MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/11023 chromosome

Total Repeats: 22973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_017431	TCA	2	6	861144	861149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242134
19003	NC_017431	AGC	2	6	861185	861190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242134
19004	NC_017431	TAA	2	6	861230	861235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242134
19005	NC_017431	ATC	2	6	861281	861286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242134
19006	NC_017431	ATT	2	6	861287	861292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242134
19007	NC_017431	TAA	2	6	861319	861324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242134
19008	NC_017431	TGC	2	6	861380	861385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242134
19009	NC_017431	A	6	6	861488	861493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19010	NC_017431	T	6	6	861503	861508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19011	NC_017431	TTA	2	6	861515	861520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19012	NC_017431	AGC	2	6	861600	861605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242135
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19014	NC_017431	CTTTTT	2	12	861721	861732	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385242135
19015	NC_017431	GAC	2	6	861743	861748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242135
19016	NC_017431	GAG	2	6	861836	861841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242135
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19018	NC_017431	TTA	2	6	861926	861931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19019	NC_017431	T	7	7	862171	862177	0 %	100 %	0 %	0 %	385242136
19020	NC_017431	GAG	2	6	862228	862233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242136
19021	NC_017431	GAAG	2	8	862257	862264	50 %	0 %	50 %	0 %	385242136
19022	NC_017431	AAT	2	6	862382	862387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242136
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19045	NC_017431	GAG	2	6	863149	863154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242136
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19049	NC_017431	A	8	8	863310	863317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19054	NC_017431	T	7	7	863454	863460	0 %	100 %	0 %	0 %	385242137
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19072	NC_017431	GTTT	2	8	863834	863841	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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19096	NC_017431	AAG	2	6	864959	864964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242138
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19125	NC_017431	TAT	2	6	866167	866172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242138
19126	NC_017431	TAT	2	6	866290	866295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242138
19127	NC_017431	ACCT	2	8	866320	866327	25 %	25 %	0 %	50 %	385242138
19128	NC_017431	AAG	2	6	866375	866380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242138
19129	NC_017431	CCG	2	6	866422	866427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385242138
19130	NC_017431	GT	3	6	866435	866440	0 %	50 %	50 %	0 %	385242138
19131	NC_017431	TTA	2	6	866515	866520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242138
19132	NC_017431	TTTC	2	8	866541	866548	0 %	75 %	0 %	25 %	385242138
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19134	NC_017431	GTA	2	6	866634	866639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242138
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19136	NC_017431	GACCTG	2	12	866682	866693	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385242139
19137	NC_017431	TAGA	2	8	866733	866740	50 %	25 %	25 %	0 %	385242139
19138	NC_017431	GAG	2	6	866793	866798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242139
19139	NC_017431	GAG	2	6	866820	866825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242139
19140	NC_017431	GCT	2	6	866852	866857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242139
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19144	NC_017431	TAA	2	6	866968	866973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242139
19145	NC_017431	AGGG	2	8	867016	867023	25 %	0 %	75 %	0 %	385242139
19146	NC_017431	ATGC	2	8	867024	867031	25 %	25 %	25 %	25 %	385242139
19147	NC_017431	AG	3	6	867049	867054	50 %	0 %	50 %	0 %	385242139
19148	NC_017431	TCT	2	6	867101	867106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242139
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19151	NC_017431	TG	3	6	867316	867321	0 %	50 %	50 %	0 %	385242139
19152	NC_017431	AAC	2	6	867356	867361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242139
19153	NC_017431	AT	3	6	867417	867422	50 %	50 %	0 %	0 %	385242139
19154	NC_017431	TCT	2	6	867469	867474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242139
19155	NC_017431	GAA	2	6	867482	867487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242139
19156	NC_017431	AAG	2	6	867500	867505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242139
19157	NC_017431	TTGT	2	8	867523	867530	0 %	75 %	25 %	0 %	385242139
19158	NC_017431	GA	3	6	867560	867565	50 %	0 %	50 %	0 %	385242139
19159	NC_017431	TTTG	2	8	867573	867580	0 %	75 %	25 %	0 %	385242139
19160	NC_017431	TAT	3	9	867612	867620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242139
19161	NC_017431	TA	3	6	867654	867659	50 %	50 %	0 %	0 %	385242139
19162	NC_017431	GT	3	6	867701	867706	0 %	50 %	50 %	0 %	385242139
19163	NC_017431	CAT	2	6	867711	867716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242139
19164	NC_017431	AAAAC	2	10	867722	867731	80 %	0 %	0 %	20 %	385242139
19165	NC_017431	TTG	2	6	867760	867765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242139
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19175	NC_017431	TCT	2	6	868318	868323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242140
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19178	NC_017431	ATC	2	6	868392	868397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242140
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19180	NC_017431	TGTT	2	8	868623	868630	0 %	75 %	25 %	0 %	385242140
19181	NC_017431	TTC	2	6	868707	868712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242140
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19184	NC_017431	TTC	2	6	868860	868865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242140
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19196	NC_017431	AGT	2	6	869406	869411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242141
19197	NC_017431	AGG	2	6	869570	869575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242141
19198	NC_017431	GAG	2	6	869644	869649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242141
19199	NC_017431	C	6	6	869817	869822	0 %	0 %	0 %	100 %	385242141
19200	NC_017431	AG	3	6	870029	870034	50 %	0 %	50 %	0 %	385242141
19201	NC_017431	TAA	2	6	870068	870073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242141
19202	NC_017431	A	9	9	870117	870125	100 %	0 %	0 %	0 %	385242141
19203	NC_017431	TA	3	6	870167	870172	50 %	50 %	0 %	0 %	385242141
19204	NC_017431	GGA	2	6	870187	870192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242141
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19206	NC_017431	CCTCTA	2	12	870257	870268	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
19207	NC_017431	CTT	2	6	870304	870309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242142
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19209	NC_017431	TTTG	2	8	870361	870368	0 %	75 %	25 %	0 %	385242142
19210	NC_017431	CTG	2	6	870383	870388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242142
19211	NC_017431	AT	3	6	870390	870395	50 %	50 %	0 %	0 %	385242142
19212	NC_017431	CTT	2	6	870517	870522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242142
19213	NC_017431	CTC	2	6	870536	870541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242142
19214	NC_017431	T	6	6	870562	870567	0 %	100 %	0 %	0 %	385242142
19215	NC_017431	TA	3	6	870599	870604	50 %	50 %	0 %	0 %	385242142
19216	NC_017431	GC	3	6	870617	870622	0 %	0 %	50 %	50 %	385242142
19217	NC_017431	ATC	2	6	870647	870652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242142
19218	NC_017431	T	6	6	870698	870703	0 %	100 %	0 %	0 %	385242142
19219	NC_017431	CTC	2	6	870778	870783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242142
19220	NC_017431	T	6	6	871054	871059	0 %	100 %	0 %	0 %	385242142
19221	NC_017431	GCAT	2	8	871098	871105	25 %	25 %	25 %	25 %	385242142
19222	NC_017431	TGC	2	6	871235	871240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242142
19223	NC_017431	TTC	2	6	871250	871255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242142
19224	NC_017431	AGG	2	6	871298	871303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242142
19225	NC_017431	GA	3	6	871313	871318	50 %	0 %	50 %	0 %	385242142
19226	NC_017431	AG	3	6	871340	871345	50 %	0 %	50 %	0 %	385242142
19227	NC_017431	GTT	2	6	871441	871446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242142
19228	NC_017431	TCA	2	6	871449	871454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242142
19229	NC_017431	ATA	2	6	871455	871460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242142
19230	NC_017431	T	7	7	871555	871561	0 %	100 %	0 %	0 %	385242142
19231	NC_017431	CAGCC	2	10	871610	871619	20 %	0 %	20 %	60 %	385242142
19232	NC_017431	GTA	2	6	871662	871667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242142
19233	NC_017431	CTTG	2	8	871684	871691	0 %	50 %	25 %	25 %	385242142
19234	NC_017431	CA	4	8	871699	871706	50 %	0 %	0 %	50 %	385242142
19235	NC_017431	CAT	2	6	871790	871795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242142
19236	NC_017431	TTC	2	6	871838	871843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242142
19237	NC_017431	GATA	2	8	871891	871898	50 %	25 %	25 %	0 %	385242142
19238	NC_017431	TCG	2	6	871985	871990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242142
19239	NC_017431	GAT	2	6	872137	872142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242142
19240	NC_017431	TC	3	6	872200	872205	0 %	50 %	0 %	50 %	385242142
19241	NC_017431	CTT	2	6	872224	872229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242142
19242	NC_017431	GTA	2	6	872235	872240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242142
19243	NC_017431	GTT	2	6	872254	872259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242142
19244	NC_017431	GGA	2	6	872269	872274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242142
19245	NC_017431	GCA	2	6	872307	872312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242142
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19247	NC_017431	GGA	2	6	872339	872344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242142
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