MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1/06-A chromosome

Total Repeats: 43087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41503	NC_017308	ATA	2	6	2195979	2195984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387141566
41504	NC_017308	GC	3	6	2195985	2195990	0 %	0 %	50 %	50 %	387141566
41505	NC_017308	TCT	2	6	2196036	2196041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387141566
41506	NC_017308	GCC	2	6	2196042	2196047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387141566
41507	NC_017308	TA	3	6	2196209	2196214	50 %	50 %	0 %	0 %	387141566
41508	NC_017308	GCC	2	6	2196216	2196221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387141566
41509	NC_017308	CGA	2	6	2196241	2196246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141566
41510	NC_017308	CGGGC	2	10	2196289	2196298	0 %	0 %	60 %	40 %	387141566
41511	NC_017308	TGC	2	6	2196300	2196305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141566
41512	NC_017308	T	6	6	2196311	2196316	0 %	100 %	0 %	0 %	387141566
41513	NC_017308	CAG	2	6	2196343	2196348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141566
41514	NC_017308	CTT	2	6	2196374	2196379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387141566
41515	NC_017308	T	7	7	2196378	2196384	0 %	100 %	0 %	0 %	387141566
41516	NC_017308	TGA	2	6	2196443	2196448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141566
41517	NC_017308	GTT	2	6	2196452	2196457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387141566
41518	NC_017308	TTAT	2	8	2196515	2196522	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41519	NC_017308	GT	3	6	2196640	2196645	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41520	NC_017308	CCAG	2	8	2196650	2196657	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41521	NC_017308	C	6	6	2196674	2196679	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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41525	NC_017308	TTCCT	2	10	2196796	2196805	0 %	60 %	0 %	40 %	387141567
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41532	NC_017308	TGTT	2	8	2197240	2197247	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41533	NC_017308	TTA	2	6	2197266	2197271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41534	NC_017308	CCA	2	6	2197272	2197277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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41540	NC_017308	CGT	2	6	2197569	2197574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141568
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41544	NC_017308	CTT	2	6	2197798	2197803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41545	NC_017308	TC	3	6	2197832	2197837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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41552	NC_017308	TAA	2	6	2198059	2198064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387141569
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41555	NC_017308	GGC	2	6	2198206	2198211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387141569
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41558	NC_017308	TGC	2	6	2198319	2198324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141569
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41585	NC_017308	ATTT	2	8	2199791	2199798	25 %	75 %	0 %	0 %	387141571
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41587	NC_017308	CAT	2	6	2199935	2199940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141571
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41590	NC_017308	GCT	2	6	2200071	2200076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141572
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41603	NC_017308	TTA	2	6	2200617	2200622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141572
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41606	NC_017308	TCT	2	6	2200743	2200748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387141572
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41610	NC_017308	CA	3	6	2200903	2200908	50 %	0 %	0 %	50 %	387141572
41611	NC_017308	ATC	2	6	2200995	2201000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141572
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41613	NC_017308	TGA	2	6	2201183	2201188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141573
41614	NC_017308	CAA	2	6	2201194	2201199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387141573
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41616	NC_017308	CTT	2	6	2201277	2201282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387141573
41617	NC_017308	ATC	2	6	2201313	2201318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141573
41618	NC_017308	T	6	6	2201346	2201351	0 %	100 %	0 %	0 %	387141573
41619	NC_017308	CGC	2	6	2201447	2201452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387141573
41620	NC_017308	A	6	6	2201486	2201491	100 %	0 %	0 %	0 %	387141573
41621	NC_017308	CGG	2	6	2201500	2201505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387141573
41622	NC_017308	AG	3	6	2201540	2201545	50 %	0 %	50 %	0 %	387141573
41623	NC_017308	GAA	2	6	2201559	2201564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141573
41624	NC_017308	CGG	2	6	2201741	2201746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387141573
41625	NC_017308	CAA	2	6	2201762	2201767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387141573
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41627	NC_017308	GC	3	6	2201918	2201923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41628	NC_017308	ACT	2	6	2202022	2202027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41629	NC_017308	TCA	2	6	2202046	2202051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141574
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41631	NC_017308	TA	3	6	2202182	2202187	50 %	50 %	0 %	0 %	387141574
41632	NC_017308	TTG	2	6	2202190	2202195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387141574
41633	NC_017308	CCA	2	6	2202292	2202297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387141574
41634	NC_017308	TTCT	2	8	2202308	2202315	0 %	75 %	0 %	25 %	387141574
41635	NC_017308	CACG	2	8	2202335	2202342	25 %	0 %	25 %	50 %	387141574
41636	NC_017308	ATC	2	6	2202361	2202366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141574
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41638	NC_017308	TTC	2	6	2202514	2202519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387141574
41639	NC_017308	TAA	2	6	2202547	2202552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41640	NC_017308	TGTT	2	8	2202557	2202564	0 %	75 %	25 %	0 %	387141575
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41642	NC_017308	CAA	2	6	2202637	2202642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387141575
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41644	NC_017308	TCCAC	2	10	2202711	2202720	20 %	20 %	0 %	60 %	387141575
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41647	NC_017308	TTA	2	6	2202924	2202929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141575
41648	NC_017308	CG	3	6	2203018	2203023	0 %	0 %	50 %	50 %	387141575
41649	NC_017308	GATC	2	8	2203032	2203039	25 %	25 %	25 %	25 %	387141575
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41651	NC_017308	CCGT	2	8	2203221	2203228	0 %	25 %	25 %	50 %	387141575
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41655	NC_017308	TG	3	6	2203324	2203329	0 %	50 %	50 %	0 %	387141575
41656	NC_017308	CATG	2	8	2203444	2203451	25 %	25 %	25 %	25 %	387141576
41657	NC_017308	GCA	2	6	2203475	2203480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141576
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41691	NC_017308	A	6	6	2205171	2205176	100 %	0 %	0 %	0 %	387141577
41692	NC_017308	AGA	2	6	2205215	2205220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141577
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41703	NC_017308	GCC	2	6	2205902	2205907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387141578
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41705	NC_017308	GCA	2	6	2205948	2205953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141578
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41708	NC_017308	AG	3	6	2206037	2206042	50 %	0 %	50 %	0 %	387141578
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41723	NC_017308	TGA	2	6	2206871	2206876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141578
41724	NC_017308	CAC	2	6	2206878	2206883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387141578
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41726	NC_017308	GC	3	6	2206896	2206901	0 %	0 %	50 %	50 %	387141578
41727	NC_017308	CCTG	2	8	2206922	2206929	0 %	25 %	25 %	50 %	387141578
41728	NC_017308	TCA	2	6	2206946	2206951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141578
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41730	NC_017308	ACC	3	9	2206984	2206992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387141578
41731	NC_017308	GAG	2	6	2207011	2207016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387141578
41732	NC_017308	T	6	6	2207017	2207022	0 %	100 %	0 %	0 %	387141578
41733	NC_017308	TGCT	2	8	2207053	2207060	0 %	50 %	25 %	25 %	387141578
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41974	NC_017308	CACG	2	8	2220416	2220423	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41975	NC_017308	TGC	2	6	2220446	2220451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41976	NC_017308	CAC	2	6	2220602	2220607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41977	NC_017308	ATC	2	6	2220903	2220908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41978	NC_017308	T	6	6	2220955	2220960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41979	NC_017308	GAG	2	6	2220976	2220981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41980	NC_017308	TCTT	2	8	2221000	2221007	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41981	NC_017308	T	7	7	2221006	2221012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41982	NC_017308	CTT	2	6	2221122	2221127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41983	NC_017308	TGC	2	6	2221136	2221141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41984	NC_017308	CTC	2	6	2221152	2221157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41985	NC_017308	GGT	2	6	2221245	2221250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41986	NC_017308	CAA	2	6	2221338	2221343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41987	NC_017308	TTA	2	6	2221396	2221401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41988	NC_017308	TCTTTA	2	12	2221513	2221524	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41989	NC_017308	TTC	2	6	2221619	2221624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41990	NC_017308	CGCTT	2	10	2221661	2221670	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
41991	NC_017308	GTG	2	6	2221688	2221693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41992	NC_017308	TTC	2	6	2221702	2221707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41993	NC_017308	GCC	2	6	2221774	2221779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41994	NC_017308	ATC	2	6	2221781	2221786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41995	NC_017308	GTA	2	6	2221831	2221836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41996	NC_017308	AGA	2	6	2221848	2221853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41997	NC_017308	AGA	2	6	2221904	2221909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41998	NC_017308	CCG	2	6	2221922	2221927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41999	NC_017308	CAT	2	6	2221948	2221953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42000	NC_017308	CGA	2	6	2221975	2221980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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