MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/11023 chromosome

Total Repeats: 22973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017431	TCG	2	6	228689	228694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241566
5002	NC_017431	A	7	7	228761	228767	100 %	0 %	0 %	0 %	385241566
5003	NC_017431	CCTT	2	8	228769	228776	0 %	50 %	0 %	50 %	385241566
5004	NC_017431	TTG	2	6	228791	228796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241566
5005	NC_017431	T	6	6	228827	228832	0 %	100 %	0 %	0 %	385241566
5006	NC_017431	GATA	2	8	228864	228871	50 %	25 %	25 %	0 %	385241566
5007	NC_017431	ATT	2	6	228904	228909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241566
5008	NC_017431	GAA	2	6	228913	228918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241566
5009	NC_017431	TCCTC	2	10	228944	228953	0 %	40 %	0 %	60 %	385241566
5010	NC_017431	AGA	2	6	228978	228983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241566
5011	NC_017431	CTT	2	6	229070	229075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241567
5012	NC_017431	TAC	2	6	229172	229177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241567
5013	NC_017431	TAT	2	6	229181	229186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241567
5014	NC_017431	TCT	2	6	229241	229246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241567
5015	NC_017431	TTTC	2	8	229317	229324	0 %	75 %	0 %	25 %	385241567
5016	NC_017431	CTT	2	6	229379	229384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241567
5017	NC_017431	TTA	2	6	229446	229451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241567
5018	NC_017431	TGT	2	6	229502	229507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241567
5019	NC_017431	T	6	6	229571	229576	0 %	100 %	0 %	0 %	385241567
5020	NC_017431	TAT	2	6	229646	229651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241567
5021	NC_017431	ATT	2	6	229725	229730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241567
5022	NC_017431	CAC	2	6	229771	229776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385241567
5023	NC_017431	GAA	2	6	229791	229796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241567
5024	NC_017431	ATT	2	6	229857	229862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241567
5025	NC_017431	CAA	2	6	229924	229929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241567
5026	NC_017431	TTCT	2	8	229993	230000	0 %	75 %	0 %	25 %	385241567
5027	NC_017431	ACT	2	6	230004	230009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241567
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5029	NC_017431	CTTC	2	8	230053	230060	0 %	50 %	0 %	50 %	385241567
5030	NC_017431	TTAT	2	8	230155	230162	25 %	75 %	0 %	0 %	385241567
5031	NC_017431	CTAT	2	8	230174	230181	25 %	50 %	0 %	25 %	385241567
5032	NC_017431	TCTT	2	8	230221	230228	0 %	75 %	0 %	25 %	385241567
5033	NC_017431	TGC	2	6	230264	230269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241567
5034	NC_017431	CTTAGC	2	12	230270	230281	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385241567
5035	NC_017431	GGA	2	6	230301	230306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241567
5036	NC_017431	CA	3	6	230309	230314	50 %	0 %	0 %	50 %	385241567
5037	NC_017431	TGG	2	6	230373	230378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385241567
5038	NC_017431	TTGG	2	8	230417	230424	0 %	50 %	50 %	0 %	385241567
5039	NC_017431	TGG	3	9	230436	230444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385241567
5040	NC_017431	GTC	2	6	230490	230495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241568
5041	NC_017431	CTT	2	6	230528	230533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241568
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5043	NC_017431	CTT	2	6	230596	230601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241568
5044	NC_017431	CTA	2	6	230655	230660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241568
5045	NC_017431	ATTT	2	8	230664	230671	25 %	75 %	0 %	0 %	385241568
5046	NC_017431	TGG	2	6	230742	230747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385241568
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5049	NC_017431	GC	3	6	230953	230958	0 %	0 %	50 %	50 %	385241568
5050	NC_017431	ATT	2	6	231001	231006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241568
5051	NC_017431	GCA	2	6	231114	231119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241568
5052	NC_017431	CTA	2	6	231155	231160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241568
5053	NC_017431	CATC	2	8	231170	231177	25 %	25 %	0 %	50 %	385241568
5054	NC_017431	TTA	2	6	231227	231232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241568
5055	NC_017431	TCT	3	9	231247	231255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241568
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5057	NC_017431	GCT	2	6	231382	231387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241568
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5059	NC_017431	T	6	6	231696	231701	0 %	100 %	0 %	0 %	385241568
5060	NC_017431	GC	3	6	231855	231860	0 %	0 %	50 %	50 %	385241568
5061	NC_017431	GAC	2	6	231882	231887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241568
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5073	NC_017431	A	6	6	232294	232299	100 %	0 %	0 %	0 %	385241569
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5110	NC_017431	CAA	2	6	234017	234022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241570
5111	NC_017431	TCTCT	2	10	234048	234057	0 %	60 %	0 %	40 %	385241570
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5121	NC_017431	AGA	2	6	234665	234670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_017431	GAG	2	6	234682	234687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_017431	GCT	2	6	234734	234739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_017431	ACC	2	6	234743	234748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5125	NC_017431	A	6	6	234774	234779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_017431	ACT	2	6	234838	234843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5487	NC_017431	A	8	8	251616	251623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5488	NC_017431	AAG	2	6	251634	251639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5489	NC_017431	CAT	4	12	251684	251695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241587
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5494	NC_017431	TCTT	2	8	251949	251956	0 %	75 %	0 %	25 %	385241587
5495	NC_017431	C	7	7	251961	251967	0 %	0 %	0 %	100 %	385241587
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5499	NC_017431	TTG	2	6	252108	252113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241587
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