MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1/06-A chromosome

Total Repeats: 43087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_017308	CT	3	6	2119296	2119301	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40002	NC_017308	TTA	2	6	2119380	2119385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141502
40003	NC_017308	CCA	2	6	2119452	2119457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387141502
40004	NC_017308	TAA	2	6	2119545	2119550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387141502
40005	NC_017308	GA	3	6	2119576	2119581	50 %	0 %	50 %	0 %	387141502
40006	NC_017308	CG	3	6	2119622	2119627	0 %	0 %	50 %	50 %	387141502
40007	NC_017308	TCA	2	6	2119690	2119695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141502
40008	NC_017308	CAAAGT	2	12	2119774	2119785	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387141502
40009	NC_017308	GCA	2	6	2119830	2119835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141502
40010	NC_017308	AGA	2	6	2119872	2119877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141502
40011	NC_017308	TGC	2	6	2119916	2119921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141502
40012	NC_017308	ATC	2	6	2119949	2119954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141502
40013	NC_017308	GTCT	2	8	2120027	2120034	0 %	50 %	25 %	25 %	387141502
40014	NC_017308	TTC	2	6	2120105	2120110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387141502
40015	NC_017308	TGC	2	6	2120117	2120122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141502
40016	NC_017308	AATC	2	8	2120131	2120138	50 %	25 %	0 %	25 %	387141502
40017	NC_017308	GC	3	6	2120161	2120166	0 %	0 %	50 %	50 %	387141502
40018	NC_017308	ATTG	2	8	2120293	2120300	25 %	50 %	25 %	0 %	387141502
40019	NC_017308	GCG	2	6	2120414	2120419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387141502
40020	NC_017308	CAA	2	6	2120422	2120427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387141502
40021	NC_017308	TTG	2	6	2120439	2120444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387141502
40022	NC_017308	GCG	2	6	2120454	2120459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387141502
40023	NC_017308	CCG	2	6	2120655	2120660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387141503
40024	NC_017308	CGGC	2	8	2120669	2120676	0 %	0 %	50 %	50 %	387141503
40025	NC_017308	GC	3	6	2120675	2120680	0 %	0 %	50 %	50 %	387141503
40026	NC_017308	AGC	2	6	2120785	2120790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141503
40027	NC_017308	GCG	2	6	2120860	2120865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387141503
40028	NC_017308	GCCC	2	8	2120899	2120906	0 %	0 %	25 %	75 %	387141503
40029	NC_017308	TCG	2	6	2120929	2120934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141503
40030	NC_017308	CAG	2	6	2120945	2120950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141503
40031	NC_017308	GC	4	8	2120965	2120972	0 %	0 %	50 %	50 %	387141503
40032	NC_017308	CAA	2	6	2121023	2121028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387141503
40033	NC_017308	TTG	2	6	2121073	2121078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387141503
40034	NC_017308	GC	3	6	2121171	2121176	0 %	0 %	50 %	50 %	387141503
40035	NC_017308	GC	3	6	2121198	2121203	0 %	0 %	50 %	50 %	387141503
40036	NC_017308	TACG	2	8	2121386	2121393	25 %	25 %	25 %	25 %	387141503
40037	NC_017308	CGA	2	6	2121416	2121421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141504
40038	NC_017308	AGAA	2	8	2121440	2121447	75 %	0 %	25 %	0 %	387141504
40039	NC_017308	TCCT	2	8	2121507	2121514	0 %	50 %	0 %	50 %	387141504
40040	NC_017308	AGG	2	6	2121530	2121535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387141504
40041	NC_017308	CCA	2	6	2121591	2121596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387141504
40042	NC_017308	ACC	2	6	2121653	2121658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387141504
40043	NC_017308	GCG	2	6	2121725	2121730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387141504
40044	NC_017308	CAGA	2	8	2121775	2121782	50 %	0 %	25 %	25 %	387141504
40045	NC_017308	GCA	2	6	2121783	2121788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141504
40046	NC_017308	GTA	2	6	2121807	2121812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141504
40047	NC_017308	GCC	2	6	2121985	2121990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387141504
40048	NC_017308	CAA	2	6	2122026	2122031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387141504
40049	NC_017308	CGC	2	6	2122032	2122037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387141504
40050	NC_017308	CGA	2	6	2122053	2122058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141504
40051	NC_017308	TGG	2	6	2122086	2122091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387141504
40052	NC_017308	CTG	2	6	2122197	2122202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141504
40053	NC_017308	AGCA	2	8	2122204	2122211	50 %	0 %	25 %	25 %	387141504
40054	NC_017308	TGG	2	6	2122271	2122276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387141504
40055	NC_017308	CGCT	2	8	2122277	2122284	0 %	25 %	25 %	50 %	387141504
40056	NC_017308	CCA	2	6	2122344	2122349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387141504
40057	NC_017308	ACT	2	6	2122461	2122466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40058	NC_017308	CAT	2	6	2122509	2122514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141505
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40061	NC_017308	TAA	2	6	2122856	2122861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387141505
40062	NC_017308	GCC	2	6	2122967	2122972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387141505
40063	NC_017308	TCG	2	6	2123000	2123005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141505
40064	NC_017308	GCC	2	6	2123015	2123020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387141505
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40067	NC_017308	CCA	2	6	2123112	2123117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387141505
40068	NC_017308	CTG	2	6	2123169	2123174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141505
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40071	NC_017308	CAAC	2	8	2123399	2123406	50 %	0 %	0 %	50 %	387141505
40072	NC_017308	CAT	2	6	2123479	2123484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141505
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40075	NC_017308	CTTT	2	8	2123539	2123546	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40076	NC_017308	GACA	2	8	2123582	2123589	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40077	NC_017308	GCT	2	6	2123662	2123667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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40082	NC_017308	TTA	2	6	2123941	2123946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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40084	NC_017308	ACG	2	6	2123970	2123975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141506
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40090	NC_017308	CGG	2	6	2124515	2124520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387141506
40091	NC_017308	CAG	2	6	2124536	2124541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141506
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40100	NC_017308	GGT	2	6	2125333	2125338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387141506
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40102	NC_017308	CG	3	6	2125355	2125360	0 %	0 %	50 %	50 %	387141506
40103	NC_017308	TGC	2	6	2125505	2125510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141506
40104	NC_017308	TCG	2	6	2125514	2125519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141506
40105	NC_017308	ATC	2	6	2125618	2125623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141506
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40108	NC_017308	CAT	2	6	2125782	2125787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141506
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40110	NC_017308	CAT	2	6	2126101	2126106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141507
40111	NC_017308	TGG	2	6	2126113	2126118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387141507
40112	NC_017308	CAG	2	6	2126249	2126254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141507
40113	NC_017308	CAT	2	6	2126401	2126406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141507
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40115	NC_017308	GGCC	2	8	2126739	2126746	0 %	0 %	50 %	50 %	387141507
40116	NC_017308	A	6	6	2126759	2126764	100 %	0 %	0 %	0 %	387141507
40117	NC_017308	GC	3	6	2126781	2126786	0 %	0 %	50 %	50 %	387141507
40118	NC_017308	TCC	2	6	2126889	2126894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387141507
40119	NC_017308	TCT	2	6	2127036	2127041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387141508
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40201	NC_017308	CGC	2	6	2130592	2130597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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40217	NC_017308	CCCA	2	8	2131376	2131383	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
40218	NC_017308	CATAGA	2	12	2131395	2131406	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40219	NC_017308	T	7	7	2131420	2131426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40220	NC_017308	TGC	2	6	2131495	2131500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141512
40221	NC_017308	AG	3	6	2131554	2131559	50 %	0 %	50 %	0 %	387141512
40222	NC_017308	TACA	2	8	2131568	2131575	50 %	25 %	0 %	25 %	387141512
40223	NC_017308	GGA	2	6	2131604	2131609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387141512
40224	NC_017308	TGC	2	6	2131751	2131756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141512
40225	NC_017308	AT	3	6	2131794	2131799	50 %	50 %	0 %	0 %	387141512
40226	NC_017308	TC	3	6	2131851	2131856	0 %	50 %	0 %	50 %	387141512
40227	NC_017308	CCG	2	6	2131888	2131893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387141512
40228	NC_017308	TTC	2	6	2131907	2131912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387141512
40229	NC_017308	GCA	2	6	2131926	2131931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141512
40230	NC_017308	CTG	2	6	2131940	2131945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141512
40231	NC_017308	CCA	2	6	2131966	2131971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387141512
40232	NC_017308	CGG	2	6	2132057	2132062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387141512
40233	NC_017308	GCA	2	6	2132181	2132186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40234	NC_017308	GGC	2	6	2132216	2132221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40235	NC_017308	GTC	2	6	2132317	2132322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141513
40236	NC_017308	TAA	2	6	2132354	2132359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387141513
40237	NC_017308	GTGGA	2	10	2132499	2132508	20 %	20 %	60 %	0 %	387141513
40238	NC_017308	CGG	2	6	2132598	2132603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387141513
40239	NC_017308	GCA	3	9	2132654	2132662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141513
40240	NC_017308	GGA	2	6	2132668	2132673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387141513
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40242	NC_017308	TGC	2	6	2132702	2132707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141513
40243	NC_017308	TG	3	6	2132744	2132749	0 %	50 %	50 %	0 %	387141513
40244	NC_017308	ATG	2	6	2132792	2132797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141513
40245	NC_017308	CGT	2	6	2132838	2132843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141513
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40247	NC_017308	TAG	2	6	2133086	2133091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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40278	NC_017308	GAGCA	2	10	2134364	2134373	40 %	0 %	40 %	20 %	387141515
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40341	NC_017308	GA	3	6	2137527	2137532	50 %	0 %	50 %	0 %	387141517
40342	NC_017308	ATT	2	6	2137542	2137547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141517
40343	NC_017308	ATG	2	6	2137552	2137557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141517
40344	NC_017308	TG	3	6	2137556	2137561	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40345	NC_017308	AAG	2	6	2137576	2137581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141518
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40350	NC_017308	GTGG	2	8	2138109	2138116	0 %	25 %	75 %	0 %	387141518
40351	NC_017308	T	6	6	2138126	2138131	0 %	100 %	0 %	0 %	387141518
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40353	NC_017308	CG	3	6	2138164	2138169	0 %	0 %	50 %	50 %	387141518
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