MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/11023 chromosome

Total Repeats: 22973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017431	CCT	2	6	587562	587567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241892
13002	NC_017431	CT	3	6	587573	587578	0 %	50 %	0 %	50 %	385241892
13003	NC_017431	AAT	2	6	587585	587590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241892
13004	NC_017431	AAT	2	6	587630	587635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241892
13005	NC_017431	GGAA	2	8	587756	587763	50 %	0 %	50 %	0 %	385241892
13006	NC_017431	TGT	2	6	587861	587866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241892
13007	NC_017431	AAATA	2	10	587886	587895	80 %	20 %	0 %	0 %	385241892
13008	NC_017431	ACA	2	6	587923	587928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241892
13009	NC_017431	AAC	2	6	587951	587956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241892
13010	NC_017431	ATTC	2	8	587960	587967	25 %	50 %	0 %	25 %	385241892
13011	NC_017431	AAG	2	6	588107	588112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241892
13012	NC_017431	AAC	2	6	588143	588148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241892
13013	NC_017431	A	6	6	588190	588195	100 %	0 %	0 %	0 %	385241892
13014	NC_017431	GCAA	2	8	588309	588316	50 %	0 %	25 %	25 %	385241892
13015	NC_017431	T	6	6	588334	588339	0 %	100 %	0 %	0 %	385241892
13016	NC_017431	GCA	2	6	588451	588456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241893
13017	NC_017431	TC	3	6	588515	588520	0 %	50 %	0 %	50 %	385241893
13018	NC_017431	TCTT	2	8	588534	588541	0 %	75 %	0 %	25 %	385241893
13019	NC_017431	GTTGT	2	10	588593	588602	0 %	60 %	40 %	0 %	385241893
13020	NC_017431	TTC	2	6	588606	588611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241893
13021	NC_017431	AGA	2	6	588762	588767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241893
13022	NC_017431	TTC	2	6	588791	588796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241893
13023	NC_017431	ATA	2	6	588860	588865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241894
13024	NC_017431	AG	3	6	588877	588882	50 %	0 %	50 %	0 %	385241894
13025	NC_017431	ATT	2	6	588925	588930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241894
13026	NC_017431	CAT	2	6	589050	589055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241894
13027	NC_017431	TCC	2	6	589084	589089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241894
13028	NC_017431	T	6	6	589115	589120	0 %	100 %	0 %	0 %	385241894
13029	NC_017431	AGC	2	6	589123	589128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241894
13030	NC_017431	AAACT	2	10	589226	589235	60 %	20 %	0 %	20 %	385241894
13031	NC_017431	CCT	2	6	589241	589246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241894
13032	NC_017431	AAC	2	6	589249	589254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241894
13033	NC_017431	ACA	2	6	589258	589263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241894
13034	NC_017431	GAC	2	6	589270	589275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241894
13035	NC_017431	CT	3	6	589362	589367	0 %	50 %	0 %	50 %	385241895
13036	NC_017431	CTA	2	6	589388	589393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241895
13037	NC_017431	CTC	2	6	589412	589417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241895
13038	NC_017431	T	6	6	589498	589503	0 %	100 %	0 %	0 %	385241895
13039	NC_017431	CAT	2	6	589571	589576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241895
13040	NC_017431	TA	3	6	589697	589702	50 %	50 %	0 %	0 %	385241895
13041	NC_017431	T	6	6	589740	589745	0 %	100 %	0 %	0 %	385241896
13042	NC_017431	GCT	2	6	589756	589761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241896
13043	NC_017431	ACG	2	6	589773	589778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241896
13044	NC_017431	AACT	2	8	589863	589870	50 %	25 %	0 %	25 %	385241896
13045	NC_017431	GTCT	2	8	590105	590112	0 %	50 %	25 %	25 %	385241896
13046	NC_017431	AACA	2	8	590133	590140	75 %	0 %	0 %	25 %	385241896
13047	NC_017431	CTT	2	6	590168	590173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241896
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13049	NC_017431	ACCAA	2	10	590318	590327	60 %	0 %	0 %	40 %	385241897
13050	NC_017431	CGC	2	6	590339	590344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385241897
13051	NC_017431	GAG	2	6	590387	590392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241897
13052	NC_017431	TGC	2	6	590439	590444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241897
13053	NC_017431	AC	3	6	590474	590479	50 %	0 %	0 %	50 %	385241897
13054	NC_017431	TCT	2	6	590554	590559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241897
13055	NC_017431	TGC	2	6	590587	590592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241897
13056	NC_017431	CTT	2	6	590744	590749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241898
13057	NC_017431	ATTC	2	8	590822	590829	25 %	50 %	0 %	25 %	385241898
13058	NC_017431	ATC	2	6	590879	590884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241898
13059	NC_017431	CATA	2	8	590986	590993	50 %	25 %	0 %	25 %	385241898
13060	NC_017431	TTA	2	6	591169	591174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241898
13061	NC_017431	TCT	2	6	591178	591183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241898
13062	NC_017431	TCTT	2	8	591235	591242	0 %	75 %	0 %	25 %	385241898
13063	NC_017431	TA	3	6	591253	591258	50 %	50 %	0 %	0 %	385241898
13064	NC_017431	T	7	7	591260	591266	0 %	100 %	0 %	0 %	385241898
13065	NC_017431	TC	5	10	591288	591297	0 %	50 %	0 %	50 %	385241899
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13067	NC_017431	ACGT	2	8	591405	591412	25 %	25 %	25 %	25 %	385241899
13068	NC_017431	GAG	2	6	591425	591430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241899
13069	NC_017431	T	6	6	591481	591486	0 %	100 %	0 %	0 %	385241899
13070	NC_017431	AAC	2	6	591527	591532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241899
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13072	NC_017431	ATC	2	6	591729	591734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241900
13073	NC_017431	GAT	2	6	591735	591740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241900
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13076	NC_017431	ATCAC	2	10	591880	591889	40 %	20 %	0 %	40 %	385241900
13077	NC_017431	CGA	2	6	591907	591912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241900
13078	NC_017431	TAT	2	6	591956	591961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241900
13079	NC_017431	ACT	2	6	592008	592013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241901
13080	NC_017431	CTT	2	6	592089	592094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241901
13081	NC_017431	ATA	2	6	592117	592122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241901
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13086	NC_017431	ACT	2	6	592214	592219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241901
13087	NC_017431	T	7	7	592275	592281	0 %	100 %	0 %	0 %	385241902
13088	NC_017431	TGA	2	6	592332	592337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241902
13089	NC_017431	AGC	2	6	592361	592366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241902
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13091	NC_017431	AG	3	6	592384	592389	50 %	0 %	50 %	0 %	385241902
13092	NC_017431	T	6	6	592391	592396	0 %	100 %	0 %	0 %	385241902
13093	NC_017431	TC	3	6	592435	592440	0 %	50 %	0 %	50 %	385241902
13094	NC_017431	TAA	2	6	592451	592456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241902
13095	NC_017431	T	6	6	592461	592466	0 %	100 %	0 %	0 %	385241902
13096	NC_017431	GCA	2	6	592525	592530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241903
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13099	NC_017431	CAG	2	6	592655	592660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241903
13100	NC_017431	T	6	6	592662	592667	0 %	100 %	0 %	0 %	385241903
13101	NC_017431	GGC	2	6	592757	592762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385241903
13102	NC_017431	ATCC	2	8	592768	592775	25 %	25 %	0 %	50 %	385241903
13103	NC_017431	CAA	2	6	592811	592816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241903
13104	NC_017431	CTG	2	6	592854	592859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241903
13105	NC_017431	ATA	2	6	592891	592896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241903
13106	NC_017431	CA	3	6	592900	592905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13107	NC_017431	GCA	2	6	592929	592934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241904
13108	NC_017431	CTT	2	6	592961	592966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241904
13109	NC_017431	AGT	2	6	593009	593014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241904
13110	NC_017431	CCGA	2	8	593089	593096	25 %	0 %	25 %	50 %	385241904
13111	NC_017431	GAAA	2	8	593195	593202	75 %	0 %	25 %	0 %	385241904
13112	NC_017431	CGA	2	6	593236	593241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241904
13113	NC_017431	TTC	2	6	593346	593351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241904
13114	NC_017431	AAC	2	6	593414	593419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241904
13115	NC_017431	GCA	2	6	593427	593432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241904
13116	NC_017431	AAG	2	6	593440	593445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241904
13117	NC_017431	TCT	2	6	593449	593454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241904
13118	NC_017431	ATT	2	6	593507	593512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241904
13119	NC_017431	CT	3	6	593602	593607	0 %	50 %	0 %	50 %	385241905
13120	NC_017431	CAA	2	6	593611	593616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241905
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13122	NC_017431	CAA	2	6	593842	593847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241905
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13228	NC_017431	T	6	6	598283	598288	0 %	100 %	0 %	0 %	385241912
13229	NC_017431	AACC	2	8	598302	598309	50 %	0 %	0 %	50 %	385241912
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13231	NC_017431	AG	3	6	598479	598484	50 %	0 %	50 %	0 %	385241912
13232	NC_017431	GATA	2	8	598516	598523	50 %	25 %	25 %	0 %	385241912
13233	NC_017431	TCCC	2	8	598601	598608	0 %	25 %	0 %	75 %	385241912
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13245	NC_017431	CTT	2	6	599247	599252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241913
13246	NC_017431	T	6	6	599251	599256	0 %	100 %	0 %	0 %	385241913
13247	NC_017431	CT	4	8	599295	599302	0 %	50 %	0 %	50 %	385241913
13248	NC_017431	TCT	2	6	599369	599374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241913
13249	NC_017431	GCC	2	6	599469	599474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385241913
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13285	NC_017431	T	12	12	601435	601446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13287	NC_017431	A	6	6	601464	601469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13353	NC_017431	TACT	2	8	604616	604623	25 %	50 %	0 %	25 %	385241919
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13492	NC_017431	TCT	2	6	611398	611403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13493	NC_017431	GAC	2	6	611435	611440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13494	NC_017431	TAC	2	6	611443	611448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13495	NC_017431	ATG	2	6	611460	611465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13496	NC_017431	A	6	6	611495	611500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13497	NC_017431	AC	3	6	611568	611573	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13498	NC_017431	CCT	2	6	611620	611625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241926
13499	NC_017431	TCT	2	6	611693	611698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241926
13500	NC_017431	TTC	2	6	611722	611727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241926

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