MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 chromosome

Total Repeats: 44122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26003	NC_017305	GCT	2	6	1374444	1374449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384511136
26004	NC_017305	TCA	2	6	1374502	1374507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384511136
26005	NC_017305	TCG	2	6	1374522	1374527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384511136
26006	NC_017305	CG	3	6	1374636	1374641	0 %	0 %	50 %	50 %	384511136
26007	NC_017305	GCT	2	6	1374661	1374666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384511136
26008	NC_017305	CAAC	2	8	1374676	1374683	50 %	0 %	0 %	50 %	384511136
26009	NC_017305	GCT	2	6	1374696	1374701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384511136
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26014	NC_017305	CTG	2	6	1375048	1375053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384511136
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26168	NC_017305	CTTC	2	8	1382567	1382574	0 %	50 %	0 %	50 %	384511142
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26222	NC_017305	GAACA	2	10	1385414	1385423	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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26234	NC_017305	CGT	2	6	1386305	1386310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384511144
26235	NC_017305	CAT	2	6	1386392	1386397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384511144
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26465	NC_017305	AG	3	6	1397478	1397483	50 %	0 %	50 %	0 %	384511154
26466	NC_017305	CTT	2	6	1397492	1397497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384511154
26467	NC_017305	TGT	2	6	1397532	1397537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384511154
26468	NC_017305	TTC	2	6	1397568	1397573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384511154
26469	NC_017305	AAG	2	6	1397607	1397612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384511154
26470	NC_017305	TCAA	2	8	1397629	1397636	50 %	25 %	0 %	25 %	384511154
26471	NC_017305	CCAAAG	2	12	1397713	1397724	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384511155
26472	NC_017305	TCC	2	6	1397839	1397844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384511155
26473	NC_017305	TCA	3	9	1397874	1397882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384511155
26474	NC_017305	T	7	7	1397909	1397915	0 %	100 %	0 %	0 %	384511155
26475	NC_017305	CTTCAA	2	12	1397917	1397928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384511155
26476	NC_017305	AAC	2	6	1397930	1397935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384511155
26477	NC_017305	GTA	2	6	1397970	1397975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384511155
26478	NC_017305	TAC	2	6	1398083	1398088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384511155
26479	NC_017305	ATCT	2	8	1398276	1398283	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26480	NC_017305	GCA	2	6	1398321	1398326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384511156
26481	NC_017305	AGC	2	6	1398422	1398427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384511156
26482	NC_017305	GCC	2	6	1398432	1398437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384511156
26483	NC_017305	CTT	2	6	1398562	1398567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384511156
26484	NC_017305	GAC	2	6	1398570	1398575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384511156
26485	NC_017305	TGC	2	6	1398587	1398592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384511156
26486	NC_017305	CTTTGA	2	12	1398608	1398619	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384511156
26487	NC_017305	CAG	2	6	1398626	1398631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384511156
26488	NC_017305	CGC	2	6	1398641	1398646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384511156
26489	NC_017305	TTG	2	6	1398724	1398729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384511156
26490	NC_017305	AGC	2	6	1398746	1398751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384511156
26491	NC_017305	TAAA	2	8	1398790	1398797	75 %	25 %	0 %	0 %	384511156
26492	NC_017305	TCC	2	6	1398804	1398809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384511156
26493	NC_017305	CT	3	6	1398846	1398851	0 %	50 %	0 %	50 %	384511156
26494	NC_017305	A	6	6	1399022	1399027	100 %	0 %	0 %	0 %	384511156
26495	NC_017305	CAA	2	6	1399032	1399037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384511156
26496	NC_017305	ATT	2	6	1399096	1399101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384511156
26497	NC_017305	GCT	2	6	1399113	1399118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384511156
26498	NC_017305	ACT	2	6	1399128	1399133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384511156
26499	NC_017305	CTAGCT	2	12	1399146	1399157	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384511156
26500	NC_017305	CGGC	2	8	1399174	1399181	0 %	0 %	50 %	50 %	384511156

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