MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis C231 chromosome

Total Repeats: 43968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_017301	GCT	2	6	1537907	1537912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507090
29003	NC_017301	TCC	2	6	1537972	1537977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384507090
29004	NC_017301	TTCCT	2	10	1538108	1538117	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
29005	NC_017301	ACG	2	6	1538264	1538269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507091
29006	NC_017301	CCG	2	6	1538369	1538374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384507091
29007	NC_017301	AAT	2	6	1538399	1538404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384507091
29008	NC_017301	TGC	2	6	1538440	1538445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507091
29009	NC_017301	TAC	2	6	1538580	1538585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507091
29010	NC_017301	TCCGC	2	10	1538617	1538626	0 %	20 %	20 %	60 %	384507091
29011	NC_017301	CAA	2	6	1538633	1538638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384507091
29012	NC_017301	TTTG	2	8	1538673	1538680	0 %	75 %	25 %	0 %	384507091
29013	NC_017301	GCA	2	6	1538708	1538713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507091
29014	NC_017301	CAG	2	6	1538792	1538797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507091
29015	NC_017301	GAAG	2	8	1538803	1538810	50 %	0 %	50 %	0 %	384507091
29016	NC_017301	GGA	2	6	1538846	1538851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384507091
29017	NC_017301	TTC	2	6	1538865	1538870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507091
29018	NC_017301	GAT	2	6	1538908	1538913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507091
29019	NC_017301	TGG	2	6	1538930	1538935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507091
29020	NC_017301	TGC	2	6	1538993	1538998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507091
29021	NC_017301	GGA	2	6	1539008	1539013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384507091
29022	NC_017301	CTG	2	6	1539050	1539055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507091
29023	NC_017301	TAT	2	6	1539107	1539112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384507091
29024	NC_017301	GTT	2	6	1539134	1539139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384507091
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29027	NC_017301	CCGT	2	8	1539319	1539326	0 %	25 %	25 %	50 %	384507091
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29031	NC_017301	CGT	2	6	1539654	1539659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507091
29032	NC_017301	TGA	2	6	1539674	1539679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507091
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29035	NC_017301	CTAT	2	8	1539913	1539920	25 %	50 %	0 %	25 %	384507091
29036	NC_017301	GCGCT	2	10	1539933	1539942	0 %	20 %	40 %	40 %	384507091
29037	NC_017301	CA	3	6	1539970	1539975	50 %	0 %	0 %	50 %	384507091
29038	NC_017301	GC	3	6	1539993	1539998	0 %	0 %	50 %	50 %	384507091
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29042	NC_017301	ACG	2	6	1540149	1540154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29043	NC_017301	GAG	2	6	1540169	1540174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29044	NC_017301	TGC	2	6	1540269	1540274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507092
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29048	NC_017301	GCA	2	6	1540510	1540515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507092
29049	NC_017301	AGA	3	9	1540563	1540571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507092
29050	NC_017301	GCT	2	6	1540637	1540642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507092
29051	NC_017301	TAG	2	6	1540661	1540666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507092
29052	NC_017301	ATC	2	6	1540705	1540710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507092
29053	NC_017301	CAA	2	6	1540713	1540718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384507092
29054	NC_017301	CGACG	2	10	1540766	1540775	20 %	0 %	40 %	40 %	384507092
29055	NC_017301	CTT	2	6	1540867	1540872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507092
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29066	NC_017301	GTAT	2	8	1541731	1541738	25 %	50 %	25 %	0 %	384507093
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29072	NC_017301	TTAA	2	8	1542067	1542074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29073	NC_017301	GAA	2	6	1542102	1542107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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29083	NC_017301	CAA	2	6	1542748	1542753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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29088	NC_017301	GCCA	2	8	1543080	1543087	25 %	0 %	25 %	50 %	384507095
29089	NC_017301	CATA	2	8	1543091	1543098	50 %	25 %	0 %	25 %	384507095
29090	NC_017301	A	6	6	1543098	1543103	100 %	0 %	0 %	0 %	384507095
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29097	NC_017301	TCC	2	6	1543417	1543422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384507096
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29099	NC_017301	GCT	2	6	1543509	1543514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507096
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29102	NC_017301	CAG	2	6	1543663	1543668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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29104	NC_017301	CGC	2	6	1543925	1543930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384507097
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29106	NC_017301	GTA	2	6	1544067	1544072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507097
29107	NC_017301	TTAAG	2	10	1544143	1544152	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29108	NC_017301	A	6	6	1544260	1544265	100 %	0 %	0 %	0 %	384507098
29109	NC_017301	TCCATT	2	12	1544285	1544296	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384507099
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29115	NC_017301	A	6	6	1544697	1544702	100 %	0 %	0 %	0 %	384507099
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29117	NC_017301	TAC	2	6	1544796	1544801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507099
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29125	NC_017301	GGA	2	6	1545500	1545505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384507100
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29133	NC_017301	CATC	2	8	1545921	1545928	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29134	NC_017301	CA	3	6	1546064	1546069	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29135	NC_017301	GC	3	6	1546188	1546193	0 %	0 %	50 %	50 %	384507101
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29156	NC_017301	TCATC	2	10	1547904	1547913	20 %	40 %	0 %	40 %	384507102
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29182	NC_017301	AGGC	2	8	1549136	1549143	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29183	NC_017301	GTC	2	6	1549148	1549153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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29217	NC_017301	CGG	2	6	1550966	1550971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384507104
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29221	NC_017301	GCT	2	6	1551105	1551110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507104
29222	NC_017301	CGC	2	6	1551187	1551192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384507104
29223	NC_017301	TTCC	2	8	1551259	1551266	0 %	50 %	0 %	50 %	384507104
29224	NC_017301	GAAA	2	8	1551274	1551281	75 %	0 %	25 %	0 %	384507104
29225	NC_017301	A	6	6	1551294	1551299	100 %	0 %	0 %	0 %	384507104
29226	NC_017301	GAA	2	6	1551305	1551310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507104
29227	NC_017301	CTGTGC	2	12	1551502	1551513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29228	NC_017301	GCA	2	6	1551540	1551545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507105
29229	NC_017301	A	6	6	1551736	1551741	100 %	0 %	0 %	0 %	384507105
29230	NC_017301	TCA	2	6	1551752	1551757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507105
29231	NC_017301	ATA	2	6	1551869	1551874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384507105
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29352	NC_017301	AATGC	2	10	1558211	1558220	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29353	NC_017301	ACC	2	6	1558270	1558275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384507111
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29467	NC_017301	ACG	2	6	1563162	1563167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507116
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29470	NC_017301	CTG	2	6	1563269	1563274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507116
29471	NC_017301	ATG	2	6	1563277	1563282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507116
29472	NC_017301	ACCAA	2	10	1563459	1563468	60 %	0 %	0 %	40 %	384507116
29473	NC_017301	TTTC	2	8	1563618	1563625	0 %	75 %	0 %	25 %	384507116
29474	NC_017301	ATTGCT	2	12	1563627	1563638	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384507116
29475	NC_017301	ATCCA	2	10	1563649	1563658	40 %	20 %	0 %	40 %	384507117
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29480	NC_017301	TCTT	2	8	1563792	1563799	0 %	75 %	0 %	25 %	384507117
29481	NC_017301	TCA	2	6	1563801	1563806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507117
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29486	NC_017301	TA	3	6	1564066	1564071	50 %	50 %	0 %	0 %	384507117
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29488	NC_017301	GCA	2	6	1564174	1564179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507117
29489	NC_017301	TTGC	2	8	1564327	1564334	0 %	50 %	25 %	25 %	384507117
29490	NC_017301	GC	3	6	1564343	1564348	0 %	0 %	50 %	50 %	384507117
29491	NC_017301	CCGGTA	2	12	1564392	1564403	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384507117
29492	NC_017301	GCG	2	6	1564451	1564456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384507117
29493	NC_017301	GGT	2	6	1564523	1564528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507117
29494	NC_017301	CAT	2	6	1564532	1564537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507117
29495	NC_017301	AGTTC	2	10	1564575	1564584	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29496	NC_017301	TGAA	2	8	1564627	1564634	50 %	25 %	25 %	0 %	384507118
29497	NC_017301	TGA	2	6	1564643	1564648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507118
29498	NC_017301	ACC	2	6	1564693	1564698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384507118
29499	NC_017301	GCA	2	6	1564702	1564707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507118
29500	NC_017301	GTG	2	6	1564804	1564809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507118

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