MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/11023 chromosome

Total Repeats: 22973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_017431	AGC	2	6	700149	700154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242002
15503	NC_017431	TTG	2	6	700159	700164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242002
15504	NC_017431	CTT	2	6	700172	700177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242002
15505	NC_017431	AAG	2	6	700295	700300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242002
15506	NC_017431	AAG	2	6	700325	700330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242002
15507	NC_017431	TTG	2	6	700380	700385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242002
15508	NC_017431	CAG	3	9	700451	700459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242002
15509	NC_017431	T	6	6	700469	700474	0 %	100 %	0 %	0 %	385242002
15510	NC_017431	TTG	2	6	700522	700527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242002
15511	NC_017431	TAGT	2	8	700540	700547	25 %	50 %	25 %	0 %	385242002
15512	NC_017431	ATC	2	6	700560	700565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242002
15513	NC_017431	A	6	6	700584	700589	100 %	0 %	0 %	0 %	385242002
15514	NC_017431	T	6	6	700596	700601	0 %	100 %	0 %	0 %	385242002
15515	NC_017431	GTTC	2	8	700604	700611	0 %	50 %	25 %	25 %	385242002
15516	NC_017431	CT	3	6	700918	700923	0 %	50 %	0 %	50 %	385242002
15517	NC_017431	TGCTTG	2	12	700929	700940	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385242002
15518	NC_017431	AAG	2	6	700942	700947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242002
15519	NC_017431	ACC	2	6	701038	701043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242002
15520	NC_017431	TG	3	6	701116	701121	0 %	50 %	50 %	0 %	385242002
15521	NC_017431	TAC	2	6	701126	701131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242002
15522	NC_017431	TCC	2	6	701137	701142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242002
15523	NC_017431	CTT	2	6	701201	701206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242002
15524	NC_017431	ATT	2	6	701241	701246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242002
15525	NC_017431	TCCA	2	8	701254	701261	25 %	25 %	0 %	50 %	385242002
15526	NC_017431	TGCT	2	8	701378	701385	0 %	50 %	25 %	25 %	385242002
15527	NC_017431	TG	3	6	701413	701418	0 %	50 %	50 %	0 %	385242002
15528	NC_017431	TCA	2	6	701428	701433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242002
15529	NC_017431	ATA	2	6	701436	701441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242002
15530	NC_017431	AGCTG	2	10	701500	701509	20 %	20 %	40 %	20 %	385242002
15531	NC_017431	CTT	2	6	701525	701530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242002
15532	NC_017431	TTCT	2	8	701547	701554	0 %	75 %	0 %	25 %	385242002
15533	NC_017431	CTG	2	6	701640	701645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242002
15534	NC_017431	TGC	2	6	701667	701672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242002
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15536	NC_017431	TAC	2	6	701792	701797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242002
15537	NC_017431	CTG	2	6	701810	701815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242002
15538	NC_017431	TGC	2	6	701822	701827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242002
15539	NC_017431	CTT	2	6	701839	701844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242002
15540	NC_017431	C	6	6	701846	701851	0 %	0 %	0 %	100 %	385242002
15541	NC_017431	TCC	2	6	701856	701861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242002
15542	NC_017431	CTC	2	6	701964	701969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242002
15543	NC_017431	TGGC	2	8	701978	701985	0 %	25 %	50 %	25 %	385242002
15544	NC_017431	TAAA	2	8	702032	702039	75 %	25 %	0 %	0 %	385242002
15545	NC_017431	AGT	2	6	702054	702059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242002
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15547	NC_017431	AAAAC	2	10	702091	702100	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15548	NC_017431	A	6	6	702132	702137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15549	NC_017431	T	7	7	702139	702145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15550	NC_017431	TGTT	2	8	702149	702156	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15551	NC_017431	TAA	2	6	702225	702230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242003
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15555	NC_017431	ATG	2	6	702389	702394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242003
15556	NC_017431	AGTT	2	8	702413	702420	25 %	50 %	25 %	0 %	385242003
15557	NC_017431	TCT	2	6	702430	702435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242003
15558	NC_017431	TTGG	2	8	702550	702557	0 %	50 %	50 %	0 %	385242003
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15563	NC_017431	ACT	2	6	702667	702672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242003
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15572	NC_017431	TATC	2	8	703118	703125	25 %	50 %	0 %	25 %	385242003
15573	NC_017431	TA	3	6	703159	703164	50 %	50 %	0 %	0 %	385242003
15574	NC_017431	CT	3	6	703179	703184	0 %	50 %	0 %	50 %	385242003
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15579	NC_017431	AACT	2	8	703328	703335	50 %	25 %	0 %	25 %	385242003
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15590	NC_017431	CT	3	6	703902	703907	0 %	50 %	0 %	50 %	385242003
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15603	NC_017431	CAA	2	6	704572	704577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242003
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15606	NC_017431	GTA	2	6	704653	704658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242003
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15608	NC_017431	CTAG	2	8	704710	704717	25 %	25 %	25 %	25 %	385242003
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15612	NC_017431	AAAT	2	8	704813	704820	75 %	25 %	0 %	0 %	385242004
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