MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 chromosome

Total Repeats: 44122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29004	NC_017305	CGTCAT	2	12	1538564	1538575	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384511269
29005	NC_017305	TCC	2	6	1538802	1538807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384511270
29006	NC_017305	GAA	2	6	1538869	1538874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384511270
29007	NC_017305	AGC	2	6	1538963	1538968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384511270
29008	NC_017305	CTA	2	6	1538992	1538997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384511270
29009	NC_017305	GCTA	2	8	1539047	1539054	25 %	25 %	25 %	25 %	384511270
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29011	NC_017305	ATC	2	6	1539155	1539160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384511270
29012	NC_017305	ATCTC	2	10	1539288	1539297	20 %	40 %	0 %	40 %	384511270
29013	NC_017305	GGAA	2	8	1539324	1539331	50 %	0 %	50 %	0 %	384511270
29014	NC_017305	GTAT	2	8	1539345	1539352	25 %	50 %	25 %	0 %	384511270
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29019	NC_017305	CGT	2	6	1539661	1539666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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29021	NC_017305	GAA	2	6	1539716	1539721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29022	NC_017305	ACC	2	6	1539825	1539830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384511271
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29027	NC_017305	TCA	2	6	1540015	1540020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384511271
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29031	NC_017305	CAA	2	6	1540362	1540367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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29047	NC_017305	GCT	2	6	1541123	1541128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384511273
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29054	NC_017305	GTA	2	6	1541681	1541686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384511274
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29056	NC_017305	A	6	6	1541874	1541879	100 %	0 %	0 %	0 %	384511275
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29131	NC_017305	GTC	2	6	1546762	1546767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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29204	NC_017305	TC	3	6	1551016	1551021	0 %	50 %	0 %	50 %	384511283
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29208	NC_017305	CAC	3	9	1551240	1551248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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29216	NC_017305	GCGTAA	2	12	1551659	1551670	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384511284
29217	NC_017305	GA	3	6	1551676	1551681	50 %	0 %	50 %	0 %	384511284
29218	NC_017305	AGC	2	6	1551727	1551732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384511284
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29222	NC_017305	A	6	6	1552053	1552058	100 %	0 %	0 %	0 %	384511284
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29225	NC_017305	GTG	2	6	1552211	1552216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384511284
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29230	NC_017305	GGC	2	6	1552405	1552410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384511284
29231	NC_017305	TTC	2	6	1552431	1552436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384511284
29232	NC_017305	GCA	2	6	1552444	1552449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384511284
29233	NC_017305	GCTCTT	2	12	1552506	1552517	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384511284
29234	NC_017305	TCT	2	6	1552529	1552534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384511284
29235	NC_017305	T	6	6	1552534	1552539	0 %	100 %	0 %	0 %	384511284
29236	NC_017305	AAAGC	2	10	1552648	1552657	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
29237	NC_017305	AACC	2	8	1552713	1552720	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29238	NC_017305	CAT	2	6	1552757	1552762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29239	NC_017305	CAG	2	6	1552776	1552781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29240	NC_017305	T	6	6	1552851	1552856	0 %	100 %	0 %	0 %	384511285
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29246	NC_017305	GCA	3	9	1553236	1553244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384511285
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29249	NC_017305	CGA	2	6	1553362	1553367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384511285
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29251	NC_017305	CGA	2	6	1553433	1553438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384511285
29252	NC_017305	CAG	2	6	1553496	1553501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384511285
29253	NC_017305	TTG	2	6	1553527	1553532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384511285
29254	NC_017305	AG	3	6	1553557	1553562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29255	NC_017305	CCA	2	6	1553670	1553675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384511286
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29274	NC_017305	CG	3	6	1554659	1554664	0 %	0 %	50 %	50 %	384511287
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29321	NC_017305	CA	3	6	1556912	1556917	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29322	NC_017305	A	6	6	1556920	1556925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29323	NC_017305	TAAT	2	8	1557014	1557021	50 %	50 %	0 %	0 %	384511289
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29336	NC_017305	CAA	2	6	1557810	1557815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384511290
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29341	NC_017305	A	6	6	1557962	1557967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29342	NC_017305	CAC	2	6	1557991	1557996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29343	NC_017305	ATA	2	6	1558050	1558055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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29345	NC_017305	A	6	6	1558117	1558122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29346	NC_017305	TAA	3	9	1558223	1558231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384511291
29347	NC_017305	CATG	2	8	1558258	1558265	25 %	25 %	25 %	25 %	384511291
29348	NC_017305	TA	4	8	1558327	1558334	50 %	50 %	0 %	0 %	384511291
29349	NC_017305	AGC	2	6	1558359	1558364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29350	NC_017305	GCT	2	6	1558384	1558389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29351	NC_017305	T	6	6	1558407	1558412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29352	NC_017305	TTCTGC	2	12	1558448	1558459	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384511292
29353	NC_017305	CTT	2	6	1558479	1558484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384511292
29354	NC_017305	GAT	2	6	1558488	1558493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384511292
29355	NC_017305	TCC	2	6	1558529	1558534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384511292
29356	NC_017305	GAA	2	6	1558546	1558551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384511292
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29358	NC_017305	GCT	2	6	1558593	1558598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384511292
29359	NC_017305	CAG	2	6	1558605	1558610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384511292
29360	NC_017305	GTAA	2	8	1558774	1558781	50 %	25 %	25 %	0 %	384511292
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29366	NC_017305	CAT	2	6	1558980	1558985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384511292
29367	NC_017305	TCT	3	9	1558995	1559003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384511292
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29383	NC_017305	ATC	2	6	1559560	1559565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384511292
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29391	NC_017305	CAA	2	6	1559890	1559895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384511292
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29415	NC_017305	ACG	2	6	1560831	1560836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384511293
29416	NC_017305	TTC	2	6	1560843	1560848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384511293
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29422	NC_017305	ATCCA	2	10	1561264	1561273	40 %	20 %	0 %	40 %	384511294
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29432	NC_017305	CAC	2	6	1561642	1561647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384511294
29433	NC_017305	TA	3	6	1561681	1561686	50 %	50 %	0 %	0 %	384511294
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29435	NC_017305	GCA	2	6	1561789	1561794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384511294
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29437	NC_017305	GC	3	6	1561958	1561963	0 %	0 %	50 %	50 %	384511294
29438	NC_017305	CCGGTA	2	12	1562007	1562018	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384511294
29439	NC_017305	GCG	2	6	1562066	1562071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384511294
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29442	NC_017305	AGTTC	2	10	1562190	1562199	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29443	NC_017305	TGAA	2	8	1562242	1562249	50 %	25 %	25 %	0 %	384511295
29444	NC_017305	TGA	2	6	1562258	1562263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384511295
29445	NC_017305	ACC	2	6	1562308	1562313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384511295
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29448	NC_017305	GTA	2	6	1562484	1562489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384511295
29449	NC_017305	CAA	2	6	1562523	1562528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384511295
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29451	NC_017305	CTG	2	6	1562576	1562581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384511295
29452	NC_017305	AC	3	6	1562585	1562590	50 %	0 %	0 %	50 %	384511295
29453	NC_017305	CTT	2	6	1562669	1562674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384511295
29454	NC_017305	CAAA	2	8	1562723	1562730	75 %	0 %	0 %	25 %	384511295
29455	NC_017305	TGC	2	6	1562820	1562825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384511295
29456	NC_017305	TTC	2	6	1562874	1562879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29457	NC_017305	ACG	2	6	1563002	1563007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29458	NC_017305	TCA	2	6	1563023	1563028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29459	NC_017305	CCT	2	6	1563081	1563086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29460	NC_017305	TTTC	2	8	1563090	1563097	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29461	NC_017305	GA	3	6	1563126	1563131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29462	NC_017305	TGC	2	6	1563165	1563170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29463	NC_017305	T	6	6	1563230	1563235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29464	NC_017305	ATT	2	6	1563247	1563252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29465	NC_017305	CAG	2	6	1563283	1563288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29466	NC_017305	A	6	6	1563308	1563313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29467	NC_017305	ATTT	2	8	1563351	1563358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29468	NC_017305	CAA	2	6	1563381	1563386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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29500	NC_017305	A	6	6	1565295	1565300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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