MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis C231 chromosome

Total Repeats: 43968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28002	NC_017301	A	6	6	1483398	1483403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28003	NC_017301	TTC	2	6	1483466	1483471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507041
28004	NC_017301	ACA	2	6	1483495	1483500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384507041
28005	NC_017301	GA	3	6	1483518	1483523	50 %	0 %	50 %	0 %	384507041
28006	NC_017301	CAG	2	6	1483534	1483539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507041
28007	NC_017301	GAA	2	6	1483604	1483609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507041
28008	NC_017301	CTT	2	6	1483670	1483675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507041
28009	NC_017301	CAAGAA	2	12	1483688	1483699	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384507041
28010	NC_017301	ATA	2	6	1483811	1483816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384507041
28011	NC_017301	ACC	2	6	1484015	1484020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384507041
28012	NC_017301	ATC	2	6	1484054	1484059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507041
28013	NC_017301	ATC	2	6	1484121	1484126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507041
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28015	NC_017301	CA	3	6	1484196	1484201	50 %	0 %	0 %	50 %	384507041
28016	NC_017301	AAT	2	6	1484204	1484209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384507041
28017	NC_017301	ATG	2	6	1484220	1484225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507041
28018	NC_017301	GTC	2	6	1484330	1484335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28019	NC_017301	ATT	2	6	1484336	1484341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28020	NC_017301	GATG	2	8	1484438	1484445	25 %	25 %	50 %	0 %	384507042
28021	NC_017301	CTG	2	6	1484451	1484456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507042
28022	NC_017301	CCA	2	6	1484457	1484462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384507042
28023	NC_017301	GCA	2	6	1484489	1484494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507042
28024	NC_017301	T	6	6	1484502	1484507	0 %	100 %	0 %	0 %	384507042
28025	NC_017301	ACC	2	6	1484516	1484521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384507042
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28028	NC_017301	ATC	2	6	1484780	1484785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507042
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28031	NC_017301	ATT	2	6	1484885	1484890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384507042
28032	NC_017301	GCA	2	6	1485050	1485055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507042
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28035	NC_017301	GGC	2	6	1485116	1485121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384507042
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28038	NC_017301	AAC	2	6	1485274	1485279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28039	NC_017301	AAT	2	6	1485345	1485350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28040	NC_017301	TCT	2	6	1485450	1485455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507043
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28042	NC_017301	AGCA	2	8	1485517	1485524	50 %	0 %	25 %	25 %	384507043
28043	NC_017301	AGC	3	9	1485568	1485576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507043
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28047	NC_017301	GCAAA	2	10	1485783	1485792	60 %	0 %	20 %	20 %	384507043
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28051	NC_017301	CCATG	2	10	1485913	1485922	20 %	20 %	20 %	40 %	384507043
28052	NC_017301	TGG	2	6	1485993	1485998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507043
28053	NC_017301	CT	3	6	1486005	1486010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28054	NC_017301	GTC	2	6	1486024	1486029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28055	NC_017301	GC	3	6	1486043	1486048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28056	NC_017301	AGC	2	6	1486059	1486064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507044
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28059	NC_017301	ATCC	2	8	1486277	1486284	25 %	25 %	0 %	50 %	384507044
28060	NC_017301	CAT	2	6	1486289	1486294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507044
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28063	NC_017301	GCT	2	6	1486542	1486547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507045
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28072	NC_017301	GT	3	6	1487314	1487319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28073	NC_017301	TC	3	6	1487342	1487347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28074	NC_017301	ACT	2	6	1487409	1487414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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28088	NC_017301	TTCT	2	8	1488148	1488155	0 %	75 %	0 %	25 %	384507046
28089	NC_017301	CAT	2	6	1488157	1488162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507046
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28091	NC_017301	AG	3	6	1488249	1488254	50 %	0 %	50 %	0 %	384507047
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28105	NC_017301	GAA	2	6	1488999	1489004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28106	NC_017301	AG	3	6	1489008	1489013	50 %	0 %	50 %	0 %	384507048
28107	NC_017301	GCT	2	6	1489103	1489108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507048
28108	NC_017301	A	6	6	1489239	1489244	100 %	0 %	0 %	0 %	384507048
28109	NC_017301	CTTT	2	8	1489250	1489257	0 %	75 %	0 %	25 %	384507048
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28112	NC_017301	AGC	2	6	1489619	1489624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507048
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28115	NC_017301	GGA	2	6	1489704	1489709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384507049
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28117	NC_017301	TGT	2	6	1489786	1489791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384507049
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28235	NC_017301	GCT	2	6	1496110	1496115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507055
28236	NC_017301	CCG	2	6	1496129	1496134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384507055
28237	NC_017301	TCA	2	6	1496161	1496166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507055
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28268	NC_017301	TAAG	2	8	1497710	1497717	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28269	NC_017301	CGA	2	6	1497785	1497790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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28350	NC_017301	TCC	2	6	1502002	1502007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384507059
28351	NC_017301	CCG	2	6	1502060	1502065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384507059
28352	NC_017301	CAA	2	6	1502170	1502175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384507059
28353	NC_017301	GAC	2	6	1502277	1502282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507059
28354	NC_017301	CAAA	2	8	1502319	1502326	75 %	0 %	0 %	25 %	384507059
28355	NC_017301	GC	3	6	1502328	1502333	0 %	0 %	50 %	50 %	384507059
28356	NC_017301	AAC	2	6	1502420	1502425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384507059
28357	NC_017301	ACC	2	6	1502483	1502488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28358	NC_017301	CCG	2	6	1502490	1502495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28359	NC_017301	CA	3	6	1502511	1502516	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28360	NC_017301	CTA	2	6	1502533	1502538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28361	NC_017301	TG	3	6	1502570	1502575	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28362	NC_017301	CTTCT	2	10	1502622	1502631	0 %	60 %	0 %	40 %	384507060
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28364	NC_017301	GCAC	2	8	1502885	1502892	25 %	0 %	25 %	50 %	384507060
28365	NC_017301	CT	3	6	1502924	1502929	0 %	50 %	0 %	50 %	384507060
28366	NC_017301	CAG	2	6	1502939	1502944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507060
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28370	NC_017301	GTA	2	6	1503105	1503110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507060
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28372	NC_017301	GCCG	2	8	1503291	1503298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28373	NC_017301	TCA	2	6	1503325	1503330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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28381	NC_017301	TGG	2	6	1504057	1504062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507061
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28388	NC_017301	ATC	2	6	1504230	1504235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507061
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28391	NC_017301	GGCT	2	8	1504434	1504441	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28392	NC_017301	TGC	2	6	1504451	1504456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28393	NC_017301	ACAG	2	8	1504460	1504467	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28394	NC_017301	CAA	2	6	1504471	1504476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28395	NC_017301	ATCG	2	8	1504561	1504568	25 %	25 %	25 %	25 %	384507062
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28406	NC_017301	GTT	2	6	1505093	1505098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384507064
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28421	NC_017301	TCG	2	6	1505921	1505926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507065
28422	NC_017301	CCGG	2	8	1505989	1505996	0 %	0 %	50 %	50 %	384507065
28423	NC_017301	AGA	2	6	1506057	1506062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28424	NC_017301	CGA	2	6	1506112	1506117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507066
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28445	NC_017301	GAAC	2	8	1507180	1507187	50 %	0 %	25 %	25 %	384507066
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28449	NC_017301	TGCGG	2	10	1507524	1507533	0 %	20 %	60 %	20 %	384507067
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28452	NC_017301	TTA	2	6	1507618	1507623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384507067
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28455	NC_017301	ATG	2	6	1507795	1507800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507067
28456	NC_017301	TCT	2	6	1507804	1507809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507067
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28458	NC_017301	TCTT	2	8	1507912	1507919	0 %	75 %	0 %	25 %	384507067
28459	NC_017301	ACG	2	6	1507926	1507931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507067
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28461	NC_017301	TCTG	2	8	1508014	1508021	0 %	50 %	25 %	25 %	384507067
28462	NC_017301	CAT	2	6	1508162	1508167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507067
28463	NC_017301	T	6	6	1508214	1508219	0 %	100 %	0 %	0 %	384507067
28464	NC_017301	CAA	2	6	1508259	1508264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384507067
28465	NC_017301	GGA	2	6	1508480	1508485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384507067
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28467	NC_017301	AT	3	6	1508605	1508610	50 %	50 %	0 %	0 %	384507067
28468	NC_017301	GCG	2	6	1508668	1508673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384507067
28469	NC_017301	TTG	2	6	1508680	1508685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384507067
28470	NC_017301	ACA	2	6	1508756	1508761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384507067
28471	NC_017301	GCT	2	6	1508804	1508809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507067
28472	NC_017301	TCA	2	6	1508917	1508922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507067
28473	NC_017301	TCG	2	6	1508941	1508946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507067
28474	NC_017301	CAC	2	6	1509140	1509145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384507067
28475	NC_017301	CAG	2	6	1509150	1509155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507067
28476	NC_017301	GTC	2	6	1509171	1509176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507067
28477	NC_017301	GTG	2	6	1509178	1509183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507067
28478	NC_017301	CAGG	2	8	1509301	1509308	25 %	0 %	50 %	25 %	384507067
28479	NC_017301	CG	3	6	1509342	1509347	0 %	0 %	50 %	50 %	384507067
28480	NC_017301	CAC	2	6	1509423	1509428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384507067
28481	NC_017301	T	7	7	1509458	1509464	0 %	100 %	0 %	0 %	384507067
28482	NC_017301	GCG	2	6	1509718	1509723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384507067
28483	NC_017301	ATC	2	6	1509730	1509735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507067
28484	NC_017301	CGA	2	6	1509745	1509750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507067
28485	NC_017301	TCGATA	2	12	1509760	1509771	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384507067
28486	NC_017301	AGA	2	6	1509814	1509819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507067
28487	NC_017301	CCA	2	6	1509863	1509868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384507067
28488	NC_017301	TCAGC	2	10	1509932	1509941	20 %	20 %	20 %	40 %	384507067
28489	NC_017301	AAG	2	6	1509956	1509961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507067
28490	NC_017301	ATCA	2	8	1509975	1509982	50 %	25 %	0 %	25 %	384507067
28491	NC_017301	CGAT	2	8	1510003	1510010	25 %	25 %	25 %	25 %	384507067
28492	NC_017301	GT	3	6	1510132	1510137	0 %	50 %	50 %	0 %	384507067
28493	NC_017301	TCC	2	6	1510138	1510143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384507067
28494	NC_017301	TAT	2	6	1510187	1510192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384507067
28495	NC_017301	TC	3	6	1510223	1510228	0 %	50 %	0 %	50 %	384507067
28496	NC_017301	TAA	2	6	1510252	1510257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384507067
28497	NC_017301	GCAC	2	8	1510310	1510317	25 %	0 %	25 %	50 %	384507067
28498	NC_017301	TGG	2	6	1510380	1510385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507067
28499	NC_017301	AAT	2	6	1510469	1510474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384507067
28500	NC_017301	ACG	2	6	1510655	1510660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507067

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