MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis C231 chromosome

Total Repeats: 43968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_017301	TTC	2	6	1264655	1264660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384506851
24003	NC_017301	AAG	2	6	1264663	1264668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384506851
24004	NC_017301	GACCA	2	10	1264730	1264739	40 %	0 %	20 %	40 %	384506851
24005	NC_017301	GTT	2	6	1264768	1264773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384506851
24006	NC_017301	GTT	2	6	1264831	1264836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384506851
24007	NC_017301	GCA	2	6	1264953	1264958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384506851
24008	NC_017301	ATT	2	6	1264986	1264991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384506851
24009	NC_017301	GA	3	6	1265021	1265026	50 %	0 %	50 %	0 %	384506851
24010	NC_017301	GC	3	6	1265092	1265097	0 %	0 %	50 %	50 %	384506851
24011	NC_017301	ACT	2	6	1265135	1265140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384506851
24012	NC_017301	GC	3	6	1265147	1265152	0 %	0 %	50 %	50 %	384506851
24013	NC_017301	CGCC	2	8	1265173	1265180	0 %	0 %	25 %	75 %	384506851
24014	NC_017301	CAT	2	6	1265344	1265349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384506851
24015	NC_017301	CAG	2	6	1265474	1265479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384506851
24016	NC_017301	CTAG	2	8	1265517	1265524	25 %	25 %	25 %	25 %	384506851
24017	NC_017301	TAC	2	6	1265534	1265539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384506851
24018	NC_017301	GTT	2	6	1265576	1265581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384506851
24019	NC_017301	GCA	2	6	1265586	1265591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384506851
24020	NC_017301	GCTTG	2	10	1265596	1265605	0 %	40 %	40 %	20 %	384506851
24021	NC_017301	GTG	2	6	1265608	1265613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384506851
24022	NC_017301	ATA	2	6	1265672	1265677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384506851
24023	NC_017301	CT	3	6	1265696	1265701	0 %	50 %	0 %	50 %	384506851
24024	NC_017301	TTG	2	6	1265742	1265747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384506851
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24032	NC_017301	ACC	2	6	1266164	1266169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384506852
24033	NC_017301	GCA	2	6	1266171	1266176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384506852
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24036	NC_017301	CTTTT	2	10	1266336	1266345	0 %	80 %	0 %	20 %	384506852
24037	NC_017301	CTG	2	6	1266381	1266386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384506852
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24042	NC_017301	AG	3	6	1266497	1266502	50 %	0 %	50 %	0 %	384506852
24043	NC_017301	GCT	2	6	1266543	1266548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384506852
24044	NC_017301	TC	3	6	1266561	1266566	0 %	50 %	0 %	50 %	384506852
24045	NC_017301	GCA	2	6	1266663	1266668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384506852
24046	NC_017301	AGTA	2	8	1266715	1266722	50 %	25 %	25 %	0 %	384506852
24047	NC_017301	TGA	2	6	1266766	1266771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384506852
24048	NC_017301	CTGT	2	8	1266900	1266907	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24049	NC_017301	ATT	2	6	1267128	1267133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384506853
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24052	NC_017301	GAA	2	6	1267284	1267289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384506853
24053	NC_017301	CG	3	6	1267318	1267323	0 %	0 %	50 %	50 %	384506853
24054	NC_017301	ATTC	2	8	1267380	1267387	25 %	50 %	0 %	25 %	384506853
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24094	NC_017301	ACTT	2	8	1269713	1269720	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24095	NC_017301	TGA	2	6	1269769	1269774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24103	NC_017301	TAAT	2	8	1270119	1270126	50 %	50 %	0 %	0 %	384506856
24104	NC_017301	TAC	2	6	1270190	1270195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384506856
24105	NC_017301	TTCCG	2	10	1270376	1270385	0 %	40 %	20 %	40 %	384506856
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24111	NC_017301	A	6	6	1270576	1270581	100 %	0 %	0 %	0 %	384506856
24112	NC_017301	CAG	2	6	1270594	1270599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384506856
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24115	NC_017301	CTT	2	6	1270762	1270767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24117	NC_017301	TAA	2	6	1270793	1270798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24118	NC_017301	CTA	2	6	1270825	1270830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24120	NC_017301	ACC	2	6	1270957	1270962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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24122	NC_017301	TTA	2	6	1271316	1271321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384506857
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24230	NC_017301	CCG	2	6	1277381	1277386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24231	NC_017301	ATA	2	6	1277387	1277392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24232	NC_017301	TA	3	6	1277391	1277396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24233	NC_017301	CTTAA	2	10	1277567	1277576	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24234	NC_017301	CTC	2	6	1277597	1277602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384506864
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24236	NC_017301	GCA	2	6	1277645	1277650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384506864
24237	NC_017301	TCC	2	6	1277705	1277710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384506864
24238	NC_017301	CT	3	6	1277732	1277737	0 %	50 %	0 %	50 %	384506864
24239	NC_017301	TCTTCC	2	12	1277738	1277749	0 %	50 %	0 %	50 %	384506864
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24241	NC_017301	CAT	2	6	1277851	1277856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384506864
24242	NC_017301	CTG	2	6	1277859	1277864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384506864
24243	NC_017301	CAC	2	6	1277878	1277883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384506864
24244	NC_017301	AAG	2	6	1277924	1277929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384506864
24245	NC_017301	AATT	2	8	1277934	1277941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24246	NC_017301	TCA	2	6	1278100	1278105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384506865
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24248	NC_017301	GTT	2	6	1278205	1278210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384506865
24249	NC_017301	GGC	2	6	1278275	1278280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384506865
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24252	NC_017301	TAGC	2	8	1278442	1278449	25 %	25 %	25 %	25 %	384506865
24253	NC_017301	CTTC	2	8	1278468	1278475	0 %	50 %	0 %	50 %	384506865
24254	NC_017301	CCGAT	2	10	1278625	1278634	20 %	20 %	20 %	40 %	384506865
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24258	NC_017301	TAGTT	2	10	1278914	1278923	20 %	60 %	20 %	0 %	384506865
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24272	NC_017301	AAAG	2	8	1279671	1279678	75 %	0 %	25 %	0 %	384506865
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24274	NC_017301	GCTT	2	8	1279764	1279771	0 %	50 %	25 %	25 %	384506865
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24279	NC_017301	TCT	2	6	1279974	1279979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384506865
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24284	NC_017301	ATCC	2	8	1280376	1280383	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24285	NC_017301	CT	3	6	1280406	1280411	0 %	50 %	0 %	50 %	384506866
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24325	NC_017301	TTCT	2	8	1282886	1282893	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24326	NC_017301	TGC	2	6	1282906	1282911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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24332	NC_017301	TGCC	2	8	1283760	1283767	0 %	25 %	25 %	50 %	384506868
24333	NC_017301	TTC	2	6	1283784	1283789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384506868
24334	NC_017301	CAA	2	6	1283942	1283947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384506868
24335	NC_017301	GCCT	2	8	1284035	1284042	0 %	25 %	25 %	50 %	384506868
24336	NC_017301	GCC	3	9	1284054	1284062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384506868
24337	NC_017301	TTG	2	6	1284102	1284107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384506869
24338	NC_017301	CTT	2	6	1284127	1284132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384506869
24339	NC_017301	CGA	2	6	1284151	1284156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384506869
24340	NC_017301	CCCAT	2	10	1284237	1284246	20 %	20 %	0 %	60 %	384506869
24341	NC_017301	AAG	2	6	1284309	1284314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384506869
24342	NC_017301	CAC	2	6	1284317	1284322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384506869
24343	NC_017301	CGT	2	6	1284335	1284340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384506869
24344	NC_017301	ATAA	2	8	1284389	1284396	75 %	25 %	0 %	0 %	384506869
24345	NC_017301	GTA	2	6	1284543	1284548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384506869
24346	NC_017301	CCAATA	2	12	1284549	1284560	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384506869
24347	NC_017301	AAG	2	6	1284643	1284648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384506869
24348	NC_017301	GAT	2	6	1284668	1284673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384506869
24349	NC_017301	GTAGAA	2	12	1284686	1284697	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384506869
24350	NC_017301	TGC	2	6	1284704	1284709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384506869
24351	NC_017301	TGG	2	6	1284787	1284792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384506869
24352	NC_017301	CCA	2	6	1284795	1284800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384506869
24353	NC_017301	CTT	2	6	1284871	1284876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384506869
24354	NC_017301	ACC	2	6	1285088	1285093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384506869
24355	NC_017301	GCT	2	6	1285205	1285210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384506869
24356	NC_017301	TCA	2	6	1285242	1285247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384506869
24357	NC_017301	TGT	2	6	1285307	1285312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384506869
24358	NC_017301	CTT	2	6	1285334	1285339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384506869
24359	NC_017301	T	6	6	1285355	1285360	0 %	100 %	0 %	0 %	384506869
24360	NC_017301	GCCTCG	2	12	1285368	1285379	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384506869
24361	NC_017301	TCT	2	6	1285440	1285445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384506869
24362	NC_017301	TCA	2	6	1285500	1285505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384506869
24363	NC_017301	GGCTG	2	10	1285578	1285587	0 %	20 %	60 %	20 %	384506869
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24369	NC_017301	ACC	2	6	1285808	1285813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384506869
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24372	NC_017301	AGA	2	6	1286012	1286017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24373	NC_017301	CGA	2	6	1286021	1286026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24374	NC_017301	TCG	2	6	1286052	1286057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24375	NC_017301	CAA	2	6	1286059	1286064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24376	NC_017301	TG	3	6	1286076	1286081	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24377	NC_017301	ACCC	2	8	1286200	1286207	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
24378	NC_017301	TAA	2	6	1286222	1286227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24379	NC_017301	GCTTA	2	10	1286262	1286271	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24380	NC_017301	TCG	2	6	1286470	1286475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384506870
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24382	NC_017301	ATC	2	6	1286511	1286516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384506870
24383	NC_017301	GCTTCT	2	12	1286554	1286565	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384506870
24384	NC_017301	ACG	2	6	1286578	1286583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384506870
24385	NC_017301	TAG	2	6	1286597	1286602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384506870
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24388	NC_017301	AGAA	2	8	1286652	1286659	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24389	NC_017301	GCC	2	6	1286674	1286679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24390	NC_017301	GCA	2	6	1286749	1286754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384506871
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24420	NC_017301	ACC	2	6	1288258	1288263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384506872
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24422	NC_017301	TCT	2	6	1288435	1288440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24423	NC_017301	ATT	2	6	1288471	1288476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24424	NC_017301	TTC	2	6	1288512	1288517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24425	NC_017301	ATCGT	2	10	1288523	1288532	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24426	NC_017301	GCT	2	6	1288591	1288596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384506873
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24431	NC_017301	CT	3	6	1288919	1288924	0 %	50 %	0 %	50 %	384506873
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24438	NC_017301	GTAT	2	8	1289221	1289228	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24439	NC_017301	CA	3	6	1289229	1289234	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24440	NC_017301	A	6	6	1289237	1289242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24441	NC_017301	CAC	2	6	1289244	1289249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24442	NC_017301	TAA	2	6	1289292	1289297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24443	NC_017301	CA	3	6	1289300	1289305	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24444	NC_017301	ATT	2	6	1289331	1289336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24445	NC_017301	CA	3	6	1289356	1289361	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24446	NC_017301	TC	3	6	1289393	1289398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24447	NC_017301	CAAGAA	2	12	1289416	1289427	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24448	NC_017301	ACTA	2	8	1289452	1289459	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24449	NC_017301	TGG	2	6	1289473	1289478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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24453	NC_017301	TCC	2	6	1289650	1289655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384506874
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24455	NC_017301	CGT	2	6	1289783	1289788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384506874
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24458	NC_017301	ATG	2	6	1289980	1289985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384506874
24459	NC_017301	CTT	2	6	1290066	1290071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384506874
24460	NC_017301	CTT	2	6	1290075	1290080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384506874
24461	NC_017301	CAC	2	6	1290119	1290124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384506874
24462	NC_017301	GCA	2	6	1290133	1290138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384506874
24463	NC_017301	AGC	2	6	1290192	1290197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384506874
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24465	NC_017301	TGG	2	6	1290209	1290214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384506874
24466	NC_017301	GTG	2	6	1290255	1290260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24467	NC_017301	GCT	2	6	1290338	1290343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384506875
24468	NC_017301	ACG	2	6	1290390	1290395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384506875
24469	NC_017301	T	6	6	1290440	1290445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24470	NC_017301	TCT	2	6	1290474	1290479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384506876
24471	NC_017301	TTC	2	6	1290544	1290549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384506876
24472	NC_017301	CTT	2	6	1290576	1290581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384506876
24473	NC_017301	GTG	2	6	1290584	1290589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384506876
24474	NC_017301	CAA	2	6	1290594	1290599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384506876
24475	NC_017301	GC	3	6	1290636	1290641	0 %	0 %	50 %	50 %	384506876
24476	NC_017301	GA	3	6	1290660	1290665	50 %	0 %	50 %	0 %	384506876
24477	NC_017301	GGA	2	6	1290705	1290710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384506876
24478	NC_017301	TCA	3	9	1290827	1290835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384506876
24479	NC_017301	CTT	2	6	1290843	1290848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384506876
24480	NC_017301	TCA	2	6	1290941	1290946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384506876
24481	NC_017301	TCG	2	6	1291051	1291056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384506876
24482	NC_017301	CGTC	2	8	1291088	1291095	0 %	25 %	25 %	50 %	384506876
24483	NC_017301	GCT	2	6	1291247	1291252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384506876
24484	NC_017301	GCC	2	6	1291276	1291281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384506876
24485	NC_017301	AT	3	6	1291360	1291365	50 %	50 %	0 %	0 %	384506876
24486	NC_017301	CTA	2	6	1291406	1291411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24487	NC_017301	TATG	2	8	1291552	1291559	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24488	NC_017301	GTT	2	6	1291566	1291571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24489	NC_017301	A	6	6	1291590	1291595	100 %	0 %	0 %	0 %	384506877
24490	NC_017301	TCT	2	6	1291622	1291627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384506877
24491	NC_017301	CTG	2	6	1291788	1291793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384506877
24492	NC_017301	GCA	2	6	1291807	1291812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384506877
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24495	NC_017301	TGC	2	6	1292090	1292095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384506877
24496	NC_017301	TC	3	6	1292141	1292146	0 %	50 %	0 %	50 %	384506877
24497	NC_017301	CCT	2	6	1292159	1292164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384506877
24498	NC_017301	GGGT	2	8	1292192	1292199	0 %	25 %	75 %	0 %	384506877
24499	NC_017301	GCCA	2	8	1292261	1292268	25 %	0 %	25 %	50 %	384506877
24500	NC_017301	TCT	2	6	1292314	1292319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384506877

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