MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 22971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_017432	T	7	7	273759	273765	0 %	100 %	0 %	0 %	385242531
6003	NC_017432	CAA	2	6	273779	273784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242531
6004	NC_017432	CT	3	6	273790	273795	0 %	50 %	0 %	50 %	385242531
6005	NC_017432	T	9	9	273895	273903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_017432	CAG	2	6	273923	273928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_017432	TA	3	6	273929	273934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_017432	ATTT	2	8	274010	274017	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_017432	TTCT	2	8	274145	274152	0 %	75 %	0 %	25 %	385242532
6010	NC_017432	A	7	7	274167	274173	100 %	0 %	0 %	0 %	385242532
6011	NC_017432	TTG	2	6	274228	274233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242532
6012	NC_017432	AAG	2	6	274261	274266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242532
6013	NC_017432	CAG	2	6	274276	274281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242532
6014	NC_017432	TTGC	2	8	274285	274292	0 %	50 %	25 %	25 %	385242532
6015	NC_017432	T	7	7	274311	274317	0 %	100 %	0 %	0 %	385242532
6016	NC_017432	CTG	3	9	274344	274352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242532
6017	NC_017432	GCA	2	6	274374	274379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242532
6018	NC_017432	GAAA	2	8	274391	274398	75 %	0 %	25 %	0 %	385242532
6019	NC_017432	TG	3	6	274435	274440	0 %	50 %	50 %	0 %	385242532
6020	NC_017432	TGG	2	6	274472	274477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385242532
6021	NC_017432	GCA	2	6	274500	274505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242532
6022	NC_017432	TCT	2	6	274530	274535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242532
6023	NC_017432	TCCCT	2	10	274614	274623	0 %	40 %	0 %	60 %	385242532
6024	NC_017432	ATT	2	6	274632	274637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242532
6025	NC_017432	ATGG	2	8	274645	274652	25 %	25 %	50 %	0 %	385242532
6026	NC_017432	TCTT	2	8	274724	274731	0 %	75 %	0 %	25 %	385242532
6027	NC_017432	ATTT	2	8	274753	274760	25 %	75 %	0 %	0 %	385242532
6028	NC_017432	CAC	2	6	274791	274796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242532
6029	NC_017432	CAA	2	6	274800	274805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242532
6030	NC_017432	TAT	2	6	274817	274822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242532
6031	NC_017432	TCT	2	6	274904	274909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242532
6032	NC_017432	ATCCT	2	10	274918	274927	20 %	40 %	0 %	40 %	385242532
6033	NC_017432	GAT	2	6	274971	274976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242532
6034	NC_017432	AGA	2	6	275066	275071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242532
6035	NC_017432	TGA	2	6	275130	275135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242533
6036	NC_017432	AGGAG	2	10	275169	275178	40 %	0 %	60 %	0 %	385242533
6037	NC_017432	GCT	2	6	275269	275274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242533
6038	NC_017432	TGGAAT	2	12	275280	275291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242533
6039	NC_017432	AGC	2	6	275295	275300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242533
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6041	NC_017432	TC	3	6	275345	275350	0 %	50 %	0 %	50 %	385242533
6042	NC_017432	TGC	2	6	275355	275360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242533
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6044	NC_017432	TAT	2	6	275392	275397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242533
6045	NC_017432	GCT	2	6	275449	275454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242533
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6047	NC_017432	AAC	2	6	275581	275586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242533
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6049	NC_017432	AAG	2	6	275684	275689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242533
6050	NC_017432	GCT	2	6	275743	275748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242533
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6052	NC_017432	CT	3	6	275773	275778	0 %	50 %	0 %	50 %	385242533
6053	NC_017432	ACGA	2	8	275796	275803	50 %	0 %	25 %	25 %	385242533
6054	NC_017432	CTC	2	6	275827	275832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242533
6055	NC_017432	A	7	7	275842	275848	100 %	0 %	0 %	0 %	385242533
6056	NC_017432	TTGTC	2	10	275856	275865	0 %	60 %	20 %	20 %	385242533
6057	NC_017432	GAA	2	6	275869	275874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242533
6058	NC_017432	ATT	2	6	275879	275884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242533
6059	NC_017432	ACG	2	6	275911	275916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242533
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6064	NC_017432	A	6	6	276140	276145	100 %	0 %	0 %	0 %	385242534
6065	NC_017432	TGGT	2	8	276229	276236	0 %	50 %	50 %	0 %	385242534
6066	NC_017432	TTG	2	6	276249	276254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242534
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6069	NC_017432	TGT	2	6	276355	276360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242534
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6097	NC_017432	TGAT	2	8	277278	277285	25 %	50 %	25 %	0 %	385242534
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6105	NC_017432	TA	3	6	277543	277548	50 %	50 %	0 %	0 %	385242535
6106	NC_017432	TCT	2	6	277628	277633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242535
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6123	NC_017432	ATA	2	6	278591	278596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242535
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6125	NC_017432	GAA	2	6	278694	278699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242535
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6127	NC_017432	TC	3	6	278725	278730	0 %	50 %	0 %	50 %	385242535
6128	NC_017432	GAA	2	6	278742	278747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242535
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6130	NC_017432	CAT	2	6	278833	278838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242535
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6234	NC_017432	CAG	2	6	283953	283958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242538
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6239	NC_017432	ATA	2	6	284174	284179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242538
6240	NC_017432	CGTT	2	8	284181	284188	0 %	50 %	25 %	25 %	385242538
6241	NC_017432	ATTC	2	8	284190	284197	25 %	50 %	0 %	25 %	385242538
6242	NC_017432	GGGA	2	8	284223	284230	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6243	NC_017432	A	7	7	284269	284275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6244	NC_017432	CTT	2	6	284302	284307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6245	NC_017432	C	6	6	284430	284435	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6246	NC_017432	AT	4	8	284489	284496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6247	NC_017432	CAT	2	6	284509	284514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242539
6248	NC_017432	T	9	9	284514	284522	0 %	100 %	0 %	0 %	385242539
6249	NC_017432	ATC	2	6	284557	284562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242539
6250	NC_017432	TTC	2	6	284598	284603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242539
6251	NC_017432	GT	3	6	284622	284627	0 %	50 %	50 %	0 %	385242539
6252	NC_017432	CTG	2	6	284678	284683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242539
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6254	NC_017432	CAC	2	6	284994	284999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242539
6255	NC_017432	CCT	2	6	285028	285033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242539
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6257	NC_017432	AAGC	2	8	285098	285105	50 %	0 %	25 %	25 %	385242539
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6260	NC_017432	CTC	2	6	285177	285182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242539
6261	NC_017432	GAT	2	6	285226	285231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242539
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6264	NC_017432	CT	3	6	285341	285346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6265	NC_017432	TAAA	2	8	285365	285372	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6266	NC_017432	A	6	6	285370	285375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6267	NC_017432	T	6	6	285390	285395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6268	NC_017432	A	6	6	285410	285415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6269	NC_017432	TC	4	8	285432	285439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6270	NC_017432	T	6	6	285560	285565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6271	NC_017432	CTT	2	6	285602	285607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242540
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6285	NC_017432	TTCGA	2	10	286135	286144	20 %	40 %	20 %	20 %	385242540
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6294	NC_017432	T	7	7	286454	286460	0 %	100 %	0 %	0 %	385242541
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6310	NC_017432	A	8	8	287000	287007	100 %	0 %	0 %	0 %	385242541
6311	NC_017432	GATA	2	8	287026	287033	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6312	NC_017432	A	6	6	287040	287045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6315	NC_017432	TC	3	6	287180	287185	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6316	NC_017432	TTA	2	6	287206	287211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242542
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6324	NC_017432	TA	3	6	287482	287487	50 %	50 %	0 %	0 %	385242542
6325	NC_017432	TTC	2	6	287584	287589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242542
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6359	NC_017432	TA	3	6	288999	289004	50 %	50 %	0 %	0 %	385242543
6360	NC_017432	AACT	2	8	289020	289027	50 %	25 %	0 %	25 %	385242543
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6369	NC_017432	TC	3	6	289355	289360	0 %	50 %	0 %	50 %	385242544
6370	NC_017432	A	6	6	289373	289378	100 %	0 %	0 %	0 %	385242544
6371	NC_017432	TCA	2	6	289545	289550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242544
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6374	NC_017432	TGT	2	6	289794	289799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242544
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6500	NC_017432	GA	3	6	295585	295590	50 %	0 %	50 %	0 %	385242551

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