MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017432	TGT	2	6	364326	364331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_017432	GA	3	6	364345	364350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_017432	AAC	2	6	364381	364386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_017432	A	6	6	364392	364397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_017432	TC	3	6	364423	364428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8006	NC_017432	T	7	7	364455	364461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_017432	TCC	2	6	364500	364505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8008	NC_017432	TTC	2	6	364538	364543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8009	NC_017432	GCTTC	2	10	364554	364563	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8010	NC_017432	TAGT	2	8	364592	364599	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_017432	TA	3	6	364624	364629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_017432	AGTAG	2	10	364631	364640	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_017432	TTC	2	6	364674	364679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242611
8014	NC_017432	GC	3	6	364688	364693	0 %	0 %	50 %	50 %	385242611
8015	NC_017432	TTC	2	6	364704	364709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242611
8016	NC_017432	CCGC	2	8	364768	364775	0 %	0 %	25 %	75 %	385242611
8017	NC_017432	TAT	2	6	364983	364988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242611
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8019	NC_017432	TTAT	2	8	365132	365139	25 %	75 %	0 %	0 %	385242611
8020	NC_017432	CTC	2	6	365144	365149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242611
8021	NC_017432	TAT	2	6	365163	365168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242611
8022	NC_017432	T	6	6	365175	365180	0 %	100 %	0 %	0 %	385242611
8023	NC_017432	AT	3	6	365238	365243	50 %	50 %	0 %	0 %	385242611
8024	NC_017432	CAT	2	6	365292	365297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242611
8025	NC_017432	CGC	2	6	365335	365340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385242611
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8029	NC_017432	CTCTT	2	10	365617	365626	0 %	60 %	0 %	40 %	385242612
8030	NC_017432	ACAA	2	8	365656	365663	75 %	0 %	0 %	25 %	385242612
8031	NC_017432	T	8	8	365784	365791	0 %	100 %	0 %	0 %	385242612
8032	NC_017432	T	6	6	365892	365897	0 %	100 %	0 %	0 %	385242612
8033	NC_017432	GGA	2	6	365937	365942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242612
8034	NC_017432	TCC	2	6	366033	366038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8035	NC_017432	ACT	2	6	366049	366054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242613
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8038	NC_017432	TGT	2	6	366165	366170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242613
8039	NC_017432	GAA	2	6	366206	366211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242613
8040	NC_017432	TAT	2	6	366248	366253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242613
8041	NC_017432	ACG	2	6	366257	366262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242613
8042	NC_017432	TTG	2	6	366307	366312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242613
8043	NC_017432	GCA	2	6	366430	366435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242613
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8046	NC_017432	ATC	2	6	366465	366470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242613
8047	NC_017432	TCT	2	6	366520	366525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242613
8048	NC_017432	TA	3	6	366527	366532	50 %	50 %	0 %	0 %	385242613
8049	NC_017432	CAA	2	6	366563	366568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242613
8050	NC_017432	AGGC	2	8	366581	366588	25 %	0 %	50 %	25 %	385242613
8051	NC_017432	TCCA	2	8	366637	366644	25 %	25 %	0 %	50 %	385242613
8052	NC_017432	A	7	7	366644	366650	100 %	0 %	0 %	0 %	385242613
8053	NC_017432	AGC	2	6	366688	366693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242613
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8055	NC_017432	CTT	2	6	366802	366807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242613
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8058	NC_017432	AGT	2	6	366957	366962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242613
8059	NC_017432	CAA	2	6	366963	366968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242613
8060	NC_017432	AGGGA	2	10	366993	367002	40 %	0 %	60 %	0 %	385242613
8061	NC_017432	GCT	2	6	367006	367011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242613
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8064	NC_017432	TAC	2	6	367083	367088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242613
8065	NC_017432	TAG	2	6	367127	367132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242613
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8067	NC_017432	TGAG	2	8	367236	367243	25 %	25 %	50 %	0 %	385242613
8068	NC_017432	AC	3	6	367264	367269	50 %	0 %	0 %	50 %	385242613
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8078	NC_017432	CA	3	6	367678	367683	50 %	0 %	0 %	50 %	385242613
8079	NC_017432	CAA	2	6	367724	367729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242613
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8088	NC_017432	GT	3	6	367995	368000	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8092	NC_017432	A	6	6	368120	368125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_017432	A	8	8	368140	368147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_017432	TCTCT	2	10	368207	368216	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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8098	NC_017432	AAC	2	6	368291	368296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242614
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8102	NC_017432	AT	3	6	368400	368405	50 %	50 %	0 %	0 %	385242614
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8105	NC_017432	CAA	2	6	368507	368512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8106	NC_017432	AAG	2	6	368564	368569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_017432	AACAA	2	10	368590	368599	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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8109	NC_017432	GCTT	2	8	368649	368656	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8110	NC_017432	ACA	2	6	368768	368773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8111	NC_017432	TGA	2	6	368793	368798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8114	NC_017432	A	6	6	368861	368866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_017432	AAAAC	2	10	368912	368921	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8116	NC_017432	TAAA	2	8	368927	368934	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_017432	CTT	2	6	368996	369001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8128	NC_017432	GTC	2	6	369525	369530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242615
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8240	NC_017432	TC	3	6	374577	374582	0 %	50 %	0 %	50 %	385242620
8241	NC_017432	ATCAC	2	10	374657	374666	40 %	20 %	0 %	40 %	385242620
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8244	NC_017432	CTT	2	6	374770	374775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8249	NC_017432	TAT	2	6	375018	375023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242621
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8251	NC_017432	GAAC	2	8	375181	375188	50 %	0 %	25 %	25 %	385242621
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