MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1/06-A chromosome

Total Repeats: 43087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_017308	CGG	2	6	1644255	1644260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387141107
31003	NC_017308	GAA	2	6	1644278	1644283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141107
31004	NC_017308	TGC	2	6	1644394	1644399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141108
31005	NC_017308	TCG	3	9	1644461	1644469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141108
31006	NC_017308	ACCA	2	8	1644503	1644510	50 %	0 %	0 %	50 %	387141108
31007	NC_017308	GGC	2	6	1644527	1644532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387141108
31008	NC_017308	TGC	2	6	1644537	1644542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141108
31009	NC_017308	CGC	2	6	1644668	1644673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387141108
31010	NC_017308	GCT	2	6	1644683	1644688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141108
31011	NC_017308	TCA	2	6	1644806	1644811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141108
31012	NC_017308	GCA	2	6	1644830	1644835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141108
31013	NC_017308	CGA	2	6	1644886	1644891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141108
31014	NC_017308	C	6	6	1645044	1645049	0 %	0 %	0 %	100 %	387141108
31015	NC_017308	AT	3	6	1645080	1645085	50 %	50 %	0 %	0 %	387141108
31016	NC_017308	ATT	2	6	1645164	1645169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141108
31017	NC_017308	GCAC	2	8	1645184	1645191	25 %	0 %	25 %	50 %	387141108
31018	NC_017308	CGA	2	6	1645198	1645203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141108
31019	NC_017308	CTT	2	6	1645224	1645229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387141108
31020	NC_017308	AGG	2	6	1645257	1645262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387141108
31021	NC_017308	CGT	2	6	1645284	1645289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141108
31022	NC_017308	AT	3	6	1645465	1645470	50 %	50 %	0 %	0 %	387141109
31023	NC_017308	CT	3	6	1645508	1645513	0 %	50 %	0 %	50 %	387141109
31024	NC_017308	ACG	2	6	1645535	1645540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141109
31025	NC_017308	AT	3	6	1645549	1645554	50 %	50 %	0 %	0 %	387141109
31026	NC_017308	GA	3	6	1645600	1645605	50 %	0 %	50 %	0 %	387141109
31027	NC_017308	TAAT	2	8	1645659	1645666	50 %	50 %	0 %	0 %	387141109
31028	NC_017308	AAG	2	6	1645701	1645706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141109
31029	NC_017308	TAT	2	6	1645725	1645730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141109
31030	NC_017308	TGCA	2	8	1645732	1645739	25 %	25 %	25 %	25 %	387141109
31031	NC_017308	ACA	2	6	1645762	1645767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387141109
31032	NC_017308	GAA	2	6	1645787	1645792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141109
31033	NC_017308	CCCCTC	2	12	1645798	1645809	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	387141109
31034	NC_017308	TC	3	6	1645839	1645844	0 %	50 %	0 %	50 %	387141109
31035	NC_017308	CAA	2	6	1645858	1645863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387141109
31036	NC_017308	TATT	2	8	1645871	1645878	25 %	75 %	0 %	0 %	387141109
31037	NC_017308	GAA	2	6	1645892	1645897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141109
31038	NC_017308	AAAAAC	2	12	1645946	1645957	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	387141109
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31040	NC_017308	ACG	2	6	1646007	1646012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141109
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31042	NC_017308	GGC	2	6	1646087	1646092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387141109
31043	NC_017308	CCA	2	6	1646118	1646123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387141109
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31048	NC_017308	TCA	2	6	1646317	1646322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141109
31049	NC_017308	GGA	2	6	1646342	1646347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387141109
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31051	NC_017308	ACG	2	6	1646400	1646405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141109
31052	NC_017308	CAC	2	6	1646455	1646460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387141109
31053	NC_017308	TGGC	2	8	1646470	1646477	0 %	25 %	50 %	25 %	387141109
31054	NC_017308	ACC	2	6	1646479	1646484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387141109
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31062	NC_017308	ATC	2	6	1646865	1646870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141110
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31065	NC_017308	CAT	2	6	1646895	1646900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141110
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31084	NC_017308	ACTT	2	8	1647687	1647694	25 %	50 %	0 %	25 %	387141110
31085	NC_017308	GAT	2	6	1647780	1647785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141110
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31087	NC_017308	GTC	2	6	1648131	1648136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141110
31088	NC_017308	AGC	2	6	1648269	1648274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141110
31089	NC_017308	GAT	2	6	1648284	1648289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141110
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31098	NC_017308	GCG	2	6	1648864	1648869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387141111
31099	NC_017308	AAG	2	6	1648967	1648972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31100	NC_017308	CAT	2	6	1648998	1649003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31101	NC_017308	TTC	2	6	1649007	1649012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31102	NC_017308	CAA	2	6	1649025	1649030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387141112
31103	NC_017308	GCATAT	2	12	1649122	1649133	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387141112
31104	NC_017308	CGA	2	6	1649171	1649176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141112
31105	NC_017308	CAT	2	6	1649199	1649204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141112
31106	NC_017308	GGT	3	9	1649298	1649306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387141112
31107	NC_017308	AGTA	2	8	1649373	1649380	50 %	25 %	25 %	0 %	387141112
31108	NC_017308	GTG	2	6	1649528	1649533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387141112
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31110	NC_017308	CGT	2	6	1649579	1649584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141112
31111	NC_017308	GCC	2	6	1649619	1649624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387141112
31112	NC_017308	CA	3	6	1649734	1649739	50 %	0 %	0 %	50 %	387141112
31113	NC_017308	CAA	3	9	1649793	1649801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387141112
31114	NC_017308	ACA	2	6	1649815	1649820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387141112
31115	NC_017308	TTC	2	6	1649866	1649871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387141112
31116	NC_017308	A	6	6	1649913	1649918	100 %	0 %	0 %	0 %	387141112
31117	NC_017308	C	6	6	1650037	1650042	0 %	0 %	0 %	100 %	387141113
31118	NC_017308	CG	3	6	1650044	1650049	0 %	0 %	50 %	50 %	387141113
31119	NC_017308	TGA	2	6	1650057	1650062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141113
31120	NC_017308	GTGC	2	8	1650084	1650091	0 %	25 %	50 %	25 %	387141113
31121	NC_017308	TGC	2	6	1650205	1650210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141113
31122	NC_017308	TTGC	2	8	1650284	1650291	0 %	50 %	25 %	25 %	387141113
31123	NC_017308	CAG	2	6	1650378	1650383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141113
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31125	NC_017308	ATG	2	6	1650557	1650562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141113
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31136	NC_017308	GCA	2	6	1651430	1651435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141113
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31152	NC_017308	TGC	2	6	1652114	1652119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141114
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31158	NC_017308	AGT	2	6	1652540	1652545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141115
31159	NC_017308	CGG	2	6	1652557	1652562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387141115
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31219	NC_017308	CGATG	2	10	1655960	1655969	20 %	20 %	40 %	20 %	387141118
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31226	NC_017308	GACGC	2	10	1656414	1656423	20 %	0 %	40 %	40 %	387141119
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31229	NC_017308	AGG	2	6	1656603	1656608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387141119
31230	NC_017308	GGC	2	6	1656610	1656615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387141119
31231	NC_017308	GGC	2	6	1656743	1656748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387141119
31232	NC_017308	TGA	2	6	1656819	1656824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141119
31233	NC_017308	GAG	2	6	1656845	1656850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387141119
31234	NC_017308	GTC	2	6	1656862	1656867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141119
31235	NC_017308	GAG	2	6	1656968	1656973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387141119
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31240	NC_017308	CGT	2	6	1657119	1657124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141120
31241	NC_017308	CGG	2	6	1657125	1657130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387141120
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31249	NC_017308	GTC	2	6	1657544	1657549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141120
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31254	NC_017308	CGT	2	6	1657710	1657715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141120
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31270	NC_017308	AATA	2	8	1658453	1658460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31271	NC_017308	TGC	2	6	1658467	1658472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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31273	NC_017308	GCG	2	6	1658513	1658518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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31280	NC_017308	A	10	10	1658861	1658870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31281	NC_017308	GCAGT	2	10	1658921	1658930	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31282	NC_017308	TAG	2	6	1658955	1658960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141121
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31297	NC_017308	GCC	2	6	1659791	1659796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387141123
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31321	NC_017308	CGA	2	6	1660957	1660962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141123
31322	NC_017308	CG	3	6	1660981	1660986	0 %	0 %	50 %	50 %	387141123
31323	NC_017308	A	6	6	1660999	1661004	100 %	0 %	0 %	0 %	387141123
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31334	NC_017308	TCGCGT	2	12	1661348	1661359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141123
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31340	NC_017308	GAT	2	6	1661832	1661837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141124
31341	NC_017308	CG	3	6	1661961	1661966	0 %	0 %	50 %	50 %	387141124
31342	NC_017308	GCCC	2	8	1661997	1662004	0 %	0 %	25 %	75 %	387141124
31343	NC_017308	AG	4	8	1662086	1662093	50 %	0 %	50 %	0 %	387141124
31344	NC_017308	TTG	2	6	1662103	1662108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387141124
31345	NC_017308	CAG	2	6	1662164	1662169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141124
31346	NC_017308	AGC	2	6	1662217	1662222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141124
31347	NC_017308	TCTT	2	8	1662436	1662443	0 %	75 %	0 %	25 %	387141124
31348	NC_017308	CAG	2	6	1662739	1662744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141125
31349	NC_017308	TCA	2	6	1662801	1662806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141125
31350	NC_017308	GTC	2	6	1662854	1662859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141125
31351	NC_017308	CAGA	2	8	1662955	1662962	50 %	0 %	25 %	25 %	387141125
31352	NC_017308	T	6	6	1663001	1663006	0 %	100 %	0 %	0 %	387141125
31353	NC_017308	CTTT	2	8	1663029	1663036	0 %	75 %	0 %	25 %	387141125
31354	NC_017308	CCG	2	6	1663060	1663065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387141125
31355	NC_017308	AGC	2	6	1663074	1663079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141125
31356	NC_017308	GCC	2	6	1663107	1663112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387141125
31357	NC_017308	GTA	2	6	1663202	1663207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141125
31358	NC_017308	CAA	2	6	1663240	1663245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387141125
31359	NC_017308	ATG	2	6	1663272	1663277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141125
31360	NC_017308	GCA	2	6	1663285	1663290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141125
31361	NC_017308	CAT	2	6	1663295	1663300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141125
31362	NC_017308	GCT	2	6	1663417	1663422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141125
31363	NC_017308	CGC	2	6	1663469	1663474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387141125
31364	NC_017308	A	6	6	1663481	1663486	100 %	0 %	0 %	0 %	387141125
31365	NC_017308	GGGA	2	8	1663533	1663540	25 %	0 %	75 %	0 %	387141125
31366	NC_017308	AAGC	2	8	1663558	1663565	50 %	0 %	25 %	25 %	387141125
31367	NC_017308	AGC	2	6	1663583	1663588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141125
31368	NC_017308	TCA	2	6	1663612	1663617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141125
31369	NC_017308	GCG	2	6	1663685	1663690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387141125
31370	NC_017308	CGA	2	6	1663738	1663743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141125
31371	NC_017308	CTG	2	6	1663906	1663911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141125
31372	NC_017308	TGC	2	6	1663922	1663927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141125
31373	NC_017308	AGCC	2	8	1663976	1663983	25 %	0 %	25 %	50 %	387141125
31374	NC_017308	CAA	2	6	1664024	1664029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387141125
31375	NC_017308	GAA	2	6	1664072	1664077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141125
31376	NC_017308	TTG	2	6	1664084	1664089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387141125
31377	NC_017308	AAACC	2	10	1664110	1664119	60 %	0 %	0 %	40 %	387141125
31378	NC_017308	CAC	2	6	1664174	1664179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387141125
31379	NC_017308	AGC	2	6	1664217	1664222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31380	NC_017308	TCGT	2	8	1664303	1664310	0 %	50 %	25 %	25 %	387141126
31381	NC_017308	AT	3	6	1664333	1664338	50 %	50 %	0 %	0 %	387141126
31382	NC_017308	ATC	2	6	1664354	1664359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141126
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31384	NC_017308	AGC	2	6	1664438	1664443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141126
31385	NC_017308	TCA	2	6	1664465	1664470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141126
31386	NC_017308	CAG	2	6	1664518	1664523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141126
31387	NC_017308	AG	3	6	1664560	1664565	50 %	0 %	50 %	0 %	387141126
31388	NC_017308	AGT	2	6	1664640	1664645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141126
31389	NC_017308	ATG	2	6	1664699	1664704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141126
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31391	NC_017308	TGA	2	6	1664817	1664822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141126
31392	NC_017308	ACT	2	6	1665043	1665048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141127
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31403	NC_017308	CGT	2	6	1665516	1665521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141127
31404	NC_017308	CTC	2	6	1665594	1665599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387141127
31405	NC_017308	TTAGC	2	10	1665689	1665698	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31406	NC_017308	CGTG	2	8	1665790	1665797	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31407	NC_017308	CGTG	2	8	1665831	1665838	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31408	NC_017308	CTT	2	6	1665887	1665892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387141128
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31411	NC_017308	CAG	2	6	1665951	1665956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141128
31412	NC_017308	GA	3	6	1665968	1665973	50 %	0 %	50 %	0 %	387141128
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31419	NC_017308	AAG	2	6	1666282	1666287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141128
31420	NC_017308	GAT	2	6	1666293	1666298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141128
31421	NC_017308	GA	3	6	1666342	1666347	50 %	0 %	50 %	0 %	387141128
31422	NC_017308	TCC	2	6	1666356	1666361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387141128
31423	NC_017308	GTG	2	6	1666396	1666401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387141128
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31425	NC_017308	GGT	2	6	1666428	1666433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387141128
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31427	NC_017308	CGT	2	6	1666682	1666687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141128
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31432	NC_017308	GAT	2	6	1667199	1667204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141128
31433	NC_017308	GCA	2	6	1667239	1667244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141128
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31436	NC_017308	CTG	2	6	1667442	1667447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141128
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31442	NC_017308	ACACA	2	10	1667846	1667855	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
31443	NC_017308	GAA	2	6	1668072	1668077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141129
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31446	NC_017308	GGAC	2	8	1668110	1668117	25 %	0 %	50 %	25 %	387141129
31447	NC_017308	A	6	6	1668171	1668176	100 %	0 %	0 %	0 %	387141129
31448	NC_017308	TTG	2	6	1668193	1668198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387141129
31449	NC_017308	CCT	2	6	1668230	1668235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387141129
31450	NC_017308	ACG	3	9	1668259	1668267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141129
31451	NC_017308	CGA	2	6	1668464	1668469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31452	NC_017308	TTC	2	6	1668504	1668509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31453	NC_017308	TGTT	2	8	1668552	1668559	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31454	NC_017308	A	6	6	1668710	1668715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31455	NC_017308	CAA	2	6	1668804	1668809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387141130
31456	NC_017308	CAA	2	6	1668951	1668956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387141130
31457	NC_017308	AAG	2	6	1668967	1668972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141130
31458	NC_017308	ATG	2	6	1669089	1669094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31459	NC_017308	AGA	2	6	1669161	1669166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141131
31460	NC_017308	CCA	2	6	1669256	1669261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387141131
31461	NC_017308	GAA	2	6	1669323	1669328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141131
31462	NC_017308	AAT	2	6	1669336	1669341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387141131
31463	NC_017308	CGC	2	6	1669342	1669347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387141131
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31465	NC_017308	CCA	2	6	1669454	1669459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387141131
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31467	NC_017308	CCA	2	6	1669524	1669529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387141131
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