MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1/06-A chromosome

Total Repeats: 43087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_017308	TCA	2	6	2274804	2274809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141632
43002	NC_017308	G	6	6	2274848	2274853	0 %	0 %	100 %	0 %	387141632
43003	NC_017308	CTG	2	6	2274884	2274889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141632
43004	NC_017308	CCG	2	6	2274929	2274934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387141632
43005	NC_017308	AGA	2	6	2274991	2274996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141632
43006	NC_017308	TGT	2	6	2275010	2275015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387141632
43007	NC_017308	TCT	2	6	2275029	2275034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387141632
43008	NC_017308	GGT	2	6	2275084	2275089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387141632
43009	NC_017308	GATCAA	2	12	2275123	2275134	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387141632
43010	NC_017308	GGT	2	6	2275190	2275195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387141632
43011	NC_017308	CG	3	6	2275289	2275294	0 %	0 %	50 %	50 %	387141632
43012	NC_017308	GTC	2	6	2275334	2275339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141632
43013	NC_017308	T	6	6	2275394	2275399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43014	NC_017308	CACC	2	8	2275497	2275504	25 %	0 %	0 %	75 %	387141633
43015	NC_017308	CGC	2	6	2275524	2275529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387141633
43016	NC_017308	T	6	6	2275545	2275550	0 %	100 %	0 %	0 %	387141633
43017	NC_017308	CTT	2	6	2275566	2275571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387141633
43018	NC_017308	CAA	2	6	2275680	2275685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387141633
43019	NC_017308	CAG	2	6	2276029	2276034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141633
43020	NC_017308	GGA	2	6	2276063	2276068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387141633
43021	NC_017308	GTT	2	6	2276098	2276103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387141633
43022	NC_017308	CCA	2	6	2276239	2276244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43023	NC_017308	GCC	2	6	2276263	2276268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43024	NC_017308	TG	3	6	2276273	2276278	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43025	NC_017308	GAA	2	6	2276295	2276300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43026	NC_017308	ATT	2	6	2276302	2276307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141634
43027	NC_017308	T	6	6	2276306	2276311	0 %	100 %	0 %	0 %	387141634
43028	NC_017308	CTT	2	6	2276318	2276323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387141634
43029	NC_017308	TTC	2	6	2276390	2276395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387141634
43030	NC_017308	TTA	2	6	2276415	2276420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141634
43031	NC_017308	GCT	2	6	2276431	2276436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141634
43032	NC_017308	GAA	2	6	2276438	2276443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141634
43033	NC_017308	TGT	2	6	2276452	2276457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387141634
43034	NC_017308	CCA	2	6	2276461	2276466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387141634
43035	NC_017308	CAT	2	6	2276534	2276539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141634
43036	NC_017308	TCA	2	6	2276545	2276550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141634
43037	NC_017308	TGCATT	2	12	2276559	2276570	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387141634
43038	NC_017308	TAG	2	6	2276578	2276583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141634
43039	NC_017308	GAT	2	6	2276663	2276668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141634
43040	NC_017308	AT	3	6	2276757	2276762	50 %	50 %	0 %	0 %	387141634
43041	NC_017308	CAG	2	6	2276815	2276820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141634
43042	NC_017308	AGA	2	6	2276821	2276826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141634
43043	NC_017308	TC	3	6	2276839	2276844	0 %	50 %	0 %	50 %	387141634
43044	NC_017308	CAT	2	6	2277011	2277016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141634
43045	NC_017308	CTG	2	6	2277020	2277025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141634
43046	NC_017308	CAG	2	6	2277143	2277148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141634
43047	NC_017308	ATA	2	6	2277150	2277155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387141634
43048	NC_017308	ACT	2	6	2277201	2277206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141634
43049	NC_017308	TGG	2	6	2277277	2277282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43050	NC_017308	CG	3	6	2277373	2277378	0 %	0 %	50 %	50 %	387141635
43051	NC_017308	CAC	2	6	2277404	2277409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387141635
43052	NC_017308	AT	3	6	2277487	2277492	50 %	50 %	0 %	0 %	387141635
43053	NC_017308	CAG	2	6	2277519	2277524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141635
43054	NC_017308	ATT	3	9	2277561	2277569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141635
43055	NC_017308	GA	3	6	2277603	2277608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43056	NC_017308	CTC	2	6	2277611	2277616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43057	NC_017308	AAG	2	6	2277627	2277632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141636
43058	NC_017308	CGAA	2	8	2277645	2277652	50 %	0 %	25 %	25 %	387141636
43059	NC_017308	GCC	2	6	2277685	2277690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387141636
43060	NC_017308	GAC	2	6	2277705	2277710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141636
43061	NC_017308	CCT	2	6	2277835	2277840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387141636
43062	NC_017308	ACG	2	6	2277886	2277891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141636
43063	NC_017308	TCG	2	6	2277937	2277942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141636
43064	NC_017308	CTG	2	6	2277946	2277951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141636
43065	NC_017308	GAAG	2	8	2277964	2277971	50 %	0 %	50 %	0 %	387141636
43066	NC_017308	CGT	2	6	2277975	2277980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43067	NC_017308	AAG	2	6	2277992	2277997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43068	NC_017308	ACG	3	9	2278028	2278036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141637
43069	NC_017308	CG	3	6	2278049	2278054	0 %	0 %	50 %	50 %	387141637
43070	NC_017308	CGA	2	6	2278101	2278106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141637
43071	NC_017308	GTT	2	6	2278109	2278114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387141637
43072	NC_017308	CTC	2	6	2278153	2278158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43073	NC_017308	TG	3	6	2278163	2278168	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43074	NC_017308	GAT	2	6	2278258	2278263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43075	NC_017308	CAC	2	6	2278281	2278286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43076	NC_017308	CA	3	6	2278335	2278340	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43077	NC_017308	ATG	2	6	2278349	2278354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43078	NC_017308	GCG	2	6	2278385	2278390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43079	NC_017308	CAA	2	6	2278395	2278400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43080	NC_017308	CTAG	2	8	2278472	2278479	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43081	NC_017308	GCT	2	6	2278540	2278545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43082	NC_017308	TC	3	6	2278570	2278575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43083	NC_017308	ACA	2	6	2278637	2278642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43084	NC_017308	CA	3	6	2278702	2278707	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43085	NC_017308	AAC	2	6	2278928	2278933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43086	NC_017308	ATT	2	6	2279005	2279010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43087	NC_017308	GTT	3	9	2279082	2279090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.