MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 chromosome

Total Repeats: 44122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42502	NC_017305	CCAT	2	8	2250482	2250489	25 %	25 %	0 %	50 %	384511888
42503	NC_017305	TTG	2	6	2250496	2250501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384511888
42504	NC_017305	GTA	2	6	2250523	2250528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384511888
42505	NC_017305	CCT	2	6	2250553	2250558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384511888
42506	NC_017305	T	6	6	2250695	2250700	0 %	100 %	0 %	0 %	384511888
42507	NC_017305	TCAG	2	8	2250823	2250830	25 %	25 %	25 %	25 %	384511888
42508	NC_017305	T	6	6	2250833	2250838	0 %	100 %	0 %	0 %	384511888
42509	NC_017305	AGCG	2	8	2250850	2250857	25 %	0 %	50 %	25 %	384511888
42510	NC_017305	GAA	2	6	2250926	2250931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384511888
42511	NC_017305	CCA	2	6	2251012	2251017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384511888
42512	NC_017305	TGC	2	6	2251074	2251079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384511888
42513	NC_017305	TCT	2	6	2251150	2251155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384511888
42514	NC_017305	GTA	2	6	2251161	2251166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384511888
42515	NC_017305	GCAC	2	8	2251168	2251175	25 %	0 %	25 %	50 %	384511888
42516	NC_017305	GCC	2	6	2251204	2251209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384511888
42517	NC_017305	T	6	6	2251243	2251248	0 %	100 %	0 %	0 %	384511888
42518	NC_017305	CTG	2	6	2251266	2251271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384511888
42519	NC_017305	TGG	3	9	2251286	2251294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384511888
42520	NC_017305	TCT	2	6	2251324	2251329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384511888
42521	NC_017305	GC	3	6	2251450	2251455	0 %	0 %	50 %	50 %	384511888
42522	NC_017305	TTC	2	6	2251521	2251526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384511888
42523	NC_017305	TGC	2	6	2251632	2251637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384511888
42524	NC_017305	CATT	2	8	2251711	2251718	25 %	50 %	0 %	25 %	384511888
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42528	NC_017305	CTG	2	6	2251800	2251805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384511888
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42531	NC_017305	TCT	2	6	2251912	2251917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384511888
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42533	NC_017305	TA	3	6	2252085	2252090	50 %	50 %	0 %	0 %	384511888
42534	NC_017305	GCC	2	6	2252092	2252097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384511888
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42537	NC_017305	TGC	2	6	2252176	2252181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384511888
42538	NC_017305	T	6	6	2252187	2252192	0 %	100 %	0 %	0 %	384511888
42539	NC_017305	CAG	2	6	2252219	2252224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384511888
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42541	NC_017305	T	7	7	2252254	2252260	0 %	100 %	0 %	0 %	384511888
42542	NC_017305	TGA	2	6	2252319	2252324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384511888
42543	NC_017305	GTT	2	6	2252328	2252333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384511888
42544	NC_017305	TTAT	2	8	2252391	2252398	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42545	NC_017305	GT	3	6	2252516	2252521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42546	NC_017305	CCAG	2	8	2252526	2252533	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42547	NC_017305	C	6	6	2252550	2252555	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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42551	NC_017305	TTCCT	2	10	2252672	2252681	0 %	60 %	0 %	40 %	384511889
42552	NC_017305	GCA	2	6	2252685	2252690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384511889
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42555	NC_017305	CGA	2	6	2252910	2252915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384511889
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42559	NC_017305	TTA	2	6	2253142	2253147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42561	NC_017305	TCCG	2	8	2253221	2253228	0 %	25 %	25 %	50 %	384511890
42562	NC_017305	TCTGA	2	10	2253274	2253283	20 %	40 %	20 %	20 %	384511890
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42571	NC_017305	TTC	2	6	2253675	2253680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42573	NC_017305	TGC	2	6	2253716	2253721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42601	NC_017305	GCA	2	6	2255202	2255207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384511892
42602	NC_017305	GGA	2	6	2255272	2255277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384511892
42603	NC_017305	CAAG	2	8	2255306	2255313	50 %	0 %	25 %	25 %	384511892
42604	NC_017305	GGC	2	6	2255316	2255321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384511892
42605	NC_017305	AGT	2	6	2255366	2255371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384511892
42606	NC_017305	CT	3	6	2255378	2255383	0 %	50 %	0 %	50 %	384511892
42607	NC_017305	AAC	2	6	2255387	2255392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384511892
42608	NC_017305	AG	3	6	2255456	2255461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42609	NC_017305	AGCT	2	8	2255559	2255566	25 %	25 %	25 %	25 %	384511893
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42611	NC_017305	TCAA	2	8	2255598	2255605	50 %	25 %	0 %	25 %	384511893
42612	NC_017305	ATTT	2	8	2255668	2255675	25 %	75 %	0 %	0 %	384511893
42613	NC_017305	TGG	2	6	2255759	2255764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384511893
42614	NC_017305	CAT	2	6	2255812	2255817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384511893
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42616	NC_017305	ATGG	2	8	2255899	2255906	25 %	25 %	50 %	0 %	384511893
42617	NC_017305	GCT	2	6	2255948	2255953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384511894
42618	NC_017305	AATGC	2	10	2256058	2256067	40 %	20 %	20 %	20 %	384511894
42619	NC_017305	TGG	2	6	2256078	2256083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384511894
42620	NC_017305	ATGC	2	8	2256154	2256161	25 %	25 %	25 %	25 %	384511894
42621	NC_017305	CGT	2	6	2256198	2256203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384511894
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42625	NC_017305	GAC	2	6	2256322	2256327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384511894
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42727	NC_017305	T	6	6	2261517	2261522	0 %	100 %	0 %	0 %	384511900
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42733	NC_017305	ACC	2	6	2261782	2261787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384511900
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42735	NC_017305	GCC	2	6	2261830	2261835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384511900
42736	NC_017305	GCA	2	6	2261859	2261864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384511900
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42830	NC_017305	AGT	2	6	2267436	2267441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384511901
42831	NC_017305	CTCG	2	8	2267445	2267452	0 %	25 %	25 %	50 %	384511901
42832	NC_017305	AT	3	6	2267569	2267574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42833	NC_017305	CCG	2	6	2267578	2267583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42834	NC_017305	C	6	6	2267594	2267599	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42835	NC_017305	A	6	6	2267674	2267679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42836	NC_017305	CTT	2	6	2267783	2267788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384511902
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42840	NC_017305	CAG	2	6	2267944	2267949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42841	NC_017305	GCA	2	6	2268233	2268238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384511904
42842	NC_017305	CTA	2	6	2268282	2268287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384511904
42843	NC_017305	TA	3	6	2268345	2268350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42844	NC_017305	CAG	2	6	2268387	2268392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42845	NC_017305	TGC	2	6	2268398	2268403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42846	NC_017305	AT	3	6	2268479	2268484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42847	NC_017305	CAA	2	6	2268531	2268536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42848	NC_017305	AGC	2	6	2268546	2268551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42849	NC_017305	GTAA	2	8	2268566	2268573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42850	NC_017305	TGCC	2	8	2268627	2268634	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42851	NC_017305	CA	3	6	2268640	2268645	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42852	NC_017305	AG	3	6	2268660	2268665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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