC_017432	TGT	2	6	514361	514366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11362	NC_017432	TAAAA	2	10	514765	514774	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11363	NC_017432	T	6	6	514788	514793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11364	NC_017432	TAA	2	6	514807	514812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11365	NC_017432	CAAA	2	8	514834	514841	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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11368	NC_017432	AATA	2	8	514908	514915	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11373	NC_017432	TA	3	6	514963	514968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11491	NC_017432	TCT	2	6	520035	520040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242748
11492	NC_017432	CAT	2	6	520047	520052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242748
11493	NC_017432	TCT	2	6	520094	520099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242748
11494	NC_017432	AAT	2	6	520114	520119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242748
11495	NC_017432	TCA	2	6	520152	520157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242748
11496	NC_017432	TTGC	2	8	520167	520174	0 %	50 %	25 %	25 %	385242748
11497	NC_017432	AATC	2	8	520176	520183	50 %	25 %	0 %	25 %	385242748
11498	NC_017432	AGCAC	2	10	520217	520226	40 %	0 %	20 %	40 %	385242748
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11500	NC_017432	AAT	2	6	520328	520333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242748

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