MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/11023 chromosome

Total Repeats: 22973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017431	GCC	2	6	4	9	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017431	TGC	2	6	63	68	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017431	ATT	2	6	75	80	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017431	CGA	2	6	97	102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017431	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017431	TAT	2	6	239	244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017431	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017431	GAA	2	6	286	291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017431	AGA	2	6	315	320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017431	AGA	2	6	369	374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017431	CAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017431	AATG	2	8	466	473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017431	TTG	2	6	585	590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017431	CTC	2	6	614	619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017431	GAT	2	6	676	681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017431	GAT	2	6	730	735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017431	GAAGGA	2	12	760	771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017431	ATG	2	6	793	798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017431	CTAT	2	8	800	807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017431	CCT	2	6	952	957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017431	CTT	2	6	1013	1018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017431	CAG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017431	TGA	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017431	A	6	6	1203	1208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017431	AAG	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017431	TGG	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017431	CTT	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017431	T	7	7	1247	1253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017431	A	6	6	1258	1263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017431	AAGG	2	8	1309	1316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017431	ATG	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241360
32	NC_017431	GTG	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385241360
33	NC_017431	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241360
34	NC_017431	AGC	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241360
35	NC_017431	T	6	6	1384	1389	0 %	100 %	0 %	0 %	385241360
36	NC_017431	AGC	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241360
37	NC_017431	AAG	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241360
38	NC_017431	TAC	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241360
39	NC_017431	GCT	2	6	1451	1456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241360
40	NC_017431	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	385241360
41	NC_017431	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241360
42	NC_017431	T	6	6	1639	1644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017431	TAA	2	6	1651	1656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017431	T	7	7	1661	1667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017431	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017431	A	6	6	1733	1738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017431	AGA	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241361
48	NC_017431	ATC	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241361
49	NC_017431	TGC	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241361
50	NC_017431	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	385241361
51	NC_017431	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	385241361
52	NC_017431	CAT	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241361
53	NC_017431	AGA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241361
54	NC_017431	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241361
55	NC_017431	GGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241361
56	NC_017431	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	385241362
57	NC_017431	ATC	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241362
58	NC_017431	TTTC	2	8	2228	2235	0 %	75 %	0 %	25 %	385241362
59	NC_017431	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241362
60	NC_017431	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241362
61	NC_017431	GGT	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385241362
62	NC_017431	AAT	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241362
63	NC_017431	TTC	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241362
64	NC_017431	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241362
65	NC_017431	GGA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241362
66	NC_017431	CAG	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241362
67	NC_017431	GTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241362
68	NC_017431	GGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385241362
69	NC_017431	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	385241362
70	NC_017431	T	6	6	2828	2833	0 %	100 %	0 %	0 %	385241362
71	NC_017431	AAG	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241362
72	NC_017431	ATT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241362
73	NC_017431	TTG	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241362
74	NC_017431	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	385241362
75	NC_017431	AAG	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241362
76	NC_017431	AAG	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241362
77	NC_017431	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241362
78	NC_017431	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241362
79	NC_017431	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	385241362
80	NC_017431	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	385241362
81	NC_017431	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241362
82	NC_017431	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241362
83	NC_017431	GGA	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241362
84	NC_017431	AAT	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241362
85	NC_017431	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	385241363
86	NC_017431	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241363
87	NC_017431	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241363
88	NC_017431	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	385241363
89	NC_017431	GTA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241363
90	NC_017431	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	385241363
91	NC_017431	AGA	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241363
92	NC_017431	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	385241363
93	NC_017431	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241363
94	NC_017431	CGT	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241363
95	NC_017431	A	7	7	4328	4334	100 %	0 %	0 %	0 %	385241363
96	NC_017431	GTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241363
97	NC_017431	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	385241363
98	NC_017431	A	7	7	4374	4380	100 %	0 %	0 %	0 %	385241363
99	NC_017431	TGA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241363
100	NC_017431	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	385241363
101	NC_017431	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	385241363
102	NC_017431	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241363
103	NC_017431	TTC	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241363
104	NC_017431	TCT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241363
105	NC_017431	AGA	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241363
106	NC_017431	GTT	2	6	4847	4852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241363
107	NC_017431	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	385241363
108	NC_017431	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385241363
109	NC_017431	AAAGCT	2	12	4941	4952	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385241363
110	NC_017431	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	385241363
111	NC_017431	CTC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241363
112	NC_017431	AGC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241363
113	NC_017431	GCA	2	6	5055	5060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017431	A	6	6	5066	5071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017431	AGA	2	6	5082	5087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017431	ATT	2	6	5147	5152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241364
117	NC_017431	TCT	2	6	5165	5170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241364
118	NC_017431	GCT	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241364
119	NC_017431	GTCTT	2	10	5217	5226	0 %	60 %	20 %	20 %	385241364
120	NC_017431	GAT	2	6	5246	5251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241364
121	NC_017431	TC	3	6	5262	5267	0 %	50 %	0 %	50 %	385241364
122	NC_017431	GA	3	6	5273	5278	50 %	0 %	50 %	0 %	385241364
123	NC_017431	ACG	2	6	5284	5289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241364
124	NC_017431	GAA	2	6	5308	5313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241364
125	NC_017431	TGGA	2	8	5321	5328	25 %	25 %	50 %	0 %	385241364
126	NC_017431	AT	3	6	5377	5382	50 %	50 %	0 %	0 %	385241364
127	NC_017431	AGA	3	9	5385	5393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241364
128	NC_017431	GCT	2	6	5394	5399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241364
129	NC_017431	AGA	2	6	5403	5408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241364
130	NC_017431	TGG	2	6	5439	5444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385241364
131	NC_017431	AGA	3	9	5457	5465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241364
132	NC_017431	GGA	2	6	5466	5471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241364
133	NC_017431	TG	3	6	5530	5535	0 %	50 %	50 %	0 %	385241364
134	NC_017431	T	6	6	5608	5613	0 %	100 %	0 %	0 %	385241364
135	NC_017431	TCA	2	6	5651	5656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241364
136	NC_017431	GGA	2	6	5688	5693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241364
137	NC_017431	CTTT	2	8	5698	5705	0 %	75 %	0 %	25 %	385241364
138	NC_017431	CTT	2	6	5748	5753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241364
139	NC_017431	CTG	2	6	5754	5759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241364
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146	NC_017431	CTT	2	6	6360	6365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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157	NC_017431	A	6	6	7011	7016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017431	TATTT	2	10	7032	7041	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_017431	TA	3	6	11870	11875	50 %	50 %	0 %	0 %	385241371
272	NC_017431	T	6	6	11879	11884	0 %	100 %	0 %	0 %	385241371
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406	NC_017431	TCT	2	6	18467	18472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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