MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis C231 chromosome

Total Repeats: 43968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_017301	GC	3	6	940305	940310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18002	NC_017301	CTT	2	6	940325	940330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18003	NC_017301	TGA	2	6	940395	940400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384506576
18004	NC_017301	CGT	2	6	940430	940435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384506576
18005	NC_017301	GCA	2	6	940525	940530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384506576
18006	NC_017301	CTC	2	6	940694	940699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384506576
18007	NC_017301	TGC	2	6	940701	940706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384506576
18008	NC_017301	AGC	2	6	940713	940718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384506576
18009	NC_017301	GAT	2	6	940720	940725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384506576
18010	NC_017301	GAA	2	6	940762	940767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384506576
18011	NC_017301	AGA	2	6	940887	940892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384506576
18012	NC_017301	GCT	2	6	940912	940917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384506576
18013	NC_017301	TCT	2	6	940948	940953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384506576
18014	NC_017301	GAA	2	6	940972	940977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384506576
18015	NC_017301	CG	3	6	941074	941079	0 %	0 %	50 %	50 %	384506576
18016	NC_017301	CCG	2	6	941105	941110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384506576
18017	NC_017301	TCA	2	6	941125	941130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384506576
18018	NC_017301	ACT	2	6	941164	941169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384506576
18019	NC_017301	TCC	2	6	941202	941207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384506576
18020	NC_017301	TGCCGC	2	12	941256	941267	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384506576
18021	NC_017301	GTTT	2	8	941291	941298	0 %	75 %	25 %	0 %	384506576
18022	NC_017301	TGC	2	6	941300	941305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384506576
18023	NC_017301	GGA	2	6	941371	941376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384506576
18024	NC_017301	GCA	2	6	941455	941460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384506576
18025	NC_017301	TGC	3	9	941496	941504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384506576
18026	NC_017301	TCCT	2	8	941524	941531	0 %	50 %	0 %	50 %	384506576
18027	NC_017301	CAC	2	6	941610	941615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384506576
18028	NC_017301	TGC	2	6	941627	941632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384506576
18029	NC_017301	TGG	2	6	941746	941751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384506576
18030	NC_017301	AATAA	2	10	941785	941794	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18031	NC_017301	CG	3	6	941897	941902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18032	NC_017301	ACG	2	6	941972	941977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18033	NC_017301	AGC	2	6	942080	942085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18034	NC_017301	CCT	2	6	942123	942128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18035	NC_017301	AAG	2	6	942187	942192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18036	NC_017301	TCC	2	6	942221	942226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18037	NC_017301	ACC	2	6	942249	942254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18038	NC_017301	TTTA	2	8	942275	942282	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18039	NC_017301	GAT	2	6	942284	942289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18040	NC_017301	CTT	2	6	942301	942306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18041	NC_017301	TAC	2	6	942371	942376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18042	NC_017301	TCC	2	6	942416	942421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18043	NC_017301	ATGC	2	8	942433	942440	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18044	NC_017301	CAT	2	6	942445	942450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18045	NC_017301	TGG	2	6	942463	942468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18046	NC_017301	TGG	2	6	942514	942519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18047	NC_017301	CTT	2	6	942559	942564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18048	NC_017301	ATG	2	6	942613	942618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18049	NC_017301	CCG	2	6	942690	942695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18050	NC_017301	ACAA	2	8	942745	942752	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18051	NC_017301	TG	3	6	942760	942765	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18052	NC_017301	TCA	2	6	942771	942776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18053	NC_017301	GA	5	10	942783	942792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18054	NC_017301	CTT	2	6	942805	942810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18055	NC_017301	GT	3	6	942825	942830	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18056	NC_017301	ACCC	2	8	942847	942854	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
18057	NC_017301	CTT	2	6	942889	942894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18058	NC_017301	TCT	2	6	942927	942932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18059	NC_017301	GTA	2	6	942938	942943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18060	NC_017301	TTC	2	6	943121	943126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18061	NC_017301	TTGT	2	8	943129	943136	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18062	NC_017301	TCG	2	6	943143	943148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18063	NC_017301	CAA	2	6	943216	943221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18064	NC_017301	CGG	2	6	943345	943350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18065	NC_017301	CTG	2	6	943395	943400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18066	NC_017301	CAT	2	6	943441	943446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18067	NC_017301	CAA	2	6	943504	943509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18068	NC_017301	TGC	2	6	943721	943726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384506577
18069	NC_017301	T	6	6	943787	943792	0 %	100 %	0 %	0 %	384506577
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18071	NC_017301	TG	3	6	943822	943827	0 %	50 %	50 %	0 %	384506577
18072	NC_017301	TGGG	2	8	943837	943844	0 %	25 %	75 %	0 %	384506577
18073	NC_017301	GCA	2	6	943849	943854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384506577
18074	NC_017301	CTCAT	2	10	943882	943891	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18075	NC_017301	T	6	6	943920	943925	0 %	100 %	0 %	0 %	384506578
18076	NC_017301	CGC	2	6	943935	943940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384506578
18077	NC_017301	TTC	2	6	943946	943951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384506578
18078	NC_017301	CTT	2	6	944012	944017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384506578
18079	NC_017301	ATC	2	6	944219	944224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384506578
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18081	NC_017301	TGC	2	6	944300	944305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384506578
18082	NC_017301	ATG	2	6	944310	944315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384506578
18083	NC_017301	TGCG	2	8	944355	944362	0 %	25 %	50 %	25 %	384506578
18084	NC_017301	A	6	6	944371	944376	100 %	0 %	0 %	0 %	384506578
18085	NC_017301	G	6	6	944402	944407	0 %	0 %	100 %	0 %	384506578
18086	NC_017301	TAC	2	6	944499	944504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384506579
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18089	NC_017301	GCC	2	6	944535	944540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384506579
18090	NC_017301	TTC	2	6	944619	944624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384506579
18091	NC_017301	TTG	2	6	944655	944660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384506579
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18094	NC_017301	CGT	2	6	944819	944824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384506579
18095	NC_017301	ACA	2	6	944872	944877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384506579
18096	NC_017301	TCC	2	6	944904	944909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384506579
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18098	NC_017301	TTGG	2	8	944995	945002	0 %	50 %	50 %	0 %	384506579
18099	NC_017301	ATT	2	6	945015	945020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384506579
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18102	NC_017301	GCT	2	6	945151	945156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384506579
18103	NC_017301	TGA	2	6	945260	945265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384506579
18104	NC_017301	TGA	2	6	945303	945308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384506579
18105	NC_017301	TCA	2	6	945373	945378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384506579
18106	NC_017301	ACGC	2	8	945554	945561	25 %	0 %	25 %	50 %	384506579
18107	NC_017301	CTT	2	6	945590	945595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384506579
18108	NC_017301	AATGG	2	10	945616	945625	40 %	20 %	40 %	0 %	384506579
18109	NC_017301	ACT	2	6	945634	945639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384506579
18110	NC_017301	AAT	2	6	945650	945655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384506579
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18112	NC_017301	TCGC	2	8	945731	945738	0 %	25 %	25 %	50 %	384506579
18113	NC_017301	TGG	2	6	945770	945775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384506579
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18123	NC_017301	TG	3	6	946234	946239	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18124	NC_017301	G	10	10	946267	946276	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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18158	NC_017301	CGCTG	2	10	947979	947988	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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18245	NC_017301	TGAG	2	8	952499	952506	25 %	25 %	50 %	0 %	384506583
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18486	NC_017301	TTCG	2	8	966370	966377	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18487	NC_017301	TGATG	2	10	966413	966422	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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