MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1/06-A chromosome

Total Repeats: 43087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21003	NC_017308	GAT	2	6	1102133	1102138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387140634
21004	NC_017308	T	6	6	1102151	1102156	0 %	100 %	0 %	0 %	387140634
21005	NC_017308	CCATG	2	10	1102178	1102187	20 %	20 %	20 %	40 %	387140634
21006	NC_017308	TCT	2	6	1102245	1102250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387140634
21007	NC_017308	CTT	2	6	1102267	1102272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387140634
21008	NC_017308	TGC	2	6	1102290	1102295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387140634
21009	NC_017308	GCT	2	6	1102379	1102384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387140634
21010	NC_017308	ATT	2	6	1102412	1102417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387140634
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21012	NC_017308	GTG	2	6	1102507	1102512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21013	NC_017308	AGT	2	6	1102518	1102523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21033	NC_017308	GAA	2	6	1103665	1103670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21102	NC_017308	TAGG	2	8	1107341	1107348	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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21105	NC_017308	TAT	2	6	1107455	1107460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21118	NC_017308	TG	3	6	1108029	1108034	0 %	50 %	50 %	0 %	387140639
21119	NC_017308	TGC	2	6	1108082	1108087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387140639
21120	NC_017308	CAT	2	6	1108094	1108099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387140639
21121	NC_017308	CAA	2	6	1108195	1108200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387140639
21122	NC_017308	CA	3	6	1108209	1108214	50 %	0 %	0 %	50 %	387140639
21123	NC_017308	TCTT	2	8	1108248	1108255	0 %	75 %	0 %	25 %	387140639
21124	NC_017308	ATC	2	6	1108304	1108309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387140639
21125	NC_017308	T	6	6	1108317	1108322	0 %	100 %	0 %	0 %	387140639
21126	NC_017308	AAGCC	2	10	1108337	1108346	40 %	0 %	20 %	40 %	387140639
21127	NC_017308	AG	3	6	1108394	1108399	50 %	0 %	50 %	0 %	387140639
21128	NC_017308	TAC	2	6	1108439	1108444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387140639
21129	NC_017308	CGA	2	6	1108543	1108548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387140639
21130	NC_017308	TC	3	6	1108658	1108663	0 %	50 %	0 %	50 %	387140639
21131	NC_017308	GCC	2	6	1108688	1108693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387140639
21132	NC_017308	TGC	2	6	1108715	1108720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387140639
21133	NC_017308	ATG	3	9	1108731	1108739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387140639
21134	NC_017308	GAA	2	6	1108798	1108803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387140639
21135	NC_017308	GC	4	8	1108844	1108851	0 %	0 %	50 %	50 %	387140639
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21137	NC_017308	TAA	2	6	1108914	1108919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21138	NC_017308	GATCGC	2	12	1108981	1108992	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21139	NC_017308	CAT	2	6	1109006	1109011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21140	NC_017308	TAT	2	6	1109024	1109029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21141	NC_017308	TTA	2	6	1109066	1109071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21142	NC_017308	CT	3	6	1109117	1109122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21143	NC_017308	T	6	6	1109162	1109167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21144	NC_017308	GTTT	2	8	1109221	1109228	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21145	NC_017308	GC	3	6	1109366	1109371	0 %	0 %	50 %	50 %	387140640
21146	NC_017308	TTGG	2	8	1109432	1109439	0 %	50 %	50 %	0 %	387140640
21147	NC_017308	TCGC	2	8	1109458	1109465	0 %	25 %	25 %	50 %	387140640
21148	NC_017308	CTT	2	6	1109536	1109541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387140640
21149	NC_017308	CGGTCG	2	12	1109547	1109558	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	387140640
21150	NC_017308	TTCA	2	8	1109633	1109640	25 %	50 %	0 %	25 %	387140640
21151	NC_017308	T	6	6	1109649	1109654	0 %	100 %	0 %	0 %	387140640
21152	NC_017308	ATC	2	6	1109837	1109842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387140640
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21155	NC_017308	A	6	6	1110065	1110070	100 %	0 %	0 %	0 %	387140640
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21157	NC_017308	C	6	6	1110118	1110123	0 %	0 %	0 %	100 %	387140640
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21159	NC_017308	TTG	2	6	1110180	1110185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387140640
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21165	NC_017308	GCA	2	6	1110485	1110490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21173	NC_017308	ATT	2	6	1111201	1111206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21174	NC_017308	TC	3	6	1111248	1111253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21175	NC_017308	CTC	2	6	1111363	1111368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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21178	NC_017308	T	6	6	1111498	1111503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21179	NC_017308	GAA	2	6	1111522	1111527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21187	NC_017308	AGCTTT	2	12	1112166	1112177	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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21189	NC_017308	CTTT	2	8	1112228	1112235	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21190	NC_017308	TGC	2	6	1112238	1112243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21191	NC_017308	TAA	2	6	1112341	1112346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21194	NC_017308	ACC	2	6	1112406	1112411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21195	NC_017308	CAA	2	6	1112490	1112495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21198	NC_017308	GTC	2	6	1112685	1112690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21201	NC_017308	T	6	6	1112888	1112893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21202	NC_017308	CT	3	6	1112906	1112911	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21203	NC_017308	AGC	2	6	1112937	1112942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21204	NC_017308	CTG	2	6	1113026	1113031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21207	NC_017308	CATT	2	8	1113145	1113152	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21208	NC_017308	GCA	2	6	1113181	1113186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21209	NC_017308	AG	3	6	1113210	1113215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21210	NC_017308	TCT	2	6	1113298	1113303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21211	NC_017308	GAT	2	6	1113339	1113344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21212	NC_017308	GTC	2	6	1113345	1113350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21213	NC_017308	TTC	2	6	1113351	1113356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21214	NC_017308	TAA	2	6	1113383	1113388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21215	NC_017308	T	7	7	1113407	1113413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21216	NC_017308	AGC	2	6	1113414	1113419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21217	NC_017308	GTGC	2	8	1113421	1113428	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21218	NC_017308	TCG	2	6	1113439	1113444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21219	NC_017308	CTA	2	6	1113455	1113460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21220	NC_017308	TGC	2	6	1113472	1113477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21221	NC_017308	CAGCG	2	10	1113548	1113557	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21222	NC_017308	ACC	2	6	1113558	1113563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21223	NC_017308	AATC	2	8	1113605	1113612	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21224	NC_017308	ATG	2	6	1113613	1113618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21225	NC_017308	AGC	2	6	1113640	1113645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21226	NC_017308	TG	3	6	1113710	1113715	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21227	NC_017308	TTG	2	6	1113729	1113734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21228	NC_017308	ATC	2	6	1113823	1113828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21229	NC_017308	AGA	2	6	1113870	1113875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21230	NC_017308	CAA	2	6	1113938	1113943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21231	NC_017308	CTG	2	6	1113956	1113961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21232	NC_017308	GCT	2	6	1114039	1114044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21233	NC_017308	GAAA	2	8	1114141	1114148	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21234	NC_017308	CTCA	2	8	1114158	1114165	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21235	NC_017308	AC	3	6	1114290	1114295	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21236	NC_017308	CTA	2	6	1114313	1114318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21237	NC_017308	ATGC	2	8	1114325	1114332	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21238	NC_017308	ATC	2	6	1114411	1114416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21239	NC_017308	GTA	2	6	1114434	1114439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21240	NC_017308	CGG	2	6	1114516	1114521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21241	NC_017308	TCG	2	6	1114546	1114551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21242	NC_017308	AAGC	2	8	1114583	1114590	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21243	NC_017308	CAA	2	6	1114658	1114663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21244	NC_017308	GTAT	2	8	1114899	1114906	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21245	NC_017308	TG	3	6	1114907	1114912	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21246	NC_017308	ATCTTC	2	12	1114990	1115001	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387140643
21247	NC_017308	CGTA	2	8	1115019	1115026	25 %	25 %	25 %	25 %	387140643
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21339	NC_017308	CAT	2	6	1119936	1119941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387140648
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21342	NC_017308	AAG	2	6	1120031	1120036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387140648
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21344	NC_017308	GGC	2	6	1120113	1120118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387140648
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21346	NC_017308	CTTC	2	8	1120198	1120205	0 %	50 %	0 %	50 %	387140648
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21348	NC_017308	GCT	2	6	1120249	1120254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387140648
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21352	NC_017308	GAT	2	6	1120537	1120542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387140648
21353	NC_017308	AG	3	6	1120615	1120620	50 %	0 %	50 %	0 %	387140648
21354	NC_017308	GC	3	6	1120676	1120681	0 %	0 %	50 %	50 %	387140648
21355	NC_017308	GTGG	2	8	1120756	1120763	0 %	25 %	75 %	0 %	387140648
21356	NC_017308	CAA	2	6	1120777	1120782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387140648
21357	NC_017308	TTAT	2	8	1120835	1120842	25 %	75 %	0 %	0 %	387140648
21358	NC_017308	GCT	2	6	1120882	1120887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387140648
21359	NC_017308	GC	4	8	1120893	1120900	0 %	0 %	50 %	50 %	387140648
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21443	NC_017308	TTC	2	6	1125422	1125427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21446	NC_017308	ATCA	2	8	1125492	1125499	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21447	NC_017308	GCTT	2	8	1125592	1125599	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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21460	NC_017308	CAG	2	6	1126519	1126524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387140657
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21462	NC_017308	TTG	2	6	1126555	1126560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387140657
21463	NC_017308	CGT	2	6	1126573	1126578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387140657
21464	NC_017308	TGC	2	6	1126647	1126652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387140657
21465	NC_017308	TGG	2	6	1126744	1126749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387140657
21466	NC_017308	CGT	2	6	1126774	1126779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387140657
21467	NC_017308	TGC	2	6	1126875	1126880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387140657
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21472	NC_017308	A	6	6	1127200	1127205	100 %	0 %	0 %	0 %	387140658
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21479	NC_017308	TA	3	6	1127567	1127572	50 %	50 %	0 %	0 %	387140658
21480	NC_017308	TTC	2	6	1127662	1127667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387140658
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